470 research outputs found

    Cargo Transport: Two Motors Are Sometimes Better Than One

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    Molecular motor proteins are crucial for the proper distribution of organelles and vesicles in cells. Much of our current understanding of how motors function stems from studies of single motors moving cargos in vitro. More recently, however, there has been mounting evidence that the cooperation of multiple motors in moving cargos and the regulation of motor–filament affinity could be key mechanisms that cells utilize to regulate cargo transport. Here, we review these recent advances and present a picture of how the different mechanisms of regulating the number of motors moving a cargo could facilitate cellular functions

    Avaliação de interfaces de comunicação USB em cluster de computadores

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    Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação.A computação de alto desempenho sempre fascinou os experimentadores de hardware. A busca incessante por performance conduziu diversos projetos de computação cooperativa, e nesse cenário os CLUSTER obtiveram lugar de destaque. Através da análise de testes de desempenho, podemos argumentar que as conexões em rede utilizando-se de ligações PCI em máquinas heterogêneas pode ser uma solução viável e de baixo custo. Porém o padrão USB, com sua flexibilidade e conectividade, poderá substituir as atuais placas de redes Ethernet e Fast-Ethernet baseadas no barramento PCI, em vários outros ambientes CLUSTERS. Nesse trabalho será abordado o assunto CLUSTER no seu ponto mais fraco: as interfaces de conexão. No capítulo 2 é apresentado os modelos conceituais de hardware em sistemas distribuídos e os respectivos modelos baseados na Taxonomia de Flynn. O capitulo 3 explora as principais tecnologia em protocolos de comunicação internet e os de baixa latência, bem como o hardware necessário para a montagem e configuração de ambientes de multicomputadores. O capitulo 4 cita as redes de interconexão e seus tipos. No capitulo 5 é apresentado o Multicomputador CRUX, a sua arquitetura de funcionamento e de hardware. No capitulo 6 é apresentado o barramento USB e todas as suas características técnicas, a forma como a comunicação serial funciona no USB e como o Linux trata os pacotes USB-Ethernet. O capítulo 7 apresenta os resultados de desempenho após os testes com os periféricos USB e os cenários de implementação do Multicomputador CRUX ligado por USB

    Classical, novel and atypical isoforms of PKC stimulate ANF- and TRE/AP-1-regulated-promoter activity in ventricular cardiomyocytes

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    Cultured neonatal rat ventricular myocytes were co-transfected with expression plasmids encoding protein kinase C (PKC) isoforms from each of the PKC subfamilies (classical PKC-α, novel PKC-ε or atypical PKC-ξ) together with an atrial natriuretic factor (ANF) reporter plasmid. Each PKC had been rendered constitutively active by a single Ala→Glu mutation or a small deletion in the inhibitory pseudosubstrate site. cPKC-α, nPKC-ε or aPKC-ξ expression plasmids each stimulated ANF-promoter activity and expression of a reporter gene under the control of a 12-O-tetradecanoylphorbol 13-acetate-response element (TRE). Upregulation of the ANF promoter is characteristic of the hypertrophic response in the heart ventricle and a TRE is present in the ANF promoter. Thus all subfamilies of PKC may have the potential to contribute to hypertrophic response in cardiomyocytes

    On the use of thermal forces to probe kinesin’s response to force

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    The stepping dynamics of cytoskeletal motor proteins determines the dynamics of cargo transport. In its native cellular environment, a molecular motor is subject to forces from several sources including thermal forces and forces ensuing from the interaction with other motors bound to the same cargo. Understanding how the individual motors respond to these forces can allow us to predict how they move their cargo when part of a team. Here, using simulation, we show that details of how the kinesin motor responds to small assisting forces–which, at the moment, are not experimentally constrained-can lead to significant changes in cargo dynamics. Using different models of the force-dependent detachment probability of the kinesin motor leads to different predictions on the run-length of the cargo they carry. These differences emerge from the thermal forces acting on the cargo and transmitted to the motor through the motor tail that tethers the motor head to the microtubule. We show that these differences appear for cargo carried by individual motors or motor teams, and use our findings to propose the use of thermal forces as a probe of kinesin’s response to force in this otherwise inaccessible force regime
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