Challenges and opportunities for quantifying roots and rhizosphere interactions through imaging and image analysis

The morphology of roots and root systems influences the efficiency by which plants acquire nutrients and water, anchor themselves and provide stability to the surrounding soil. Plant genotype and the biotic and abiotic environment significantly influence root morphology, growth and ultimately crop yield. The challenge for researchers interested in phenotyping root systems is, therefore, not just to measure roots and link their phenotype to the plant genotype, but also to understand how the growth of roots is influenced by their environment. This review discusses progress in quantifying root system parameters (e.g. in terms of size, shape and dynamics) using imaging and image analysis technologies and also discusses their potential for providing a better understanding of root:soil interactions. Significant progress has been made in image acquisition techniques, however trade-offs exist between sample throughput, sample size, image resolution and information gained. All of these factors impact on downstream image analysis processes. While there have been significant advances in computation power, limitations still exist in statistical processes involved in image analysis. Utilizing and combining different imaging systems, integrating measurements and image analysis where possible, and amalgamating data will allow researchers to gain a better understanding of root:soil interactions

Une copie de la Muqaddima de l'exemplaire du Kitāb al-'Ibar offert par Ibn-Haldūn à l'Université Al-Qarawiyîn de Fès

A copy of the Muqaddima of the lost Kitäb al-'Ibar given by Ibn Haldün to the Al-Qarawiyln University at Fes. First noticed in the 18th century by al-Maggarf, the so called « Fes manuscript » of the Kitäb al-'Ibar took the Orientalists' attention in the early 19th century. Unfortunately for almost a hundred years it was not accessible to scholars and when they could look at, out of the seven books send by Ibn Haldün himself from Cairo to the library of the well-known al-Qarawijin University at Fes, two only were surviving, may be three according to a description given on 1961. The contradictory informations about these two or three items are not enough for scholars and the most quoted manuscript of Ibn Haldün's historical work remains anyway the less known. The original manuscript is now incomplete but its copies, and those especially containing the lost parts, have unfortunately been thoroughly neglected. There are actually many of them, one of which is a copy acquired in 1841 by the Bibliothèque nationale of Paris. This manuscript, which the author has discovered, containing the Prolegomena and being certainly a direct copy of the lost original, will take a very important part in the text tradition.Signalé au XVIIe siècle par al-Maqqarî, le manuscrit du Kitäb al-'Ibar dit « manuscrit de Fès » attira l'attention des orientalistes dès le début du XIXe siècle. Mais, durant un siècle encore, il demeurera inaccessible aux chercheurs. Et quand, au XIXe siècle, ils purent le consulter, il n'en subsistait plus que deux volumes — trois selon une notice publiée en 1961 — sur les sept envoyés du Caire par Ibn Haldün lui-même à la bibliothèque de la célèbre Université al-Qarawiyîn. Mais les descriptions contradictoires de ces deux ou trois volumes laissent sur sa faim le chercheur scrupuleux. Ainsi, le manuscrit le plus décrit de l'œuvre historique d'Ibn Haldün reste encore le moins bien connu. L' « original » étant incomplet, on se serait attendu à ce que l'on s'intéressât à ses copies, et tout spécialement à celles des parties considérées comme perdues. Il n'en est malheureusement rien. Or, il en existe de nombreuses parmi lesquelles celle entrée à la Bibliothèque nationale en 1841 et qui ne fut jamais identifiée. Elle représente les Prolégomènes dont l'original n'a pas encore été retrouvé. C'est dire l'importance de ce manuscrit que nous regardons, par ailleurs, comme une copie directe de cet original.Redjala Mbarek. Une copie de la Muqaddima de l'exemplaire du Kitāb al-'Ibar offert par Ibn-Haldūn à l'Université Al-Qarawiyîn de Fès. In: Revue d'histoire des textes, bulletin n°3 (1973), 1974. pp. 193-201

Ibn Khaldûn devant la torture et la mort violente

Redjala Mbarek. Ibn Khaldûn devant la torture et la mort violente. In: Revue de l'Occident musulman et de la Méditerranée, n°40, 1985. Al-Andalus - Culture et société. pp. 155-171

Les Barghwâta (origine de leur nom)

Abstract The North African Middle Ages will long remain obscure and muddled if we do not tackle the attentive and close examination of the texts and if we continue to content ourselves with generalities. The «dark ages» are dark only because we merely skim over them to build brilliant and seductive theories at the expense of populations who cannot protest. Much has been written on the Barghwâta and much is repetitive. Monsters for some people, Berber nationalists for others, nearly everybody more or less agreeing in accepting that their name comes from Rio Barbât in Spain, where one of them was supposedly born. I have tried through texts and by resorting to toponymy and onomastics, to give an explanation of this name that is closer to the historico-linguistic reality of the Maghrib during the medieval period.Résumé Le Moyen-Âge nord-africain demeurera encore longtemps obscur et désordonné tant que nous ne nous attaquerons pas à l'examen attentif et serré des textes et que nous continuerons à nous satisfaire de généralités. Les «siècles obscurs» ne le sont que parce que nous nous contentons de les survoler pour construire des thèses brillantes et séduisantes aux frais de populations qui ne peuvent pas protester. L'on a écrit beaucoup sur les Barghwâta et l'on s'est très souvent répété. Des monstres pour les uns, des nationalistes berbères pour d'autres, presque tous s'accordant plus ou moins à accepter qu'ils tiennent leur nom d'un des leurs qui serait né à Rio Barbât, en Espagne. J'essaie, par les textes et en faisant appel à la toponymie et à l'onomastique, de donner une explication de ce nom plus conforme à la réalité historico-linguistique du Maghreb à l'époque médiévale.Redjala Mbarek. Les Barghwâta (origine de leur nom). In: Revue de l'Occident musulman et de la Méditerranée, n°35, 1983. pp. 115-125

Etude de l'absorption racinaire du cadmium afin d'améliorer la modélisation de son transfert vers les plantes

This thesis aimed to improve the comprehension of cadmium (Cd) absorption by maize and alpine pennycress plants in order to model better its transfer into edible and hyperaccumulating plants. Since the model used is sensitive to the characteristics of root absorption, the first objective was to develop a rigorous method for measuring those parameters. Two protocols were finalized to describe precisely Cd net influx in both root compartments (apoplast and symplast) according to Cd concentration in solution. The results highlighted, for the first time, the existence of a low-affinity transport system (LATS) that works at the same time with the high-affinity transport system (HATS). However, the kinetics parameters measured through these experimentations did not succeed in improving significantly the model: Cd uptake by maize is overestimated by 100%, and Cd uptake by alpine pennycress is under-estimated by 66%. Several factors were investigated in order to understand the reasons of this difference. We showed that the experimental conditions used to measure the kinetics parameters present characteristics that are able to modify their values significantly: the ionic composition of the solution of exposition to Cd, Cd concentration during growth, and the root structure that forms in hydroponics. This thesis suggests to choose aeroponics as controlled culture condition, and to measure the kinetics parameters in an ionic composition that is representative of the close vicinity of the root cell walls and membranes in soil. This composition remains to be investigated.Cette thèse s'applique à améliorer la compréhension de l'absorption du cadmium (Cd) par le maïs et le tabouret calaminaire, dans l'objectif de mieux modéliser son transfert vers les plantes comestibles ou hyperaccumulatrices. Le modèle utilisé étant sensible aux caractéristiques d'absorption racinaire, le premier objectif était de développer une méthode rigoureuse de mesure de ces paramètres. Deux protocoles ont été mis au point pour décrire précisément, en fonction de la concentration de Cd en solution, l'influx net de Cd dans les parois et dans le milieu intracellulaire des racines. Les résultats ont mis en évidence, pour la première fois, l'existence d'un système de transport à faible affinité (LATS) qui agit en même temps que le système de transport à forte affinité pour le Cd (HATS). Les nouveaux paramètres cinétiques mesurés n'ont cependant pas amélioré significativement le modèle : le prélèvement de Cd par le maïs est surestimé de 100%, et son prélèvement par le tabouret calaminaire est sous-estimé de 66%. Plusieurs facteurs ont alors été étudiés pour comprendre les raisons de ce décalage. Nous avons montré que les conditions dans lesquelles ont été mesurés les paramètres cinétiques présentaient des caractéristiques capables de modifier radicalement leurs valeurs : la composition ionique de la solution d'exposition au Cd, la concentration de Cd durant la croissance et la structure racinaire engendrée par l'hydroponie. Cette thèse suggère de cultiver les plantes en aéroponie et de mesurer les paramètres cinétiques dans une composition ionique représentative du voisinage des parois et des membranes racinaires en sol, composition qu'il reste encore à déterminer

Remarques sur les problèmes linguistiques en Algérie

M'Barek Redjala. Remarques sur les problèmes linguistiques en Algérie. In: L'Homme et la société, N. 28, 1973. Linguistique structuralisme et marxisme. pp. 161-177

Harry Thirwal Norris, The Berbers in Arabie Literature. Longman, London and New York, Librairie du Liban, 1982

Redjala Mbarek. Harry Thirwal Norris, The Berbers in Arabie Literature. Longman, London and New York, Librairie du Liban, 1982. In: Bulletin critique des annales islamologiques, n°4, 1987. pp. 131-134

Study of cadmium root absorption to improve modeling of cadmium transfer from soil to plants

Cette thèse s’applique à améliorer la compréhension de l’absorption du cadmium (Cd) par le maïs et le tabouret calaminaire, dans l’objectif de mieux modéliser son transfert vers les plantes comestibles ou hyperaccumulatrices. Le modèle utilisé étant sensible aux caractéristiques d’absorption racinaire, le premier objectif était de développer une méthode rigoureuse de mesure de ces paramètres. Deux protocoles ont été mis au point pour décrire précisément, en fonction de la concentration de Cd en solution, l’influx net de Cd dans les parois et dans le milieu intracellulaire des racines. Les résultats ont mis en évidence, pour la première fois, l’existence d’un système de transport à faible affinité (LATS) qui agit en même temps que le système de transport à forte affinité pour le Cd (HATS). Les nouveaux paramètres cinétiques mesurés n’ont cependant pas amélioré significativement le modèle : le prélèvement de Cd par le maïs est surestimé de 100%, et son prélèvement par le tabouret calaminaire est sous-estimé de 66%. Plusieurs facteurs ont alors été étudiés pour comprendre les raisons de ce décalage. Nous avons montré que les conditions dans lesquelles ont été mesurés les paramètres cinétiques présentaient des caractéristiques capables de modifier radicalement leurs valeurs : la composition ionique de la solution d’exposition au Cd, la concentration de Cd durant la croissance et la structure racinaire engendrée par l’hydroponie. Cette thèse suggère de cultiver les plantes en aéroponie et de mesurer les paramètres cinétiques dans une composition ionique représentative du voisinage des parois et des membranes racinaires en sol, composition qu’il reste encore à déterminer.This thesis aimed to improve the comprehension of cadmium (Cd) absorption by maize and alpine pennycress plants in order to model better its transfer into edible and hyperaccumulating plants. Since the model used is sensitive to the characteristics of root absorption, the first objective was to develop a rigorous method for measuring those parameters. Two protocols were finalized to describe precisely Cd net influx in both root compartments (apoplast and symplast) according to Cd concentration in solution. The results highlighted, for the first time, the existence of a low-affinity transport system (LATS) that works at the same time with the high-affinity transport system (HATS). However, the kinetics parameters measured through these experimentations did not succeed in improving significantly the model: Cd uptake by maize is overestimated by 100%, and Cd uptake by alpine pennycress is under-estimated by 66%. Several factors were investigated in order to understand the reasons of this difference. We showed that the experimental conditions used to measure the kinetics parameters present characteristics that are able to modify their values significantly: the ionic composition of the solution of exposition to Cd, Cd concentration during growth, and the root structure that forms in hydroponics. This thesis suggests to choose aeroponics as controlled culture condition, and to measure the kinetics parameters in an ionic composition that is representative of the close vicinity of the root cell walls and membranes in soil. This composition remains to be investigated