A novel segmentation approach for crop modeling using a plenoptic light-field camera : going from 2D to 3D

OMICASCrop phenotyping is a desirable task in crop characterization since it allows the farmer to make early decisions, and therefore be more productive. This research is motivated by the generation of tools for rice crop phenotyping within the OMICAS research ecosystem framework. It proposes implementing the image process- ing technologies and artificial intelligence technics through a multisensory approach with multispectral information. Three main stages are covered: (i) A segmentation approach that allows identifying the biological material associated with plants, and the main contri- bution is the GFKuts segmentation approach; (ii) a strategy that allows the development of sensory fusion between three different cameras, a 3D camera, an infrared multispectral camera, and a thermal multispectral camera, this stage is developed through a complex object detection approach; and (iii) the characterization of a 4D model that generates topological relationships with the information of the point cloud, the main contribution of this strategy is the improvement of the point cloud captured by the 3D sensor, in this sense, this stage improves the acquisition of any 3D sensor. This research presents a development that receives information from multiple sensors, especially infrared 2D, and generates a single 4D model in geometric space [X, Y, Z]. This model integrates the color information of 5 channels and topological information, relating the points in space. Overall, the research allows the integration of the 3D information from any sensor\technology and the multispectral channels from any multispectral camera, to generate direct non-invasive measurements on the plant.Magíster en Ingeniería ElectrónicaMagíster en Inteligencia ArtificialMaestríahttps://orcid.org/ 0000-0002-1477-6825https://scholar.google.com/citations?user=cpuxcwgAAAAJ&hl=eshttps://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=000155691

Prevalence of epilepsy in childhood

El estudio se realiza en los distritos limeños del Rímac, San Martín de Porres y en Bellavista-Callao de Agosto a diciembre de 1992. Se entrevistó a 2,016 escolares de 9 a 12 años sobre la presencia de crisis convulsivas generalizadas o parciales y los datos fueron procesados según modelo del National Institute of Health (USA). Se entrevistaron a 1214 varones y 802 mujeres. En Bellavista se encontró una prevalencia de 13.9/1000. En el Rímac encontramos una prevalencia de 13.4/1000 y en San Martín de Porres el resultado fue de 8.5/1000; lo que da como prevalencia global de 11.9/1000 niños con epilepsia.The study to fulfil in the district of Rímac and San Martín de Porres in Lima and of Bellavista in Callao between August and December of 1992 year. Our interviewed to 2,016 students between 9 to 12years old on the Presence of generalized o partialis seizures and the information were worked according to model of National Institute of Health (USA). Our interviewed to 1,214 males and 802females. In Bellavista to find a Prevalence of13.9/1000. In the Rímac our finded a Prevalence of 13.4/1000 and in San Martín de Porres to finded were 8.5/1000; these result a global Prevalence of11.9/1000 children with epilepsy

Guidelines for elaboration of research protocols

La Investigación en el área de la Ciencias de la Salud ha sido siempre un problema tabú, debido a su complejidad y al desconocimiento de sus métodos, lo cual Produce gran dificultad en su realización. Este articulo pretende brindar una orientación general en los Puntos básicos de la Investigación tales como la elección del Problema, el título, el marco teórico, la recolección y análisis de datos, resultados, discusión y publicación. Esperamos así incrementar la accesibilidad al tema, contribuyendo así a un mayor desarrollo académico en la investigación entre los médicos y otros Profesionales de la Salud.Investigation in the area of health sciences has been always a hidden Problem, due to its complexity and the disgregard of its methods, which Produces big difficulty in the achievement. This article Pretends to offer a general guide in the basic points of Investigation, such as the choice of problems, title, theoretic knowlegdes, Compilation and Data analysis, results, discussion and Publication. So, we hope to increase accessibility to this matler, supporting a major academic development in the investigation between doctors and health Professionals

HLA alleles in the Peruvian population

La distribución de los alelos HLA – A -B -C DRB1 y DQB1 en la población peruana fue estudiada y comparada con aquellos alelos de otras poblaciones para proporcionar información extensa acerca del origen antropológico en ese respecto nuestra edad es consciente con el carácter mestizo de esta población

Evaluation of abruptio placentae in high altitude

De 4,467 partos ocurridos en el lapso de 15 años en el Hospital II IPSS de la Oroya (3750 mts. sobre el nivel del mar), fueron seleccionados para el presente estudio, 75 casos con diagnóstico de desprendimiento prematuro de placenta normo inserta, con una incidencia de 1.68%. En esta patología la incidencia se elevó 3.3 veces en gestantes mayores de 35 años, 2 veces cuando tenían más de 4 hijos y 4.3 veces cuando el feto se encontraba en Presentación transversa. Sangrado oculto o exterior leve con gran desprendimiento placentario fue hallado en 45.33% de los casos. En 82.7% de los casos se Practicó cesárea de emergencia, y de ellas, en 70.97 % se utilizó anestesia general. La incidencia de neonatos con apgar menor de 4 por DPP llegó al 18.02% (63.64% de los casos) 14.40% de los recién nacidos de bajo peso en estos 15 años, corresponden a DPP, así como 12.50% de los neonatos con menos de 35 semanas; siendo DPP la Principal causa de muerte neonatal temprana intrahospitalaria. En 50.67% del total de casos de DPP, los valores de hemoglobina materna fueron menores de 10 gr% 10 que corresponde a anemia aguda severa y hasta pre shock en nuestro medio. El comportamiento de la DPP en altura es más aparatoso que a nivel del mar. Su incidencia y morbimortalidad es superior a la reportada por la literatura y su etiología se debería a que la hipoxia condiciona fragilidad capilar a nivel velloso, y al mayor volumen y viscosidad sanguínea que aumenta la resistencia vascular del lecho Placentario. También influyen Patrones culturales aún no desterrados que preconizan la versión externa Para "acomodar" una mala presentación fetal.75 cases were selectionated for the present study, from 4,467 childbirths, occurred during 15 years in the IPSS Hospital of La Oroya (level Il), to 3750 m.o.s. (meters over sea). Those cases blid have the Diagnosis of Placentae Premature Sanslide (PPL) with Normal Insertion, with incidence of 1.68%. The incidence in this pathology, was elevated 3.3 times in Pregnant over 35 years, twice when they had 4 sons and 4.3 times when the fetus was in transversal position. Either hidden or mild exterior bleeding with large placentae Emergency Cesarean. From those, 70.97% in was 18.02% (63.6% of the cases) 14.40 % of Newborns with Low Weight in 15 years, correspond to PPL, 12.5% of newborns younger than 35 weeks also; PPL is the more cause of Intrahospitalary early newborns death. Values of hemoglobin Maternal were lesser than 10 gr.% in 50.7% of cases, which correspond to severe acute Anemia, and shock in own hospital. Behaviour attitude of PPL in High altitude is more exaggerated than sea level. It's incidence and mortality is greater than the reported by literature; and it's ethiology should be hypoxia

Caregivers' perceptions and practices about child feeding and physical activity

ilustracionesLa alimentación y la actividad física infantil son comportamientos definidos por los cuidadores de los niños ; quienes están condicionados por su contexto particular. Objetivo: describir las percepciones y prácticas de cuidadores de niños de 5 a 9 años en Tunja, en cuanto a la alimentación y la actividad física infantil. Metodología: investigación de tipo cualitativo, descriptivo, de análisis de contenido categorial según Bardin. Se aplicó entrevista semiestructurada a través de videollamada a 10 cuidadoras. Resultados: emergió la categoría central: actuar conforme a lo que se debería hacer, lo que se cree y/o lo que se puede. Donde las prácticas que realizan las cuidadoras referentes a la alimentación y la actividad física infantil se encuentran condicionadas a las percepciones que tienen, las que a su vez se manifiestan en ellas como creencias, barreras o facilitadores para la acción. Conclusiones: los principales condicionantes para las prácticas de las cuidadoras fueron las preferencias de los niños, el tiempo y dinero disponibles. Estos, de acuerdo con su ausencia o presencia, pueden manifestarse en ellas como barrera o facilitador para la acción. Sin embargo, no siempre resultan en adecuadas prácticas, dependiendo del equilibrio que haya entre barreras, facilitadores y creencias. Por ejemplo, la disponibilidad de dinero no garantiza adecuadas prácticas alimentarias en los niños por parte de sus cuidadores. Lo anterior evidencia la necesidad de fortalecer el sistema de salud del país desde la promoción de la salud, basándose en la realidad de los contextos vividos por los responsables del cuidado, particularmente el de los niños. (Texto tomado de la fuente)Child nutrition and physical activity are behaviors defined by the child's caregivers; who are conditioned to their particular context. Objective: to describe the perceptions and practices of caregivers of children from 5 to 9 years old in Tunja, in terms of child feeding and physical activity. Methodology: qualitative, descriptive research, categorical content analysis according to Bardin. A semi-structured interview was applied via video call to 10 caregivers. Results: the central category emerged: “Act according to what should be done, what is believed and/or what can be done”. Where the practices carried out by caregivers regarding child nutrition and physical activity are conditioned by the perceptions they have, and which are manifested in them as beliefs, barriers or facilitators for action. Conclusions: the main determining factors for the caregivers' practices were the preferences of the children, the time and money available. These, according to their absence or presence, can manifest in them as a barrier or facilitator for action. However, it does not always result in good practices, depending on the balance between barriers, facilitators and beliefs. For example, the availability of money does not guarantee adequate feeding practices in children by their caregivers. The foregoing shows the need to strengthen the country's health system from health promotion, based on the reality of the contexts experienced by those responsible for care, particularly that of children.MaestríaMagíster en EnfermeríaInvestigación de tipo cualitativo, descriptivo aplicando el análisis de contenido categorial según Bardin. Se realizaron entrevistas semiestructuradas a 10 cuidadoras de la ciudad de Tunja, a través de videollamada

Creation of a cell survival curve protocol for irradiated SiHa cells using a clinical linear accelerator

ilustraciones, fotografías, gráficasA finales del siglo XIX, poco después de la invención de los rayos X, se descubrió que la radiación ionizante podía ser utilizada como tratamiento oncológico. Durante el siguiente siglo se realizaron una serie de experimentos in vivo e in vitro, que buscaban explicar las propiedades de la interacción radiación-célula, creando el campo de la radiobiología. A partir de estas investigaciones se desarrolló el modelo lineal-cuadrático, que sirve para cuantificar el daño letal y sub-letal de la radiación en la célula, comparando la dosis recibida con la fracción de supervivencia celular. Esto se conoce como una curva de supervivencia celular y es muy útil para comparar distintas características de un tratamiento en radioterapia (como fraccionamiento, calidad de la radiación, entre otras). En este trabajo final de maestría se busca crear un protocolo de construcción de curvas de supervivencia celular utilizando haces de radiación de 6 MeV con un acelerador lineal para facilitar la realización de experimentos radiobiólogicos en el futuro. (Texto tomado de la fuente).At the end of the XIX century, right after the invention of xrays, it was discovered that ionizing radiation could be used as oncological treatment. During the following century a lot of advancements were made trying to understand that connection, in particular a lot of in vivo and in vitro experiments were made improving our understanding of the interaction of radiation and the cell, creating the field of Radiobiology. Using that research as a starting point the Lineal quadratic model was created, to attempt to quantify the lethal and sublethal damage produce to the cell by quantifying the cellular death with the dose prescribed. This is what is know as Cell Survival curve and it is very useful to define the reaction of tissue and cells after being expose to radiation. This study aims to develop a guide to create cell survival curves using what is known as an MTT assay for determining the impact of the radiation in the cell.MaestríaMagíster en Física Médic

Characterization of glial tumors cases of central nervous system in a high complexity referral hospital in Tunja, Boyacá - Colombia

ilustraciones, graficasObjetivo: Describir las características de los tumores gliales de la población del Hospital de San Rafael de Tunja entre 2017 y 2021. Metodología: Estudio observacional, unicéntrico y retrospectivo de 51 casos del periodo 2017 - 2021, las variables demográficas, clínicas, imagenológicas, funcionales y de supervivencia fueron analizadas. Se empleó RStudio v2022.07.2 para análisis estadístico. Resultados: Hay menor sobrevida en pacientes con glioma grado IV (sobrevida media 505.18 dias SD +/-169.3) comparado con gliomas de menor grado (grado III sobrevida media 1862.3 SD +/- 668.7) (Log Rank <0.0001). No hay diferencias entre el tipo de cirugía, quimioterapia, radioterapia, lateralidad, invasión cuerpo calloso, mRankin de ingreso entre los diferentes grados tumorales (Kruskal Wallis p > 0.05) El tratamiento oncológico está asociado a mayor sobrevida independientemente del subtipo histológico (Kaplan Meier Log Rank 0.023) y mayor duración con puntaje mRankin menor o igual a 2 (Log Rank 0.0023). Hay menor sobrevida para el escenario Glioblastoma IDH no mutado (p 0.012 Log Rank). A menor valor ADC, mayor puntaje en el mRankin de ingreso (Tau Score -0.249 p 0.029, Spearman Rho -0.324 p 0.028) y a mayor valor ADC, mayor sobrevida (Tau Score 0.199 p 0.046, Spearman Rho 0.310 P 0.032). Conclusiones: Uno de los primeros estudios en Colombia que documenta que la presencia de la mutación del gen IDH, mayor valor ADC y el tratamiento oncológico (independiente del tipo) están asociados a una mayor sobrevida y funcionalidad (Texto tomado de la fuente)Objective: To describe the characteristics of glial tumors in the population of Hospital de San Rafael de Tunja between 2017 and 2021. Methodology: Observational, single-center and retrospective study of 51 cases from the period 2017 - 2021, demographic, clinical, imaging and functional survival variables were analyzed. RStudio v2022.07.2 was used for statistical analysis. Results: There is lower survival in patients with grade IV glioma (mean survival 505.18 days SD +/-169.3) compared with lower grade gliomas (grade III mean survival 1862.3 SD +/- 668.7) (Log Rank 0.05) Oncology treatment is associated with greater survival regardless of the histological subtype (Kaplan Meier Log Rank 0.023) and longer duration with mRankin score less than or equal to 2 (Log Rank 0.0023). There is lower survival for the non-mutated IDH glioblastoma scenario (p 0.012 Log Rank). Lower ADC values are correlated with higher admission mRankin score (Tau Score -0.249 p 0.029, Spearman Rho -0.324 p 0.028) and higher ADC values, with greater survival rates (Tau Score 0.199 p 0.046, Spearman Rho 0.310 P 0.032). Conclusions: One of the first studies in Colombia to document that the presence of the IDH mutation, a higher ADC value, and cancer treatment (regardless of the type) are associated with higher survival and functionality outcomes.Especialidades MédicasEspecialista en NeurocirugíaTIPO DE ESTUDIO Descriptivo tipo retrospectivo POBLACIÓN OBJETIVO Población con patología oncológica glial del sistema nervioso central. Se incluirán todos los pacientes que cuenten con diagnóstico histopatológico y/o dentro del criterio CIE-10 de tumor glial manejado en el hospital San Rafael de Tunja en el periodo de 2017 a 2021 cuyos datos estén almacenados en los archivos de la institución. CRITERIOS INCLUSIÓN Paciente con tumor glial de SNC tratado en el Hospital San Rafael de Tunja Que haya recibido diagnóstico y/o tratamiento quirúrgico definitivo para su respectiva patología en el Hospital San Rafael de Tunja. CRITERIOS EXCLUSIÓN - Pacientes que no cuenten con confirmación histopatológica (o radiológica cuando la confirmación histopatología no es pertinente o factible ej. tumores difusos de línea media del tallo) en el Hospital San Rafael de Tunja. Pacientes de los que no se disponga de la totalidad de la Historia Clínica. RECOLECCIÓN DE DATOS La recolección de datos clínico patológicos se obtuvieron a partir del censo quirúrgico del servicio de Neurocirugía del Hospital San Rafael de Tunja, así como el filtro CIE-10 para tumores de sistema nervioso central clasificación WHO dentro del repositorio de patología del Hospital San Rafael de Tunja y de las historias clínicas determinadas en archivo físico y en el software de soporte que actualmente opera en la institución. La obtención de las variables imagenológicas se obtuvieron a partir de las imágenes almacenadas en el servicio principal de radiología de dicha institución. Para el cálculo de los valores del mapa ADC de las lesiones se estableció el punto con el valor más bajo así como el promedio empleando el corte de la circunferencia del mayor diámetro de la lesión en el T1 con gadolinio y que no incluyese áreas de hemorragia o necrosis vista en T2 eco gradiente/SWI. Se contó con aval del comité de ética del Hospital San Rafael de Tunja para la obtención, interpretación y publicación de los datos del presente estudio. ANÁLISIS ESTADÍSTICO Se realizó un estudio descriptivo correlacional y se realizó un análisis de supervivencia utilizando el software libre RStudio versión 2022.07.2 576. La clasificación las variables mencionadas en la tabla fueron de tipo cualitativo o cuantitativo y si eran de carácter nominal u ordinal en el primer escenario y el caso de las cuantitativas éstas últimas a su vez se definieron si tenían distribución normal con la prueba de Shapiro Wilky y su el grado de homogeneidad con las pruebas de Bartlett, Fligner y Levene. Para la comparación de grupos independientes cuyas variables fueron de tipo cualitativo nominal y ordinal se empleó la prueba de Chi cuadrado, en el caso de que los grupos en la contaran con variables de distribución normal se realizó ANOVA de una vía y cuanto eran de distribución no normal se realizó la prueba de Kruskal Wallis. Para la correlación de variables tipo ADC se emplearon los coeficientes de Spearman o Kendall Tau. Para las variables con significancia estadística (tipo de tumor y terapia oncológica) se estimó supervivencia mediante análisis de Kaplan Meier. Se determinó como significancia estadística un valor p menor a 0.05

Revealing Urban Space, Corporate Identity, and Formal Relationships in the Platform, Block, and Tower Typology through Six Iconic Buildings by German Samper in Bogotá, Medellín, and Cali

ilustracionesEste trabajo final de maestría se enfoca en explorar el desarrollo que el arquitecto Germán Samper llevó a cabo en los edificios que se clasifican tipológicamente como plataforma y torre con uso corporativo. Al analizar en profundidad estos proyectos, se descubre una variedad de respuestas arquitectónicas que desafían la imagen canónica normalmente asociada con esta tipología. (Texto tomado de la fuente) El estudio se inicia con la comprensión separada de las partes fundamentales de la estructura formal tipológica; la plataforma en relación con la ciudad, el bloque y la torre con la imagen corporativa y las categorías formales entre las mismas. Mediante este enfoque analítico, se busca comprender el papel individual que desempeña cada componente. A partir de esa comprensión, se exploran las variaciones propuestas por Samper en sus diseños. El objetivo principal es examinar cómo y por qué se plantean estas variaciones y cómo afectan la función y la forma de los edificios en las ciudades de Bogotá, Medellín y Cali. Al estudiar las distintas respuestas arquitectónicas propuestas por Samper, se busca desentrañar los principios y las intenciones detrás de sus decisiones de diseño. La comprensión de las partes de la plataforma, el bloque y la torre, de manera independiente y luego el análisis de su interacción, proporcionan una visión más completa de la complejidad y riqueza de esta tipología arquitectónica. Además, se identifica las ideas innovadoras de Samper y su contribución a la evolución de la arquitectura moderna con la ciudad. En última instancia, esta investigación busca enriquecer el conocimiento sobre esta tipología arquitectónica y ampliar la comprensión de las posibilidades y variaciones que existen dentro de ella. A través del análisis de los proyectos de Samper, se extrae lecciones y conocimientos aplicables a futuros diseños en edificios corporativos, fomentando así el desarrollo de soluciones arquitectónicas y contextualmente articuladas con la ciudad. Palabras clave: (Tipología, arquitectura, torre, bloque, plataforma)This master's thesis focuses on exploring the development carried out by the architect Germán Samper in buildings typologically classified as platform and corporate tower. By conducting an in-depth analysis of these projects, a variety of architectural responses that challenge the canonical image normally associated with this typology are uncovered. The study begins with the separate understanding of the fundamental parts of the typological formal structure: the platform in relation to the city, the block, and the tower with corporate identity and the formal categories among them. Through this analytical approach, the aim is to comprehend the individual role played by each component. Based on this understanding, the variations proposed by Samper in his designs are explored. The main objective is to examine how and why these variations are proposed and how they affect the function and form of buildings in the cities of Bogotá, Medellín, and Cali. By studying the different architectural responses proposed by Samper, the intention is to unravel the principles and intentions behind his design decisions. Understanding the components of the platform, block, and tower, both independently and then analyzing their interaction, provides a more comprehensive view of the complexity and richness of this architectural typology. Furthermore, Samper's innovative ideas and his contribution to the evolution of modern architecture within the city are identified. Ultimately, this research seeks to enrich the understanding of this architectural typology and expand the knowledge of the possibilities and variations that exist within it. Through the analysis of Samper's projects, valuable lessons and knowledge applicable to future designs in corporate buildings are extracted, thus promoting the development of architecturally and contextually articulated solutions within the cityMaestríaMagíster en ArquitecturaArquitectura y proyect

Bovine leukemia virus in Antioquia dairies: molecular prevalence, circulating genotypes and factors associated with its circulation.

ilustraciones, diagramasEl virus de la leucosis bovina (BLV) es un retrovirus que afecta los sistemas de producción de lechería especializada en todo el mundo, relacionado con menor producción de leche y reducción en la vida de los animales infectados. Se han identificado once genotipos del virus circulando y actualmente no existe tratamiento ni vacuna para la enfermedad por lo que las estrategias de control son esenciales. En Colombia la lechería contribuye a la economía y sustento alimentario del país, Antioquia es departamento mayor productor. Para establecer el estado actual del BLV en los sistemas productivos de Antioquia se seleccionaron 575 bovinos pertenecientes a 53 hatos de las regiones Norte, Oriente y Valle de Aburrá, de diferentes razas y edades. Se hizo la caracterización de los sistemas productivos, se estudió la prevalencia molecular mediante una PCR anidada del gen env de BLV, resultando un 17,04% en animales y 75,5% en hatos y por un estudio filogenético del gen tax estableciendo la presencia únicamente del genotipo 1. Además, se determinaron factores de riesgo y de protección asociados a la infección, encontrando que prácticas como el ordeño mecánico y la inseminación artificial (con semen sin conocer estatus microbiológico) suponen un riesgo de infección con BLV y como factores de protección se encontraron de desinfectantes alcoholes y agentes alquilantes y la implementación de sistemas de pediluvio. Los resultados encontrados en este estudio muestran la necesidad de plantear un programa de prevención y educación para controlar la infección por BLV y minimizar las pérdidas económicas que supone la infección. (Texto tomado de la fuente)Gobernación de AntioquiaCOLANTAMaestríaMagíster en Ciencias - BiotecnologíaDiseño experimental y muestraBiotecnología animalÁrea Curricular Biotecnologí