Rapport de sondages et d'analyses, Le Kilian et les carrières anciennes de trachyte dans la Chaîne des Puys (Puy-de-Dôme)

En 2008, l'existence de carrières souterraines médiévales avait été mise en évidence dans la pente ouest du Bois de Manson qui domine la dépression du Cratère Kilian, au pied sud du puy de Dôme. En 2009-2010, des sondages et prospections ont été étendus à tout l'ensemble du Kilian de façon à préciser l'étendue et, si possible, la chronologie de son exploitation dans le passé. Ces travaux ont permis d'observer, dans le fond du cratère et sur son flanc interne ouest, des amoncellements de déblais d'un volume considérable, témoignant d'une extraction de roche à grande échelle durant le haut Moyen Âge et très probablement aussi à l'époque gallo-romaine. Une nouvelle carrière souterraine a été découverte dans la pente interne ouest du cratère. La base du remplissage de cette carrière a livré des charbons datés entre la fin du IV e siècle et le début du VI e siècle par le radiocarbone, tandis que le sommet du remplissage contenait des tessons de céramique datables, par leur typologie, de la fin du V e siècle au début du VIII e siècle. L'état actuel des investigations conduit à faire l'hypothèse que les gallo-romains ont exploité, au fond du cratère, un trachyte compact dont on ne trouve aujourd'hui que les déchets de taille, et dont les affleurements sont masqués par les déblais, tandis que les artisans du Moyen Âge ont recherché un trachyte plus tendre dans les pentes hautes du cratère. Le Kilian doit donc s'ajouter aux trois sources actuellement connues de trachyte d'oeuvre dans le passé, à savoir les volcans Sarcoui, Aumône (ou petit Suchet) et Cliersou. Dès cette découverte, en 2008, s'est posée la question de savoir quelle part éventuelle le trachyte du Kilian avait pu prendre dans la construction du temple de Mercure au sommet du puy de Dôme et dans l'agglomération gallo-romaine située au col de Ceyssat. Pour y répondre, une campagne d'analyses géochimiques et pétrographiques été engagée pour caractériser, aux fins de comparaison, non seulement les trachytes du Kilian et ceux des ruines gallo-romaines, mais, de plus, les trachytes du Cliersou, de l'Aumône et du Sarcoui. Ces analyses ont finalement montré qu'il est possible de faire une discrimination statistiquement significative entre les différents trachytes étudiés, à l'exception de ceux du couple Cliersou-Aumône dont les laves sont très peu différentes les unes des autres. Le résultat le plus remarquable est que tous les trachytes gallo-romains échantillonnés (dont 10 échantillons distincts au temple de Mercure et 10 au col de Ceyssat) se rattachent sans ambiguïté au Kilian. En toute rigueur, ces nouvelles données ne permettent pas d'exclure sans appel la possibilité d'utilisation à l'époque gallo-romaine, au temple de Mercure et au col de Ceyssat, de trachytes provenant d'autres sources que le Kilian (cas des chaperons de mur du col de Ceyssat, provenant du puy de Dôme). Cependant, il faut ajouter qu'un examen visuel des trachytes d'oeuvre dans ces deux sites, portant sur un nombre de moellons et d'éléments architecturaux bien supérieur au nombre de ceux qui ont été analysés, conduit à conclure que leur source est probablement commune. Cette conclusion est basée sur un faciès minéralogique particulier, observable à l'oeil nu ou à la loupe

Mutations in TUBG1, DYNC1H1, KIF5C and KIF2A cause malformations of cortical development and microcephaly.

International audienceThe genetic causes of malformations of cortical development (MCD) remain largely unknown. Here we report the discovery of multiple pathogenic missense mutations in TUBG1, DYNC1H1 and KIF2A, as well as a single germline mosaic mutation in KIF5C, in subjects with MCD. We found a frequent recurrence of mutations in DYNC1H1, implying that this gene is a major locus for unexplained MCD. We further show that the mutations in KIF5C, KIF2A and DYNC1H1 affect ATP hydrolysis, productive protein folding and microtubule binding, respectively. In addition, we show that suppression of mouse Tubg1 expression in vivo interferes with proper neuronal migration, whereas expression of altered γ-tubulin proteins in Saccharomyces cerevisiae disrupts normal microtubule behavior. Our data reinforce the importance of centrosomal and microtubule-related proteins in cortical development and strongly suggest that microtubule-dependent mitotic and postmitotic processes are major contributors to the pathogenesis of MCD

The Genome of Borrelia recurrentis, the Agent of Deadly Louse-Borne Relapsing Fever, Is a Degraded Subset of Tick-Borne Borrelia duttonii

In an effort to understand how a tick-borne pathogen adapts to the body louse, we sequenced and compared the genomes of the recurrent fever agents Borrelia recurrentis and B. duttonii. The 1,242,163–1,574,910-bp fragmented genomes of B. recurrentis and B. duttonii contain a unique 23-kb linear plasmid. This linear plasmid exhibits a large polyT track within the promoter region of an intact variable large protein gene and a telomere resolvase that is unique to Borrelia. The genome content is characterized by several repeat families, including antigenic lipoproteins. B. recurrentis exhibited a 20.4% genome size reduction and appeared to be a strain of B. duttonii, with a decaying genome, possibly due to the accumulation of genomic errors induced by the loss of recA and mutS. Accompanying this were increases in the number of impaired genes and a reduction in coding capacity, including surface-exposed lipoproteins and putative virulence factors. Analysis of the reconstructed ancestral sequence compared to B. duttonii and B. recurrentis was consistent with the accelerated evolution observed in B. recurrentis. Vector specialization of louse-borne pathogens responsible for major epidemics was associated with rapid genome reduction. The correlation between gene loss and increased virulence of B. recurrentis parallels that of Rickettsia prowazekii, with both species being genomic subsets of less-virulent strains

BUILDING BRIDGES FOR INNOVATION IN AGEING : SYNERGIES BETWEEN ACTION GROUPS OF THE EIP ON AHA

The Strategic Implementation Plan of the European Innovation Partnership on Active and Healthy Ageing (EIP on AHA) proposed six Action Groups. After almost three years of activity, many achievements have been obtained through commitments or collaborative work of the Action Groups. However, they have often worked in silos and, consequently, synergies between Action Groups have been proposed to strengthen the triple win of the EIP on AHA. The paper presents the methodology and current status of the Task Force on EIP on AHA synergies. Synergies are in line with the Action Groups' new Renovated Action Plan (2016-2018) to ensure that their future objectives are coherent and fully connected. The outcomes and impact of synergies are using the Monitoring and Assessment Framework for the EIP on AHA (MAFEIP). Eight proposals for synergies have been approved by the Task Force: Five cross-cutting synergies which can be used for all current and future synergies as they consider overarching domains (appropriate polypharmacy, citizen empowerment, teaching and coaching on AHA, deployment of synergies to EU regions, Responsible Research and Innovation), and three cross-cutting synergies focussing on current Action Group activities (falls, frailty, integrated care and chronic respiratory diseases).Peer reviewe

A Solve-RD ClinVar-based reanalysis of 1522 index cases from ERN-ITHACA reveals common pitfalls and misinterpretations in exome sequencing

Purpose Within the Solve-RD project (https://solve-rd.eu/), the European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies aimed to investigate whether a reanalysis of exomes from unsolved cases based on ClinVar annotations could establish additional diagnoses. We present the results of the “ClinVar low-hanging fruit” reanalysis, reasons for the failure of previous analyses, and lessons learned. Methods Data from the first 3576 exomes (1522 probands and 2054 relatives) collected from European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies was reanalyzed by the Solve-RD consortium by evaluating for the presence of single-nucleotide variant, and small insertions and deletions already reported as (likely) pathogenic in ClinVar. Variants were filtered according to frequency, genotype, and mode of inheritance and reinterpreted. Results We identified causal variants in 59 cases (3.9%), 50 of them also raised by other approaches and 9 leading to new diagnoses, highlighting interpretation challenges: variants in genes not known to be involved in human disease at the time of the first analysis, misleading genotypes, or variants undetected by local pipelines (variants in off-target regions, low quality filters, low allelic balance, or high frequency). Conclusion The “ClinVar low-hanging fruit” analysis represents an effective, fast, and easy approach to recover causal variants from exome sequencing data, herewith contributing to the reduction of the diagnostic deadlock

"Poéthiques" de l'événement (dans les œuvres de Claude Simon, Jean Rouaud, Jean Follain, Jacques Réda, François Jacqmin et Eugène Savitzkaya)

TOULOUSE2-BUC Mirail (315552102) / SudocSudocFranceF

Une méthode statistique-topographique de prédétermination des distances d'arrêt des avalanches

National audienceInspired by the statistical/topographical "Norwegian" approaches and ideas of Ancey and Meunier, this paper presents a method to compute the predictive distribution of snow avalanches runout distances and uncertainties associated with design values. A very simple propagation operator and minimal statistical hypothesis are involved. Accordingly to the French historical database, only release and runout altitudes are necessary. Main contribution of the work is the proposed statistical model that is flexible enough to take reasonably avalanche data variability in account and to express inter variables correlations. The bayesian framework facilitates parameter estimation and allows taking estimation error in account for predictive simulations.Inspiré des approches statistiques-topographiques dites "norvégiennes" et des travaux d'Ancey et Meunier, cet article présente une méthode de calcul de la distribution prédictive des distances d'arrêt des avalanches permettant d'évaluer l'incertitude associée aux valeurs de projet. La démarche associe un opérateur de propagation très simple et un modèle statistique fondé sur des hypothèses peu contraignantes. Conformément au contexte français de collecte des données historiques, seules les altitudes de départ et d'arrivée sont nécessaires. Un soin particulier a été consacré à l'élaboration d'une structure statistique suffisamment souple pour appréhender raisonnablement la variabilité des données avalancheuses et exprimer la corrélation inter variables. L'utilisation du formalisme bayésien facilite l'estimation et permet la prise en compte le l'erreur d'estimation dans les simulations prédictives

Que se passe-t-il ?Evénements, sciences humaines et littérature

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