rouskinlab/seismic-rna: v0.10.0

<h1>What's new in 0.10.0?</h1> <h2>Features</h2> <ul> <li><p>Five new types of graphs:</p> <ul> <li><code>histpos</code>: histogram of mutations per position</li> <li><code>histread</code>: histogram of mutations per read</li> <li><code>roc</code>: receiver operating characteristic (ROC)</li> <li><code>aucroll</code>: rolling area under the curve of ROC</li> <li><code>corroll</code>: rolling correlation/comparison between profiles</li> </ul> </li> <li><p>Graphs <code>seqbar</code> and <code>diffbar</code> were renamed to <code>profile</code> and <code>delprof</code>, respectively.</p> </li> <li><p>Graphs that compare pairs of tables (<code>corroll</code>, <code>delprof</code>, and <code>scatter</code>) can now compare all combinations of 2 tables from a list (with <code>--comppair</code>) as well as compare each table to itself (with <code>--compself</code>).</p> </li> </ul> <h2>Documentation</h2> <ul> <li>Documentation for how to use the main workflow is now up to date.</li> </ul> <h2>What's Changed</h2> <ul> <li>0.10.0 by @matthewfallan in https://github.com/rouskinlab/seismic-rna/pull/9</li> </ul> <p><strong>Full Changelog</strong>: https://github.com/rouskinlab/seismic-rna/compare/v0.9.8...v0.10.0</p&gt

Ta'lim jarayoniga raqamli texnologiyalarni joriy etish aspektlari

<p>Bugun jamiyatda raqamli texnologiyalarning ahamiyati tobora ortmoqda. Ta'limning texnologik yaxshilanishi talabalar hayotini osonlashtirdi. Bugungi kunda talabalar qalam va qog'ozdan foydalanish o'rniga taqdimotlar va loyihalarni yaratish uchun turli xil dasturiy ta'minot va vositalardan foydalanadilar, og'ir kitobdan farqli o'laroq, elektron kitobni olib yurish osonroq, ular o’zlariga kerakli bo’lgan ma’lumotlarni gadjetlari orqali bevosita internet tarmog’idan ko’rib chiqishlari yoki bir vaqtni o’zida ikkita va undan ortiq oliy o’quv yurtlarida ta’lim olishlari imkoniyati yaratilyapti. Ushbu maqola ta'limda raqamli texnologiyalarga bo'lgan ehtiyoj haqida qisqacha ma'lumot beradi va ta'limdagi asosiy dasturlar va muammolarni muhokama qiladi.</p&gt

Issues of Russian language teaching and differentiated exercises for the development of written speech of non philology students

<p>The article analyzes the issue of a differentiated approach to education and the types of differentiated education in secondary specialized education. The profile and level differentiation in education is proposed as a means of improving the quality of professional education in military academic lyceums. The features of teaching Russian as a foreign language in military academic lyceums are highlighted.</p&gt

Thermal Chapter Data

<p>Data for chapter 3</p&gt

NHERI-SimCenter/BRAILS: Version 3.1.0

<p>Major Changes:</p> <ul> <li>Generate Transporartion Information for a region</li> <li>Revised FacadeParser that calculates dimensions from depth map as opposed to camera coordinates (which are proving to be inaccurate)</li> </ul&gt

weecology/PortalData: 5.35.0

<p>v5.35.0</p&gt

Futhark

<h2>Commits</h2> <ul> <li>58343e5: Add IxFun.range and use it. (Troels Henriksen)</li> </ul>If you use this software, please cite it as below

Malaria drives unique regulatory responses across multiple immune cells during human infection

Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from 6 individuals (age 6-24) with P. falciparum infection and 2 healthy adult endemic controls (ages 20 and 27) were collected before drug treatment (day 0) and at 7 and 28 days after treatment. PBMCs were isolated by Fluorescence-activated cell sorting (FACS) according to the presence or absence of XX signal, and analysed using droplet-based scRNAseq

Utilizzo di campi elettrici pulsati per aumentare il trasferimento di massa durante la marinatura/salagione di branzino

Abstract La ricerca di nuovi ingredienti per la formulazione di pesci da allevamento è un importante campo di ricerca in acquacoltura. Tuttavia, è importante verificare le performance tecnologiche dei prodotti ottenuti. I campioni di branzino utilizzati nella presente sperimentazione sono stati allevati con due diete biologiche formulate differentemente, la prima era di tipo tradizionale (commerciale), mentre la seconda era di tipo innovativo. L’obiettivo è stato quello di valutare l’effetto della dieta nella risposta all’applicazione di processi tecnologici quali applicazione di campi elettrici pulsati (PEF) e salamoiatura. Il pretrattamento PEF (0,3 kV/cm, 100 Hz, pulsi di 10 µs) aveva l’obiettivo di aumentare l’efficienza della fase di salamoiatura (immersione in soluzione al 10% di NaCl per 5 giorni). A tal fine sonio state valutate le cinetiche di trasferimento di massa e le principali caratteristiche qualitative dei campioni appartenenti alle due diete. Dai risultati ottenuti è possibile affermare che tra i due prodotti, derivanti da diete diverse, le differenze riscontrate sono state minime, sia in relazione ai parametri misurati sui prodotti freschi, sia in relazione alla risposta ai trattamenti tecnologici effettuati. A differenza di quanto riscontrato in studi precedenti, il PEF non ha migliorato la resa in peso ed acqua dopo salamoiatura, mentre solo nel prodotto innovativo si è verificato un aumento dell’assorbimento di sale, risultato che può indicare qualche differenza nella conformazione delle proteine che abbia facilitato la loro elettroporazione e pertanto la diffusione del sale nel tessuto. Tuttavia, risulta importante sottolineare le discrepanze osservate rispetto alle precedenti sperimentazioni che potrebbero imputarsi alla variabilità della materia prima. Questo aspetto merita un successivo approfondimento, in quanto potrebbe chiarire molte delle discrepanze riportate in letteratura relativamente all’applicazione dei PEF sui tessuti animali