9 research outputs found
Sympathetic nervous activation, mitochondrial dysfunction and outcome in acutely decompensated cirrhosis: the metabolomic prognostic models (CLIF-C MET)
- Author
- Aguilar Ferran
- Albillos Agustín
- Alessandria Carlo
- Angeli Paolo
- Arroyo Vicente
- Bañares Rafael
- Berg Thomas
- Bernardi Mauro
- Bruns Tony
- Caraceni Paolo
- Castelli Florence A
- Claria Joan
- de la Peña-Ramirez Carlos
- Diaz Juan Manuel
- Domenicali Marco
- Fenaille François
- Fernández Javier
- Gambino Carmine Gabriele
- Genesca Joan
- Gerbes Alexander L
- Giovo Ilaria
- Gu Wenyi
- Gustot Thierry
- Jalan Rajiv
- Jansen Christian
- Jiménez Cesar
- Junot Christophe
- Laleman Wim
- Lozano Juan-Jose
- Martin Pedro Izquierdo-Bueno
- Merli Manuela
- Mookerjee Raj
- Moreau Richard
- Papp Maria
- Piano Salvatore
- Presa José
- Putignano Antonella
- Saliba Faouzi
- Sierra Patricia
- Sánchez-Garrido Cristina
- Trautwein Christian
- Trebicka Jonel
- Uschner Frank Erhard
- Vargas Victor
- Weiss Emmanuel
- Wendon Julia A
- Zaccherini Giacomo
- Zeuzem Stefan
- Zipprich Alexander
- Publication venue
- Publication date
- 01/01/2023
- Field of study
Background and aims Current prognostic scores of patients with acutely decompensated cirrhosis (AD), particularly those with acute-on-chronic liver failure (ACLF), underestimate the risk of mortality. This is probably because systemic inflammation (SI), the major driver of AD/ACLF, is not reflected in the scores. SI induces metabolic changes, which impair delivery of the necessary energy for the immune reaction. This investigation aimed to identify metabolites associated with short-term (28-day) death and to design metabolomic prognostic models. Methods Two prospective multicentre large cohorts from Europe for investigating ACLF and development of ACLF, CANONIC (discovery, n=831) and PREDICT (validation, n=851), were explored by untargeted serum metabolomics to identify and validate metabolites which could allow improved prognostic modelling. Results Three prognostic metabolites strongly associated with death were selected to build the models. 4-Hydroxy-3-methoxyphenylglycol sulfate is a norepinephrine derivative, which may be derived from the brainstem response to SI. Additionally, galacturonic acid and hexanoylcarnitine are associated with mitochondrial dysfunction. Model 1 included only these three prognostic metabolites and age. Model 2 was built around 4-hydroxy-3-methoxyphenylglycol sulfate, hexanoylcarnitine, bilirubin, international normalised ratio (INR) and age. In the discovery cohort, both models were more accurate in predicting death within 7, 14 and 28 days after admission compared with MELDNa score (C-index: 0.9267, 0.9002 and 0.8424, and 0.9369, 0.9206 and 0.8529, with model 1 and model 2, respectively). Similar results were found in the validation cohort (C-index: 0.940, 0.834 and 0.791, and 0.947, 0.857 and 0.810, with model 1 and model 2, respectively). Also, in ACLF, model 1 and model 2 outperformed MELDNa 7, 14 and 28 days after admission for prediction of mortality. Conclusions Models including metabolites (CLIF-C MET) reflecting SI, mitochondrial dysfunction and sympathetic system activation are better predictors of short-term mortality than scores based only on organ dysfunction (eg, MELDNa), especially in patients with ACLF
Sympathetic nervous activation, mitochondrial dysfunction and outcome in acutely decompensated cirrhosis: the metabolomic prognostic models (CLIF-C MET)
- Author
- Aguilar Ferran
- Albillos Agustin
- Alessandria Carlo
- Angeli Paolo
- Arroyo Vicente
- Banares Rafael
- Berg Thomas
- Bernardi Mauro
- Bruns Tony
- Caraceni Paolo
- Castelli Florence A
- Claria Joan
- de la Pena-Ramirez Carlos
- Diaz Juan Manuel
- Domenicali Marco
- Fenaille Francois
- Fernandez Javier
- Gambino Carmine Gabriele
- Genesca Joan
- Gerbes Alexander L
- Giovo Ilaria
- Gu Wenyi
- Gustot Thierry
- Jalan Rajiv
- Jansen Christian
- Jimenez Cesar
- Junot Christophe
- Laleman Wim
- Lozano Juan-Jose
- Martin Pedro Izquierdo-Bueno
- Merli Manuela
- Mookerjee Raj
- Moreau Richard
- Papp Maria
- Piano Salvatore
- Presa Jose
- Putignano Antonella
- Saliba Faouzi
- Sanchez-Garrido Cristina
- Sierra Patricia
- Trautwein Christian
- Trebicka Jonel
- Uschner Frank Erhard
- Vargas Victor
- Weiss Emmanuel
- Wendon Julia A
- Zaccherini Giacomo
- Zeuzem Stefan
- Zipprich Alexander
- Publication venue
- BMJ PUBLISHING GROUP
- Publication date
- 14/02/2023
- Field of study
Background and aims: Current prognostic scores of patients with acutely decompensated cirrhosis (AD), particularly those with acute-on-chronic liver failure (ACLF), underestimate the risk of mortality. This is probably because systemic inflammation (SI), the major driver of AD/ACLF, is not reflected in the scores. SI induces metabolic changes, which impair delivery of the necessary energy for the immune reaction. This investigation aimed to identify metabolites associated with short-term (28-day) death and to design metabolomic prognostic models. Methods: Two prospective multicentre large cohorts from Europe for investigating ACLF and development of ACLF, CANONIC (discovery, n=831) and PREDICT (validation, n=851), were explored by untargeted serum metabolomics to identify and validate metabolites which could allow improved prognostic modelling. Results: Three prognostic metabolites strongly associated with death were selected to build the models. 4-Hydroxy-3-methoxyphenylglycol sulfate is a norepinephrine derivative, which may be derived from the brainstem response to SI. Additionally, galacturonic acid and hexanoylcarnitine are associated with mitochondrial dysfunction. Model 1 included only these three prognostic metabolites and age. Model 2 was built around 4-hydroxy-3-methoxyphenylglycol sulfate, hexanoylcarnitine, bilirubin, international normalised ratio (INR) and age. In the discovery cohort, both models were more accurate in predicting death within 7, 14 and 28 days after admission compared with MELDNa score (C-index: 0.9267, 0.9002 and 0.8424, and 0.9369, 0.9206 and 0.8529, with model 1 and model 2, respectively). Similar results were found in the validation cohort (C-index: 0.940, 0.834 and 0.791, and 0.947, 0.857 and 0.810, with model 1 and model 2, respectively). Also, in ACLF, model 1 and model 2 outperformed MELDNa 7, 14 and 28 days after admission for prediction of mortality. Conclusions: Models including metabolites (CLIF-C MET) reflecting SI, mitochondrial dysfunction and sympathetic system activation are better predictors of short-term mortality than scores based only on organ dysfunction (eg, MELDNa), especially in patients with ACLF
Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition)
- Author
- A. -G. Wu
- A. C. Ma
- A. K. Au
- Abdel-Aziz A. K.
- Abdelfatah S.
- Abdellatif M.
- Abdoli A.
- Abel S.
- Abeliovich H.
- Abildgaard M. H.
- Abudu Y. P.
- Acevedo-Arozena A.
- Adamopoulos I. E.
- Adeli K.
- Adolph T. E.
- Adornetto A.
- Aflaki E.
- Agam G.
- Agarwal A.
- Aggarwal B. B.
- Agnello M.
- Agostinis P.
- Agrewala J. N.
- Agrotis A.
- Aguilar P. V.
- Ahmad S. T.
- Ahmed Z. M.
- Ahumada-Castro U.
- Aits S.
- Aizawa S.
- Akkoc Y.
- Akoumianaki T.
- Akpinar H. A.
- Al-Abd A. M.
- Al-Akra L.
- Al-Gharaibeh A.
- Alaoui-Jamali M. A.
- Alberti S.
- Alcocer-Gomez E.
- Alessandri C.
- Ali M.
- Alim Al-Bari M. A.
- Aliwaini S.
- Alizadeh J.
- Almacellas E.
- Almasan A.
- Alonso A.
- Alonso G. D.
- Altan-Bonnet N.
- Altieri D. C.
- Alvarez E. M. C.
- Alves da Costa C.
- Alves S.
- Alzaharna M. M.
- Amadio M.
- Amantini C.
- Amaral C.
- Ambrosio S.
- Amer A. O.
- Ammanathan V.
- An Z.
- Andersen S. U.
- Andrabi S. A.
- Andrade-Silva M.
- Andres A. M.
- Angelini S.
- Ann D.
- Anozie U. C.
- Ansari M. Y.
- Antas P.
- Antebi A.
- Anton Z.
- Anwar T.
- Apetoh L.
- Apostolova N.
- Araki T.
- Araki Y.
- Arasaki K.
- Araujo W. L.
- Araya J.
- Arden C.
- Arevalo M. -A.
- Arguelles S.
- Arias E.
- Arikkath J.
- Arimoto H.
- Ariosa A. R.
- Armstrong-James D.
- Arnaune-Pelloquin L.
- Aroca A.
- Arroyo D. S.
- Arsov I.
- Artero R.
- Asaro D. M. L.
- Aschner M.
- Ashrafizadeh M.
- Ashur-Fabian O.
- Atanasov A. G.
- Auberger P.
- Auner H. W.
- Aurelian L.
- Autelli R.
- Avagliano L.
- Avalos Y.
- Aveic S.
- Aveleira C. A.
- Avin-Wittenberg T.
- Aydin Y.
- Ayton S.
- Ayyadevara S.
- Azzopardi M.
- B. C. B. Ko
- Baba M.
- Backer J. M.
- Backues S. K.
- Bae D. -H.
- Bae O. -N.
- Bae S. H.
- Baehrecke E. H.
- Baek A.
- Baek S. -H.
- Baek S. H.
- Bagetta G.
- Bagniewska-Zadworna A.
- Bai H.
- Bai J.
- Bai X.
- Bai Y.
- Bairagi N.
- Baksi S.
- Balazadeh S.
- Balbi T.
- Baldari C. T.
- Balduini W.
- Ballabio A.
- Ballester M.
- Balzan R.
- Bandopadhyay R.
- Banerjee S.
- Banerjee S.
- Banreti A.
- Bao Y.
- Baptista M. S.
- Baracca A.
- Barbati C.
- Bargiela A.
- Barila D.
- Barlow P. G.
- Barmada S. J.
- Barreiro E.
- Barreto G. E.
- Bartek J.
- Bartel B.
- Bartolome A.
- Barve G. R.
- Basagoudanavar S. H.
- Bassham D. C.
- Bast R. C.
- Basu A.
- Batoko H.
- Batten I.
- Baulieu E. E.
- Baumgarner B. L.
- Bayry J.
- Beale R.
- Beau I.
- Beaumatin F.
- Bechara L. R. G.
- Beck G. R.
- Beers M. F.
- Begun J.
- Behl C.
- Behrends C.
- Behrens G. M. N.
- Bei R.
- Bejarano E.
- Bel S.
- Belaid A.
- Belgareh-Touze N.
- Bellarosa C.
- Belleudi F.
- Bello Perez M.
- Bello-Morales R.
- Beltran J. S. D. O.
- Beltran S.
- Benbrook D. M.
- Bendorius M.
- Benitez B. A.
- Benito-Cuesta I.
- Bensalem J.
- Berchtold M. W.
- Berezowska S.
- Bergamaschi D.
- Bergami M.
- Bergmann A.
- Berliocchi L.
- Berlioz-Torrent C.
- Bernard A.
- Berthoux L.
- Besirli C. G.
- Besteiro S.
- Betin V. M.
- Beyaert R.
- Bezbradica J. S.
- Bhaskar K.
- Bhatia-Kissova I.
- Bhattacharya R.
- Bhattacharya S.
- Bhattacharyya S.
- Bhuiyan M. S.
- Bhutia S. K.
- Bi L.
- Bi X.
- Biden T. J.
- Bijian K.
- Billes V. A.
- Binart N.
- Bincoletto C.
- Birgisdottir A. B.
- Bjorkoy G.
- Blanco G.
- Blas-Garcia A.
- Blasiak J.
- Blomgran R.
- Blomgren K.
- Blum J. S.
- Boada-Romero E.
- Boban M.
- Boesze-Battaglia K.
- Boeuf P.
- Boland B.
- Bomont P.
- Bonaldo P.
- Bonam S. R.
- Bonfili L.
- Bonifacino J. S.
- Boone B. A.
- Bootman M. D.
- Bordi M.
- Borner C.
- Bornhauser B. C.
- Borthakur G.
- Bosch J.
- Bose S.
- Botana L. M.
- Botas J.
- Boulanger C. M.
- Boulton M. E.
- Bourdenx M.
- Bourgeois B.
- Bourke N. M.
- Bousquet G.
- Boya P.
- Bozhkov P. V.
- Bozi L. H. M.
- Bozkurt T. O.
- Brackney D. E.
- Brand-Saberi B.
- Brandts C. H.
- Braun R. J.
- Braus G. H.
- Bravo-Sagua R.
- Bravo-San Pedro J. M.
- Brest P.
- Bringer M. -A.
- Briones-Herrera A.
- Broaddus V. C.
- Brodersen P.
- Brodsky J. L.
- Brody S. L.
- Bronson P. G.
- Bronstein J. M.
- Brown C. N.
- Brown R. E.
- Brum P. C.
- Brumell J. H.
- Brunetti-Pierri N.
- Bruno D.
- Bryson-Richardson R. J.
- Bucci C.
- Buch S.
- Buchan J. R.
- Buchrieser C.
- Buckingham E. M.
- Budak H.
- Budini M.
- Bueno M.
- Buitrago-Molina L. E.
- Bultynck G.
- Burada F.
- Buraschi S.
- Burgoyne J. R.
- Buron M. I.
- Bustos V.
- Buttner S.
- Butturini E.
- Byrd A.
- C. C. W. Ng
- C. H. Lo
- Cabas I.
- Cabrera-Benitez S.
- Cadwell K.
- Cai J.
- Cai L.
- Cai Q.
- Cairo M.
- Calbet J. A.
- Caldwell G. A.
- Caldwell K. A.
- Call J. A.
- Calvani R.
- Calvo A. C.
- Calvo-Rubio Barrera M.
- Camara N. O. S.
- Camonis J. H.
- Camougrand N.
- Campanella M.
- Campbell E. M.
- Campbell-Valois F. -X.
- Campello S.
- Campesi I.
- Campos J. C.
- Camuzard O.
- Cancino J.
- Candido de Almeida D.
- Canesi L.
- Caniggia I.
- Canonico B.
- Canti C.
- Cao B.
- Caraglia M.
- Carames B.
- Carchman E. H.
- Cardenal-Munoz E.
- Cardenas C.
- Cardenas L.
- Cardoso S. M.
- Carew J. S.
- Carle G. F.
- Carleton G.
- Carloni S.
- Carmona-Gutierrez D.
- Carneiro L. A.
- Carnevali O.
- Carosi J. M.
- Carra S.
- Carrier A.
- Carrier L.
- Carroll B.
- Carter A. B.
- Carvalho A. N.
- Casanova M.
- Casas C.
- Casas J.
- Cassioli C.
- Castillo E. F.
- Castillo K.
- Castillo-Lluva S.
- Castoldi F.
- Castori M.
- Castro A. F.
- Castro-Caldas M.
- Castro-Hernandez J.
- Castro-Obregon S.
- Catz S. D.
- Cavadas C.
- Cavaliere F.
- Cavallini G.
- Cavinato M.
- Cayuela M. L.
- Cebollada Rica P.
- Cecarini V.
- Cecconi F.
- Cechowska-Pasko M.
- Cenci S.
- Ceperuelo-Mallafre V.
- Cerqueira J. J.
- Cerutti J. M.
- Cervia D.
- Cetintas V. B.
- Cetrullo S.
- Chae H. -J.
- Chagin A. S.
- Chai C. -Y.
- Chakrabarti G.
- Chakrabarti O.
- Chakraborty T.
- Chakraborty T.
- Chami M.
- Chamilos G.
- Chan D. W.
- Chan E. D.
- Chan E. Y. W.
- Chan H.
- Chan H. H.
- Chan H. Y. E.
- Chan M. T. V.
- Chan Y. S.
- Chandra P. K.
- Chang C.
- Chang C. -P.
- Chang H. -C.
- Chang K.
- Chao J.
- Chapman T.
- Charlet-Berguerand N.
- Chatterjee S.
- Chaube S. K.
- Chaudhary A.
- Chauhan S.
- Chaum E.
- Checler F.
- Cheetham M. E.
- Chen C. -S.
- Chen G. -C.
- Chen J. -F.
- Chen L.
- Chen L.
- Chen L. L.
- Chen M.
- Chen M. -K.
- Chen N.
- Chen Q.
- Chen R. -H.
- Chen S.
- Chen W.
- Chen W.
- Chen X.
- Chen X. -M.
- Chen X. -W.
- Chen Y.
- Chen Y.
- Chen Y.
- Chen Y. -G.
- Chen Y. -J.
- Chen Y. -Q.
- Chen Z.
- Chen Z.
- Chen Z.
- Chen Z. -H.
- Chen Z. J.
- Chen Z. S.
- Cheng H.
- Cheng J.
- Cheng S. -Y.
- Cheng W.
- Cheng X.
- Cheng X. -T.
- Cheng Y.
- Cheng Z.
- Cheong H.
- Cheong J. K.
- Chernyak B. V.
- Cherry S.
- Cheung C. F. R.
- Cheung C. H. A.
- Cheung K. -H.
- Chevet E.
- Chi R. J.
- Chiang A. K. S.
- Chiaradonna F.
- Chiarelli R.
- Chiariello M.
- Chica N.
- Chiocca S.
- Chiong M.
- Chiou S. -H.
- Chiramel A. I.
- Chiurchiu V.
- Cho D. -H.
- Choe S. -K.
- Choi A. M. K.
- Choi M. E.
- Choudhury K. R.
- Chow N. S.
- Chu C. T.
- Chua J. J. E.
- Chua J. P.
- Chung H.
- Chung K. P.
- Chung S.
- Chung S. -H.
- Chung Y. -L.
- Cianfanelli V.
- Ciechomska I. A.
- Cifuentes M.
- Cinque L.
- Cirak S.
- Cirone M.
- Clague M. J.
- Clarke R.
- Clementi E.
- Coccia E. M.
- Codogno P.
- Cohen E.
- Cohen M. M.
- Colasanti T.
- Colasuonno F.
- Colbert R. A.
- Colell A.
- Colic M.
- Coll N. S.
- Collins M. O.
- Colombo M. I.
- Colon-Ramos D. A.
- Combaret L.
- Comincini S.
- Cominetti M. R.
- Consiglio A.
- Conte A.
- Conti F.
- Contu V. R.
- Cookson M. R.
- Coombs K. M.
- Coppens I.
- Corasaniti M. T.
- Cordes N.
- Corkery D. P.
- Cortese K.
- Costa M. D. C.
- Costantino S.
- Costelli P.
- Coto-Montes A.
- Crack P. J.
- Crespo J. L.
- Criollo A.
- Crippa V.
- Cristofani R.
- Csizmadia T.
- Cuadrado A.
- Cui B.
- Cui J.
- Cui Y.
- Cui Y.
- Culetto E.
- Cumino A. C.
- Cybulsky A. V.
- Czaja M. J.
- Czuczwar S. J.
- D'Adamo S.
- D'Amelio M.
- D'Arcangelo D.
- D'Lugos A. C.
- D'Orazi G.
- D. -Q. Li
- da Silva J. A.
- Dafsari H. S.
- Dagda R. K.
- Dagdas Y.
- Daglia M.
- Dai X.
- Dai Y.
- Dai Y.
- Dal Col J.
- Dalhaimer P.
- Dalla Valle L.
- Dallenga T.
- Dalmasso G.
- Damme M.
- Dando I.
- Dantuma N. P.
- Darling A. L.
- Das H.
- Dasarathy S.
- Dasari S. K.
- Dash S.
- Daumke O.
- Dauphinee A. N.
- Davies J. S.
- Davila V. A.
- Davis R. J.
- Davis T.
- Dayalan Naidu S.
- De Amicis F.
- De Bosscher K.
- De Felice F.
- De Franceschi L.
- De Leonibus C.
- de Mattos Barbosa M. G.
- De Meyer G. R. Y.
- De Milito A.
- De Nunzio C.
- De Palma C.
- De Santi M.
- De Virgilio C.
- De Zio D.
- Debnath J.
- Debosch B. J.
- Decuypere J. -P.
- Deehan M. A.
- Deflorian G.
- Degregori J.
- Dehay B.
- Del Rio G.
- Delaney J. R.
- Delbridge L. M. D.
- Delorme-Axford E.
- Delpino M. V.
- Demarchi F.
- Dembitz V.
- Demers N. D.
- Deng H.
- Deng Z.
- Dengjel J.
- Dent P.
- Denton D.
- Depamphilis M. L.
- Der C. J.
- Deretic V.
- Descoteaux A.
- Devis L.
- Devkota S.
- Devuyst O.
- Dewson G.
- Dharmasivam M.
- Dhiman R.
- di Bernardo D.
- Di Cristina M.
- Di Domenico F.
- Di Fazio P.
- Di Fonzo A.
- Di Guardo G.
- Di Guglielmo G. M.
- Di Leo L.
- Di Malta C.
- Di Nardo A.
- Di Rienzo M.
- Di Sano F.
- Diallinas G.
- Diao J.
- Diaz-Araya G.
- Diaz-Laviada I.
- Dickinson J. M.
- Diederich M.
- Dieude M.
- Dikic I.
- Ding S.
- Ding W. -X.
- Dini L.
- Dinic J.
- Dinic M.
- Dinkova-Kostova A. T.
- Dionne M. S.
- Distler J. H. W.
- Diwan A.
- Dixon I. M. C.
- Djavaheri-Mergny M.
- Dobrinski I.
- Dobrovinskaya O.
- Dobrowolski R.
- Dobson R. C. J.
- Dokic J.
- Dokmeci Emre S.
- Donadelli M.
- Dong B.
- Dong X.
- Dong X. C.
- Dong Z.
- Dorn II G. W.
- Dotsch V.
- Dou H.
- Dou J.
- Dowaidar M.
- Dridi S.
- Drucker L.
- du Toit A.
- Du A.
- Du C.
- Du G.
- Duan S. -B.
- Duan X.
- Duarte S. P.
- Dubrovska A.
- Dunlop E. A.
- Dupont N.
- Duran R. V.
- Dwarakanath B. S.
- Dyshlovoy S. A.
- E. -K. Jo
- E. A. Ho
- Ebrahimi-Fakhari D.
- Eckhart L.
- Edelstein C. L.
- Efferth T.
- Eftekharpour E.
- Eichinger L.
- Eid N.
- Eisenberg T.
- Eissa N. T.
- Eissa S.
- Ejarque M.
- El Andaloussi A.
- El-Hage N.
- El-Naggar S.
- El-Shafey E. S.
- Eleuteri A. M.
- Elgendy M.
- Eliopoulos A. G.
- Elizalde M. M.
- Elks P. M.
- Elsasser H. -P.
- Elsherbiny E. S.
- Emerling B. M.
- Emre N. C. T.
- Eng C. H.
- Engedal N.
- Engelbrecht A. -M.
- Engelsen A. S. T.
- Enserink J. M.
- Escalante R.
- Esclatine A.
- Escobar-Henriques M.
- Eskelinen E. -L.
- Espert L.
- Eusebio M. -O.
- Fabrias G.
- Fabrizi C.
- Facchiano A.
- Facchiano F.
- Fadeel B.
- Fader C.
- Faesen A. C.
- Fairlie W. D.
- Falco A.
- Falkenburger B. H.
- Fan D.
- Fan J.
- Fan Y.
- Fang E. F.
- Fang Y.
- Fang Y.
- Fanto M.
- Farfel-Becker T.
- Faure M.
- Fazeli G.
- Fedele A. O.
- Feldman A. M.
- Feng D.
- Feng J.
- Feng L.
- Feng W.
- Feng Y.
- Feng Y.
- Fenz Araujo T.
- Ferguson T. A.
- Fernandez A. F.
- Fernandez-Checa J. C.
- Fernandez-Veledo S.
- Fernie A. R.
- Ferrante A. W.
- Ferraresi A.
- Ferrari M. F.
- Ferreira J. C. B.
- Ferro-Novick S.
- Figueras A.
- Filadi R.
- Filigheddu N.
- Filippi-Chiela E.
- Filomeni G.
- Fimia G. M.
- Fineschi V.
- Finetti F.
- Finkbeiner S.
- Fisher E. A.
- Fisher P. B.
- Flamigni F.
- Fliesler S. J.
- Flo T. H.
- Florance I.
- Florey O.
- Florio T.
- Fodor E.
- Follo C.
- Fon E. A.
- Forlino A.
- Fornai F.
- Fortini P.
- Fracassi A.
- Fraldi A.
- Franco B.
- Franco R.
- Franconi F.
- Frankel L. B.
- Friedman S. L.
- Frohlich L. F.
- Fruhbeck G.
- Fuentes J. M.
- Fujiki Y.
- Fujita N.
- Fujiwara Y.
- Fukuda M.
- Fulda S.
- Furic L.
- Furuya N.
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- Zorzano A.
- Zou W.
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- Zou Z.
- Zuryn S.
- Zwerschke W.
- Publication venue
- 'Informa UK Limited'
- Publication date
- 01/01/2021
- Field of study
Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition)1.
- Author
- Abdel-Aziz AK
- Abdelfatah S
- Abdellatif M
- Abdoli A
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- Wang Y-Y
- Wang Z
- Wang Z
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- Đokić J
- Žerovnik E
- Publication venue
- 'Informa UK Limited'
- Publication date
- 01/01/2021
- Field of study
In 2008, we published the first set of guidelines for standardizing research in autophagy. Since then, this topic has received increasing attention, and many scientists have entered the field. Our knowledge base and relevant new technologies have also been expanding. Thus, it is important to formulate on a regular basis updated guidelines for monitoring autophagy in different organisms. Despite numerous reviews, there continues to be confusion regarding acceptable methods to evaluate autophagy, especially in multicellular eukaryotes. Here, we present a set of guidelines for investigators to select and interpret methods to examine autophagy and related processes, and for reviewers to provide realistic and reasonable critiques of reports that are focused on these processes. These guidelines are not meant to be a dogmatic set of rules, because the appropriateness of any assay largely depends on the question being asked and the system being used. Moreover, no individual assay is perfect for every situation, calling for the use of multiple techniques to properly monitor autophagy in each experimental setting. Finally, several core components of the autophagy machinery have been implicated in distinct autophagic processes (canonical and noncanonical autophagy), implying that genetic approaches to block autophagy should rely on targeting two or more autophagy-related genes that ideally participate in distinct steps of the pathway. Along similar lines, because multiple proteins involved in autophagy also regulate other cellular pathways including apoptosis, not all of them can be used as a specific marker for bona fide autophagic responses. Here, we critically discuss current methods of assessing autophagy and the information they can, or cannot, provide. Our ultimate goal is to encourage intellectual and technical innovation in the field
Sympathetic nervous activation, mitochondrial dysfunction and outcome in acutely decompensated cirrhosis: the metabolomic prognostic models (CLIF-C MET)
- Author
- Aguilar Ferran
- Albillos Agustín
- Alessandria Carlo
- Angeli Paolo
- Arroyo Vicente
- Bañares Rafael
- Berg Thomas
- Bernardi Mauro
- Bruns Tony
- Caraceni Paolo
- Castelli Florence A
- Claria Joan
- De La Peña-Ramirez Carlos
- Diaz Juan Manuel
- Domenicali Marco
- Fenaille François
- Fernández Javier
- Gambino Carmine Gabriele
- Genesca Joan
- Gerbes Alexander L
- Giovo Ilaria
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- Gustot Thierry
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- Jiménez Cesar
- Junot Christophe
- Laleman Wim
- Lozano Juan-Jose
- Martin Pedro Izquierdo-Bueno
- Merli Manuela
- Mookerjee Raj
- Moreau Richard
- Papp Maria
- Piano Salvatore
- Presa José
- Putignano Antonella
- Saliba Faouzi
- Sánchez-Garrido Cristina
- Sierra Patricia
- Trautwein Christian
- Trebicka Jonel
- Uschner Frank Erhard
- Vargas Victor
- Weiss Emmanuel
- Wendon Julia A
- Zaccherini Giacomo
- Zeuzem Stefan
- Zipprich Alexander
- Publication venue
- Publication date
- 01/01/2023
- Field of study
Background and aims Current prognostic scores of patients with acutely decompensated cirrhosis (AD), particularly those with acute-on-chronic liver failure (ACLF), underestimate the risk of mortality. This is probably because systemic inflammation (SI), the major driver of AD/ACLF, is not reflected in the scores. SI induces metabolic changes, which impair delivery of the necessary energy for the immune reaction. This investigation aimed to identify metabolites associated with short-term (28-day) death and to design metabolomic prognostic models. Methods Two prospective multicentre large cohorts from Europe for investigating ACLF and development of ACLF, CANONIC (discovery, n=831) and PREDICT (validation, n=851), were explored by untargeted serum metabolomics to identify and validate metabolites which could allow improved prognostic modelling. Results Three prognostic metabolites strongly associated with death were selected to build the models. 4-Hydroxy-3-methoxyphenylglycol sulfate is a norepinephrine derivative, which may be derived from the brainstem response to SI. Additionally, galacturonic acid and hexanoylcarnitine are associated with mitochondrial dysfunction. Model 1 included only these three prognostic metabolites and age. Model 2 was built around 4-hydroxy-3-methoxyphenylglycol sulfate, hexanoylcarnitine, bilirubin, international normalised ratio (INR) and age. In the discovery cohort, both models were more accurate in predicting death within 7, 14 and 28 days after admission compared with MELDNa score (C-index: 0.9267, 0.9002 and 0.8424, and 0.9369, 0.9206 and 0.8529, with model 1 and model 2, respectively). Similar results were found in the validation cohort (C-index: 0.940, 0.834 and 0.791, and 0.947, 0.857 and 0.810, with model 1 and model 2, respectively). Also, in ACLF, model 1 and model 2 outperformed MELDNa 7, 14 and 28 days after admission for prediction of mortality. Conclusions Models including metabolites (CLIF-C MET) reflecting SI, mitochondrial dysfunction and sympathetic system activation are better predictors of short-term mortality than scores based only on organ dysfunction (eg, MELDNa), especially in patients with ACLF
Recovered possibilities: Moving the seats of empire from England and Spain to America
- Author
- Adams John.
- Adams John.
- Alamán Lucas.
- Amor de la Patria José
- Balbuena Bernardo de.
- Bartosik-Vélez Elise.
- Benson Nettie Lee.
- Blanco White José
- Botero Giovanni.
- Botero Giovanni.
- Braudel Fernand.
- Bueno Luis Eduardo
- Burton Robert.
- Bustamante Carlos María de.
- Cardim Pedro
- Carranza Francisco Xavier.
- Chastenet Jacques.
- Ciges Aparicio Manuel.
- Corona Carlos.
- Coxe William.
- Dickey Lawrence.
- Elise Bartosik-Vélez
- Elliott John H.
- Esdaile Charles.
- Fitzmaurice Andrew.
- García Samuel.
- Gibbon Edward.
- Godoy Manuel.
- Grafe Regina.
- Greene Jack P.
- Hall Christopher D.
- Hancock David.
- Hinkhouse Fred Junkin.
- Hodges James.
- Holmes Abiel.
- Inglis Charles.
- Izquierdo Hernández Manuel.
- Jovellanos Gaspar Melchor de.
- Kamen Henry.
- Koebner Richard.
- La Parra López Emilio.
- Lachmann Richard.
- Leeds Titan.
- Lemay J. A. Leo.
- Martí Gilabert Francisco.
- Montesquieu Baron de.
- Muir Roy.
- Murphy Martin.
- Navas-Sierra J. Alberto.
- Pownall Thomas.
- Presas José
- Pío Montúfar Marqués de Selva Alegre Juan.
- Ramos Demetrio.
- Ramírez de Villa-Urrutia Wenceslao.
- Ringrose David.
- Rodríguez O. Jaime.
- Rodríguez O. Jaime.
- Schultz Kirsten.
- Shalev Eran.
- Smith Adam.
- Sparks Jared
- Stein Barbara H.
- Talamantes Fray Melchor de.
- Torcy Jean-Baptiste Colbert.
- Toynbee Arnold.
- Tucker Josiah.
- Tucker Josiah.
- Villanueva Carlos A.
- Villanueva Carlos A.
- Publication venue
- 'Informa UK Limited'
- Publication date
- Field of study
Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition)
- Author
- Abdel-Aziz Amal Kamal
- Abdelfatah Sara
- Abdellatif Mahmoud
- Abdoli Asghar
- Abel Steffen
- Abeliovich Hagai
- Abildgaard Marie H
- Abudu Yakubu Princely
- Acevedo-Arozena Abraham
- Adamopoulos Iannis E
- Adeli Khosrow
- Adolph Timon E
- Adornetto Annagrazia
- Aflaki Elma
- Afshar Elham Ghasemipour
- Agam Galila
- Agarwal Anupam
- Aggarwal Bharat B
- Agnello Maria
- Agostinis Patrizia
- Agrewala Javed N
- Agrotis Alexander
- Aguilar Patricia V
- Ahmad S Tariq
- Ahmed Zubair M
- Ahumada-Castro Ulises
- Aits Sonja
- Aizawa Shu
- Akkoc Yunus
- Akoumianaki Tonia
- Akpinar Hafize Aysin
- Al-Abd Ahmed M
- Al-Akra Lina
- Al-Bari M Abdul Alim
- Al-Gharaibeh Abeer
- Alaoui-Jamali Moulay A
- Alberti Simon
- Alcocer-Gomez Elisabet
- Alcon Soledad Porte
- Alessandri Cristiano
- Ali Muhammad
- Aliwaini Saeb
- Alizadeh Javad
- Almacellas Eugenia
- Almasan Alexandru
- Alonso Alicia
- Alonso Guillermo D
- Altan-Bonnet Nihal
- Altieri Dario C
- Alvarez Elida MC
- Alves Sara
- Alzaharna Mazen M
- Amadio Marialaura
- Amantini Consuelo
- Amaral Cristina
- Ambrosio Susanna
- Amer Amal O
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- An Zhenyi
- Andersen Stig U
- Andrabi Shaida A
- Andrade-Silva Magaiver
- Andres Allen M
- Angelini Sabrina
- Ann David
- Anozie Uche C
- Ansari Mohammad Y
- Antas Pedro
- Antebi Adam
- Anton Zurine
- Anwar Tahira
- Apetoh Lionel
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- Araki Toshiyuki
- Araki Yasuhiro
- Arasaki Kohei
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- Araujo Wagner L
- Araya Jun
- Arden Catherine
- Arevalo Maria-Angeles
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- Arias Esperanza
- Arikkath Jyothi
- Arimoto Hirokazu
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- Arnaune-Pelloquin Laetitia
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- Arroyo Daniela S
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- Asaro Dalia Maria Lucia
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- Ashur-Fabian Osnat
- Atanasov Atanas G
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- Auberger Patrick
- Auner Holger W
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- Autelli Riccardo
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- Avalos Yenniffer
- Aveic Sanja
- Aveleira Celia Alexandra
- AvinWittenberg Tamar
- Aydin Yucel
- Ayton Scott
- Ayyadevara Srinivas
- Azzopardi Maria
- Baba Misuzu
- Backer Jonathan M
- Backues Steven K
- Bae Dong-Hun
- Bae Ok-Nam
- Bae Soo Han
- Baehrecke Eric H
- Baek Ahruem
- Baek Seung-Hoon
- Baek Sung Hee
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- Bagniewska-Zadworna Agnieszka
- Bai Hua
- Bai Jie
- Bai Xiyuan
- Bai Yidong
- Bairagi Nandadulal
- Baksi Shounak
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- Ballabio Andrea
- Ballester Maria
- Balzan Rena
- Bandopadhyay Rina
- Banerjee Sreeparna
- Banerjee Sulagna
- Bao Yan
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- Baracca Alessandra
- Barbati Cristiana
- Bargiela Ariadna
- Barila Daniela
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- Barmada Sami J
- Barreiro Esther
- Barrera Miguel Calvo-Rubio
- Barreto George E
- Bartek Jiri
- Bartel Bonnie
- Bartolome Alberto
- Barve Gaurav R
- Basagoudanavar Suresh H
- Bassham Diane C
- Basu Alakananda
- Batoko Henri
- Batten Isabella
- Baulieu Etienne E
- Baumgarner Bradley L
- Bayry Jagadeesh
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- Beaumatin Florian
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- Beers Michael F
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- Behl Christian
- Behrends Christian
- Behrens Georg MN
- Bei Roberto
- Bejarano Eloy
- Bel Shai
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- Belgareh-Touze Naima
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- Belleudi Francesca
- Bello Perez Melissa
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- Beltran Sebastian
- Benbrook Doris Mangiaracina
- Bendorius Mykolas
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- Benito-Cuesta Irene
- Bensalem Julien
- Berchtold Martin W
- Berezowska Sabina
- Bergamaschi Daniele
- Bergami Matteo
- Bergmann Andreas
- Berliocchi Laura
- Berlioz-Torrent Clarisse
- Bernard Amelie
- Berthoux Lionel
- Besirli Cagri G
- Besteiro Sebastien
- Betin Virginie M
- Beyaert Rudi
- Bezbradica Jelena S
- Bharath MM Srinivas
- Bhaskar Kiran
- Bhatia-Kissova Ingrid
- Bhattacharya Resham
- Bhattacharya Sujoy
- Bhattacharyya Shalmoli
- Bhuiyan Md Shenuarin
- Bhutia Sujit Kumar
- Bi Lanrong
- Bi Xiaolin
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- Birgisdottir Asa B
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- Bravo-San Pedro Jose M
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- Buckingham Erin M
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- Budini Mauricio
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- Cai Jingjing
- Cai Lu
- Cai Qian
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- Caldwell Kim A
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- Campbell-Valois Francois-Xavier
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- Carames Beatriz
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- Cardenas Cesar
- Cardenas Luis
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- Carleton Gillian
- Carloni Silvia
- Carmona-Gutierrez Didac
- Carneiro Leticia A
- Carnevali Oliana
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- Carrier Lucie
- Carroll Bernadette
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- Casas Josefina
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- Castillo Karen
- Castillo-Lluva Sonia
- Castoldi Francesca
- Castori Marco
- Castro Ariel F
- Castro-Caldas Margarida
- Castro-Hernandez Javier
- Castro-Obregon Susana
- Catz Sergio D
- Cavadas Claudia
- Cavaliere Federica
- Cavallini Gabriella
- Cavinato Maria
- Cayuela Maria L
- Cecarini Valentina
- Cecconi Francesco
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- Cenci Simone
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- Cervia Davide
- Cetintas Vildan Bozok
- Cetrullo Silvia
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- Chakrabarti Oishee
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- Chen Ye-Guang
- Chen Yingyu
- Chen Yongqiang
- Chen Yue-Qin
- Chen YuJen
- Chen Zhefan Stephen
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- Cohen Mickael M
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- Colasuonno Fiorella
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- Colombo Maria I
- Colon-Ramos Daniel A
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- Comincini Sergio
- Cominetti Marcia R
- Compagnoni Giacomo Monzio
- Consiglio Antonella
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- Conti Fabrizio
- Contu Viorica Raluca
- Cookson Mark R
- Coombs Kevin M
- Coppens Isabelle
- Corasaniti Maria Tiziana
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- Cortese Katia
- Costa Maria do Carmo
- Costantino Sarah
- Costelli Paola
- Coto-Montes Ana
- Crack Peter J
- Crespo Jose L
- Criollo Alfredo
- Crippa Valeria
- Cristofani Riccardo
- Csizmadia Tamas
- Cuadrado Antonio
- Cui Bing
- Cui Jun
- Cui Yixian
- Cui Yong
- Culetto Emmanuel
- Cumino Andrea C
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- Czaja Mark J
- Czuczwar Stanislaw J
- D'Adamo Stefania
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- D'Lugos Andrew C
- D'Orazi Gabriella
- da Costa Cristine Alves
- da Silva James A
- Dafsari Hormos Salimi
- Dagda Ruben K
- Dagdas Yasin
- Daglia Maria
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- Dai Yuyuan
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- Dalmasso Guillaume
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- de Almeida Luis Pereira
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- de Andrade Ramos Bruna Ribeiro
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- de Mattos Barbosa Mayara G
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- De Nunzio Cosimo
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- De Virgilio Claudio
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- Dengjel Joern
- Dent Paul
- Denton Donna
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- Dinic Miroslav
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- Dixon Ian MC
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- Dong Bo
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- Dong Zhiwu
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- Dou Juan
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- du Toit Andre
- Du Ailian
- Du Caigan
- Du Guangwei
- Du Hai-Ning
- Du Li-Lin
- Duan Shao-Bin
- Duan Xiaoqiong
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- Schafer Zachary T
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- Schapira Anthony HV
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- Schott Micah B
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- Sheng Zu-Hang
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- Shintani Takahiro
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- Shridhar Viji
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- Silva-Pavez Eduardo
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- Simon Hans-Uwe
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- Singh Lalit P
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- Singh Shivendra V
- Singh Shrawan K
- Singh Sudha B
- Singh Sunaina
- Singh Surinder Pal
- Sinha Debasish
- Sinha Rohit Anthony
- Sinha Sangita
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- Sirohi Kapil
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- Sousa Diana
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- Spector Stephen A
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- Stallings Christina L
- Stalnecker Clint A
- Stankov Metodi V
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- Stefanis Leonidas
- Steffan Joan S
- Steinkasserer Alexander
- Stenmark Harald
- Sterneckert Jared
- Stevens Craig
- Stoka Veronika
- Storch Stephan
- Stork Bjorn
- Strappazzon Flavie
- Strohecker Anne Marie
- Stupack Dwayne G
- Su Huanxing
- Su Ling-Yan
- Su Longxiang
- SuarezFontes Ana M
- Subauste Carlos S
- Subbian Selvakumar
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- Sui Xinbing
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- Sun Guangchao
- Sun Jun
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- Sun Meng-xiang
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- Tafani Marco
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- Tai Haoran
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- Tam Shing Yau
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- Tamura Atsushi
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- Tan Eng-King
- Tan Ya-Qin
- Tanaka Masaki
- Tanaka Motomasa
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- Tang Jingfeng
- Tang Tie-Shan
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- Tao Zhipeng
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- Tatenhorst Lars
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- Taylor Allen
- Taylor Gregory A
- Taylor Joan M
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- Tee Andrew R
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- Teixeira-Clerc Fatima
- Tekirdag Kumsal A
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- Tenreiro Sandra
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- Tharaux PierreLouis
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- Thellung Stefano
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- Thirumalaikumar VP
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- Thomes Paul G
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- Thukral Lipi
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- Thumm Michael
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- Timmerman Vincent
- Titorenko Vladimir I
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- Toivonen Janne M
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- Tong Chao
- Tong Chun-Kit
- Tong Xin
- Tooze Sharon A
- Torgersen Maria L
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- Torres-Lopez Liliana
- Torriglia Alicia
- Towers Christina G
- Towns Roberto
- Toyokuni Shinya
- Trajkovic Vladimir
- Tramontano Donatella
- Tran QuynhGiao
- Travassos Leonardo H
- Trelford Charles B
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- Trougakos Ioannis P
- Tsao Betty P
- Tschan Mario P
- Tse Hung-Fat
- Tse Tak Fu
- Tsugawa Hitoshi
- Tsvetkov Andrey S
- Tumbarello David A
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- Tunon Maria J
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- Turk Boris
- Turk Vito
- Turner Bradley J
- Tuxworth Richard I
- Tyler Jessica K
- Tyutereva Elena V
- Uchiyama Yasuo
- UgunKlusek Aslihan
- Uhlig Holm H
- Ulasov Ilya V
- Umekawa Midori
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- Urbe Sylvie
- Uribe-Carretero Elisabet
- Ustun Suayib
- Uversky Vladimir N
- Vaccari Thomas
- Vaccaro Maria I
- Vahsen Bjorn F
- Vakifahmetoglu-Norberg Helin
- Valdor Rut
- Valente Maria J
- Valko Ayelen
- Vallee Richard B
- Valverde Angela M
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- van Der Veen Stijn
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- van Loosdregt Jorg
- van Wijk Sjoerd JL
- Vandenberghe Wim
- Vanhorebeek Ilse
- Vannier-Santos Marcos A
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- Vanrell M Cristina
- Vantaggiato Chiara
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- Varela-Nieto Isabel
- Varga Mate
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- Vega-Rubin-de-Celis Silvia
- VegaNaredo Ignacio
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- Velazquez Ariadna P
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- Vervoorts Jorg
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- Vidoni Chiara
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- Villalobo Antonio
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- Wang Chenwei
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- Wang Nanbu
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- Wang Ping
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- Yang Ming
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- Zhu Yushan
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- Zhuang Xiaohong
- Zientara-Rytter Katarzyna
- Zimmermann Christine M
- Ziviani Elena
- Zoladek Teresa
- Zong Wei-Xing
- Zorov Dmitry B
- Zorzano Antonio
- Zou Weiping
- Zou Zhen
- Zou Zhengzhi
- Zuryn Steven
- Zwerschke Werner
- Publication venue
- 'Informa UK Limited'
- Publication date
- 01/01/2021
- Field of study
In 2008, we published the first set of guidelines for standardizing research in autophagy. Since then, this topic has received increasing attention, and many scientists have entered the field. Our knowledge base and relevant new technologies have also been expanding. Thus, it is important to formulate on a regular basis updated guidelines for monitoring autophagy in different organisms. Despite numerous reviews, there continues to be confusion regarding acceptable methods to evaluate autophagy, especially in multicellular eukaryotes. Here, we present a set of guidelines for investigators to select and interpret methods to examine autophagy and related processes, and for reviewers to provide realistic and reasonable critiques of reports that are focused on these processes. These guidelines are not meant to be a dogmatic set of rules, because the appropriateness of any assay largely depends on the question being asked and the system being used. Moreover, no individual assay is perfect for every situation, calling for the use of multiple techniques to properly monitor autophagy in each experimental setting. Finally, several core components of the autophagy machinery have been implicated in distinct autophagic processes (canonical and noncanonical autophagy), implying that genetic approaches to block autophagy should rely on targeting two or more autophagy-related genes that ideally participate in distinct steps of the pathway. Along similar lines, because multiple proteins involved in autophagy also regulate other cellular pathways including apoptosis, not all of them can be used as a specific marker for bona fide autophagic responses. Here, we critically discuss current methods of assessing autophagy and the information they can, or cannot, provide. Our ultimate goal is to encourage intellectual and technical innovation in the field
Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition)
- Author
- Abdel-Aziz A. K.
- Abdelfatah S.
- Abdellatif M.
- Abdoli A.
- Abel S.
- Abeliovich H.
- Abildgaard M. H.
- Abudu Y. P.
- Acevedo-Arozena A.
- Adamopoulos I. E.
- Adeli K.
- Adolph T. E.
- Adornetto A.
- Aflaki E.
- Agam G.
- Agarwal A.
- Aggarwal B. B.
- Agnello M.
- Agostinis P.
- Agrewala J. N.
- Agrotis A.
- Aguilar P. V.
- Ahmad S. T.
- Ahmed Z. M.
- Ahumada-Castro U.
- Aits S.
- Aizawa S.
- Akkoc Y.
- Akoumianaki T.
- Akpinar H. A.
- Al-Abd A. M.
- Al-Akra L.
- Al-Gharaibeh A.
- Alaoui-Jamali M. A.
- Alberti S.
- Alcocer-Gomez E.
- Alessandri C.
- Ali M.
- Alim Al-Bari M. A.
- Aliwaini S.
- Alizadeh J.
- Almacellas E.
- Almasan A.
- Alonso A.
- Alonso G. D.
- Altan-Bonnet N.
- Altieri D. C.
- Alvarez E. M. C.
- Alves da Costa C.
- Alves S.
- Alzaharna M. M.
- Amadio M.
- Amantini C.
- Amaral C.
- Ambrosio S.
- Amer A. O.
- Ammanathan V.
- An Z.
- Andersen S. U.
- Andrabi S. A.
- Andrade-Silva M.
- Andres A. M.
- Angelini S.
- Ann D.
- Anozie U. C.
- Ansari M. Y.
- Antas P.
- Antebi A.
- Anton Z.
- Anwar T.
- Apetoh L.
- Apostolova N.
- Araki T.
- Araki Y.
- Arasaki K.
- Araujo W. L.
- Araya J.
- Arden C.
- Arevalo M. -A.
- Arguelles S.
- Arias E.
- Arikkath J.
- Arimoto H.
- Ariosa A. R.
- Armstrong-James D.
- Arnaune-Pelloquin L.
- Aroca A.
- Arroyo D. S.
- Arsov I.
- Artero R.
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- Sandri M.
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- Seglen P. O.
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- Zorzano A.
- Zou W.
- Zou Z.
- Zou Z.
- Zuryn S.
- Zwerschke W.
- Publication venue
- Taylor & Francis
- Publication date
- 01/01/2021
- Field of study
International audienceIn 2008, we published the first set of guidelines for standardizing research in autophagy. Since then, this topic has received increasing attention, and many scientists have entered the field. Our knowledge base and relevant new technologies have also been expanding. Thus, it is important to formulate on a regular basis updated guidelines for monitoring autophagy in different organisms. Despite numerous reviews, there continues to be confusion regarding acceptable methods to evaluate autophagy, especially in multicellular eukaryotes. Here, we present a set of guidelines for investigators to select and interpret methods to examine autophagy and related processes, and for reviewers to provide realistic and reasonable critiques of reports that are focused on these processes. These guidelines are not meant to be a dogmatic set of rules, because the appropriateness of any assay largely depends on the question being asked and the system being used. Moreover, no individual assay is perfect for every situation, calling for the use of multiple techniques to properly monitor autophagy in each experimental setting. Finally, several core components of the autophagy machinery have been implicated in distinct autophagic processes (canonical and noncanonical autophagy), implying that genetic approaches to block autophagy should rely on targeting two or more autophagy-related genes that ideally participate in distinct steps of the pathway. Along similar lines, because multiple proteins involved in autophagy also regulate other cellular pathways including apoptosis, not all of them can be used as a specific marker for bona fide autophagic responses. Here, we critically discuss current methods of assessing autophagy and the information they can, or cannot, provide. Our ultimate goal is to encourage intellectual and technical innovation in the field
Characteristics and predictors of death among 4035 consecutively hospitalized patients with COVID-19 in Spain
- Author
- Adoración Valiente
- Adriana Hernández Belmonte
- Adriana Sánchez Serrano
- Adrián Sánchez Montalvá
- Agustín Rojas-Vieyra
- Aida Gutiérrez García
- Aina Gabarrell Pascuet
- Aina Gomila Grange
- Ainhoa Urrutia Losada
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- Alba Bergas
- Alba Rueda López
- Albert Sabater Gil
- Alberto Arranz Caso
- Alberto Bahamonde Carrasco
- Alberto Delgado-Iribarren
- Alberto Oreja
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- Alejandra Pérez García
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- Alejandro García García
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- Ana Ferrer Ribera
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- Ana Isabel Cañabate
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- Ana Lérida Urteaga
- Ana Mariño Callejo
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- Ana Milagro Beamonte
- Ana Such Diaz
- Ana Vegas Serrano
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- Andrea Pérez Rodríguez
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- Andrés Felipe Cardona Arias
- Andrés Javier Ruiz Fernández
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- Aránzazu Villasante de la Puente
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- Beatriz Loureiro Rodríguez
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- Beatriz Rodríguez-Alonso
- Beatriz Álvarez Zapatero
- Beatriz Álvarez Álvarez
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- Belén Gutiérrez-Gutiérrez
- Belén Loeches Yagüe
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- Berta Torres
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- Blanca Martínez Cifre
- Blanca Marzo
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- Carlos Rodríguez Franco
- Carlos Ruiz Martínez
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- Carmen Ardanuy
- Carmen Busca Arenzana
- Carmen Herrero Rodríguez
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- Carmen Martínez Cilleros
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- Carmen Sáez Barberá
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- Carolina Roldán Fontana
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- Chen
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- Concepción García García
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- Cristina Cervera Acedo
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- José Antonio Pérez de León
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- José Ignacio Bernardino de la Serna
- José Luis Blanco
- José Luis Díaz de Tuesta del Arco
- José Luis García Fogeda
- José Luis Velasco Garrido
- José Luís Del Pozo León
- José M. Azcona Gutiérrez
- José Manuel Vázquez Comendador
- José María Aguado
- José María Marimón Ortiz de Zárate
- José María Milicua Muñoz
- José Miguel Cisneros
- José Mª García de Lomas Guerrero
- José R. Blanco Ramos
- José Ramón Arriba
- José Ramón Arribas López
- José Román Muñoz del Rey
- José Sanz Moreno
- José Tomas Algado Rabasa
- Juan Berenguer
- Juan Berenguer
- Juan Cantón de Seoane
- Juan Carlos Abad Almendro
- Juan Carlos Gainzarain Arana
- Juan Carlos López
- Juan Carlos Ramos Ramos
- Juan Cuadros González
- Juan Emilio Losa García
- Juan Espinosa Pereiro
- Juan Pablo Avilés
- Juan Pablo Horcajada
- Juan Salillas Hernando
- Juan Torres Macho
- Judit Villar-García
- Julen Cadiñaños Loidi
- Julia Pareja Coca
- Julia Praena
- Julio García Rodríguez
- Justo Menéndez
- Júlia Sellarés
- Karim Mohamed Ramírez
- Kass
- Klein
- Kuderer
- Kwong
- Lagunas-Rangel
- Laia Lorenzo-Esteller
- Lara Montes Andújar
- Laura Castelo Corral
- Laura Iglesias Llorente
- Laura Mao Martín
- Laura Muñoz López
- Laura Prieto Pérez
- Leire Balerdi Sarasola
- Leire Pérez-Latorre
- Liang
- Lidia Martín
- Lighter
- Liu
- Lorea Arteche Eguizabal
- Lorena De la Mora
- Loreto Vidaur Tello
- Lourdes Herrera Pacheco
- Lucia Boix Palop
- Lucia Cajuela
- Lucia Suárez Pérez
- Lucio García-Fraile
- Lucy Abella Vázquez
- Lucía Fernández de Orueta
- Lucía Gómez García
- Lucía Marín-Barrera
- Lucía Ramos Merino
- Luis Alberto Nieto Fernández del Campo
- Luis E. López-Cortés
- Luis Falgueras López
- Luis Force Sanmartín
- Luis Metola Sacristán
- Luis Puente
- Luisa Sorli Redò
- Lydia Gálvez-Benítez
- Lydia Martín González
- M. Teresa Pérez-Rodríguez
- Maialen Ibarguren Pinilla
- Manuel Cervantes García
- Manuela Aguilar-Guisado
- Mar Masiá Canuto
- Mar Mosquera
- Marcelino Hayek Peraza
- Marco Antonio Sempere Alcocer
- Marcos Díez Martínez
- Marcos López Dosil
- Margarita Ramírez-Schacke
- Maria Álvarez de Castro
- Maribel Zamora Cintas
- Marina Pacheco Martínez-Atienza
- Mario Fernández-Ruiz
- Mario José Rodriguez Dominguez
- Mario Pérez Butragueño
- Marta Alvarado Blasco
- Marta Arsuaga Vicente
- Marta Díaz Menéndez
- Marta Lamata Subero
- Marta Miarons
- Marta Mora Rillo
- Marta Navarro Vilasaró
- Marta Rava
- Marta Rico Rodríguez
- Marta Robledo del Prado
- Marta Ruiz-Alguero
- Marta Santos Peña
- Marta Vizcaíno Callejón
- María Aroca Ferri
- María Aránzazu Galindo Martín
- María Carmen Fariñas Álvarez
- María Cecilia Cánepa
- María de la Luz Padilla Salazar
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- María del Mar Alonso Socas
- María Dolores Avilés
- María E. García-Leoni
- María Isabel Quijano Contreras
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- María José Blanco Vidal
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- María Larrosa
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- María Luisa Machado Sicilia
- María López-Jódar
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- María Novella Mena
- María Paz García Butenegro
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- 'Elsevier BV'
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