Exploring the IL-21–STAT3 Axis as Therapeutic Target for Sézary Syndrome

Sézary syndrome is an aggressive cutaneous T-cell lymphoma. The malignant cells (Sézary cells) are present in skin, lymph nodes, and blood, and express constitutively activated signal transducer and activator of transcription (STAT)3. STAT3 can be activated by IL-21 in vitro and the IL-21 gene itself is a STAT3 target gene, thereby creating an autocrine positive feedback loop that might serve as a therapeutic target. Sézary cells underwent apoptosis when incubated with Stattic, a selective STAT3 inhibitor. STAT3 activation in Sézary cells did not affect expression of the supposed anti-apoptotic STAT3 target genes BCL2, BCL-xL, and SURVIVIN, whereas expression of (proto)oncogenes miR-21, TWIST1, MYC, and PIM1 was significantly increased. CD3/CD28-mediated activation of Sézary cells induced IL-21 expression, accompanied by STAT3 activation and increased proliferation. Blocking IL-21 in CD3/CD28-activated cells had no effects, whereas Stattic abrogated IL-21 expression and cell proliferation. Thus, specific inhibition of STAT3 is highly efficient in the induction of apoptosis of Sézary cells, likely mediated via the regulation of (proto)oncogenes. In contrast, blocking IL-21 alone seems insufficient to affect STAT3 activation, cell proliferation, or apoptosis. These data provide further insights into the pathogenic role of STAT3 in Sézary syndrome and strengthen the notion that STAT3 represents a promising therapeutic target in this disease

Large expert-curated database for benchmarking document similarity detection in biomedical literature search

Document recommendation systems for locating relevant literature have mostly relied on methods developed a decade ago. This is largely due to the lack of a large offline gold-standard benchmark of relevant documents that cover a variety of research fields such that newly developed literature search techniques can be compared, improved and translated into practice. To overcome this bottleneck, we have established the RElevant LIterature SearcH consortium consisting of more than 1500 scientists from 84 countries, who have collectively annotated the relevance of over 180 000 PubMed-listed articles with regard to their respective seed (input) article/s. The majority of annotations were contributed by highly experienced, original authors of the seed articles. The collected data cover 76% of all unique PubMed Medical Subject Headings descriptors. No systematic biases were observed across different experience levels, research fields or time spent on annotations. More importantly, annotations of the same document pairs contributed by different scientists were highly concordant. We further show that the three representative baseline methods used to generate recommended articles for evaluation (Okapi Best Matching 25, Term Frequency–Inverse Document Frequency and PubMed Related Articles) had similar overall performances. Additionally, we found that these methods each tend to produce distinct collections of recommended articles, suggesting that a hybrid method may be required to completely capture all relevant articles. The established database server located at https://relishdb.ict.griffith.edu.au is freely available for the downloading of annotation data and the blind testing of new methods. We expect that this benchmark will be useful for stimulating the development of new powerful techniques for title and title/abstract-based search engines for relevant articles in biomedical research

Large expert-curated database for benchmarking document similarity detection in biomedical literature search

Document recommendation systems for locating relevant literature have mostly relied on methods developed a decade ago. This is largely due to the lack of a large offline gold-standard benchmark of relevant documents that cover a variety of research fields such that newly developed literature search techniques can be compared, improved and translated into practice. To overcome this bottleneck, we have established the RElevant LIterature SearcH consortium consisting of more than 1500 scientists from 84 countries, who have collectively annotated the relevance of over 180 000 PubMed-listed articles with regard to their respective seed (input) article/s. The majority of annotations were contributed by highly experienced, original authors of the seed articles. The collected data cover 76% of all unique PubMed Medical Subject Headings descriptors. No systematic biases were observed across different experience levels, research fields or time spent on annotations. More importantly, annotations of the same document pairs contributed by different scientists were highly concordant. We further show that the three representative baseline methods used to generate recommended articles for evaluation (Okapi Best Matching 25, Term Frequency-Inverse Document Frequency and PubMed Related Articles) had similar overall performances. Additionally, we found that these methods each tend to produce distinct collections of recommended articles, suggesting that a hybrid method may be required to completely capture all relevant articles. The established database server located at https://relishdb.ict.griffith.edu.au is freely available for the downloading of annotation data and the blind testing of new methods. We expect that this benchmark will be useful for stimulating the development of new powerful techniques for title and title/abstract-based search engines for relevant articles in biomedical research.Peer reviewe

Analyse des conditions de propagation à 20 et 30 GHZ en Europe

Sur un trajet Terre-Satellite à 20 et 30 GHz, l'absorption et la diffusion des ondes par les hydrométéores (pluie, grêle, neige, cristaux de glace, brouillards ...) provoquent des baisses de niveau du signal reçu (affaiblissements), des rotations du plan de polarisation des ondes (dépolarisation), des scintillations de phase et d'amplitude. Ces phénomènes contribuent à la dégradation de la qualité des liaisons. Pour les liaisons où une seule polarisation est utilisée, seule la pluie (exceptionnellement la neige) peut provoquer des affaiblissements qui affectent la disponibilité de la liaison. Dans le cas de systèmes fonctionnant en réutilisation de fréquence sur deux polarisations croisées, la connaissance du découplage de polarisation est essentielle. La réception en diversité d'emplacement permet d'améliorer la qualité des liaisons pendant les périodes où la propagation est perturbée. Les objectifs de cette étude sont donc d'établir des caractéristiques prévisibles de propagation (affaiblissement par la pluie, découplage de polarisation, gain apporté par la réception en diversité d'emplacement) dans les bandes de fréquence de 20 et 30 GHz pour des liaisons Terre - Satellite entre un satellite géostationnaire et un point quelconque en Europe. Ces caractéristiques seront établies à la fois à partir des données disponibles, des méthodes de prévision et des lois de transposition en fréquence généralement admises. Les données nécessaires à cette étude sont d'une part les données de pluviométrie qui décrivent le phénomène perturbateur et d'autre part les données de propagation qui décrivent les perturbations, c'est-à-dire les affaiblissements et les découplages de polarisation

Propagation radioélectrique à 900 MHz en milieu urbain : modélisation à fréquence fixe et résultats expérimentaux

L'objet de cette note est de présenter les premiers résultats de propagation à 900 MHz en mileu urbain issus d'une campagne de mesures en région parisienne menée par le CNET en collaboration avec la DTRE. Dans une première partie, une analyse de la propagation radioélectrique à fréquence fixe est proposée, introduisant et justifiant les divers traitements effectués sur les mesures, lesquels seront exposés dans la seconde partie de la note. Dans l'ensemble, il se dégage des résultats suffisamment significatifs et conformes à ceux publiés ailleurs, même lorsque, s'agissant des phénomènes de petite échelle, les conditions expérimentales n'étaient pas vraiment adaptées au type de résultat recherché. Nous remercions le département PAB/ETR/CEM d'avoir bien voulu mettre à notre disposition les données collectées lors de la campagne de mesures CNET-DTRE

Le piège de l'employabilité: Critique d’une notion au regard de ses usages sociaux

International audienc

Des leviers pour économiser l’eau dans les vignobles

International audienceL’eau est une ressource indispensable à la production agricole. La viticulture ne fait pas exception. De plus, elle particulièrement menacée par les épisodes de sécheresse qui s’annoncent de plus en plus fréquents et intenses. En effet, les vignobles ont souvent été installés dans des situations où l’eau devient déficitaire en fin de cycle afin de permettre l’expression de forts potentiels qualitatifs. La vigne consomme alors peu d’eau, grâce à la fermeture des pores stomatiques situés à la surface des feuilles et qui contrôlent la perte d’eau par les plantes. Mais cet équilibre est fragile car le contenu résiduel en eau dans le sol est alors très limité.En même temps, la demande évaporative atmosphérique est très élevée. Dans ce contexte, il est nécessaire d’explorer toutes les solutions qui permettent d’économiser l’eau sans altérer le rendement ni sa qualité. Cet objectif a fait l’objet de plusieurs travaux récents conduits à Montpellier. À court terme, la conduite du couvert est un levier puissant pour diminuer les pertes en eau lorsqu’une trop grande partie des feuilles se retrouve à l’ombre au sein même du feuillage. Par ailleurs, des dispositifs d’ombrage artificiel placés au-dessus du couvert sont à l’étude.Comme attendu, de fortes économies d’eau sont possibles, mais il reste à optimiser ces ombrages pour qu’ils n’altèrent pas la production. À plus long terme, des variétés économes ont été identifiées. Des études génétiques sur des populations étendues ont permis également de repérer les zones du génome associées à cette économie d’eau, ouvrant la voie à la sélection ou la création de variétés adaptées. Toutes ces économies d’eau méritent d’être envisagées, que ce soit pour réduire la compétition avec d’autres usages de l’eau ou pour limiter les risques de dégradation de la production