Prediction of survival with second-line therapy in biliary tract cancer: Actualisation of the AGEO CT2BIL cohort and European multicentre validations

BACKGROUND: The benefit of second-line chemotherapy (L2) over standard first-line (L1) gemcitabine plus cisplatin (GEMCIS) or oxaliplatin (GEMOX) chemotherapy in advanced biliary tract cancer (aBTC) is unclear. Our aim was to identify and validate prognostic factors for overall survival (OS) with L2 in aBTC to guide clinical decisions in this setting. METHODS: We performed a retrospective analysis of four prospective patient cohorts: a development cohort (28 French centres) and three validation cohorts from Italy, UK and France. All consecutive patients with aBTC receiving L2 after GEMCIS/GEMOX L1 between 2003 and 2016 were included. The association of clinicobiological data with OS was investigated in univariate and multivariate Cox analyses. A simple score was derived from the multivariate model. RESULTS: The development cohort included 405 patients treated with L1 GEMOX (91%) or GEMCIS. Of them, 55.3% were men, and median age was 64.8 years. Prior surgical resection was observed in 26.7%, and 94.8% had metastatic disease. Performance status (PS) was 0, 1 and 2 in 17.8%, 52.4% and 29.7%, respectively. Among 22 clinical parameters, eight were associated with OS in univariate analysis. In multivariate analysis, four were independent prognostic factors (p < 0.05): PS, reason for L1 discontinuation, prior resection of primary tumour and peritoneal carcinomatosis. The model had the Harrell's concordance index of 0.655, a good calibration and was validated in the three external cohorts (N = 392). CONCLUSION: We validated previously reported predictive factors of OS with L2 and identified peritoneal carcinomatosis as a new pejorative factor in nearly 800 patients. Our model and score may be useful in daily practice and for future clinical trial design

Workshop on Raising Data using the RDBES and TAF (WKRDBESRaiseTAF; outputs from 2022 meeting)

41 páginasThe Workshop on Raising Data using the RDBES and TAF (WKRDBES-Raise&TAF) met online (26–30 of September 2022) to evaluate the use of the Regional Database and Estimation System (RDBES) format to reproduce the 2022 InterCatch input and output, identifying a Transparent Assessment Framework (TAF) structure to organize the intermediate steps and to propose standardized output formats. The main outcomes of WKRDBES-Raise&TAF were: · RDBES provides sufficient support for current national estimation protocols. However, some minor issues were reported that hampered an exact reproduction of the estimates. Therefore, adaptations of the data model should not be excluded completely. · All the input to stock assessment that InterCatch currently provides, could be reproduced. The participants started from the current stock extracts that can be downloaded from InterCatch. · A workflow was proposed with a national TAF repository for each country, a stock estimation repository and a stock assessment repository. The intermediate output of those repositories will be stored in an ‘intermediate output database’ and depending on the user role, you will get access to the relevant stages in this workflow. · The following requirements for the standard output formats were defined: they cannot be more restrictive than the InterCatch input and output format; they should present measures of uncertainty and sample sizes (for national estimates) and should have a configurable domain definition (for national estimates). Despite those successful outcomes, the current plan for transition to an operational system was concluded to be too optimistic. WKRDBES-Raise&TAF therefore recommends to the Working Group on Governance of the Regional Database and Estimation System (WGRDBESGOV) to revise the roadmap and allow RDBES to be in a test phase also for 2023. WKRDBES-Raise&TAF felt the need to test the proposed workflow on a small scale and therefore recommends to the WGRDBESGOV to arrange a workshop where two stocks (pok.27.3a46 (Saithe (Pollachius virens) in Subareas 4, 6 and Division 3.a (North Sea, Rockall and West of Scotland, Skagerrak and Kattegat) and wit.27.3a47d (Witch (Glyptocephalus cynoglossus) in Subarea 4 and Divisions 3.a and 7.d (North Sea, Skagerrak and Kattegat, eastern English Channel)) will be set up to go through the whole flow.Peer reviewe

Optimasi Portofolio Resiko Menggunakan Model Markowitz MVO Dikaitkan dengan Keterbatasan Manusia dalam Memprediksi Masa Depan dalam Perspektif Al-Qur`an

Risk portfolio on modern finance has become increasingly technical, requiring the use of sophisticated mathematical tools in both research and practice. Since companies cannot insure themselves completely against risk, as human incompetence in predicting the future precisely that written in Al-Quran surah Luqman verse 34, they have to manage it to yield an optimal portfolio. The objective here is to minimize the variance among all portfolios, or alternatively, to maximize expected return among all portfolios that has at least a certain expected return. Furthermore, this study focuses on optimizing risk portfolio so called Markowitz MVO (Mean-Variance Optimization). Some theoretical frameworks for analysis are arithmetic mean, geometric mean, variance, covariance, linear programming, and quadratic programming. Moreover, finding a minimum variance portfolio produces a convex quadratic programming, that is minimizing the objective function ðð¥with constraintsð ð 𥠥 ðandð´ð¥ = ð. The outcome of this research is the solution of optimal risk portofolio in some investments that could be finished smoothly using MATLAB R2007b software together with its graphic analysis

Search for heavy resonances decaying to two Higgs bosons in final states containing four b quarks

A search is presented for narrow heavy resonances X decaying into pairs of Higgs bosons (H) in proton-proton collisions collected by the CMS experiment at the LHC at root s = 8 TeV. The data correspond to an integrated luminosity of 19.7 fb(-1). The search considers HH resonances with masses between 1 and 3 TeV, having final states of two b quark pairs. Each Higgs boson is produced with large momentum, and the hadronization products of the pair of b quarks can usually be reconstructed as single large jets. The background from multijet and t (t) over bar events is significantly reduced by applying requirements related to the flavor of the jet, its mass, and its substructure. The signal would be identified as a peak on top of the dijet invariant mass spectrum of the remaining background events. No evidence is observed for such a signal. Upper limits obtained at 95 confidence level for the product of the production cross section and branching fraction sigma(gg -> X) B(X -> HH -> b (b) over barb (b) over bar) range from 10 to 1.5 fb for the mass of X from 1.15 to 2.0 TeV, significantly extending previous searches. For a warped extra dimension theory with amass scale Lambda(R) = 1 TeV, the data exclude radion scalar masses between 1.15 and 1.55 TeV

Search for supersymmetry in events with one lepton and multiple jets in proton-proton collisions at root s=13 TeV

Peer reviewe

Measurement of the top quark mass using charged particles in pp collisions at root s=8 TeV

Peer reviewe

Modélisation statistique de distribution spatiale et temporelle d'espèces d'invertébrés dans le Golfe du Saint Laurent.

Understanding spatial and spatio-temporal species distribution is a key aspect in a management context. Thereby, a large number of statistical approaches have been developed to study their spatio-temporal distributions. However, the modeling of species distribution raises two main difficulties: (i) typical data present an excess of zero. This large proportion of zero requires specific zero-inflated modeling approaches. (ii) variables sampled in the same area often present spatial autocorrelation. Ignoring this autocorrelation may produce to false conclusion. Two approaches, which can handle zero- inflated data are compared in terms of response to variable sampling effort. This comparison is performed by simulations and using fishery dependent data of groundfish species. Delta-distribution approaches, which are the classical tool to model such zero-inflated data in ecology, can lead to poor estimates when the variability in the sampling effort is important. On the opposite, a compound Poisson with gamma marks (CPG) is much more robust to variable sampling conditions. The second part of this work aims at developing spatial model for representing the biomass distribution of epibenthic invertebrates sampled in the southern Gulf of Saint Lawrence (sGSL) since 1989 by Fisheries and Ocean Canada. Data from such broad scale surveys are ideal for understanding spatial and temporal changes in population abundance and community structure. A Bayesian hierarchical model (HBM) based on the CPG is proposed to study the distribution of these species. The latent spatial process is modeled with an exponential variogram associated with three environmental variables (sediment, depth and temperature). Maps of quantities of interest (e.g. probability of presence, quantity of biomass) are produced, taking into account the uncertainty of the estimated parameters and observation errors. This hierarchical Bayesian modeling approach provides a useful tool for spatial management of human activities that may affect living resources. Finally, a spatio-temporal model is presented to study the evolution of the biomass of invertebrates in the sGSL. The HBM proposed previously is used again, but the variogram is replaced by a latent grid, which accounts for the spatial and temporal dependencies. The spatial structure is modeled by convolving an independent process with an exponential kernel on the grid. This grid is also controlling the temporal dependency, which is modeled with an autoregressive model of order 1. The approach allows to study the evolution of biomass quantities of the epibenthic invertebrates of the sGSL. The spatio-temporel model developed is flexible and efficient and open a whole range of perspectives.Comprendre et étudier la distribution spatiale et temporelle des espèces est un enjeu margeur pour leur gestion. De ce fait, de nombreuses approches statistiques ont été développées pour étudier leur répartition spatio-temporelles. Cependant, modéliser la distribution d'une population pose deux difficultés majeures : (i) les jeux de données disponibles présentent souvent une forte quantité de zéros. Cet excès de zéros implique l'utilisation d'outils statistiques spécifiques, (ii) les valeurs de variables prélevées en des sites voisins sont spatialement corrélées. Ignorer cette autocorrélation peut amener à de fausses conclusions. Deux approches, adaptées aux données continues à forte proportion de zéros, sont comparées lorsque l'effort d'échantillonnage (p. ex. durée, distance) est variable. La comparaison est effectuée par simulations et avec des données de pêches commerciales de poissons de fond au large de Vancouver. L'approche delta, la plus utilisée en écologie, ne permet pas de prendre en compte cet effort variable correctement, tandis que la seconde approche, un Poisson composé à marques gamma (CPG), est robuste à cette variabilité. La seconde partie de ces travaux s'est intéressée à la modélisation spatiale de quantités de biomasses d'invertébrés épibenthiques dans le golfe du Saint-Laurent. Chaque année depuis 1989, Pêche et Océan Canada organise une campagne de pêche scientifique dans cette région. De telles données sont idéales pour comprendre les changements spatio-temporels d'abondance de populations. Un modèle hiérarchique bayésien (HBM) basé sur le modèle CPG est proposé pour étudier la répartition spatiale de ces espèces d'invertébrés. La structure spatiale de la biomasse est modélisée grâce à un variogramme exponentiel associé à trois variables environnementales (sédiment, profondeur et température) dans la couche latente du HBM. Cette méthode produit des cartes de quantités d'intérêt (p. ex. probabilité de présence, biomasse moyenne) en tenant compte de l'incertitude des paramètres estimés ainsi que les erreurs associées aux observations. Ce HBM fournit des outils utiles pour la gestion spatiale de populations. Enfin, une approche de modélisation spatio-temporelle des quantités de biomasses d'invertébré est proposée. Le HBM basé sur le modèle CPG est une nouvelle fois utilisé, mais l'utilisation du variogramme est remplacée par une grille latente, support de la dépendance spatio-temporelle. La structure spatiale est approchée par convolution discrète d'un bruit blanc à l'aide d'un noyau exponentiel sur la grille latente. Cette même grille contrôle également la dépendance temporelle qui est modélisée par un processus autorégressif d'ordre 1. Ce modèle permet d'étudier l'évolution des quantités de biomasses des espèces d'invertébrés du golfe. L'approche spatio-temporelle développée, flexible et performante, ouvre beaucoup de perspectives quant à la modélisation spatio-temporelle de distribution d'espèce

Evaluation des impacts de mesures de gestion pour la sole du golfe de Gascogne (8ab)

Une baisse de captures de sole du Golfe de Gascogne est recommandée par le CIEM pour 2022. Pour y répondre, un certain nombre de mesures de gestion peuvent être envisagées et leur impact estimé par simulations. Ces mesures doivent conduire à une diminution effective des captures (pas seulement des débarquements), nécessaire pour rétablir le stock, quel que soit le niveau auquel sera fixé le TAC. L’amélioration de l’état d’un stock passe par une diminution de la mortalité par pêche globale et donc des volumes capturés, mais peut également impliquer une amélioration du diagramme d’exploitation, par exemple en capturant moins de petits individus. La diminution de la mortalité par pêche globale implique une réduction d’effort de pêche (arrêt temporaire, diminution de la taille des filets…) ; l’amélioration du diagramme d’exploitation peut, elle, nécessiter des augmentations de maillages et/ou des modifications de pratiques de pêche comme la diminution de l’effort de pêche dans des zones ou à des périodes où les captures de petits individus sont importantes. Dans un contexte où le recrutement est faible, toute mesure permettant d’en tirer le meilleur parti, en permettant aux petits individus de grandir, devrait être encouragée. La pertinence des résultats de ces diverses simulations repose sur la qualité des données utilisées. Ainsi des données non exhaustives de capture de petits individus conduira à une sous-estimation des impacts d’une amélioration de la sélectivité (au sens large). L’impact de chacun des scénarios sur le chiffre d’affaires est estimé pour chaque flottille en supposant que la diminution du chiffre d’affaire (CA) est proportionnelle à la diminution d’effort de pêche. Cependant, l’impact sur les autres espèces que la sole d’une modification des maillages ne peut être estimé, en l’absence de paramètres de sélectivité. De même, l’impact d’une fermeture spatiale ne peut être quantifié en l’absence d’information sur l’activité dans ces zones des navires non soumis à la géolocalisation (VMS). Les fileyeurs de plus de 12 mètres étant les plus gros contributeurs à la mortalité par pêche de la sole, principalement au 1er trimestre, il peut être logique de faire porter une grande part de l’effort de réduction à cette flottille, ou à ce trimestre. Néanmoins, cela reste une option, pas une recommandation, comme le sont tous les scénarios présentés dans ce document