82 research outputs found
Bacterial laccases: some recent advances and applications
- Author
- A Bolognese
- A Changela
- A Pawlik
- A Sanchez-Amat
- AC Sousa
- AC Sousa
- AC Sousa
- AC Sousa
- AC Sousa
- AC Sousa
- AM Mayer
- AT Fernandes
- AT Fernandes
- AT Fernandes
- AT Fernandes
- AT Fernandes
- C Liu
- C Madzak
- C Rademacher
- C Rademacher
- C Romero-Guido
- CN Pace
- CS Silva
- D Hernandez-Romero
- D Kalyani
- DA Rouch
- DL Huffman
- E Agostinelli
- E Espinosa
- E Fernandez
- E Ricklefs
- E Sedlak
- F Bruyneel
- F d’Acunzo
- F Solano
- F Solano
- F Tonin
- F Xu
- FJ Enguita
- FJ Enguita
- FJ Marcos-Torres
- FW Outten
- FW Outten
- G Grass
- G Grass
- G Hong
- GA Petsko
- GH Jones
- H Komori
- H Sakuraba
- H Serrano-Posada
- H Wang
- HW Kim
- I Galli
- I Matera
- I Pozdnyakova
- I Savini
- I Starke
- J Cha
- J Fitter
- J Muñoz-Dorado
- J Pérez
- J Yang
- JP Kallio
- K Koschorreck
- K Miyazaki
- K Nakamura
- L Sawle
- LE Navas
- LO Martins
- LO Martins
- M Beeby
- M Bello
- M Bello
- M Gunne
- M McDonald
- MC Machczynski
- MC Sanchez-Sutil
- MC Sánchez-Sutil
- MCB Bonaccorsi di Patti
- ME Arias
- ME Eugenio
- ME Palm-Espling
- MF Hullo
- MI Giannotti
- N Hakulinen
- N Hakulinen
- NL Brown
- NM Marshall
- NV Borrero
- OJX Morel
- OV Koroleva
- P Corona
- P Durao
- P Durao
- P Durao
- PS Chauhan
- R Chandra
- R Moya
- R Pauliukaite
- R Reiss
- R Singh
- RE Goacher
- RP Baptista
- RS Granja-Travez
- RS Granja-Travez
- S Brander
- S Brander
- S Callejon
- S Callejon
- S Galai
- S Ghatge
- S Kumar
- S Majumdar
- S Robic
- S Roth
- S Sitthisak
- S Sondhi
- S Uthandi
- SA Roberts
- SJ Hall
- SK Singh
- SM Jones
- T Bertrand
- T Kudanga
- T Rosado
- T Skalova
- T Xie
- T Yamamoto
- X-F Huang
- ZB Guan
- ZQ Zheng
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- 01/08/2020
- Field of study
Laccases belong to the large family of multi-copper oxidases (MCOs) that couple the one-electron oxidation of substrates with the four-electron reduction of molecular oxygen to water. Because of their high relative non-specific oxidation capacity particularly on phenols and aromatic amines as well as the lack of requirement for expensive organic cofactors, they have found application in a large number of biotechnological fields. The vast majority of studies and applications were performed using fungal laccases, but bacterial laccases show interesting properties such as optimal temperature above 50 °C, optimal pH at the neutral to alkaline range, thermal and chemical stability and increased salt tolerance. Additionally, bacterial systems benefit from a wide range of molecular biology tools that facilitates their engineering and achievement of high yields of protein production and set-up of cost-effective bioprocesses. In this review we will provide up-to-date information on the distribution and putative physiological role of bacterial laccases and highlight their distinctive structural and biochemical properties, discuss the key role of copper in the biochemical properties, discuss thermostability determinants and, finally, review biotechnological applications with a focus on catalytic mechanisms on phenolics and aromatic amines.info:eu-repo/semantics/publishedVersio
Global urban environmental change drives adaptation in white clover.
- Author
- Aguirre WE
- Akinwole PO
- Alberti M
- Anderson JJ
- Anderson JT
- Ando Y
- Andrew NR
- Angeoletto F
- Anstett DN
- Anstett J
- Aoki-Gonçalves F
- Arietta AZA
- Arroyo MTK
- Austen EJ
- Baena-Díaz F
- Barker CA
- Baylis HA
- Beliz JM
- Benitez-Mora A
- Bickford D
- Biedebach G
- Blackburn GS
- Boehm MMA
- Bonser SP
- Bonte D
- Bragger JR
- Branquinho C
- Brans KI
- Bresciano JC
- Brom PD
- Bucharova A
- Burt B
- Cahill JF
- Campbell KD
- Carlen EJ
- Carmona D
- Castellanos MC
- Centenaro G
- Chalen I
- Chaves JA
- Chen X-Y
- Chilton AM
- Chomiak KM
- Chávez-Pesqueira M
- Cisneros-Heredia DF
- Cisse IK
- Classen AT
- Cohan B
- Comerford MS
- Corney H
- Crawford AJ
- Crawford KM
- Dahirel M
- David S
- De Haan R
- Deacon NJ
- Dean C
- Del-Val E
- Deligiannis EK
- Denney D
- Dettlaff MA
- DiLeo MF
- Ding Y-Y
- Dominoni DM
- Domínguez-López ME
- Draud SL
- Dyson K
- Ellers J
- Espinosa CI
- Essi L
- Falahati-Anbaran M
- Falcão JCF
- Fargo HT
- Fellowes MDE
- Fitzpatrick CR
- Fitzpatrick RM
- Flaherty LE
- Flood PJ
- Flores MF
- Fornoni J
- Foster AG
- Fradinger CC
- Frost CJ
- Fuentes TL
- Fulkerson JR
- Gagnon E
- Garbsch F
- Garroway CJ
- Gerstein AC
- Giasson MM
- Girdler EB
- Gkelis S
- Godsoe W
- Golemiec AM
- Golemiec M
- González-Lagos C
- Gorton AJ
- Gotanda KM
- Granath G
- Greiner S
- Griffiths JS
- Grilo F
- Gundel PE
- Hamilton B
- Hardin JM
- He T
- Heard SB
- Henriques AF
- Hernández-Poveda M
- Hetherington-Rauth MC
- Hill SJ
- Hochuli DF
- Hodgins KA
- Hood GR
- Hopkins GR
- Hovanes KA
- Howard AR
- Hubbard SC
- Ibarra-Cerdeña CN
- Innes SG
- Iñiguez-Armijos C
- Jara-Arancio P
- Jarrett BJM
- Jeannot M
- Jiménez-Lobato V
- Johnson M
- Johnson MTJ
- Johnson O
- Johnson PP
- Johnson R
- Josephson MP
- Jung MC
- Just MG
- Kahilainen A
- Kailing OS
- Kariñho-Betancourt E
- Karousou R
- Kirn LA
- Kirschbaum A
- Koch S
- Laine A-L
- LaMontagne JM
- Lampei C
- Lara C
- Larson EL
- Le JH
- Leandro DS
- Lee C
- Lei Y
- Lequerica Tamara ME
- Levesque DC
- León CA
- Liao W-J
- Ljubotina M
- Locke H
- Lockett MT
- Longo TC
- Lundholm JT
- Lázaro-Lobo A
- MacGillavry T
- Mackin CR
- Mahmoud AR
- Manju IA
- Mariën J
- Martínez DN
- Martínez-Bartolomé M
- Meineke EK
- Mendoza-Arroyo W
- Merritt LEL
- Merritt TJS
- Migiani G
- Miles LS
- Minor ES
- Mitchell N
- Mohammadi Bazargani M
- Moles AT
- Monk JD
- Moore CM
- Morales-Morales PA
- Moyers BT
- Munim S
- Munshi-South J
- Murphy SM
- Murúa MM
- Muñoz-Rojas M
- Neila M
- Ness RW
- Nikolaidis O
- Njunjić I
- Nosko P
- Núñez-Farfán J
- Ohgushi T
- Olsen KM
- Opedal ØH
- Ornelas C
- Parachnowitsch AL
- Paratore AS
- Parody-Merino AM
- Paule J
- Paulo OS
- Pena JC
- Peres-Neto PR
- Pfeiffer VW
- Pinho P
- Piot A
- Porth IM
- Poulos N
- Prashad C
- Puentes A
- Qu J
- Quintero-Vallejo E
- Raciti SM
- Raeymaekers JAM
- Raveala KM
- Rennison DJ
- Ribeiro MC
- Richardson JL
- Rivas-Torres G
- Rivera BJ
- Roddy AB
- Rodriguez-Muñoz E
- Román JR
- Rossi LS
- Rowntree JK
- Ryan TJ
- Salinas S
- Sanders NJ
- Santangelo JS
- Santiago-Rosario LY
- Savage AM
- Scheepens JF
- Schilthuizen M
- Schneider AC
- Scholier T
- Scott JL
- Shaheed SA
- Shefferson RP
- Shepard CA
- Shykoff JA
- Silveira G
- Smith AD
- Solis-Gabriel L
- Soro A
- Spellman KV
- Starke-Ottich I
- Stephan JG
- Stephens JD
- Szulc J
- Szulkin M
- Tack AJM
- Tamburrino Í
- Tate TD
- Tergemina E
- Theodorou P
- Thompson KA
- Threlfall CG
- Tinghitella RM
- Toledo-Chelala L
- Tong AT
- Tong X
- Uroy L
- Utsumi S
- Vandegehuchte ML
- VanWallendael A
- Vidal PM
- Wadgymar SM
- Wang A-Y
- Wang N
- Warbrick ML
- Whitney KD
- Whitney KS
- Wiesmeier M
- Wiles JT
- Wu J
- Xirocostas ZA
- Yan Z
- Yao J
- Yoder JB
- Yoshida O
- Zhang J
- Zhao Z
- Ziter CD
- Zuellig MP
- Zufall RA
- Zurita JE
- Zytynska SE
- Álvarez J
- Publication venue
- 'American Association for the Advancement of Science (AAAS)'
- Publication date
- 01/01/2022
- Field of study
Urbanization transforms environments in ways that alter biological evolution. We examined whether urban environmental change drives parallel evolution by sampling 110,019 white clover plants from 6169 populations in 160 cities globally. Plants were assayed for a Mendelian antiherbivore defense that also affects tolerance to abiotic stressors. Urban-rural gradients were associated with the evolution of clines in defense in 47% of cities throughout the world. Variation in the strength of clines was explained by environmental changes in drought stress and vegetation cover that varied among cities. Sequencing 2074 genomes from 26 cities revealed that the evolution of urban-rural clines was best explained by adaptive evolution, but the degree of parallel adaptation varied among cities. Our results demonstrate that urbanization leads to adaptation at a global scale
Autoantibodies against type I IFNs in patients with critical influenza pneumonia
- Author
- 3c-dijon Study
- Abad Arranz Maria
- Abel Laurent
- Abel Laurent
- Abelenda Alonso Gabriela
- Abou Tayoun Ahmad
- Aguilar Guisado Manuela
- Aiuti Alessandro
- Al-muhsen Saleh
- Al-mulla Fahd
- Anderson Mark S.
- Andreakos Evangelos
- Andreakos Evangelos
- Argaud Laurent
- Arias Andrés A.
- Aydillo Teresa
- Balsera-manzanero María
- Baris Feldman Hagit
- Bastard Paul
- Belot Alexandre
- Belot Alexandre
- Biggs Catherine M.
- Bizien Lucy
- Boeuf Benoit
- Bogunovic Dusan
- Bolze Alexandre
- Bondarenko Anastasiia
- Bonneaudeau Brigitte
- Bousfiha Ahmed A.
- Briones Marisa
- Brodin Petter
- Bryceson Yenan
- Bustamante Carlos D.
- Butte Manish J.
- Cannet Dorothée
- Carratala Jordi
- Casalegno Jean Sebastien
- Casanova Jean Laurent
- Casanova Jean Laurent
- Casari Giorgio
- Castagnoli Riccardo
- Cerba Healthcare Group
- Christodoulou John
- Cobat Aurélie
- Coeuret Pellicer Mireille
- Cognasse Fabrice
- Colomb Benoit
- Condino-neto Antonio
- Constances Cohort
- Constantinescu Stefan N.
- Cooper Megan A.
- Cordero Elisa
- Covid Human Genetic Effort
- Cupic Anastasija
- Dalgard Clifton L.
- Darmon Michael
- Debette Stéphanie
- Debette Stéphanie
- Del Mar Muñoz Garcia Maria
- Desai Murkesh
- Dominguez Pinilla Nerea
- Drolet Beth A.
- Dufouil Carole
- El Baghdadi Jamila
- Escoresca Ortega Ana
- Espinosa Padilla Sara
- Etablissement Français Du Sang Study Group
- Etzioni Amos
- Fellay Jacques
- Ferreres José
- Ferres Marcela
- Feys Simon
- Fievet Nathalie
- Flaig Amandine
- Flores Carlos
- Fournet Thomas
- Fragkou Paraskevi C.
- Franco José Luis
- Froidure Antoine
- Galani Ioanna Evdokia
- Gallardo Ríos Rafaela
- Gallian Pierre
- García Salum Tamara
- García Sastre Adolfo
- Gervais Adrian
- Goavec Kelian
- Goldberg Marcel
- Gonzalez Granado Luis L.
- Gregersen Peter K.
- Grimbacher Bodo
- Haerynck Filomeen
- Haerynck Filomeen
- Hagin David
- Halwani Rabih
- Hammarström Lennart
- Hamzeh Cognasse Hind
- Hanna Suhair
- Heath James R.
- Henny Joseph
- Henrickson Sarah E.
- Hernu Romain
- Hsieh Elena W.Y.
- Husebye Eystein
- Imai Kohsuke
- Itan Yuval
- Jarvis Erich D.
- Javouhey Etienne
- Jeanne Michel
- Jouanguy Emmanuelle
- Karamitros Timokratis
- Kisand Kai
- Kisand Kai
- Koltsida Ourania
- Ku Cheng-lung
- Ku Cheng-lung
- Kuo Chen-yen
- Lachaize Morgane
- Lau Yu-lung
- Laurent Emilie
- Le Corre Nicole
- Le Got Stéphane
- Le Voyer Tom
- Lei Wei-te
- Lemonnier Sylvie
- Lina Bruno
- Ling Yun
- Lucas Carrie L.
- Lyon Antigrippe Working Group
- Maniatis Tom
- Manry Jeremy
- Mansouri Davood
- Martin Fernando
- Maródi László
- Medina Rafael A.
- Mehlal Sedkaoui Souad
- Merino Díaz Laura
- Meyts Isabelle
- Meyts Isabelle
- Milner Joshua D.
- Miorin Lisa
- Mironska Kristina
- Mogensen Trine H.
- Morand Patrice
- Morel Pascal
- Morio Tomohiro
- Nadif Rachel
- Navarrete Nicolás
- Ng Lisa F.P.
- Niubó Jordi
- Notarangelo Luigi D.
- Notarangelo Luigi D.
- Novelli Antonio
- Novelli Giuseppe
- O'farrelly Cliona
- Okada Satoshi
- Okamoto Keisuke
- Ozcelik Tayfun
- Ozguler Anna
- Padey Blandine
- Palomo Virginia
- Pan-hammarström Qiang
- Pape Jean W.
- Patural Hugues
- Peigue Lafeuille Helene
- Perez De Diego Rebeca
- Perlin David S.
- Perroquin Magali
- Pesole Graziano
- Philippot Quentin
- Pizzorno Andrés
- Planas Anna M.
- Pothier Pierre
- Pozzetto Bruno
- Prando Carolina
- Puel Anne
- Pujol Aurora
- Quenot Jean Pierre
- Queromes Gregory
- Quintana Murci Lluis
- Ramaswamy Sathishkumar
- Ramírez Duque Nieves
- Rapti Vasiliki
- Reipi Inf Working Group
- Renia Laurent
- Resnick Igor
- Retamar Gentil Pilar
- Richard Pascale
- Rodríguez De Castro Felipe
- Rodríguez Gallego Carlos
- Rodríguez-gallego Carlos
- Rombauts Alexander
- Romero Oraa Laura
- Romero Vázquez Gloria María
- Rosa Calatrava Manuel
- Rosain Jérémie
- Rovina Nikoletta
- Ruiz Hernandez José Juan
- Saker Kahina
- Salamanca Rivera Celia
- Sallette Jérôme
- Sancho Shimizu Vanessa
- Schwebel Carole
- Sediva Anna
- Seppänen Mikko R.J.
- Shahrooei Mohammed
- Shcherbina Anna
- Slaby Ondrej
- Snow Andrew L.
- Soler Palacín Pere
- Solé Violán Jordi
- Soumaré Aïcha
- Souweine Bertrand
- Spaan András N.
- Su Helen C.
- Sánchez Cordero Maria Jose
- Sánchez Céspedes Javier
- Särekannu Karita
- Tal Galit
- Tancevski Ivan
- Tangye Stuart G.
- Temel Şehime Gülsün
- Tiberghien Pierre
- Tiberghien Pierre
- Triantafyllia Vasiliki
- Trouillet Assant Sophie
- Tsiodras Sotirios
- Turvey Stuart E.
- Tzourio Christophe
- Uddin K.m. Furkan
- Uddin Mohammed J.
- Valiente Adoración
- Van De Beek Diederik
- Vanderbeke Lore
- Vanker Martti
- Vinh Donald C.
- Von Bernuth Horst
- Wauters Joost
- Wauters Joost
- Wroblewski Isabelle
- Zatz Mayana
- Zawadzki Pawel
- Zhang Qian
- Zins Marie
- Zins Marie
- Publication venue
- 'Rockefeller University Press'
- Publication date
- 01/01/2022
- Field of study
In an international cohort of 279 patients with hypoxemic influenza pneumonia, we identified 13 patients (4.6%) with autoantibodies neutralizing IFN-alpha and/or -omega, which were previously reported to underlie 15% cases of life-threatening COVID-19 pneumonia and one third of severe adverse reactions to live-attenuated yellow fever vaccine. Autoantibodies neutralizing type I interferons (IFNs) can underlie critical COVID-19 pneumonia and yellow fever vaccine disease. We report here on 13 patients harboring autoantibodies neutralizing IFN-alpha 2 alone (five patients) or with IFN-omega (eight patients) from a cohort of 279 patients (4.7%) aged 6-73 yr with critical influenza pneumonia. Nine and four patients had antibodies neutralizing high and low concentrations, respectively, of IFN-alpha 2, and six and two patients had antibodies neutralizing high and low concentrations, respectively, of IFN-omega. The patients' autoantibodies increased influenza A virus replication in both A549 cells and reconstituted human airway epithelia. The prevalence of these antibodies was significantly higher than that in the general population for patients 70 yr of age (3.1 vs. 4.4%, P = 0.68). The risk of critical influenza was highest in patients with antibodies neutralizing high concentrations of both IFN-alpha 2 and IFN-omega (OR = 11.7, P = 1.3 x 10(-5)), especially those <70 yr old (OR = 139.9, P = 3.1 x 10(-10)). We also identified 10 patients in additional influenza patient cohorts. Autoantibodies neutralizing type I IFNs account for similar to 5% of cases of life-threatening influenza pneumonia in patients <70 yr old
Deep-sea deployment of the KM3NeT neutrino telescope detection units by self-unrolling
- Author
- Aiello S.
- Albert A.
- Aly Z.
- Ameli F.
- Anassontzis E. G.
- Andre M.
- Androulakis G.
- Anghinolfi M.
- Anguita M.
- Anton G.
- Ardid M.
- Aublin J.
- Bagatelas C.
- Bakker R.
- Barbarino G.
- Baret B.
- Bendahman M.
- Berbeen E.
- Berg A. M. van den
- Bertin V.
- Biagi S.
- Billault M.
- Bissinger M.
- Boettcher M.
- Bojaddaini I. El
- Boumaaza J.
- Bouta M.
- Bouwhuis M.
- Bozza C.
- Breton R. Le
- Bruijn R.
- Brunner J.
- Brânzaş H.
- Buis E.
- Buompane R.
- Busto J.
- Cacopardo G.
- Caiffi B.
- Caillat L.
- Calvo D.
- Capone A.
- Carretero V.
- Castaldi P.
- Celli S.
- Chabab M.
- Chau N.
- Chen A.
- Cherubini S.
- Chiarella V.
- Chiarusi T.
- Chowdhury N. R. Khan
- Circella M.
- Clark M. Lindsey
- Cocimano R.
- Coelho J. A. B.
- Coleiro A.
- Colonges S.
- Coniglione R.
- Corredoira I.
- Cosquer A.
- Coyle P.
- Creusot A.
- Cuttone G.
- D'Amato C.
- D'Onofrio A.
- Dallier R.
- de Jong M.
- de Jong P.
- De Palma M.
- de Wasseige G.
- de Wolf E.
- Di Palma I.
- Diego-Tortosa D.
- Distefano C.
- Domi A.
- Donzau C.
- Donà R.
- Dornic D.
- Drouhin D.
- Díaz A. F.
- Dörr M.
- Eberl T.
- Eddyamoui A.
- Elsaesser D.
- Enzenhöfer A.
- Espinosa V.
- Fearraigh B. Ó
- Fermani P.
- Ferrara G.
- Filipović M. D.
- Filippini F.
- Fusco L. A.
- Gabella O.
- Gal T.
- Garre S. Alves
- Garufi F.
- Gatelet Y.
- Geißelbrecht N.
- Gialanella L.
- Giorgio E.
- González J. Palacios
- Gostiaux L.
- Gozzini S. R.
- Gracia R.
- Graf K.
- Grasso D.
- Grella G.
- Greus F. Salesa
- Grmek A.
- Guderian D.
- Guidii C.
- Hallmann S.
- Hamdaoui H.
- Heijboer A.
- Hekaloa A.
- Henry S.
- Hernández-Rey J. J.
- Hillebrand T.
- Hofestädt J.
- Huang F.
- Ibnsalih W. Idrissi
- Ilioni A.
- Illuminati G.
- James C. W.
- Jung B. J.
- Kadler M.
- Kalaczyński P.
- Kalekin O.
- Katz U. F.
- Kistauri G.
- Koffeman E. N.
- Kooijman P.
- Kouchner A.
- Kreter M.
- Kulikovskiy V.
- Laan M.
- Lahmann R.
- Lamare P.
- Larosa G.
- Laurence J.
- Leonardi O.
- Leone F.
- Leonora E.
- Levi G.
- Lincetto M.
- Lipreau T.
- Longhitano F.
- LopezCotoa D.
- Losa A. Sánchez
- Maderer L.
- Mannheim K.
- Margiotta A.
- Marinelli A.
- Markou C.
- Martin L.
- Martini A.
- Martínez-Mora J. A.
- Marzaioli F.
- Mastroianni S.
- Mazzou S.
- Mańczak J.
- Melis K. W.
- Miele G.
- Migliozzi P.
- Migneco E.
- Mijakowski P.
- Miranda L. S.
- Molla M. Colomer
- Mollo C. M.
- Mongelli M.
- Morganti M.
- Moser M.
- Moussa A.
- Muller R.
- Musumeci M.
- Nauta L.
- Navas S.
- Nicolau C. A.
- O'Sullivan M.
- Organokov M.
- Orlando A.
- Papalashvili G.
- Papaleo R.
- Pastore C.
- Pellegrino C.
- Perrin-Terrin M.
- Piattelli P.
- Pieterse C.
- Pikounis K.
- Pisanti O.
- Poirè C.
- Popa V.
- Pradier T.
- Pree S. Basegmez du
- Pulvirenti S.
- Pérez D. Muñoz
- Pühlhofer G.
- Păun A. M.
- Păvălaş G. E.
- Rabyang O.
- Raffaelli F.
- Randazzo N.
- Razzaque S.
- Real D.
- Reck S.
- Riccobene G.
- Richer M.
- Rivoire S.
- Rovelli A.
- Samtleben D. F. E.
- Sanguineti M.
- Santangelo A.
- Santonocito D.
- Sapienza P.
- Schnabel J.
- Schumann J.
- Seneca J.
- Sgura I.
- Shanidze R.
- Sharma A.
- Simeone F.
- Sinopoulou A.
- Soto A. Garcia
- Spisso B.
- Spurio M.
- Stavropoulos D.
- Steijger J.
- Stellacci S. M.
- Taiutii M.
- Tayalati Y.
- Tenllado E.
- Thakore T.
- The KM3NeT Collaboration
- Tingay S.
- Tzamariudaki E.
- Tzanetatos D.
- Tézier D.
- van der Knaap F.
- van Eeden T.
- van Eijk D.
- Van Elewyck V.
- van Haren H.
- van Heerwaarden J.
- Vasileiadis G.
- Versari F.
- Viola S.
- Vivolo D.
- Wilms J.
- Wojaczyński R.
- Zavatarelli S.
- Zegarelli A.
- Zito D.
- Zornoza J. D.
- Zywucka N.
- Zúñiga J.
- Publication venue
- 'IOP Publishing'
- Publication date
- 01/01/2020
- Field of study
KM3NeT is a research infrastructure being installed in the deep Mediterranean Sea.
It will house a neutrino telescope comprising hundreds of networked moorings — detection units
or strings — equipped with optical instrumentation to detect the Cherenkov radiation generated
by charged particles from neutrino-induced collisions in its vicinity. In comparison to moorings
typically used for oceanography, several key features of the KM3NeT string are different: the
instrumentation is contained in transparent and thus unprotected glass spheres; two thin Dyneema®
ropes are used as strength members; and a thin delicate backbone tube with fibre-optics and copper
wires for data and power transmission, respectively, runs along the full length of the mooring. Also,
compared to other neutrino telescopes such as ANTARES in the Mediterranean Sea and GVD in
Lake Baikal, the KM3NeT strings are more slender to minimise the amount of material used for
support of the optical sensors. Moreover, the rate of deploying a large number of strings in a period
of a few years is unprecedented. For all these reasons, for the installation of the KM3NeT strings,
a custom-made, fast deployment method was designed. Despite the length of several hundreds of
metres, the slim design of the string allows it to be compacted into a small, re-usable spherical
launching vehicle instead of deploying the mooring weight down from a surface vessel. After
being lowered to the seafloor, the string unfurls to its full length with the buoyant launching vehicle
rolling along the two ropes. The design of the vehicle, the loading with a string, and its underwater
self-unrolling are detailed in this paper.French National Research Agency (ANR)
ANR-15-CE31-0020Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)European Union (EU)Institut Universitaire de France (IUF)LabEx UnivEarthS
ANR-10-LABX-0023
ANR-18-IDEX-0001Paris Ile-de-France Region, FranceShota Rustaveli National Science Foundation of Georgia (SRNSFG), Georgia
FR-18-1268German Research Foundation (DFG)Greek Ministry of Development-GSRTIstituto Nazionale di Fisica Nucleare (INFN), Ministero dell'Universita e della Ricerca (MUR), PRIN Italy
NAT-NET 2017W4HA7SMinistry of Higher Education, Scientific Research and Professional Training, MoroccoNetherlands Organization for Scientific Research (NWO)
Netherlands GovernmentNational Science Center, Poland
National Science Centre, Poland
2015/18/E/ST2/00758National Authority for Scientific Research (ANCS), RomaniaMinisterio de Ciencia, Innovación, Investigación y Universidades (MCIU): Programa Estatal de Generación de Conocimiento (MCIU/FEDER)
PGC2018-096663-B-C41
PGC2018-096663-B-A-C42
PGC2018-096663-B-BC43
PGC2018-096663-B-B-C44Severo Ochoa Centre of Excellence and MultiDark Consolider (MCIU), Junta de Andalucía
SOMM17/6104/UGRGeneralitat Valenciana
GRISOLIA/2018/119
CIDEGENT/2018/034La Caixa Foundation
LCF/BQ/IN17/11620019EU: MSC program, Spain
71367
Autoantibodies against type I IFNs in patients with life-threatening COVID-19
- Author
- Abad Capa Jorge
- Abel L.
- Abela L.
- Abelb L.
- Abelc L.
- Abers M.S.
- Agra J.J.C.
- Aguilera-Albesa S.
- Aiuti A.
- Akcan O.M.
- Al-Mulla F.
- Alarcon M.G.
- Alavoine L.
- Albert M.L.
- Alcover A.
- Aldave J.C.
- Algera A.G.
- Alkan G.
- Allardet-Servent J.
- Allende L.M.
- Alsina L.
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- Alyanakian M.A.
- Amador-Borrero B.
- Amat K.K.A.
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- Anderson M.S.
- Andrejak C.
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- Arquero M.F.
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- Aytekin S.E.
- Azot A.
- Bachelet D.
- Bajolle F.
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- Ballester M.
- Bansal N.
- Barrett K.S.
- Barrou B.
- Basmaci R.
- Bastard P.
- Bax D.
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- Behillil S.
- Bellani G.
- Belot A.
- Belota A.
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- Blanchard-Rohner G.
- Blanco I.
- Blandinières A.
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- Brodin P.
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- Bustamante J.
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- Catherinot E.
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- Couffin-Cadiergues S.
- Couffin-Cadiergues S.
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- de Diego R.P.
- de Diego R.P.
- de Jesus A.A.
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- de Pontual L.
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- Debray M.P.
- Dechanet A.
- Dehban A.
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- Descamps D.
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- Duval X.
- Duval X.
- Duval X.
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- Flores Carlos
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- Malvy D.
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- Mansouri D.
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- Mohammed N.S.
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- Moreno X.S.
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- Mouquet H.
- Mouquet H.
- Muhsen S.A.
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- Neant N.
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- Notarangeloa L.D.
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- Novelli G.
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- Yazdanpanah Y.
- Yazdanpanah Y.
- Yosunkaya A.
- Young B.E.
- Yucel F.
- Zannad F.
- Zarhrate M.
- Zatz M.
- Zawadzki P.
- Zhang P.
- Zhang Q.
- Zhang S.Y.
- Zhang Y.
- Zwinderman A.H.
- Íñigo-Campos A.
- Publication venue
- 'American Association for the Advancement of Science (AAAS)'
- Publication date
- 01/01/2020
- Field of study
Interindividual clinical variability in the course of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection is vast. We report that at least 101 of 987 patients with life-threatening coronavirus disease 2019 (COVID-19) pneumonia had neutralizing immunoglobulin G (IgG) autoantibodies (auto-Abs) against interferon-w (IFN-w) (13 patients), against the 13 types of IFN-a (36), or against both (52) at the onset of critical disease; a few also had auto-Abs against the other three type I IFNs. The auto-Abs neutralize the ability of the corresponding type I IFNs to block SARS-CoV-2 infection in vitro. These auto-Abs were not found in 663 individuals with asymptomatic or mild SARS-CoV-2 infection and were present in only 4 of 1227 healthy individuals. Patients with auto-Abs were aged 25 to 87 years and 95 of the 101 were men. A B cell autoimmune phenocopy of inborn errors of type I IFN immunity accounts for life-threatening COVID-19 pneumonia in at least 2.6% of women and 12.5% of men
A922 Sequential measurement of 1 hour creatinine clearance (1-CRCL) in critically ill patients at risk of acute kidney injury (AKI)
- Author
- Abbott TE
- Abdallah RI
- Abdel-Aal IR
- Abdelmonem SA
- Abdo WF
- Abellan AN
- Abellán AN
- Abellán AN
- Abellán AN
- Abrams ST
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- Adhikari NK
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- 01/01/2016
- Field of study
Meeting abstrac
Risk profiles and one-year outcomes of patients with newly diagnosed atrial fibrillation in India: Insights from the GARFIELD-AF Registry.
- Author
- A. Abd El-Aziz
- A. Abdul
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- A. Aggarwala
- A. Agrawal
- A. Al Mulla
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- Z.M. Yang
- Publication venue
- Indian Heart J
- Publication date
- 01/01/2018
- Field of study
BACKGROUND: The Global Anticoagulant Registry in the FIELD-Atrial Fibrillation (GARFIELD-AF) is an ongoing prospective noninterventional registry, which is providing important information on the baseline characteristics, treatment patterns, and 1-year outcomes in patients with newly diagnosed non-valvular atrial fibrillation (NVAF). This report describes data from Indian patients recruited in this registry. METHODS AND RESULTS: A total of 52,014 patients with newly diagnosed AF were enrolled globally; of these, 1388 patients were recruited from 26 sites within India (2012-2016). In India, the mean age was 65.8 years at diagnosis of NVAF. Hypertension was the most prevalent risk factor for AF, present in 68.5% of patients from India and in 76.3% of patients globally (P < 0.001). Diabetes and coronary artery disease (CAD) were prevalent in 36.2% and 28.1% of patients as compared with global prevalence of 22.2% and 21.6%, respectively (P < 0.001 for both). Antiplatelet therapy was the most common antithrombotic treatment in India. With increasing stroke risk, however, patients were more likely to receive oral anticoagulant therapy [mainly vitamin K antagonist (VKA)], but average international normalized ratio (INR) was lower among Indian patients [median INR value 1.6 (interquartile range {IQR}: 1.3-2.3) versus 2.3 (IQR 1.8-2.8) (P < 0.001)]. Compared with other countries, patients from India had markedly higher rates of all-cause mortality [7.68 per 100 person-years (95% confidence interval 6.32-9.35) vs 4.34 (4.16-4.53), P < 0.0001], while rates of stroke/systemic embolism and major bleeding were lower after 1 year of follow-up. CONCLUSION: Compared to previously published registries from India, the GARFIELD-AF registry describes clinical profiles and outcomes in Indian patients with AF of a different etiology. The registry data show that compared to the rest of the world, Indian AF patients are younger in age and have more diabetes and CAD. Patients with a higher stroke risk are more likely to receive anticoagulation therapy with VKA but are underdosed compared with the global average in the GARFIELD-AF. CLINICAL TRIAL REGISTRATION-URL: http://www.clinicaltrials.gov. Unique identifier: NCT01090362
Circulating microRNAs in sera correlate with soluble biomarkers of immune activation but do not predict mortality in ART treated individuals with HIV-1 infection: A case control study
- Author
- Aagaard B.
- Abel S.
- Abeli C.
- Abgrall S.
- Aboulker J. P.
- Abrams D. I.
- Abusamra L.
- Acosta E. A.
- Adam A.
- Adams S.
- Adams S.
- Adamski A.
- Agmon-Levin N.
- Agrawal S.
- Aichelburg A.
- Aichelburg A.
- Ainsworth J. G.
- Aiuti F.
- Alcázar-Caballero R.
- Aldir M.
- Alexander I.
- Allegra D.
- Allworth A. M.
- Almeida M. M. T. B.
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- Andersen P Lehm
- Andersen Å. Bengaard
- Anderson C.
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- Anderson J.
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- Andrews L.
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- Aquilia S.
- Aquilia S.
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- Aragon E.
- Aragon E.
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- Arnaiz J.
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- Belloso W.
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- Bouchaud O.
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- Brockmeyer N.
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- Weiss L.
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- Weller I.
- Wellons A.
- Wendt N.
- Wendt N. A.
- Wengenroth C.
- Wentworth D.
- Wentworth Deborah
- Whiles H. J.
- White D.
- White D. J.
- White M.
- Whitman T.
- Wiedemeyer K.
- Wilkin M.
- Williams B.
- Williams E.
- Williams G.
- Williams I.
- Williams K.
- Williams L.
- Williams L.
- Williams N.
- Willoughby M.
- Windham J.
- Winzer R.
- Winzer R.
- Wirtz S.
- Wiselka M.
- Witt M.
- Witter J. H.
- Wojtusic L.
- Wolf E.
- Wood H.
- Wood R.
- Workowski K.
- Worley J.
- Worley J.
- Wortmann G.
- Wright T.
- Wright T. J.
- Wyman N.
- Wyzydrag L.
- Xylomenos G.
- Yakovlev A.
- Yamamoto Y.
- Yazdanpanah Y.
- Yee T.
- Yeh V.
- Yeni P.
- Youds D.
- Youds D. W.
- Youle M.
- Young B.
- Yust I.
- Yust I.
- Zajdenverg R.
- Zakharova N.
- Zala C.
- Zarowny D.
- Zarowny D.
- Zeana C.
- Zeh J.
- Zelasky C.
- Zeng A.
- Zillman J.
- Zilmer K.
- Zoloth L.
- Zucman D.
- Zwickl B.
- Publication venue
- 'Public Library of Science (PLoS)'
- Publication date
- 01/01/2015
- Field of study
Introduction: The use of anti-retroviral therapy (ART) has dramatically reduced HIV-1 associated morbidity and mortality. However, HIV-1 infected individuals have increased rates of morbidity and mortality compared to the non-HIV-1 infected population and this appears to be related to end-organ diseases collectively referred to as Serious Non-AIDS Events (SNAEs). Circulating miRNAs are reported as promising biomarkers for a number of human disease conditions including those that constitute SNAEs. Our study sought to investigate the potential of selected miRNAs in predicting mortality in HIV-1 infected ART treated individuals. Materials and Methods: A set of miRNAs was chosen based on published associations with human disease conditions that constitute SNAEs. This case: control study compared 126 cases (individuals who died whilst on therapy), and 247 matched controls (individuals who remained alive). Cases and controls were ART treated participants of two pivotal HIV-1 trials. The relative abundance of each miRNA in serum was measured, by RTqPCR. Associations with mortality (all-cause, cardiovascular and malignancy) were assessed by logistic regression analysis. Correlations between miRNAs and CD4+ T cell count, hs-CRP, IL-6 and D-dimer were also assessed. Results: None of the selected miRNAs was associated with all-cause, cardiovascular or malignancy mortality. The levels of three miRNAs (miRs -21, -122 and -200a) correlated with IL-6 while miR-21 also correlated with D-dimer. Additionally, the abundance of miRs -31, -150 and -223, correlated with baseline CD4+ T cell count while the same three miRNAs plus miR- 145 correlated with nadir CD4+ T cell count. Discussion: No associations with mortality were found with any circulating miRNA studied. These results cast doubt onto the effectiveness of circulating miRNA as early predictors of mortality or the major underlying diseases that contribute to mortality in participants treated for HIV-1 infection
The diet of feral cats on islands: a review and a call for more studies
- Author
- A Aguirre-Muñoz
- A Balmford
- A Berruti
- A Burbidge
- AJ Stattersfield
- AP Clevenger
- ARE Sinclair
- AW Trites
- B. Keitt
- B. Tershy
- BG Tabachnick
- BJ Karl
- BM Fitzgerald
- BM Fitzgerald
- BM Fitzgerald
- BM Fitzgerald
- BM Fitzgerald
- BM Fitzgerald
- BS Keitt
- BS Keitt
- C Gillies
- C Jones
- C. J. Donlan
- CA Driscoll
- CJ Krebs
- CM King
- CR Dickman
- CR Tidemann
- CV Espinosa-Gayosso
- D Oro
- D Pontier
- DR Peck
- DW Macdonald
- E Bonnaud
- E Jones
- E Jones
- E. Bonnaud
- E. Vidal
- E. Zavaleta
- EC Murphy
- F Courchamp
- F Courchamp
- F Santana
- F. M. Medina
- FM Medina
- FM Medina
- FM Medina
- FM Medina
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- G Roemer
- GA Harper
- GA Harper
- GN Bramley
- IAE Atkinson
- J Diamond
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- JE Martínez-Gómez
- JJ Schall
- JL Long
- JP Bloomer
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- K Kawakami
- KA Hayde
- KS Sousa
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- M García-Márquez
- M Nogales
- M Nogales
- M Nogales
- M Nogales
- M Nogales
- M Nogales
- M. Le Corre
- M. Nogales
- ME Jones
- MJ Konecny
- MJ Rauzon
- N Alterio
- N Alterio
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- N Kawauchi
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- P Derenne
- P Derenne
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- PJ Apps
- PJ Apps
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- RB Phillips
- RD Kirkpatrick
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- RJ Aarde Van
- RJ Aarde Van
- RJ Whittaker
- RR Sokal
- S Mukherjee
- S Pearre Jr
- S Watanabe
- S. V. Horwath
- T Brooks
- T Jogahara
- TD Smucker
- TH Fritts
- TJ Snetsinger
- TM Blackburn
- W Seabrook
- W Seabrook
- WH Marshall
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- Field of study
Global urban environmental change drives adaptation in white clover
- Author
- Aguirre Windsor E.
- Akinwole Philips O.
- Alberti Marina
- Anderson Jill T.
- Anderson Joseph J.
- Ando Yoshino
- Andrew Nigel R.
- Angeoletto Fabio
- Anstett Daniel N.
- Anstett Julia
- Aoki-Gonçalves Felipe
- Arietta A. Z. Andis
- Arroyo Mary T. K.
- Austen Emily J.
- Baena-Díaz Fernanda
- Barker Cory A.
- Baylis Howard A.
- Beliz Julia M.
- Benitez-Mora Alfonso
- Bickford David
- Biedebach Gabriela
- Blackburn Gwylim S.
- Boehm Mannfred M. A.
- Bonser Stephen P.
- Bonte Dries
- Bragger Jesse R.
- Branquinho Cristina
- Brans Kristien I.
- Bresciano Jorge C.
- Brom Peta D.
- Bucharova Anna
- Burt Briana
- Cahill James F.
- Campbell Katelyn D.
- Carlen Elizabeth J.
- Carmona Diego
- Castellanos Maria Clara
- Centenaro Giada
- Chalen Izan
- Chaves Jaime A.
- Chen Xiao-Yong
- Chilton Angela M.
- Chomiak Kristina M.
- Chávez-Pesqueira Mariana
- Cisneros-Heredia Diego F.
- Cisse Ibrahim K.
- Classen Aimée T.
- Cohan Beata
- Comerford Mattheau S.
- Corney Hannah
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- Crawford Kerri M.
- Dahirel Maxime
- David Santiago
- De Haan Robert
- Deacon Nicholas J.
- Dean Clare
- del-Val Ek
- Deligiannis Eleftherios K.
- Denney Derek
- Dettlaff Margarete A.
- DiLeo Michelle F.
- Ding Yuan-Yuan
- Dominoni Davide M.
- Domínguez-López Moisés E.
- Draud Savannah L.
- Dyson Karen
- Ellers Jacintha
- Espinosa Carlos I.
- Essi Liliana
- Falahati-Anbaran Mohsen
- Falcão Jéssica C. F.
- Fargo Hayden T.
- Fellowes Mark D. E.
- Fitzpatrick Connor R.
- Fitzpatrick Raina M.
- Flaherty Leah E.
- Flood Pádraic J.
- Flores María F.
- Fornoni Juan
- Foster Amy G.
- Fradinger Camila Cordoba
- Frost Christopher J.
- Fuentes Tracy L.
- Fulkerson Justin R.
- Gagnon Edeline
- Garbsch Frauke
- Garroway Colin J.
- Gerstein Aleeza C.
- Giasson Mischa M.
- Girdler E. Binney
- Gkelis Spyros
- Godsoe William
- Golemiec Anneke M.
- Golemiec Mireille
- González-Lagos César
- Gorton Amanda J.
- Gotanda Kiyoko M.
- Granath Gustaf
- Greiner Stephan
- Griffiths Joanna S.
- Grilo Filipa
- Gundel Pedro E.
- Hamilton Benjamin
- Hardin Joyce M.
- He Tianhua
- Heard Stephen B.
- Henriques André F.
- Hernández-Poveda Melissa
- Hetherington-Rauth Molly C.
- Hill Sarah J.
- Hochuli Dieter F.
- Hodgins Kathryn A.
- Hood Glen R.
- Hopkins Gareth R.
- Hovanes Katherine A.
- Howard Ava R.
- Hubbard Sierra C.
- Ibarra-Cerdeña Carlos N.
- Innes Simon G.
- Iñiguez-Armijos Carlos
- Jara-Arancio Paola
- Jarrett Benjamin J. M.
- Jeannot Manon
- Jiménez-Lobato Vania
- Johnson Mae
- Johnson Marc T. J.
- Johnson Oscar
- Johnson Philip P.
- Johnson Reagan
- Josephson Matthew P.
- Jung Meen Chel
- Just Michael G.
- Kahilainen Aapo
- Kailing Otto S.
- Kariñho-Betancourt Eunice
- Karousou Regina
- Kirn Lauren A.
- Kirschbaum Anna
- Koch Sophie
- Laine Anna-Liisa
- LaMontagne Jalene M.
- Lampei Christian
- Lara Carlos
- Larson Erica L.
- Le Jennifer H.
- Leandro Deleon S.
- Lee Christopher
- Lei Yunting
- Lequerica Tamara Manuel E.
- Levesque Danica C.
- León Carolina A.
- Liao Wan-Jin
- Ljubotina Megan
- Locke Hannah
- Lockett Martin T.
- Longo Tiffany C.
- Lundholm Jeremy T.
- Lázaro-Lobo Adrián
- MacGillavry Thomas
- Mackin Christopher R.
- Mahmoud Alex R.
- Manju Isaac A.
- Mariën Janine
- Martínez D. Nayeli
- Martínez-Bartolomé Marina
- Meineke Emily K.
- Mendoza-Arroyo Wendy
- Merritt Lila Elizabeth L.
- Merritt Thomas J. S.
- Migiani Giuditta
- Miles Lindsay S.
- Minor Emily S.
- Mitchell Nora
- Mohammadi Bazargani Mitra
- Moles Angela T.
- Monk Julia D.
- Moore Christopher M.
- Morales-Morales Paula A.
- Moyers Brook T.
- Munim Samreen
- Munshi-South Jason
- Murphy Shannon M.
- Murúa Maureen M.
- Muñoz-Rojas Miriam
- Neila Melisa
- Ness Rob W.
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- Njunjić Iva
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- Núñez-Farfán Juan
- Ohgushi Takayuki
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- Opedal Øystein H.
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- Parachnowitsch Amy L.
- Paratore Aaron S.
- Parody-Merino Angela M.
- Paule Juraj
- Paulo Octávio S.
- Pena João Carlos
- Peres-Neto Pedro R.
- Pfeiffer Vera W.
- Pinho Pedro
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- Prashad Cindy
- Puentes Adriana
- Qu Jiao
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- Raeymaekers Joost A. M.
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- Rivera Benjamin J.
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- Rossi Laura S.
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- Ryan Travis J.
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- Sanders Nathan J.
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- Santiago-Rosario Luis Y.
- Savage Amy M.
- Scheepens J.F.
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- Schneider Adam C.
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- Scott Jared L.
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- Shefferson Richard P.
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- Shykoff Jacqui A.
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- Smith Alexis D.
- Solis-Gabriel Lizet
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- Stephan Jörg G.
- Stephens Jessica D.
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- Theodorou Panagiotis
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- Threlfall Caragh G.
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- Wu Jianqiang
- Xirocostas Zoe A.
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- Yao Jiahe
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- Yoshida Owen
- Zhang Jingxiong
- Zhao Zhigang
- Ziter Carly D.
- Zuellig Matthew P.
- Zufall Rebecca A.
- Zurita Juan E.
- Zytynska Sharon E.
- Álvarez Jackie
- Publication venue
- 'American Association for the Advancement of Science (AAAS)'
- Publication date
- 01/01/2022
- Field of study
Urbanization transforms environments in ways that alter biological evolution. We examined whether urban environmental change drives parallel evolution by sampling 110,019 white clover plants from 6169 populations in 160 cities globally. Plants were assayed for a Mendelian antiherbivore defense that also affects tolerance to abiotic stressors. Urban-rural gradients were associated with the evolution of clines in defense in 47% of cities throughout the world. Variation in the strength of clines was explained by environmental changes in drought stress and vegetation cover that varied among cities. Sequencing 2074 genomes from 26 cities revealed that the evolution of urban-rural clines was best explained by adaptive evolution, but the degree of parallel adaptation varied among cities. Our results demonstrate that urbanization leads to adaptation at a global scale
- …