Description of the first species of gall wasp (Hym., Cynipidae: Cynipini) and other unknown galls on Quercus macdougallii (Fagaceae)

Es descriu de Mèxic una nova espècie de cinípid de roures, Neuroterus chinanteco Pujade-Villar & Clark n. sp., coneguda només a partir de la seva generació sexual que indueix gales a les fulles de Quercus macdougallii Martínez (secció Quercus). Quercus macdougallii és una espècie poc coneguda, endèmica d’Oaxaca i poc comú (localitzada entre els 2700-3000 m), en perill d’extinció (inclosa a la Llista Vermella de la UICN). Es donen dades referents a la diagnosi, la distribució i la biologia d’aquesta nova espècie. Neuroterus chinanteco Pujade-Villar & Clark n. sp. representa la primera espècie esmentada en aquest hostatger. També s’il·lustren altres gales col·lectades en Q. macdougallii de les quals només s’han obtingut inquilins i/o parasitoides.A new species of oak gallwasp, Neuroterus chinanteco Pujade-Villar & Clark n. sp., known only from its sexual generation that induces galls on the leaves of Quercus macdougallii Martínez, (section Quercus) is described. Quercus macdougallii is a poorly known species, endemic to Oaxaca and rare (located between 2700-3000 m a.s.l.), endangered (included in the IUCN Red List). Diagnosis, distribution and data on biology of the new species are given. Neuroterus chinanteco Pujade-Villar & Clark n. sp. represents the first species mentioned on this oak host. Other galls collected on Q. macdougallii from which only inquilines and/or parasitoids have been obtained are also illustrated

Registros recientes de felinos en el bosque de niebla en Santiago Comaltepec, Sierra Norte de Oaxaca, México

We confirm the presence of four big cats, Panthera onca, Puma concolor, Leopardus pardalis and Leopardus wiedii in cloud forest on La Esperanza community lands, Santiago Comaltepec, Oaxaca. Camera traps were used to evaluate the presence of these species in two transects of 2.5 km and 1.5 km respectively, from August of 2014 to February of 2016. This information is necessary for the conservation in situ of these species.RESUMEN. Se confirma la presencia de cuatro grandes felinos, Panthera onca, Puma concolor, Leopardus pardalis y Leopardus wiedii, en el bosque de niebla de la comunidad La Esperanza, Santiago Comaltepec, Oaxaca. Se usó fototrampeo para evaluar la presencia de estas especies en dos transectos de 2.5 y 1.5 km respectivamente, desde agosto de 2014 a febrero de 2016. Esta información es necesaria para la conservación in situ de estas especies.

Diversidad y riqueza herpetofaunística asociada al bosque de manejo forestal y áreas de cultivo, en Ixtlán de Juárez, Oaxaca; Herpetofaunistic diversity and richness in forest management and plantation areas in Ixtlán de Juárez, Oaxaca

Los bosques templados de Ixtlán de Juárez, Oaxaca, han estado sujetos a manejo forestal por más de 50 años; el efecto que dicha modificación tiene en los grupos de anfibios y reptiles necesita ser evaluado. El objetivo de este estudio fue analizar la abundancia, distribución y riqueza de especies de anfibios y reptiles en zonas agrícolas, y en áreas de bosque con manejo forestal (BMF). El BMF presenta franjas alteradas (FA), en la cual se ha removido la cobertura vegetal, y franjas conservadas (FC), donde predomina la vegetación de pino-encino. De acuerdo a nuestras estimaciones fue posible registrar el 76% de las especies presentes. En todo el estudio identificamos 37 especies, agrupadas en 25 géneros y 11 familias, lo que representa el 8.37% de las especies presentes en Oaxaca. En el BMF identificamos 15 especies, de las cuales 13 son reptiles y dos son anfibios. La FA tuvo nueve especies, mientras que en la FC registramos ocho especies. En las AM registramos 31 especies, agrupadas en 22 géneros y 10 familias. Las zonas con mayor diversidad fueron las AM y las FA en comparación con las FC en donde la diversidad de especies fue menor. A pesar de que las FC y FA son colindantes la similitud fue mayor entre las AM, las cuales tienen más de 50 años de haber sido perturbadas, y las FA, las cuales han sido recientemente modificadas. Las prácticas de manejo forestal que caracterizan a Ixtlán de Juárez han promovido la interconectividad entre las zonas evitando, en cierta medida, una modificación en el ensamble natural de la herpetofauna. Se recomienda continuar con el monitoreo espacial y temporal de la herpetofauna no solamente en áreas naturales, sino también en las áreas de manejo forestal y modificadas que no han perdido conectividad con las zonas conservadas o de manejo forestal.Los bosques templados de Ixtlán de Juárez, Oaxaca, han estado sujetos a manejo forestal por más de 50 años; el efecto que dicha modificación tiene en los grupos de anfibios y reptiles necesita ser evaluado. El objetivo de este estudio fue analizar la abundancia, distribución y riqueza de especies de anfibios y reptiles en zonas agrícolas, y en áreas de bosque con manejo forestal (BMF). El BMF presenta franjas alteradas (FA), en la cual se ha removido la cobertura vegetal, y franjas conservadas (FC), donde predomina la vegetación de pino-encino. De acuerdo a nuestras estimaciones fue posible registrar el 76% de las especies presentes. En todo el estudio identificamos 37 especies, agrupadas en 25 géneros y 11 familias, lo que representa el 8.37% de las especies presentes en Oaxaca. En el BMF identificamos 15 especies, de las cuales 13 son reptiles y dos son anfibios. La FA tuvo nueve especies, mientras que en la FC registramos ocho especies. En las AM registramos 31 especies, agrupadas en 22 géneros y 10 familias. Las zonas con mayor diversidad fueron las AM y las FA en comparación con las FC en donde la diversidad de especies fue menor. A pesar de que las FC y FA son colindantes la similitud fue mayor entre las AM, las cuales tienen más de 50 años de haber sido perturbadas, y las FA, las cuales han sido recientemente modificadas. Las prácticas de manejo forestal que caracterizan a Ixtlán de Juárez han promovido la interconectividad entre las zonas evitando, en cierta medida, una modificación en el ensamble natural de la herpetofauna. Se recomienda continuar con el monitoreo espacial y temporal de la herpetofauna no solamente en áreas naturales, sino también en las áreas de manejo forestal y modificadas que no han perdido conectividad con las zonas conservadas o de manejo forestal

A new genus of oak gall wasp, Striatoandricus Pujade-Villar (Hyenoptera: Cynipidae: Cynipini) from Americ with descriptions of two new Mexican species

A new genus of cynipid oak gall wasp, Striatoandricus Pujade-Villar (Hymenoptera: Cynipidae: Cynipini), is described. Striatoandricus gen. nov. includes four previously described species, Andricus nievesaldreyi n. comb., A. georgei n. comb., A. maesi n. comb., and A. barriosi n. comb., which induce pubescent leaves or twig galls on Quercus belonging to Quercus section. Two new species from México are also described: S. cuixarti Pujade-Villar n. sp. and S. sanchezi Pujade-Villar n. sp. in Quercus section. Descriptions of the genus and diagnostic characters, including DNA sequence data, are presented. This new genus is supported by both morphological and molecular data

Abundancia y distribución de agallas foliosas en Quercus resinosa Liemb. (Fagaceae) en Aguascalientes, México

Las agallas son estructuras de crecimiento anormal en los tejidos de las plantas debido a la actividad parasítica de otro organismo. El estudio de este tipo de estructuras como microhábitat de avispas es escaso en la literatura y no se presenta una descripción detallada de su conformación. En este trabajo se describe la anatomía y morfología de las agallas foliosas, y se evalúan los factores que restringen su abundancia y distribución a nivel foliar, individual y poblacional en los encinosQuercus resinosa. Se encontró que la agalla es generada por una avispa de la familia Cynipidae, específica deQuercus resinosaLiemb. A nivel foliar, las agallas presentan características anatómicas y morfológicas similares a las del hospedero. A nivel del individuo, el 72.52% de las agallas están ubicadas en el envés de la hoja, mientras que sólo el 27.48% de estas estructuras se forman en el haz. A nivel de la población, el número de agallas varía de una a diez agallas por árbol. En promedio, cada árbol puede tener 4.88 ± 2.34 agallas. Los árboles mayormente infectados son los de categorías intermedias (X2=9.67;

Search for dark matter produced in association with bottom or top quarks in √s = 13 TeV pp collisions with the ATLAS detector

A search for weakly interacting massive particle dark matter produced in association with bottom or top quarks is presented. Final states containing third-generation quarks and miss- ing transverse momentum are considered. The analysis uses 36.1 fb−1 of proton–proton collision data recorded by the ATLAS experiment at √s = 13 TeV in 2015 and 2016. No significant excess of events above the estimated backgrounds is observed. The results are in- terpreted in the framework of simplified models of spin-0 dark-matter mediators. For colour- neutral spin-0 mediators produced in association with top quarks and decaying into a pair of dark-matter particles, mediator masses below 50 GeV are excluded assuming a dark-matter candidate mass of 1 GeV and unitary couplings. For scalar and pseudoscalar mediators produced in association with bottom quarks, the search sets limits on the production cross- section of 300 times the predicted rate for mediators with masses between 10 and 50 GeV and assuming a dark-matter mass of 1 GeV and unitary coupling. Constraints on colour- charged scalar simplified models are also presented. Assuming a dark-matter particle mass of 35 GeV, mediator particles with mass below 1.1 TeV are excluded for couplings yielding a dark-matter relic density consistent with measurements

Finishing the euchromatic sequence of the human genome

The sequence of the human genome encodes the genetic instructions for human physiology, as well as rich information about human evolution. In 2001, the International Human Genome Sequencing Consortium reported a draft sequence of the euchromatic portion of the human genome. Since then, the international collaboration has worked to convert this draft into a genome sequence with high accuracy and nearly complete coverage. Here, we report the result of this finishing process. The current genome sequence (Build 35) contains 2.85 billion nucleotides interrupted by only 341 gaps. It covers ∼99% of the euchromatic genome and is accurate to an error rate of ∼1 event per 100,000 bases. Many of the remaining euchromatic gaps are associated with segmental duplications and will require focused work with new methods. The near-complete sequence, the first for a vertebrate, greatly improves the precision of biological analyses of the human genome including studies of gene number, birth and death. Notably, the human enome seems to encode only 20,000-25,000 protein-coding genes. The genome sequence reported here should serve as a firm foundation for biomedical research in the decades ahead

Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals <1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data