Implementing GitHub Actions Continuous Integration to Reduce Error Rates in Ecological Data Collection

Accurate field data are essential to understanding ecological systems and forecasting their responses to global change. Yet, data collection errors are common, and data analysis often lags far enough behind its collection that many errors can no longer be corrected, nor can anomalous observations be revisited. Needed is a system in which data quality assurance and control (QA/QC), along with the production of basic data summaries, can be automated immediately following data collection. Here, we implement and test a system to satisfy these needs. For two annual tree mortality censuses and a dendrometer band survey at two forest research sites, we used GitHub Actions continuous integration (CI) to automate data QA/QC and run routine data wrangling scripts to produce cleaned datasets ready for analysis. This system automation had numerous benefits, including (1) the production of near real-time information on data collection status and errors requiring correction, resulting in final datasets free of detectable errors, (2) an apparent learning effect among field technicians, wherein original error rates in field data collection declined significantly following implementation of the system, and (3) an assurance of computational reproducibility—that is, robustness of the system to changes in code, data and software. By implementing CI, researchers can ensure that datasets are free of any errors for which a test can be coded. The result is dramatically improved data quality, increased skill among field technicians, and reduced need for expert oversight. Furthermore, we view CI implementation as a first step towards a data collection and analysis pipeline that is also more responsive to rapidly changing ecological dynamics, making it better suited to study ecological systems in the current era of rapid environmental change

Management of multidrug resistant Gram-negative bacilli infections in solid organ transplant recipients: SET/GESITRA-SEIMC/REIPI recommendations

Solid organ transplant (SOT) recipients are especially at risk of developing infections by multidrug resistant (MDR) Gram-negative bacilli (GNB), as they are frequently exposed to antibiotics and the healthcare setting, and are regulary subject to invasive procedures. Nevertheless, no recommendations concerning prevention and treatment are available. A panel of experts revised the available evidence; this document summarizes their recommendations: (1) it is important to characterize the isolate´s phenotypic and genotypic resistance profile; (2) overall, donor colonization should not constitute a contraindication to transplantation, although active infected kidney and lung grafts should be avoided; (3) recipient colonization is associated with an increased risk of infection, but is not a contraindication to transplantation; (4) different surgical prophylaxis regimens are not recommended for patients colonized with carbapenem-resistant GNB; (5) timely detection of carriers, contact isolation precautions, hand hygiene compliance and antibiotic control policies are important preventive measures; (6) there is not sufficient data to recommend intestinal decolonization; (7) colonized lung transplant recipients could benefit from prophylactic inhaled antibiotics, specially for Pseudomonas aeruginosa; (8) colonized SOT recipients should receive an empirical treatment which includes active antibiotics, and directed therapy should be adjusted according to susceptibility study results and the severity of the infection.J.T.S. holds a research contract from the Fundación para la Formación e Investigación de los Profesionales de la Salud de Extremadura (FundeSalud), Instituto de Salud Carlos III. M.F.R. holds a clinical research contract “Juan Rodés” (JR14/00036) from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness, Instituto de Salud Carlos III

Propuesta para la creación de una organización sin ánimo de lucro enfocada en la implementación de un proyecto socio productivo, agrícola y ecológico para el desarrollo del adulto mayor, en el municipio de Guasca – Cundinamarca.

El presente trabajo analiza la construcción de la “propuesta de núcleo de trabajo como proyecto socio productivo agrícola y ecológico para el desarrollo del adulto mayor del municipio de Guasca –Cundinamarca”, como un aporte social en busca de la economía solidaria y ayuda a la mejora continua de los habitantes de tercera edad dedicados al rubro de la agricultura, ubicados en el municipio nombrado anteriormente, lo anterior será realiza por medio de la creación de una Organización No Gubernamental. En el presente proyecto se resalta la importancia de generar por medio de un núcleo de trabajo, una manera óptima de beneficiar a los adultos mayores a través de la implementación de la metodología de investigación el cual se implementa por un manejo ergonómico en busca de la mejora de una actividad en específica a nivel agro-económico, en donde, se hará una revisión puntual del contexto general del campesino, sus recursos físicos y económicos, sus capacidades, motivaciones y problemáticas generales, de esta forma, el análisis de la información evidenciará el infinito potencial que tiene cada puesto de trabajo instalado para mejorar la calidad de vida de estas personas, donde a partir de la implementación del mismo, principalmente enfocado en los campesinos de la tercera edad, se espera abordar las principales características físicas y cognitivas de este segmento poblacional, así mismo mitigar o compensar los impactos ambientales negativos fundamentando la adopción de modelos ambientales teniendo admisibilidad de los impactos residuales, implementando el reciclaje durante el proceso de producción.1. Introducción. -- 2. Descripción del problema. -- 3. formulación del problema. -- 4. Objetivos específicos. -- 5. Estudio de mercado. -- 6. Definición del producto. -- 7. Análisis de clientes, consumidor y usuario. -- 8. Segmentación estratégica / análisis sectorial. -- 9. Usuario. -- 10. Consumidor. -- 11. Descripción del problema. -- 12. Formulación del problema. -- 13. Objetivos específicos. -- 14. Estudio de mercado. -- 15. Definición del producto. -- 16. Análisis de clientes, consumidor y usuario. -- 17. Segmentación estratégica / Análisis sectorial. --18. Usuario. -- 19. Consumidor. -- 20. Demanda. -- 21. Demanda histórica. -- 22. Demanda actual. -- 23. Demanda proyectada. -- 24. Oferta. -- 25. Publicidad, promoción y Producción del producto en el núcleo de trabajo. -- 26. Sistema de comercialización. -- 27. Evaluación de precios. -- 28. Estudio técnico. -- 29. Descripción del núcleo de trabajo. -- 30. Localización núcleos de trabajo. -- 31. Características de la zona. -- 32. Tamaño y capacidad del proyecto. -- 33. Distribución y diseño de cada núcleo de trabajo. -- 34. Render’s. -- 35. Estanque. -- 36. Módulos. -- 37. Soportes. -- 38. Canastillas. -- 39. Oxigenador. -- 40. Botellas de plástico. -- 41. Pérgola. -- 42. Filtro entrada de agua. -- 43. Filtro de salida de agua. -- 44. Mueble auxiliar. -- 45. Planos. -- 46. Especificaciones. -- 47. Recursos materiales. -- 48. Recursos financieros. -- 49. Recursos humanos. -- 50. Características del núcleo de trabajo. -- 51. Funcionamiento. -- 52. Materiales utilizados para cada núcleo de trabajo. -- 53. Estructura organizacional. -- 54. Viabilidad técnica. -- 55. Estudio financiero. -- 56. Aspecto social y ambiental. -- 57. Recomendaciones. -- 58. Conclusione

ACVIM Consensus Statement on Therapeutic Antimicrobial Use in Animals and Antimicrobial Resistance

The epidemic of antimicrobial resistant infections continues to challenge, compromising animal care, complicating food animal production and posing zoonotic disease risks. While the overall role of therapeutic antimicrobial use in animals in the development AMR in animal and human pathogens is poorly defined, veterinarians must consider the impacts of antimicrobial use in animal and take steps to optimize antimicrobial use, so as to maximize the health benefits to animals while minimizing the likelihood of antimicrobial resistance and other adverse effects. This consensus statement aims to provide guidance on the therapeutic use of antimicrobials in animals, balancing the need for effective therapy with minimizing development of antimicrobial resistance in bacteria from animals and humans