Antimicrobial resistance among migrants in Europe: a systematic review and meta-analysis

BACKGROUND: Rates of antimicrobial resistance (AMR) are rising globally and there is concern that increased migration is contributing to the burden of antibiotic resistance in Europe. However, the effect of migration on the burden of AMR in Europe has not yet been comprehensively examined. Therefore, we did a systematic review and meta-analysis to identify and synthesise data for AMR carriage or infection in migrants to Europe to examine differences in patterns of AMR across migrant groups and in different settings. METHODS: For this systematic review and meta-analysis, we searched MEDLINE, Embase, PubMed, and Scopus with no language restrictions from Jan 1, 2000, to Jan 18, 2017, for primary data from observational studies reporting antibacterial resistance in common bacterial pathogens among migrants to 21 European Union-15 and European Economic Area countries. To be eligible for inclusion, studies had to report data on carriage or infection with laboratory-confirmed antibiotic-resistant organisms in migrant populations. We extracted data from eligible studies and assessed quality using piloted, standardised forms. We did not examine drug resistance in tuberculosis and excluded articles solely reporting on this parameter. We also excluded articles in which migrant status was determined by ethnicity, country of birth of participants' parents, or was not defined, and articles in which data were not disaggregated by migrant status. Outcomes were carriage of or infection with antibiotic-resistant organisms. We used random-effects models to calculate the pooled prevalence of each outcome. The study protocol is registered with PROSPERO, number CRD42016043681. FINDINGS: We identified 2274 articles, of which 23 observational studies reporting on antibiotic resistance in 2319 migrants were included. The pooled prevalence of any AMR carriage or AMR infection in migrants was 25·4% (95% CI 19·1-31·8; I2 =98%), including meticillin-resistant Staphylococcus aureus (7·8%, 4·8-10·7; I2 =92%) and antibiotic-resistant Gram-negative bacteria (27·2%, 17·6-36·8; I2 =94%). The pooled prevalence of any AMR carriage or infection was higher in refugees and asylum seekers (33·0%, 18·3-47·6; I2 =98%) than in other migrant groups (6·6%, 1·8-11·3; I2 =92%). The pooled prevalence of antibiotic-resistant organisms was slightly higher in high-migrant community settings (33·1%, 11·1-55·1; I2 =96%) than in migrants in hospitals (24·3%, 16·1-32·6; I2 =98%). We did not find evidence of high rates of transmission of AMR from migrant to host populations. INTERPRETATION: Migrants are exposed to conditions favouring the emergence of drug resistance during transit and in host countries in Europe. Increased antibiotic resistance among refugees and asylum seekers and in high-migrant community settings (such as refugee camps and detention facilities) highlights the need for improved living conditions, access to health care, and initiatives to facilitate detection of and appropriate high-quality treatment for antibiotic-resistant infections during transit and in host countries. Protocols for the prevention and control of infection and for antibiotic surveillance need to be integrated in all aspects of health care, which should be accessible for all migrant groups, and should target determinants of AMR before, during, and after migration. FUNDING: UK National Institute for Health Research Imperial Biomedical Research Centre, Imperial College Healthcare Charity, the Wellcome Trust, and UK National Institute for Health Research Health Protection Research Unit in Healthcare-associated Infections and Antimictobial Resistance at Imperial College London

Surgical site infection after gastrointestinal surgery in high-income, middle-income, and low-income countries: a prospective, international, multicentre cohort study

Background: Surgical site infection (SSI) is one of the most common infections associated with health care, but its importance as a global health priority is not fully understood. We quantified the burden of SSI after gastrointestinal surgery in countries in all parts of the world. Methods: This international, prospective, multicentre cohort study included consecutive patients undergoing elective or emergency gastrointestinal resection within 2-week time periods at any health-care facility in any country. Countries with participating centres were stratified into high-income, middle-income, and low-income groups according to the UN's Human Development Index (HDI). Data variables from the GlobalSurg 1 study and other studies that have been found to affect the likelihood of SSI were entered into risk adjustment models. The primary outcome measure was the 30-day SSI incidence (defined by US Centers for Disease Control and Prevention criteria for superficial and deep incisional SSI). Relationships with explanatory variables were examined using Bayesian multilevel logistic regression models. This trial is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT02662231. Findings: Between Jan 4, 2016, and July 31, 2016, 13 265 records were submitted for analysis. 12 539 patients from 343 hospitals in 66 countries were included. 7339 (58·5%) patient were from high-HDI countries (193 hospitals in 30 countries), 3918 (31·2%) patients were from middle-HDI countries (82 hospitals in 18 countries), and 1282 (10·2%) patients were from low-HDI countries (68 hospitals in 18 countries). In total, 1538 (12·3%) patients had SSI within 30 days of surgery. The incidence of SSI varied between countries with high (691 [9·4%] of 7339 patients), middle (549 [14·0%] of 3918 patients), and low (298 [23·2%] of 1282) HDI (p < 0·001). The highest SSI incidence in each HDI group was after dirty surgery (102 [17·8%] of 574 patients in high-HDI countries; 74 [31·4%] of 236 patients in middle-HDI countries; 72 [39·8%] of 181 patients in low-HDI countries). Following risk factor adjustment, patients in low-HDI countries were at greatest risk of SSI (adjusted odds ratio 1·60, 95% credible interval 1·05–2·37; p=0·030). 132 (21·6%) of 610 patients with an SSI and a microbiology culture result had an infection that was resistant to the prophylactic antibiotic used. Resistant infections were detected in 49 (16·6%) of 295 patients in high-HDI countries, in 37 (19·8%) of 187 patients in middle-HDI countries, and in 46 (35·9%) of 128 patients in low-HDI countries (p < 0·001). Interpretation: Countries with a low HDI carry a disproportionately greater burden of SSI than countries with a middle or high HDI and might have higher rates of antibiotic resistance. In view of WHO recommendations on SSI prevention that highlight the absence of high-quality interventional research, urgent, pragmatic, randomised trials based in LMICs are needed to assess measures aiming to reduce this preventable complication

Grecs et indigènes de la Catalogne à la mer Noire

Le programme de travail qui aboutit à ce livre s’inscrit dans le cadre du réseau d’excellence européen Ramses2, initié par la Maison méditerranéenne des sciences de l’homme. Une demi-douzaine de tables rondes ont réuni entre 2006 et 2008, d’un bout à l’autre de la Méditerranée (à Empúries, Aix-en-Provence, Palerme, Naples, Athènes), quelque soixante-dix chercheurs essentiellement français, italiens et espagnols, mais aussi anglais, grecs, bulgares, roumains, canadiens et russes. Il s’agissait d’étudier les rapports d’acculturation entre colons grecs et populations indigènes, en tenant compte des différences géographiques et chronologiques mais aussi de l’historiographie et des habitudes de recherche des diverses institutions. Les nombreuses communications qui ont jalonné les six tables rondes sont ici la plupart du temps précédées de textes introductifs. Une première partie, consacrée aux approches régionales, permet d’illustrer l’état de la recherche dans quelques régions choisies (autour d’Empuries, d’Himère, de Marseille, de Vélia, en Thrace et en mer Noire). La seconde partie, thématique, aborde un certain nombre de thèmes de recherche dans les régions précédentes, mais aussi dans d’autres régions du monde de la colonisation grecque. Le point de vue adopté dans ce livre est d’abord celui de la culture matérielle ; l’approche en est essentiellement archéologique. On se demandera par exemple quels sont les indices archéologiques qui permettent de dire si un site est habité par des Grecs, par des indigènes ou par une population “mixte”, et comment ces indices ont été appréciés selon les périodes et selon les régions. Beaucoup de communications présentent des synthèses régionales ou thématiques, mais une large place est faite également à des sites inédits, pour lesquels on n’a pas hésité à livrer une abondante documentation (plans, matériel de fouille). C’est en effet par le renouvellement de la documentation archéologique que nous pouvons espérer avancer dans la compréhension des rapports d’acculturation entre les colons grecs et les populations locales

Contacts et acculturations en Méditerranée occidentale

La question des contacts entre les différents peuples qui bordent les rives de la Méditerranée nord occidentale est l’un des sujets phares de la recherche archéologique de ces trente dernières années. Que l’on parle d’époque archaïque et classique ou de Protohistoire et d’âge du Fer, les échanges et les processus d’acculturation de ces peuples qui entrèrent alors en contact les uns avec les autres : Grecs, Celtes, Phéniciens, Ibères, Ligures, Étrusques, ont retenu l’attention des chercheurs travaillant sur l’expansion grecque dans ces régions, sur les trafics commerciaux, sur les échanges culturels. L’œuvre de Michel Bats (Directeur de recherche honoraire du CNRS) traverse toutes ces thématiques : la présence des Phocéens et des Étrusques dans le bassin occidental de la Méditerranée, l’acculturation et les identités ethno-culturelles, les recherches sur la céramique et ses usages dans une perspective anthropologique, l’appropriation de l’écriture par les sociétés protohistoriques. Ses collègues et amis, en organisant ce colloque et en participant à ces actes, entendent lui témoigner leur amitié et leur dette intellectuelle. Ce volume réunit des articles des meilleurs spécialistes, actuels de la question - des chercheurs de toute la Méditerranée - autour des quatre grands thèmes que nous venons d’évoquer afin tout à la fois de dresser un bilan et de définir de nouvelles perspectives. Cet ouvrage présente donc aussi bien des synthèses - sur la présence grecque en Espagne, sur l’origine de l’écriture, sur les pratiques funéraires, sur les identités culturelles et ethniques - que des découvertes récentes concernant la thématique des contacts et de l’acculturation en Méditerranée nord occidentale : l’agglomération du Premier âge du Fer de La Cougourlude (Lattes, Hérault) fouillée durant l’été 2010 ; le sanctuaire hellénistique de Cumes et les fouilles récentes de Fratte en Italie ; les ateliers de potiers de Rosas en Espagne ; les dernières découvertes d’Olbia de Provence

Bognon C. 1988. — Les végétaux dans la vie du peuple WE, Côte d'Ivoire. Thèse de Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie

Puig Henri. Bognon C. 1988. — Les végétaux dans la vie du peuple WE, Côte d'Ivoire. Thèse de Doctorat de l'Université Pierre et Marie Curie. In: Journal d'agriculture traditionnelle et de botanique appliquée, 34ᵉ année,1987. p. 187

Breedlove, D. E. & R. M. Laughlin. — The Flowering of Man. A Tzotzil Botany of Zinacantan

Puig Henri. Breedlove, D. E. & R. M. Laughlin. — The Flowering of Man. A Tzotzil Botany of Zinacantan. In: Journal de la Société des Américanistes. Tome 81, 1995. pp. 356-358

Eléments pour une réflexion sur la modélisation de la forêt tropicale humide : a-t-on les connaissances requises ?

Many factors influence the tropical rain forest regeneration. Some of them are rather well known (tree-fall gaps), some others not. A number of less known factors are quoted here, they should be carefully studied if the tropical rain forest ecosystem functioning has to be understood and a fortiori if it has to be modelized. In the tropics, flowering and fructification phenomena happen on particular periods of the year and reach their maximum either during the dry or the rainy season ; and are obviously adapted to such seasonal environment. However, important disynchronisms are recognized among species, populations of the same species, trees of a population and sometimes even within a tree crown. The determinism of the flowering, the fructification, as well as the foliation phenology is far from being explained. What are the causes of this determinism ? May it be considered as a global phenomenon with multiple components ? What are the consequences of phenological variability on the regeneration processes ? The forest dynamics studies allowed to establish functional models that tend to show that the tropical rain forest is an heterogeneous system in space and time. This structural heterogeneity can be apprehended in several ways ; the tree-fall gaps theory is one of them, the «empty places » theory is another one. The plant physiognomic and functional organization is built on the opposition «empty places-full places ». The understanding of the spatial distribution of forms in space and time as well as the role of this distribution on the forest functioning is one of the keys of the forest dynamic understanding. Is the «empty-place » an indicator of the forest structure and dynamics ? Is the «empty-place » filling an homoge¬ neity or heterogeneity factor ? The most revealing variations of the tropical forest heterogeneity are structural. This heterogeneity can be observed at three perception levels : general or continental level, regional level and local level. Changing the scale brings up numerous methodological problems. The absence of correlations among scales or levels is another lack. Extrapolations are hasardous and comparisons may only be established with caution. The predictibility of the evolution and its variability are uncertain due to a deficient knowledge of the parameters governing the forest dynamics. Beyond the importance of improving our very deficient knowledge on the species diversity, it is essential to understand the mechanisms leading to this ecosystem diversity. The attempt to link the structures to the processes should help our understanding on how the biological diversity takes place, continues or decreases. How to identify the relative contribution of the biodiversity factors such as the spatial heterogeneity, in time variability or biogeographical history ? Is an ecosystem species diversity higher than the necessary one for its functional efficiency ? Is there a redundancy of species effecting the same function ? How to estimate the redundancy ? Function of key-species in the ecosystem functioning ? Function of key-resources ? What are the effects of human disturbances on keeping or loosing the biodiversity ? Communities vulnerability and resistance against species introductions and/or extinctions (cf. Miconia calvescens in Tahiti) ? The uses and management of the tropical rain forest must be considered as positive actions against the increasing destruction of this forest. They are numerous. Let us see two examples. The Amazonian extractivism, defined as any activity of gathering natural forest products of vegetal, animal or mineral origin for trade, seems to be successful from the social and ecological point of view as well as from the economical one. However, if carried on without discernment, it may lead to a progressive disappearing of the resources and become depredatory. Is the extractivism exportable and how ? Agroforestry is considered as the most convenient alternative to a sustainable agriculture production in the humid tropics. Agroforestry is rather successful in some tropical countries. In spite of the progresses made during the last twenty years many studies are still necessary. One of the main questions is the following : Are the recognised agroforestry successes exportable in other tropical countries and how ? In any case, new researches have to be conducted. They should deal with the study of forest regrowth after cultivation and with the fallows management.Les facteurs qui interviennent dans la régénération de la forêt tropicale humide sont nombreux. Certains sont insuffisamment connus et devaient faire l’objet d’études plus approfondies si l’on veut comprendre le fonctionnement de cet écosystème et a fortiori modéliser la forêt tropicale humide. Sous les latitudes tropicales, le fait que la floraison et la fructification se produisent à des périodes privilégiées de l’année semble plaider en faveur d’un comportement adapté aux variations saisonnières du milieu extérieur. Cependant, on constate l’existence de disynchronismes importants entre espèces, entre populations d’une même espèce, entre individus d’une même population et parfois dans la cime d’un même individu. Le déterminisme de la phénologie de la floraison et de la fructification se pose : quelles en sont les causes ? Est-ce un phénomène global à composantes multiples ? Quelles sont les conséquences de la variabilité phénologique sur la régénération ? L’hétérogénéité structurale peut être appréhendée sous différents angles : le chablis en est un, les «espaces vides » en sont un autre. L’observation des «espaces vides » ressort d’une analyse physionomique. L’organisation physionomique et fonctionnelle des végétaux se construit sur l’opposition espaces vides-espaces pleins. Comprendre l’étagement et le fonctionnement des formes dans l’espace et dans le temps et le rôle de cet agencement sur le fonctionnement de la forêt est une des clés de la dynamique forestière. Les variations qui traduisent le mieux l’hétérogénéité des forêts tropicales sont de type structural. Cette hétérogénéité s’observe à trois niveaux de perception : niveau général ou continental, niveau régional, niveau stationnel. Passer d’une échelle à l’autre pose de nombreux problèmes méthodologiques. Les extrapolations et la prédictibilité de l’évolution dans le temps et de sa variabilité se heurte à la maîtrise incomplète des paramètres qui régissent la dynamique forestière. Au-delà de l’importance de faire avancer nos connaissances, très incomplètes, sur la diversité spécifique il importe de comprendre les mécanismes qui induisent la diversité des écosystèmes. Relier les structures aux processus devrait aider à comprendre comment se met en place, se maintient ou se réduit la diversité biologique. Quels sont les facteurs de la biodiversité ? Diversité spécifique et efficacité fonctionnelle ? Y a-t-il redondance d’espèces qui accomplissent la même fonction ? Comment évaluer la redondance ? Rôles des espèces-clés et des ressources-clés ? Quels sont les effets des perturbations anthropiques sur le maintien ou la perte de la biodiversité ? Vulnérabilité et résistance aux introductions et/ou aux extinctions d’espèces. Les usages et la gestion de la forêt tropicale humide doivent être envisagés comme des réactions constructives à la destruction croissante de cette forêt. A titre d’exemple, l’extractivisme amazonien semble être un succès tant sur le plan social et écologique (conservation des ressources) qu’économique. Mené sans discernement, il peut conduire à la disparition progressive des ressources et devenir déprédateur. L’extractivisme est-il exportable et dans quelles conditions ? L’agroforesterie est considérée comme l’alternative la mieux adaptée pour une production agricole stable dans les tropiques humides. Mais une des principales questions qui se posent est la suivante : les réussites agroforestières reconnues sont-elles exportables dans d’autres pays tropicaux et dans quelles conditions ?Puig Henri. Eléments pour une réflexion sur la modélisation de la forêt tropicale humide : a-t-on les connaissances requises ?. In: Revue d'Écologie (La Terre et La Vie), tome 50, n°3, 1995. pp. 199-208

Observations ethnobotaniques sur les plantes utiles d'un village Otomi de la Sierra de Puebla, Mexique

Within the scope of an interdisciplinary research program of the French CNRS in Mexico, the uses of plants in an Otomi village of the Sierra de Puebla have been surveyed with particular reference to cultivated and semi-cultivated plants. Lists of ornamental plants, medicinal plants, plants providing building material and other uses are also given.Turra E., Puig Henri. Observations ethnobotaniques sur les plantes utiles d'un village Otomi de la Sierra de Puebla, Mexique. In: Journal d'agriculture traditionnelle et de botanique appliquée, 25ᵉ année, bulletin n°2, Avril-juin 1978. pp. 85-96