Randomized Controlled Trial of Parent Therapeutic Education on Antibiotics to Improve Parent Satisfaction and Attitudes in a Pediatric Emergency Department

Objective: To evaluate therapeutic education delivered in a pediatric emergency department to improve parents’ satisfaction and attitudes about judicious antibiotic use. Methods: In an emergency department of a tertiary pediatric hospital, children aged 1 month to 6 years and discharged with an oral antibiotic prescription for an acute respiratory or urinary tract infection were randomized to a patient therapeutic education on antibiotic use (intervention group) or fever control (control group) delivered to the parents (in the presence of the children) by a pharmacist trained in therapeutic education. Education consisted in a 30-minute face-to-face session with four components: educational diagnosis, educational contract, education, and evaluation. The main outcome measure was parent satisfaction about information on antibiotics received at the hospital, as assessed by a telephone interview on day 14. The secondary outcome was attitudes about antibiotic use evaluated on day 14 and at month 6. Results: Of the 300 randomized children, 150 per arm, 259 were evaluated on day 14. Parent satisfaction with information on antibiotics was higher in the intervention group (125/129, 96.9%, versus 108/130, 83.0%; P=0.002, exact Fisher test). Intervention Group parents had higher proportions of correct answers on day 14 to questions on attitudes about judicious antibiotic use than did control-group parents (P=0.017, Mann-Whitney U test). Conclusion: Therapeutic education delivered by a clinical pharmacist in the pediatric emergency department holds promise for improving the use of antibiotics prescribed to pediatric outpatients. Trial Registration ClinicalTrials.gov NCT00948779 http://clinicaltrials.gov/show/NCT0094877

Tempo and drivers of plant diversification in the European mountain system

There is still limited consensus on the evolutionary history of species-rich temperate alpine floras due to a lack of comparable and high-quality phylogenetic data covering multiple plant lineages. Here we reconstructed when and how European alpine plant lineages diversified, i.e., the tempo and drivers of speciation events. We performed full-plastome phylogenomics and used multi-clade comparative models applied to six representative angiosperm lineages that have diversified in European mountains (212 sampled species, 251 ingroup species total). Diversification rates remained surprisingly steady for most clades, even during the Pleistocene, with speciation events being mostly driven by geographic divergence and bedrock shifts. Interestingly, we inferred asymmetrical historical migration rates from siliceous to calcareous bedrocks, and from higher to lower elevations, likely due to repeated shrinkage and expansion of high elevation habitats during the Pleistocene. This may have buffered climate-related extinctions, but prevented speciation along elevation gradients as often documented for tropical alpine floras

Modalités de recrutement des sujets dans la recherche en pédiatrie : étude prospective multicentrique

Contexte. - Une enquête qualitative exploratoire a montré que le nombre de patients éligibles et sollicités dans les essais en pédiatrie était peu objectivé ainsi que les refus. Objectif. - Estimer le nombre de refus de participation des familles dans les essais en pédiatrie et lier le taux de refus aux caractéristiques protocole, investigateur et patients. Matériel et méthodes. - Étude prospective multicentrique inter-CIC (réseau pédiatrique) d'une cohorte de protocoles. Pour chaque sollicitation à participer, des fiches patient, investigateur et protocole étaient remplies. Résultats. - L'étude a été réalisée de décembre 2005 à septembre 2007 sur quatre centres et a inclus 45 protocoles : 32 à promotion industrielle, 36 multicentriques, 19 essais cliniques, 33 avec prises de sang et six avec examens invasifs, 26 avec des déplacements spécifiques et 14 des hospitalisations supplémentaires. Sur ces protocoles, 170 investigateurs étaient référencés comme recruteurs et 86 (51 %) ont répondu au questionnaire : âge médian 42 ans, sex-ratio de 1, 13 sont investigateurs principal, 32 responsables pour le CIC et 50 investigateurs associés, 20 percevaient une rétribution versée au service dans 80 % des cas. La charge de travail médiane par investigateur était d'une heure par inclusion et 67 (78 %) bénéficiaient d'une aide d'une TEC. Au total, 1022 sollicitations ont été réalisées sur 36 protocoles (neuf protocoles n'ayant eu aucune sollicitation) et 334 refus (33 %) ont été enregistrés soit une médiane de 12 % (Q1Q3 : 0-28 %) de refus par protocole. Parmi les 36 protocoles, 16 n'ont enregistré aucun refus, représentant 147 sollicitations et les 20 autres protocoles ont eu un taux moyen de 38 % de refus. L'analyse explicative est en cours. Conclusion. - Le taux de refus de 12 % n'est pas différent de celui des essais adultes et semble dépendant du type d'étude. L'absence de sollicitation concerne 20 % des études

A new 3MW ECRH system at 105 GHz for WEST

The aim of the WEST experiments is to master long plasma pulses (1000s) and expose ITER-like tungsten wall to deposited heat fluxes up to 10 MW/m$^2$. To increase the margin to reach the H-Mode and to control W-impurities in the plasma, the installation of an upgraded ECRH heating system, with a gyrotron performance of 1MW/1000s per unit, is planned in 2023. With the modifications of Tore Supra to WEST, simulations at a magnetic field B$_0$∼3.7T and a central density n$_{e0}$∼6 × 10$^{19}$ m$^{−3}$ show that the optimal frequency for central absorption is 105 GHz. For this purpose, a 105 GHz/1MW gyrotron (TH1511) has been designed at KIT in 2021, based on the technological design of the 140 GHz/1.5 MW (TH1507U) gyrotron for W7-X. Currently, three units are under fabrication at THALES. In the first phase of the project, some of the previous Tore Supra Electron Cyclotron (EC) system components will be re-installed and re-used whenever possible. This paper describes the studies performed to adapt the new ECRH system to 105 GHz and the status of the modifications necessary to re-start the system with a challenging schedule

Incidence of Sarcoma Histotypes and Molecular Subtypes in a Prospective Epidemiological Study with Central Pathology Review and Molecular Testing

International audienceBACKGROUND: The exact overall incidence of sarcoma and sarcoma subtypes is not known. The objective of the present population-based study was to determine this incidence in a European region (Rhone-Alpes) of six million inhabitants, based on a central pathological review of the cases. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: From March 2005 to February 2007, pathology reports and tumor blocks were prospectively collected from the 158 pathologists of the Rhone-Alpes region. All diagnosed or suspected cases of sarcoma were collected, reviewed centrally, examined for molecular alterations and classified according to the 2002 World Health Organization classification. Of the 1287 patients screened during the study period, 748 met the criteria for inclusion in the study. The overall crude and world age-standardized incidence rates were respectively 6.2 and 4.8 per 100,000/year. Incidence rates for soft tissue, visceral and bone sarcomas were respectively 3.6, 2.0 and 0.6 per 100,000. The most frequent histological subtypes were gastrointestinal stromal tumor (18%; 1.1/100,000), unclassified sarcoma (16%; 1/100,000), liposarcoma (15%; 0.9/100,000) and leiomyosarcoma (11%; 0.7/100,000). CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: The observed incidence of sarcomas was higher than expected. This study is the first detailed investigation of the crude incidence of histological and molecular subtypes of sarcomas

Community-Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems

Predicting responses of plankton to variations in essential nutrients is hampered by limited in situ measurements, a poor understanding of community composition, and the lack of reference gene catalogs for key taxa. Iron is a key driver of plankton dynamics and, therefore, of global biogeochemical cycles and climate. To assess the impact of iron availability on plankton communities, we explored the comprehensive bio-oceanographic and bio-omics data sets from Tara Oceans in the context of the iron products from two state-of-the-art global scale biogeochemical models. We obtained novel information about adaptation and acclimation toward iron in a range of phytoplankton, including picocyanobacteria and diatoms, and identified whole subcommunities covarying with iron. Many of the observed global patterns were recapitulated in the Marquesas archipelago, where frequent plankton blooms are believed to be caused by natural iron fertilization, although they are not captured in large-scale biogeochemical models. This work provides a proof of concept that integrative analyses, spanning from genes to ecosystems and viruses to zooplankton, can disentangle the complexity of plankton communities and can lead to more accurate formulations of resource bioavailability in biogeochemical models, thus improving our understanding of plankton resilience in a changing environment

Convergent genetic and expression data implicate immunity in Alzheimer's disease

Background Late–onset Alzheimer's disease (AD) is heritable with 20 genes showing genome wide association in the International Genomics of Alzheimer's Project (IGAP). To identify the biology underlying the disease we extended these genetic data in a pathway analysis. Methods The ALIGATOR and GSEA algorithms were used in the IGAP data to identify associated functional pathways and correlated gene expression networks in human brain. Results ALIGATOR identified an excess of curated biological pathways showing enrichment of association. Enriched areas of biology included the immune response (p = 3.27×10-12 after multiple testing correction for pathways), regulation of endocytosis (p = 1.31×10-11), cholesterol transport (p = 2.96 × 10-9) and proteasome-ubiquitin activity (p = 1.34×10-6). Correlated gene expression analysis identified four significant network modules, all related to the immune response (corrected p 0.002 – 0.05). Conclusions The immune response, regulation of endocytosis, cholesterol transport and protein ubiquitination represent prime targets for AD therapeutics

Etude du mécanisme catalytique de la lipoxygenase 1 d’olive

Lipoxygenases (LOXs, EC 1.13.11.12) are widespread dioxygenases containing a non heminic iron atom. In plants, LOXs are at the beginning of a metabolic pathway involved in several physiological processes and in the response to environmental stress. A LOX initiates the pathway, catalyzing a regiospecific and stereospecific insertion of oxygen on the pentadiene system of a free polyunsaturated fatty acid (linoleic or linolenic acid) to form fatty acid hydroperoxides.An olive lipoxygenase called olive LOX1, cloned at laboratory, has been expressed in E. coli strain and purified. Olive LOX1 produces 9S-hydroperoxides of and 13R-hydroperoxides from linoleic acid, in a ratio of 2:1, being the only plant LOX to produce R-hydroperoxides described to date. From the currently known models explaining the control of reactional specificity, none can be applied to olive LOX1. A three-dimensional model has been built by homology modeling to understand the catalytic mechanism of olive LOX1. Site-directed mutagenesis experiments have been used to modify two residues of particular interest, the phenylalanine 277 and the tyrosine 280, allowing us to point the active site entrance near these two residues. Other residues of interest have been modified to study their role in the catalytic mechanism and the reactional specificity of olive LOX1. The results have led us to propose a first hypothesis for the reactional mechanism of this enzyme: the substrate could enter into the active site with its carboxylate-end first, and could be stabilized in the active site by hydrophobic side chains of several residues. A channel could bring oxygen into the active site at a position near the side chain of the leucine 579 residue, this one targeting oxygen onto the pentadiene system of the substrate, controlling by this way the reactional specificity of olive LOX1.LOX are involved in oxylipins synthesis. Arabidopsides are a class of oxylipins found in Arabidopsis that could be produced by action of a 13-LOX on galactolipids, which carry esterified fatty acids. Activity of soybean 13-LOX, olive 9/13-LOX1 and potato 9-LOX has been investigated with galactolipids. A low activity was measured when soybean and olive LOXs were used. Activity was far more important when potato LOX was used. These results suggest that LOX can act on esterified fatty acids, especially galactolipids.Les lipoxygénases (LOX, EC 1.13.11.12) sont des dioxygénases à fer non héminique très répandues. Chez les végétaux, ces enzymes sont à l’origine d’une voie métabolique impliquée dans de nombreux processus physiologiques, mais aussi dans la réponse à un stress environnemental. La LOX initie la voie en catalysant l’incorporation régiospécifique et stéréospécifique de dioxygène sur le système pentadiénique d’un acide gras libre polyinsaturé (préférentiellement l’acide linoléique ou l’acide linolénique) pour générer un hydroperoxyde d’acide gras.Une lipoxygénase d’olive appelée LOX1, clonée au laboratoire, a été exprimée chez E. coli et purifiée. Elle produit à partir d’acide linoléique des hydroperoxydes de configuration 9S et 13R dans des proportions 2:1. Elle est la seule lipoxygénase végétale décrite à ce jour produisant des hydroperoxydes de configuration R. Les modèles proposés pour expliquer le contrôle de la spécificité réactionnelle des LOX ne s’appliquent pas à la LOX1 d’olive. Afin de mieux comprendre son mécanisme de fonctionnement, un modèle tridimensionnel de la LOX1 d’olive a été construit. La modification par mutagénèse dirigée de deux résidus particuliers, la phénylalanine 277 et la tyrosine 280, a permis d’identifier l’entrée du site actif de la LOX1 d’olive. D’autres résidus particuliers ont été modifiés par mutagénèse dirigée afin d’étudier leur rôle dans le mécanisme catalytique et le contrôle de la spécificité réactionnelle de la LOX1 d’olive. L’analyse globale des résultats obtenus a permis de proposer une première hypothèse quant au fonctionnement de cette enzyme : le substrat pénètrerait dans le site actif de la LOX1 d’olive par son extrémité carboxylate, et serait stabilisé dans le site actif par plusieurs résidus hydrophobes. Un canal pourrait cibler l’oxygène dans le site actif par l’intermédiaire du résidu L579 sur le système pentadiénique du substrat, contrôlant de cette manière la spécificité réactionnelle de la LOX1 d’olive.Par ailleurs, des oxylipines retrouvées chez Arabidopsis, appelées arabidopsides, pourraient être formées par action directe d’une 13-LOX sur des acides gras estérifiés des galactolipides. L’action de la 13-LOX1 de soja, la 9/13-LOX1 d’olive et la 9-LOX de pomme de terre a été testée avec des galactolipides. Une faible activité a été mesurée avec la 13-LOX1 de soja et la 9/13-LOX1 d’olive. Une activité plus importante a été mesurée avec la 9-LOX de pomme de terre. Ces résultats suggèrent que l’action des LOX est possible sur des acides gras estérifiés des galactolipides

Etude du mécanisme catalytique de la lipoxygenase 1 d’olive

Lipoxygenases (LOXs, EC 1.13.11.12) are widespread dioxygenases containing a non heminic iron atom. In plants, LOXs are at the beginning of a metabolic pathway involved in several physiological processes and in the response to environmental stress. A LOX initiates the pathway, catalyzing a regiospecific and stereospecific insertion of oxygen on the pentadiene system of a free polyunsaturated fatty acid (linoleic or linolenic acid) to form fatty acid hydroperoxides.An olive lipoxygenase called olive LOX1, cloned at laboratory, has been expressed in E. coli strain and purified. Olive LOX1 produces 9S-hydroperoxides of and 13R-hydroperoxides from linoleic acid, in a ratio of 2:1, being the only plant LOX to produce R-hydroperoxides described to date. From the currently known models explaining the control of reactional specificity, none can be applied to olive LOX1. A three-dimensional model has been built by homology modeling to understand the catalytic mechanism of olive LOX1. Site-directed mutagenesis experiments have been used to modify two residues of particular interest, the phenylalanine 277 and the tyrosine 280, allowing us to point the active site entrance near these two residues. Other residues of interest have been modified to study their role in the catalytic mechanism and the reactional specificity of olive LOX1. The results have led us to propose a first hypothesis for the reactional mechanism of this enzyme: the substrate could enter into the active site with its carboxylate-end first, and could be stabilized in the active site by hydrophobic side chains of several residues. A channel could bring oxygen into the active site at a position near the side chain of the leucine 579 residue, this one targeting oxygen onto the pentadiene system of the substrate, controlling by this way the reactional specificity of olive LOX1.LOX are involved in oxylipins synthesis. Arabidopsides are a class of oxylipins found in Arabidopsis that could be produced by action of a 13-LOX on galactolipids, which carry esterified fatty acids. Activity of soybean 13-LOX, olive 9/13-LOX1 and potato 9-LOX has been investigated with galactolipids. A low activity was measured when soybean and olive LOXs were used. Activity was far more important when potato LOX was used. These results suggest that LOX can act on esterified fatty acids, especially galactolipids.Les lipoxygénases (LOX, EC 1.13.11.12) sont des dioxygénases à fer non héminique très répandues. Chez les végétaux, ces enzymes sont à l’origine d’une voie métabolique impliquée dans de nombreux processus physiologiques, mais aussi dans la réponse à un stress environnemental. La LOX initie la voie en catalysant l’incorporation régiospécifique et stéréospécifique de dioxygène sur le système pentadiénique d’un acide gras libre polyinsaturé (préférentiellement l’acide linoléique ou l’acide linolénique) pour générer un hydroperoxyde d’acide gras.Une lipoxygénase d’olive appelée LOX1, clonée au laboratoire, a été exprimée chez E. coli et purifiée. Elle produit à partir d’acide linoléique des hydroperoxydes de configuration 9S et 13R dans des proportions 2:1. Elle est la seule lipoxygénase végétale décrite à ce jour produisant des hydroperoxydes de configuration R. Les modèles proposés pour expliquer le contrôle de la spécificité réactionnelle des LOX ne s’appliquent pas à la LOX1 d’olive. Afin de mieux comprendre son mécanisme de fonctionnement, un modèle tridimensionnel de la LOX1 d’olive a été construit. La modification par mutagénèse dirigée de deux résidus particuliers, la phénylalanine 277 et la tyrosine 280, a permis d’identifier l’entrée du site actif de la LOX1 d’olive. D’autres résidus particuliers ont été modifiés par mutagénèse dirigée afin d’étudier leur rôle dans le mécanisme catalytique et le contrôle de la spécificité réactionnelle de la LOX1 d’olive. L’analyse globale des résultats obtenus a permis de proposer une première hypothèse quant au fonctionnement de cette enzyme : le substrat pénètrerait dans le site actif de la LOX1 d’olive par son extrémité carboxylate, et serait stabilisé dans le site actif par plusieurs résidus hydrophobes. Un canal pourrait cibler l’oxygène dans le site actif par l’intermédiaire du résidu L579 sur le système pentadiénique du substrat, contrôlant de cette manière la spécificité réactionnelle de la LOX1 d’olive.Par ailleurs, des oxylipines retrouvées chez Arabidopsis, appelées arabidopsides, pourraient être formées par action directe d’une 13-LOX sur des acides gras estérifiés des galactolipides. L’action de la 13-LOX1 de soja, la 9/13-LOX1 d’olive et la 9-LOX de pomme de terre a été testée avec des galactolipides. Une faible activité a été mesurée avec la 13-LOX1 de soja et la 9/13-LOX1 d’olive. Une activité plus importante a été mesurée avec la 9-LOX de pomme de terre. Ces résultats suggèrent que l’action des LOX est possible sur des acides gras estérifiés des galactolipides

Study of the catalytic mechanism of lipoxygenase 1 Olive

Les lipoxygénases (LOX, EC 1.13.11.12) sont des dioxygénases à fer non héminique très répandues. Chez les végétaux, ces enzymes sont à l’origine d’une voie métabolique impliquée dans de nombreux processus physiologiques, mais aussi dans la réponse à un stress environnemental. La LOX initie la voie en catalysant l’incorporation régiospécifique et stéréospécifique de dioxygène sur le système pentadiénique d’un acide gras libre polyinsaturé (préférentiellement l’acide linoléique ou l’acide linolénique) pour générer un hydroperoxyde d’acide gras.Une lipoxygénase d’olive appelée LOX1, clonée au laboratoire, a été exprimée chez E. coli et purifiée. Elle produit à partir d’acide linoléique des hydroperoxydes de configuration 9S et 13R dans des proportions 2:1. Elle est la seule lipoxygénase végétale décrite à ce jour produisant des hydroperoxydes de configuration R. Les modèles proposés pour expliquer le contrôle de la spécificité réactionnelle des LOX ne s’appliquent pas à la LOX1 d’olive. Afin de mieux comprendre son mécanisme de fonctionnement, un modèle tridimensionnel de la LOX1 d’olive a été construit. La modification par mutagénèse dirigée de deux résidus particuliers, la phénylalanine 277 et la tyrosine 280, a permis d’identifier l’entrée du site actif de la LOX1 d’olive. D’autres résidus particuliers ont été modifiés par mutagénèse dirigée afin d’étudier leur rôle dans le mécanisme catalytique et le contrôle de la spécificité réactionnelle de la LOX1 d’olive. L’analyse globale des résultats obtenus a permis de proposer une première hypothèse quant au fonctionnement de cette enzyme : le substrat pénètrerait dans le site actif de la LOX1 d’olive par son extrémité carboxylate, et serait stabilisé dans le site actif par plusieurs résidus hydrophobes. Un canal pourrait cibler l’oxygène dans le site actif par l’intermédiaire du résidu L579 sur le système pentadiénique du substrat, contrôlant de cette manière la spécificité réactionnelle de la LOX1 d’olive.Par ailleurs, des oxylipines retrouvées chez Arabidopsis, appelées arabidopsides, pourraient être formées par action directe d’une 13-LOX sur des acides gras estérifiés des galactolipides. L’action de la 13-LOX1 de soja, la 9/13-LOX1 d’olive et la 9-LOX de pomme de terre a été testée avec des galactolipides. Une faible activité a été mesurée avec la 13-LOX1 de soja et la 9/13-LOX1 d’olive. Une activité plus importante a été mesurée avec la 9-LOX de pomme de terre. Ces résultats suggèrent que l’action des LOX est possible sur des acides gras estérifiés des galactolipides.Lipoxygenases (LOXs, EC 1.13.11.12) are widespread dioxygenases containing a non heminic iron atom. In plants, LOXs are at the beginning of a metabolic pathway involved in several physiological processes and in the response to environmental stress. A LOX initiates the pathway, catalyzing a regiospecific and stereospecific insertion of oxygen on the pentadiene system of a free polyunsaturated fatty acid (linoleic or linolenic acid) to form fatty acid hydroperoxides.An olive lipoxygenase called olive LOX1, cloned at laboratory, has been expressed in E. coli strain and purified. Olive LOX1 produces 9S-hydroperoxides of and 13R-hydroperoxides from linoleic acid, in a ratio of 2:1, being the only plant LOX to produce R-hydroperoxides described to date. From the currently known models explaining the control of reactional specificity, none can be applied to olive LOX1. A three-dimensional model has been built by homology modeling to understand the catalytic mechanism of olive LOX1. Site-directed mutagenesis experiments have been used to modify two residues of particular interest, the phenylalanine 277 and the tyrosine 280, allowing us to point the active site entrance near these two residues. Other residues of interest have been modified to study their role in the catalytic mechanism and the reactional specificity of olive LOX1. The results have led us to propose a first hypothesis for the reactional mechanism of this enzyme: the substrate could enter into the active site with its carboxylate-end first, and could be stabilized in the active site by hydrophobic side chains of several residues. A channel could bring oxygen into the active site at a position near the side chain of the leucine 579 residue, this one targeting oxygen onto the pentadiene system of the substrate, controlling by this way the reactional specificity of olive LOX1.LOX are involved in oxylipins synthesis. Arabidopsides are a class of oxylipins found in Arabidopsis that could be produced by action of a 13-LOX on galactolipids, which carry esterified fatty acids. Activity of soybean 13-LOX, olive 9/13-LOX1 and potato 9-LOX has been investigated with galactolipids. A low activity was measured when soybean and olive LOXs were used. Activity was far more important when potato LOX was used. These results suggest that LOX can act on esterified fatty acids, especially galactolipids