Y Chromosome Lineages in Men of West African Descent

The early African experience in the Americas is marked by the transatlantic slave trade from ∼1619 to 1850 and the rise of the plantation system. The origins of enslaved Africans were largely dependent on European preferences as well as the availability of potential laborers within Africa. Rice production was a key industry of many colonial South Carolina low country plantations. Accordingly, rice plantations owners within South Carolina often requested enslaved Africans from the so-called “Grain Coast” of western Africa (Senegal to Sierra Leone). Studies on the African origins of the enslaved within other regions of the Americas have been limited. To address the issue of origins of people of African descent within the Americas and understand more about the genetic heterogeneity present within Africa and the African Diaspora, we typed Y chromosome specific markers in 1,319 men consisting of 508 west and central Africans (from 12 populations), 188 Caribbeans (from 2 islands), 532 African Americans (AAs from Washington, DC and Columbia, SC), and 91 European Americans. Principal component and admixture analyses provide support for significant Grain Coast ancestry among African American men in South Carolina. AA men from DC and the Caribbean showed a closer affinity to populations from the Bight of Biafra. Furthermore, 30–40% of the paternal lineages in African descent populations in the Americas are of European ancestry. Diverse west African ancestries and sex-biased gene flow from EAs has contributed greatly to the genetic heterogeneity of African populations throughout the Americas and has significant implications for gene mapping efforts in these populations

Genetic associations at 53 loci highlight cell types and biological pathways relevant for kidney function.

Reduced glomerular filtration rate defines chronic kidney disease and is associated with cardiovascular and all-cause mortality. We conducted a meta-analysis of genome-wide association studies for estimated glomerular filtration rate (eGFR), combining data across 133,413 individuals with replication in up to 42,166 individuals. We identify 24 new and confirm 29 previously identified loci. Of these 53 loci, 19 associate with eGFR among individuals with diabetes. Using bioinformatics, we show that identified genes at eGFR loci are enriched for expression in kidney tissues and in pathways relevant for kidney development and transmembrane transporter activity, kidney structure, and regulation of glucose metabolism. Chromatin state mapping and DNase I hypersensitivity analyses across adult tissues demonstrate preferential mapping of associated variants to regulatory regions in kidney but not extra-renal tissues. These findings suggest that genetic determinants of eGFR are mediated largely through direct effects within the kidney and highlight important cell types and biological pathways

Catálogo Taxonômico da Fauna do Brasil: setting the baseline knowledge on the animal diversity in Brazil

The limited temporal completeness and taxonomic accuracy of species lists, made available in a traditional manner in scientific publications, has always represented a problem. These lists are invariably limited to a few taxonomic groups and do not represent up-to-date knowledge of all species and classifications. In this context, the Brazilian megadiverse fauna is no exception, and the Catálogo Taxonômico da Fauna do Brasil (CTFB) (http://fauna.jbrj.gov.br/), made public in 2015, represents a database on biodiversity anchored on a list of valid and expertly recognized scientific names of animals in Brazil. The CTFB is updated in near real time by a team of more than 800 specialists. By January 1, 2024, the CTFB compiled 133,691 nominal species, with 125,138 that were considered valid. Most of the valid species were arthropods (82.3%, with more than 102,000 species) and chordates (7.69%, with over 11,000 species). These taxa were followed by a cluster composed of Mollusca (3,567 species), Platyhelminthes (2,292 species), Annelida (1,833 species), and Nematoda (1,447 species). All remaining groups had less than 1,000 species reported in Brazil, with Cnidaria (831 species), Porifera (628 species), Rotifera (606 species), and Bryozoa (520 species) representing those with more than 500 species. Analysis of the CTFB database can facilitate and direct efforts towards the discovery of new species in Brazil, but it is also fundamental in providing the best available list of valid nominal species to users, including those in science, health, conservation efforts, and any initiative involving animals. The importance of the CTFB is evidenced by the elevated number of citations in the scientific literature in diverse areas of biology, law, anthropology, education, forensic science, and veterinary science, among others

Les communautés villageoises en Angleterre au Moyen Age

Les historiens anglais se sont intéressés aux problèmes de la communauté villageoise depuis longtemps. Je n’ai pas l’intention d’en faire ici l’historiographie, mais je crois qu’il serait utile, en introduisant le thème, d’insister sur deux aspects où il y a eu, depuis les dernières années du xixe siècle, une part de polémique. Les discussions ont porté d’abord sur le problème des solidarités. Y avait-il une solidarité naturelle entre les habitants de villages et de hameaux ? Ou, plutôt, les ..

Les tribunaux royaux

The Royal Courts Since they constituted the great majority of the population, the appearances of peasants were frequent in courts dealing with criminal cases (such as, murder, serious assault, burglary and theft of goods above a certain value). Their presence in non-criminal cases, such as disputes about land, debt, broken contract etc., was much less common. This was because, even in the thirteenth century, legal proceedings were expensive, even for well-to-do peasants. Nevertheless, peasants sometimes contributed to a common purse in order to hire lawyers to bring cases in the king's courts against their lords. These cases dealt with matters such as freedom of status and tenure, excessive demands for rent or labour service, encroachment on common rights. After the Black Death a new situation arose. Members of the county gentry were appointed as Justices of the Peace. They dealt not only with matters of public order but also with wage rates, prices and measures. Their justice was seen as an instrument in the hands of the gentry and against the interests of the peasantry, as the Rising of 1381 clearly showed.Dans la mesure où les paysans constituaient la grande majorité de la population, leur présence était fréquente dans les procès pour causes criminelles (meurtres, violences graves, vols au-dessus d'une certaine valeur). Par contre elle était beaucoup moins ordinaire dans les procès pour causes civiles (litiges à propos de terre, dettes, ruptures de contrat). En effet, déjà au XlIIe siècle, les procédures juridiques étaient très coûteuses et même les plus aisés des paysans ne pouvaient assumer seuls les frais d'un procès. Il arrivait cependant qu'ils fassent bourse commune pour engager des hommes de loi qui portent devant les tribunaux royaux leur cause et la défendent contre leur seigneur. Ce type de procédure était en général engagé pour des questions de liberté de statut ou de tenure, des demandes excessives de redevances ou de corvées,, des empiétements sur des droits collectifs. Après la Peste Noire, les membres de la gentry locale (county gentry) sont établis dans les fonctions de juges de Paix et traitent non seulement des affaires d'ordre public mais aussi du contrôle économique (réglementation des salaires, des prix et des mesures). La Révolte de 1381 montra clairement l'hostilité de la paysannerie à leur encontre. Les procédures juridiques paraissaient alors perverties pour servir les intérêts des grands contre les faibles, des riches contre les pauvres.Hilton Rodney H. Les tribunaux royaux. In: Études rurales, n°103-104, 1986. Droit et paysans, sous la direction de Louis Assier-Andrieu . pp. 29-38

Pourquoi il y avait si peu de redevances à part de fruits en Angleterre médiévale

Dans le cadre général des redevances payées aux seigneurs par leurs tenanciers, il est assurément aussi important de considérer le cas où il y avait peu de redevances à part de fruits (ad campipartem), comme en Angleterre, que celui où ces redevances se sont très répandues, comme en France et ailleurs en Europe. En Angleterre, comme partout en Europe occidentale au Moyen Age, les redevances demandées étaient ou en nature, ou en travail (corvée), ou en argent. On espère montrer dans ce rapport..

Pain et cervoise dans les villes anglaises au Moyen Age

Par nos sources documentaires, nous savons bien qu’aux marchés hebdomadaires et aux endroits moins légitimes, les habitants des villes anglaises ont pu acheter de la viande, des poissons, des produits laitiers, des légumes, du vin, et surtout du pain et de la cervoise. Ce n’est pas mon but de m’occuper des autres victuailles, mais seulement de ces derniers. En effet, ils étaient les plus importants, et pour des raisons alimentaires et à cause d’une documentation abondante, conséquence de l’ap..

Le clergé rural et les mouvements paysans dans l'Angleterre médiévale

L'image des gens d'Église qui ont participé aux mouvements rebelles, surtout aux mouvements paysans, dans l'Europe du Moyen Âge est souvent celle de prédicateurs itinérants plutôt que celle de curés de paroisses. John Ball, l'un des trois principaux leaders de la révolte anglaise de 1381, en est un exemple. Les chroniqueurs contemporains ont écrit beaucoup de mensonges au sujet de ce prêtre, en particulier qu'il était un adhérent de l'hérésie de John Wyclif. Mais il fait peu de doute qu'il a ..

Villages désertés et histoire économique: recherches françaises et anglaises.

Hilton R. H. Villages désertés et histoire économique: recherches françaises et anglaises.. In: Études rurales, n°32, 1968. pp. 104-109