Biomolecules

Bordeaux Region Aquitaine Initiative for Neuroscienc

Molecular dynamics simulations of glassy polymers

We review recent results from computer simulation studies of polymer glasses, from chain dynamics around the glass transition temperature Tg to the mechanical behaviour below Tg. These results clearly show that modern computer simulations are able to address and give clear answers to some important issues in the field, in spite of the obvious limitations in terms of length and time scales. In the present review we discuss the cooling rate effects, and dynamic slowing down of different relaxation processes when approaching Tg for both model and chemistry-specific polymer glasses. The impact of geometric confinement on the glass transition is discussed in detail. We also show that computer simulations are very useful tools to study structure and mechanical response of glassy polymers. The influence of large deformations on mechanical behaviour of polymer glasses in general, and strain hardening effect in particular are reviewed. Finally, we suggest some directions for future research, which we believe will be soon within the capabilities of state of the art computer simulations, and correspond to problems of fundamental interest.Comment: To apear in "Soft Matter

Consensus on circulatory shock and hemodynamic monitoring. Task force of the European Society of Intensive Care Medicine.

OBJECTIVE: Circulatory shock is a life-threatening syndrome resulting in multiorgan failure and a high mortality rate. The aim of this consensus is to provide support to the bedside clinician regarding the diagnosis, management and monitoring of shock. METHODS: The European Society of Intensive Care Medicine invited 12 experts to form a Task Force to update a previous consensus (Antonelli et al.: Intensive Care Med 33:575-590, 2007). The same five questions addressed in the earlier consensus were used as the outline for the literature search and review, with the aim of the Task Force to produce statements based on the available literature and evidence. These questions were: (1) What are the epidemiologic and pathophysiologic features of shock in the intensive care unit ? (2) Should we monitor preload and fluid responsiveness in shock ? (3) How and when should we monitor stroke volume or cardiac output in shock ? (4) What markers of the regional and microcirculation can be monitored, and how can cellular function be assessed in shock ? (5) What is the evidence for using hemodynamic monitoring to direct therapy in shock ? Four types of statements were used: definition, recommendation, best practice and statement of fact. RESULTS: Forty-four statements were made. The main new statements include: (1) statements on individualizing blood pressure targets; (2) statements on the assessment and prediction of fluid responsiveness; (3) statements on the use of echocardiography and hemodynamic monitoring. CONCLUSIONS: This consensus provides 44 statements that can be used at the bedside to diagnose, treat and monitor patients with shock

Kinesin-1 and dynein at the nuclear envelope mediate the bidirectional migrations of nuclei

The molecular motors kinesin-1 dynein navigate migrating nuclei around cytoplasmic roadblocks

Genome-wide association study identifies multiple susceptibility loci for glioma

Previous genome-wide association studies (GWASs) have shown that common genetic variation contributes to the heritable risk of glioma. To identify new glioma susceptibility loci, we conducted a meta-analysis of four GWAS (totalling 4,147 cases and 7,435 controls), with imputation using 1000 Genomes and UK10K Project data as reference. After genotyping an additional 1,490 cases and 1,723 controls we identify new risk loci for glioblastoma (GBM) at 12q23.33 (rs3851634, near POLR3B, P=3.02 × 10−9) and non-GBM at 10q25.2 (rs11196067, near VTI1A, P=4.32 × 10−8), 11q23.2 (rs648044, near ZBTB16, P=6.26 × 10−11), 12q21.2 (rs12230172, P=7.53 × 10−11) and 15q24.2 (rs1801591, near ETFA, P=5.71 × 10−9). Our findings provide further insights into the genetic basis of the different glioma subtypes

Bringing KASH under the SUN: the many faces of nucleo-cytoskeletal connections

The nucleus is the most prominent cellular organelle, and its sharp boundaries suggest the compartmentalization of the nucleoplasm from the cytoplasm. However, the recent identification of evolutionarily conserved linkers of the nucleoskeleton to the cytoskeleton (LINC) complexes, a family of macromolecular assemblies that span the double membrane of the nuclear envelope, reveals tight physical connections between the two compartments. Here, we review the structure and evolutionary conservation of SUN and KASH domain–containing proteins, whose interaction within the perinuclear space forms the “nuts and bolts” of LINC complexes. Moreover, we discuss the function of these complexes in nuclear, centrosomal, and chromosome dynamics, and their connection to human disease

Optics and Quantum Electronics

Contains table of contents for Section 3 and reports on twenty-three research projects.Joint Services Electronics Program Contract DAAL03-92-C-0001U.S. Air Force - Office of Scientific Research Contract F49620-91-C-0091Charles S. Draper Laboratories Contract DL-H-441629MIT Lincoln LaboratoryNational Science Foundation Grant ECS 90-12787Fujitsu LaboratoriesU.S. Navy - Office of Naval Research Grant N00014-92-J-1302National Center for Integrated PhotonicsNational Center for Integrated Photonics TechnologyNational Science Foundation Grant EET 88-15834Joint Services Electronics Program Contract DAAL03-91-C-0001National Science Foundation Fellowship ECS-85-52701U.S. Navy - Office of Naval Research (MGH) Contract N00014-91-C-0084U.S. Navy - Office of Naval Research Grant N00014-91-J-1956National Institutes of Health Grant NIH-5-RO1-GM35459-08Bose CorporationLawrence Livermore National Laboratories Subcontract B160530U.S. Department of Energy Grant DE-FG02-89-ER14012Rockwell International CorporationSpace Exploration AssociatesFuture Energy Applied Technology, Inc

A search for neutrino emission from the Fermi bubbles with the ANTARES telescope

Analysis of the Fermi-LAT data has revealed two extended structures above and below the Galactic Centre emitting gamma rays with a hard spectrum, the so-called Fermi bubbles. Hadronic models attempting to explain the origin of the Fermi bubbles predict the emission of high-energy neutrinos and gamma rays with similar fluxes. The ANTARES detector, a neutrino telescope located in the Mediterranean Sea, has a good visibility to the Fermi bubble regions. Using data collected from 2008 to 2011 no statistically significant excess of events is observed and therefore upper limits on the neutrino flux in TeV range from the Fermi bubbles are derived for various assumed energy cutoffs of the source

Caractéristiques cliniques et pronostic des états de mal convulsifs de 132 enfants (étude rétrospective sur 8 ans)

LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Rôle de la réaction inflammatoire sur les conséquences des crises épileptiques dans le cerveau immature murin

L'épilepsie du lobe temporale est l'épilepsie la plus fréquente à l'age adulte. Elle est fréquemment associée à une modification anatomique : la sclérose hippocampique. Les études épidémiologiques suggèrent que les convulsions fébriles (CF) dans l'enfance puissent être un facteur favorisant l'apparition d'une épilepsie temporale avec sclérose hippocampique. Bien que ces études ne soient pas toutes concordantes, il semble que les CF prolongées puissent plus particulièrement être impliqués. Les mécanismes qui sont responsables de la survenue de CF sont multiples. On pense actuellement que l'association de plusieurs de ces facteurs concoures au CF, sans que la conjonction de ces facteurs soient identique chez chaque sujet. Les facteurs incriminés sont l'immaturité cérébrale, la température corporelle, la réaction inflammatoire, des prédispositions génétiques et peut être certains agents infectieux viraux. Notre hypothèse de travail était que la réaction inflammatoire module les conséquences des crises épileptiques. Nous avons ainsi utilisé deux modèles murins de crises épileptiques. Nous avons d'une part modélisée des crises courtes induites par l'hyperthermie et d'autre part des crises prolongées par des modèles d'état de mal épileptiques chez le raton. MATERIELS ET METHODES : Nous avons utilisé un modèle de crise induite par l'hyperthermie chez des ratons de 11 et 16 jours et un modèle d'état de mal épileptique (EME) (lithium-pilocarpine) chez des ratons de 7 et 14 jours. Pour le modèle de crise hyperthermique, les crises étaient induites par une lampe chauffante. Une fois la crise commencée, la température corporelle était maintenue pour une durée de 5 minutes. Pour le modèle lithium-pilocarpine, les ratons recevaient 3mEq/kg s.c. de ClLi 16 à 20 h avant l'induction de l'EME par 100 mg/kg s.c. de pilocarpine à P7 et 60 mg/kg s.c. de pilocarpine à P14. Dans ces modèles, une réaction inflammatoire était induite par une injection de lipopolysaccharide (LPS) i.p. 2 heures avant l'induction de l'événement épileptique. Les rats étaient sacrifiés à 24 heures, les hippocampes étaient étudies sur des coupes de 8 microns. La coloration par Hematoxiline-Eosine lue en fluorescence permettait d'établir un compte des neurones éosinophilies, marqueur de mort neuronale. D'autres marqueurs de mort neuronales étaient utilisés pour confirmer ces lésions cellulaires : Fluorojade-B et TUNEL. Un seuil au pentylenetetrazol s'était réalisé à 30 jours de la crise hyperthermique pour les animaux concernés. RESULTATS : La présence d'une réaction inflammatoire n'induit pas de souffrance cellulaire dans le modèle des crises hyperthermiques alors qu'une augmentation du nombre de mort cellulaire est notée dans le modèle lithium pilocarpine. L'injection de LPS seule n'induisait pas de mort cellulaire. Dans le modèle lithium pilocarpine, la durée de l'état de mal et la température corporelle n'expliquait pas les différences observées. Dans le modèle hyperthermique, le seuil au pentylenetetrazol suggère qu'une réaction inflammatoire associe à une crise courte est responsable d'une modification prolongée de l'excitabilité cérébrale. L'évaluation au long terme après état de mal épileptique est en cours. CONCLUSION : Il semble donc que la réaction inflammatoire concomitante est un phénomène épileptique modifie les conséquences sur le cerveau immature. On notera d'une part une augmentation des morts cellulaires lors de l'EME et d'autre part une modification de l'excitabilité cérébrale au long terme avec le modèle de crise courte hyperthermique. La réaction inflammatoire influence les conséquences des phénomènes épileptiques sur le cerveau immature.LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF