227 research outputs found

    Common Co-activation of AXL and CDCP1 in EGFR-mutation-positive Non-smallcell Lung Cancer Associated With Poor Prognosis.

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    Epidermal growth factor receptor (EGFR)-mutation-positive non-smallcell lung cancer (NSCLC) is incurable, despite high rates of response to EGFR tyrosine kinase inhibitors (TKIs). We investigated receptor tyrosine kinases (RTKs), Src family kinases and focal adhesion kinase (FAK) as genetic modifiers of innate resistance in EGFR-mutation-positive NSCLC. We performed gene expression analysis in two cohorts (Cohort 1 and Cohort 2) of EGFR-mutation-positive NSCLC patients treated with EGFR TKI. We evaluated the efficacy of gefitinib or osimertinib with the Src/FAK/Janus kinase 2 (JAK2) inhibitor, TPX0005 in vitro and in vivo. In Cohort 1, CUB domain-containing protein-1 (CDCP1) was an independent negative prognostic factor for progression-free survival (hazard ratio of 1.79, p=0.0407) and overall survival (hazard ratio of 2.23, p=0.0192). A two-gene model based on AXL and CDCP1 expression was strongly associated with the clinical outcome to EGFR TKIs, in both cohorts of patients. Our preclinical experiments revealed that several RTKs and non-RTKs, were up-regulated at baseline or after treatment with gefitinib or osimertinib. TPX-0005 plus EGFR TKI suppressed expression and activation of RTKs and downstream signaling intermediates. Co-expression of CDCP1 and AXL is often observed in EGFR-mutation-positive tumors, limiting the efficacy of EGFR TKIs. Co-treatment with EGFR TKI and TPX-0005 warrants testing

    In silico Analyses of Immune System Protein Interactome Network, Single-Cell RNA Sequencing of Human Tissues, and Artificial Neural Networks Reveal Potential Therapeutic Targets for Drug Repurposing Against COVID-19

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    Background: There is pressing urgency to identify therapeutic targets and drugs that allow treating COVID-19 patients effectively.Methods: We performed in silico analyses of immune system protein interactome network, single-cell RNA sequencing of human tissues, and artificial neural networks to reveal potential therapeutic targets for drug repurposing against COVID-19.Results: We screened 1,584 high-confidence immune system proteins in ACE2 and TMPRSS2 co-expressing cells, finding 25 potential therapeutic targets significantly overexpressed in nasal goblet secretory cells, lung type II pneumocytes, and ileal absorptive enterocytes of patients with several immunopathologies. Then, we performed fully connected deep neural networks to find the best multitask classification model to predict the activity of 10,672 drugs, obtaining several approved drugs, compounds under investigation, and experimental compounds with the highest area under the receiver operating characteristics.Conclusion: After being effectively analyzed in clinical trials, these drugs can be considered for treatment of severe COVID-19 patients. Scripts can be downloaded at

    The Spanish Infrared Camera onboard the EUSO-BALLOON (CNES) flight on August 24, 2014

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    The EUSO-Balloon (CNES) campaign was held during Summer 2014 with a launch on August 24. In the gondola, next to the Photo Detector Module (PDM), a completely isolated Infrared camera was allocated. Also, a helicopter which shooted flashers flew below the balloon. We have retrieved the Cloud Top Height (CTH) with the IR camera, and also the optical depth of the nonclear atmosphere have been inferred with two approaches: The first one is with the comparison of the brightness temperature of the cloud and the real temperature obtained after the pertinent corrections. The second one is by measuring the detected signal from the helicopter flashers by the IR Camera, considering the energy of the flashers and the location of the helicopter

    Antimicrobial resistance among migrants in Europe: a systematic review and meta-analysis

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    BACKGROUND: Rates of antimicrobial resistance (AMR) are rising globally and there is concern that increased migration is contributing to the burden of antibiotic resistance in Europe. However, the effect of migration on the burden of AMR in Europe has not yet been comprehensively examined. Therefore, we did a systematic review and meta-analysis to identify and synthesise data for AMR carriage or infection in migrants to Europe to examine differences in patterns of AMR across migrant groups and in different settings. METHODS: For this systematic review and meta-analysis, we searched MEDLINE, Embase, PubMed, and Scopus with no language restrictions from Jan 1, 2000, to Jan 18, 2017, for primary data from observational studies reporting antibacterial resistance in common bacterial pathogens among migrants to 21 European Union-15 and European Economic Area countries. To be eligible for inclusion, studies had to report data on carriage or infection with laboratory-confirmed antibiotic-resistant organisms in migrant populations. We extracted data from eligible studies and assessed quality using piloted, standardised forms. We did not examine drug resistance in tuberculosis and excluded articles solely reporting on this parameter. We also excluded articles in which migrant status was determined by ethnicity, country of birth of participants' parents, or was not defined, and articles in which data were not disaggregated by migrant status. Outcomes were carriage of or infection with antibiotic-resistant organisms. We used random-effects models to calculate the pooled prevalence of each outcome. The study protocol is registered with PROSPERO, number CRD42016043681. FINDINGS: We identified 2274 articles, of which 23 observational studies reporting on antibiotic resistance in 2319 migrants were included. The pooled prevalence of any AMR carriage or AMR infection in migrants was 25·4% (95% CI 19·1-31·8; I2 =98%), including meticillin-resistant Staphylococcus aureus (7·8%, 4·8-10·7; I2 =92%) and antibiotic-resistant Gram-negative bacteria (27·2%, 17·6-36·8; I2 =94%). The pooled prevalence of any AMR carriage or infection was higher in refugees and asylum seekers (33·0%, 18·3-47·6; I2 =98%) than in other migrant groups (6·6%, 1·8-11·3; I2 =92%). The pooled prevalence of antibiotic-resistant organisms was slightly higher in high-migrant community settings (33·1%, 11·1-55·1; I2 =96%) than in migrants in hospitals (24·3%, 16·1-32·6; I2 =98%). We did not find evidence of high rates of transmission of AMR from migrant to host populations. INTERPRETATION: Migrants are exposed to conditions favouring the emergence of drug resistance during transit and in host countries in Europe. Increased antibiotic resistance among refugees and asylum seekers and in high-migrant community settings (such as refugee camps and detention facilities) highlights the need for improved living conditions, access to health care, and initiatives to facilitate detection of and appropriate high-quality treatment for antibiotic-resistant infections during transit and in host countries. Protocols for the prevention and control of infection and for antibiotic surveillance need to be integrated in all aspects of health care, which should be accessible for all migrant groups, and should target determinants of AMR before, during, and after migration. FUNDING: UK National Institute for Health Research Imperial Biomedical Research Centre, Imperial College Healthcare Charity, the Wellcome Trust, and UK National Institute for Health Research Health Protection Research Unit in Healthcare-associated Infections and Antimictobial Resistance at Imperial College London

    The atmospheric science of JEM-EUSO

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    An Atmospheric Monitoring System (AMS) is critical suite of instruments for JEM-EUSO whose aim is to detect Ultra-High Energy Cosmic Rays (UHECR) and (EHECR) from Space. The AMS comprises an advanced space qualified infrared camera and a LIDAR with cross checks provided by a ground-based and airborne Global Light System Stations. Moreover the Slow Data Mode of JEM-EUSO has been proven crucial for the UV background analysis by comparing the UV and IR images. It will also contribute to the investigation of atmospheric effects seen in the data from the GLS or even to our understanding of Space Weather

    Regulators of genetic risk of breast cancer identified by integrative network analysis.

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    Genetic risk for breast cancer is conferred by a combination of multiple variants of small effect. To better understand how risk loci might combine, we examined whether risk-associated genes share regulatory mechanisms. We created a breast cancer gene regulatory network comprising transcription factors and groups of putative target genes (regulons) and asked whether specific regulons are enriched for genes associated with risk loci via expression quantitative trait loci (eQTLs). We identified 36 overlapping regulons that were enriched for risk loci and formed a distinct cluster within the network, suggesting shared biology. The risk transcription factors driving these regulons are frequently mutated in cancer and lie in two opposing subgroups, which relate to estrogen receptor (ER)(+) luminal A or luminal B and ER(-) basal-like cancers and to different luminal epithelial cell populations in the adult mammary gland. Our network approach provides a foundation for determining the regulatory circuits governing breast cancer, to identify targets for intervention, and is transferable to other disease settings.This work was funded by Cancer Research UK and the Breast Cancer Research Foundation. MAAC is funded by the National Research Council (CNPq) of Brazil. TEH held a fellowship from the US DOD Breast Cancer Research Program (W81XWH-11-1-0592) and is currently supported by an RAH Career Development Fellowship (Australia). TEH and WDT are funded by the NHMRC of Australia (NHMRC) (ID: 1008349 WDT; 1084416 WDT, TEH) and Cancer Australia/National Breast Cancer Foundation (ID 627229; WDT, TEH). BAJP is a Gibb Fellow of Cancer Research UK. We would like to acknowledge the support of The University of Cambridge, Cancer Research UK and Hutchison Whampoa Limited.This is the author accepted manuscript. The final version is available from NPG via http://dx.doi.org/10.1038/ng.345

    Reporte de Estabilidad Financiera - I semestre 2021

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    En virtud del mandato otorgado por la Constitución Política de Colombia y de acuerdo con lo reglamentado por la Ley 31 de 1992, el Banco de la República tiene la responsabilidad de velar por la estabilidad de los precios. El adecuado cumplimiento de esta tarea depende crucialmente del mantenimiento de la estabilidad financiera. La estabilidad financiera se entiende como una condición general en la cual el sistema financiero (establecimientos, mercados e infraestructuras): 1. Evalúa y administra los riesgos financieros de una manera que facilita el desempeño de la economía y la asignación eficiente de los recursos; 2. está en capacidad de absorber, disipar y mitigar de manera autónoma la materialización de los riesgos que pueda surgir como resultado de eventos adversos. Este Reporte de Estabilidad Financiera cumple el objetivo de presentar la apreciación del Banco de la República sobre el desempeño reciente de los establecimientos de crédito y sus deudores, así como sobre los principales riesgos y vulnerabilidades que podrían tener algún efecto sobre la estabilidad financiera de la economía colombiana. Con este objetivo se pretende informar a los participantes en los mercados financieros y al público, además de promover el debate público sobre las tendencias y los riesgos que atañen al sistema financiero. Los resultados aquí presentados sirven también a la autoridad monetaria como base para la toma de decisiones que permitan promover la estabilidad financiera en el contexto general de los objetivos de estabilidad de precios y estabilidad macroeconómica. Este Reporte se complementa con el Reporte de Sistemas de Pago publicado anualmente por el Banco de la República, en el cual se divulga la labor de seguimiento a las infraestructuras financieras de la economía colombiana.Recuadro 1. Caracterización del ciclo del crédito de mediano plazo en Colombia. Autores: Wilmar Cabrera - Camilo Gómez - Daniela Rodríguez-NovoaRecuadro 2. Indicadores alternativos para medir las tasas históricas de creación y destrucción de empresas en Colombia. Autores: Julián David Castañeda - Felipe Clavijo Ramírez - Camilo Eduardo Sánche

    Reporte de Estabilidad Financiera - I semestre 2022

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    El principal objetivo del Banco de la República es preservar la capacidad adquisitiva de la moneda, en coordinación con la política económica general, entendida como aquella que propende por estabilizar el producto y el empleo en sus niveles sostenibles de largo plazo. El adecuado cumplimiento del objetivo asignado al Banco por la Constitución de 1991 depende crucialmente del mantenimiento de la estabilidad financiera. Esta se entiende como una condición general con la cual el sistema financiero evalúa y administra los riesgos financieros de una manera que facilita el desempeño de la economía y la asignación eficiente de los recursos, a la vez que está en capacidad de absorber, disipar y mitigar de manera autónoma la materialización de los riesgos que pueden surgir como resultado de eventos adversos. El Reporte de Estabilidad Financiera cumple el objetivo de presentar el diagnóstico del Banco de la República sobre el desempeño reciente del sistema financiero y de sus deudores, así como sobre los principales riesgos y vulnerabilidades que podrían tener algún efecto sobre la estabilidad de la economía colombiana. Con este objetivo se pretende informar a los participantes en los mercados financieros y a la ciudadanía, y promover el debate público sobre las tendencias y los riesgos que afectan al sistema. Los resultados aquí presentados sirven también a la autoridad monetaria como base para la toma de decisiones que permiten promover la estabilidad financiera en el contexto general de sus objetivos. Esta edición marca el vigésimo aniversario del Reporte de Estabilidad Financiera, cuyo primer número fue publicado en julio de 2002. En estos veinte años el marco de política crediticia y macroprudencial en Colombia se ha fortalecido continuamente, al tiempo que la regulación y la supervisión financiera han seguido de cerca los estándares internacionales. Gracias a ello, desde 2002 el sistema financiero colombiano ha expandido sus servicios a la economía y ha sorteado diversas circunstancias económicas, manteniendo su solidez y estabilidad. A lo largo del tiempo, el Reporte de Estabilidad Financiera ha sido y continúa siendo objeto de actualización permanente por parte del Banco de la República, con el fin de mejorar su utilidad para el público en general. El análisis presentado en este Reporte permite concluir que en los últimos meses se ha consolidado la recuperación de la actividad crediticia en Colombia: el crédito se ha acelerado (en todas sus modalidades) y continúa la caída de los préstamos vencidos y riesgosos. Los establecimientos de crédito conservan indicadores de solvencia y liquidez cómodamente superiores a los mínimos establecidos en la regulación. El desempeño de los establecimientos de crédito y de las instituciones financieras no bancarias, en un contexto de mayor volatilidad en los mercados, refleja la solidez y la estabilidad del sistema financiero colombiano. Al tiempo, la conjunción de diversos acontecimientos globales y el comportamiento reciente del crédito configuran algunas vulnerabilidades para la estabilidad del sistema financiero. Primero, al igual que lo mencionado en la edición anterior del Reporte, en los últimos meses ha persistido la exposición de la economía colombiana y de las entidades financieras a cambios súbitos en las condiciones financieras globales, en un entorno de alta incertidumbre. Segundo, en meses recientes se ha observado una rápida aceleración del crédito a los hogares en Colombia, tanto en la categoría de vivienda como especialmente en la de consumo; la tendencia de aceleración del crédito podría eventualmente ocasionar fragilidades, si se tiene en cuenta que la razón de endeudamiento a ingreso disponible de los hogares se encuentra alrededor de su máximo histórico. En todo caso, los resultados presentados en este Reporte indican que el sistema financiero se muestra suficientemente resiliente a escenarios adversos en ambos frentes de vulnerabilidad. En cumplimiento de sus objetivos constitucionales y en coordinación con la red de seguridad del sistema financiero, el Banco de la República continuará monitoreando de cerca el panorama de estabilidad financiera en esta coyuntura y tomará aquellas decisiones que sean necesarias para garantizar el adecuado funcionamiento de la economía, facilitar los flujos de recursos suficientes de crédito y liquidez, y promover el buen funcionamiento del sistema de pagos. Leonardo Villar Gómez Gerente General ecuadro 1: Descalce cambiario negativo del sector real en Colombia en 2021 Autores:Álvaro David Carmona Duarte, Adrián Martínez Osorio y Jorge Niño Cuervo Recuadro 2: Resultados del programa de evaluación del sector financiero colombiano del Fondo Monetario Internacional y el Banco Mundial Autor: Daniel OsorioRecuadro 1: Descalce cambiario negativo del sector real en Colombia en 2021. Autores: Álvaro David Carmona Duarte - Adrián Martínez Osorio - Jorge Niño CuervoRecuadro 2: Resultados del programa de evaluación del sector financiero colombiano del Fondo Monetario Internacional y el Banco Mundial. Autor: Daniel Osori

    Reporte de Estabilidad Financiera - II semestre 2021

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    El principal objetivo del Banco de la República es preservar la capacidad adquisitiva de la moneda, en coordinación con la política económica general, entendida como aquella que propende por estabilizar el producto y el empleo en sus niveles sostenibles de largo plazo. El adecuado cumplimiento del objetivo asignado al Banco por la Constitución de 1991 depende crucialmente del mantenimiento de la estabilidad financiera. Esta se entiende como una condición general en la cual el sistema financiero evalúa y administra los riesgos financieros de una manera que facilita el desempeño de la economía y la asignación eficiente de los recursos, a la vez que está en capacidad de absorber, disipar y mitigar de manera autónoma la materialización de los riesgos que pueden surgir como resultado de eventos adversos. Este Reporte de Estabilidad Financiera cumple el objetivo de presentar el diagnóstico del Banco de la República sobre el desempeño reciente del sistema financiero y de sus deudores, así como sobre los principales riesgos y vulnerabilidades que podrían tener algún efecto sobre la estabilidad de la economía colombiana. Con este objetivo se pretende informar a los participantes en los mercados financieros y a la ciudadanía, además de promover el debate público sobre las tendencias y los riesgos que afectan al sistema. Los resultados aquí presentados sirven también a la autoridad monetaria como base para la toma de decisiones que permiten promover la estabilidad financiera en el contexto general de sus objetivos. En los últimos meses, varios aspectos positivos del sistema financiero han preservado un grado notable de continuidad y estabilidad: la liquidez y solvencia de las entidades financieras se han sostenido muy por encima de los mínimos regulatorios, tanto a nivel individual como consolidado, el cubrimiento de la cartera vencida mediante provisiones continúa siendo elevado y los mercados financieros de deuda pública, privada y acciones han preservado su funcionamiento normal. Al tiempo, por primera vez desde el inicio de la pandemia se han empezado a observar una aceleración de todas las modalidades de cartera, una fuerte desaceleración de la cartera vencida y un aumento de la rentabilidad de los establecimientos de crédito. En línea con la recuperación general de la actividad económica, la principal vulnerabilidad para la estabilidad del sistema financiero colombiano identificada en la edición anterior -la incertidumbre sobre la evolución de la cartera vencida- se ha reducido y mantiene una tendencia a la baja. En esta edición, la principal fuente de vulnerabilidad que se identifica para la estabilidad financiera en el corto plazo es la exposición del sistema a cambios súbitos en las condiciones financieras internacionales, aunque los resultados presentados en este Reporte indican que el sistema se muestra suficientemente resiliente a escenarios de ese estilo. En cumplimiento de sus objetivos constitucionales y en coordinación con la red de seguridad del sistema financiero, el Banco de la República continuará monitoreando de cerca el panorama de estabilidad financiera en esta coyuntura y tomará aquellas decisiones que sean necesarias para garantizar el adecuado funcionamiento de la economía, facilitar los flujos de recursos suficientes de crédito y liquidez, y promover el buen funcionamiento del sistema de pagos. Leonardo Villar Gómez Gerente GeneralRecuadro 1. Descomposición del margen de intermediación en Colombia y Chile. Autores: Wilmar Cabrera - Daniela Rodríguez-NovoaRecuadro 2. Análisis espacial de los precios de vivienda nueva en Bogotá, Medellín y Cali mediante un enfoque de geoestadística. Autores: María Fernanda Meneses - Camilo Eduardo SánchezRecuadro 3. Modelo de tasas de interés para el ejercicio de pruebas de estrés Sysmo. Autores: Wilmar Cabrera - Diego Cuesta - Santiago Gamba - Camilo GómezRecuadro 4. Transición de la Libor y otras tasas de referencia a nivel internacional. Autores: Daniela X. Gualtero Briceño - Javier E. Pirateque Niñ
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