Aplicação da distribuição Burr XII discreta na análise de dados de produção animal

In animal production, the models that mimicry the biological reality are of great importance for optimization and sustainability of the productive system. The continuous Burr XII distribution is widely used in survival data analysis, however, the same does not occur with its discrete version, recently proposed in the literature. The purpose of this work is to use the discrete Burr XII distribution, obtained by the discretization method proposed by Nakagawa and Osaki (1975), in the analysis of data related to animal production. The data analyzed describe the time, in days, from birth to first laying of yellow quail (Coturnix coturnix japonica) submitted to two diets. For this purpose the discretized versions of five distributions were used: the discrete Burr XII, the discrete Weibull, the discrete gamma, the discrete inverse-Gaussian and the discrete log-normal. For all distributions, the parameter estimates were obtained by the maximum likelihood method. Despite the similarity between the estimates it is natural to choose the discrete given the nature of the data and assuming the discrete distribution, it could be calculated exactly, for example, the probability of the time to the first posture, which is not possible if a continuous distribution is assumed. Thus, among the discrete distributions, the chi-square goodness-of-fit test showed that the Burr XII distribution was the only one indicated to describe the behavior of the data considered.Na produção animal os modelos estatísticos que mimemetizam a realidade biológica são de grande importância para otimização e sustentabilidade de sistemas produtivos. A distribuição Burr XII contínua é bastante usada na análise de dados de sobrevivência, entretanto, o mesmo não ocorre com a sua versão discreta a qual foi recentemente proposta na literatura. A proposta deste trabalho é utilizar a distribuição Burr XII discreta, obtida pelo procedimento de discretização proposto por Nakagawa e Osaki (1975), na análise de dados relacionados a produção animal. Os dados analisados descrevem o tempo, em dias, contados do nascimento até a primeira postura de codornas amarelas (Coturnix coturnix japonica) submetidas a duas dietas alimentares. Para tanto foram utilizadas as versões discretizadas de cinco distribuições: Burr XII discreta, Weibull discreta, gama discreta, inversa-gaussiana discreta e log-normal discreta. Em todas elas, as estimativas dos parâmetros foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança. Apesar da similaridade entre as estimativas é natural optar pela versão discreta dada a natureza dos dados uma vez que, pela adoção da versão discreta, pode-se calcular exatamente, por exemplo, a probabilidade do tempo até a primeira postura, o que não e possível caso seja adotado uma distribuição contínua. Entre as distribuições discretas, o teste qui-quadrado de aderência mostrou que a distribuição Burr XII foi a única indicada para descrever o comportamento dos dados utilizados

Adsorption of arsenate, phosphate and humic acids onto acicular goethite nanoparticles recovered from acid mine drainage

Acicular goethite nanoparticles (AGNs), obtained from the active treatment of acid mine drainage (AMD) on an industrial scale, were evaluated with respect to their capacity to adsorb the contaminants arsenate, phosphate and humic acids (HAs) in aqueous solution. Kinetics and equilibrium constants that describe the adsorption process were investigated. The adsorption capacity decreased in the order: HAs (37mgCg−1)>As(V) (20mgAs(V) g−1)>phosphate ions (13mgPO43−g−1). The adsorption capacity of the AGNs produced from acid mine drainage to remove arsenate, phosphate or humic acids are similar to those found for other synthetic iron oxides produced under controlled conditions at the laboratory scale. This study demonstrates the valorization of the AGNs product derived from acid mine drainage slurry waste arising from the mining of coal as an effective adsorbent materials for water treatment

Assessing the effects of a mixed Eimeria spp. challenge on performance, intestinal integrity, and the gut microbiome of broiler chickens

A mixed Eimeria spp. challenge model was designed to assess the effects of challenge on broiler chicken performance, intestinal integrity, and the gut microbiome for future use to evaluate alternative strategies for controlling coccidiosis in broiler chickens. The experimental design involved broiler chickens divided into two groups: a control group (uninfected) and a positive control group, infected with Eimeria acervulina (EA), Eimeria maxima (EM), and Eimeria tenella (ET). At day-of-hatch, 240 off-sex male broiler chicks were randomized and allocated to one of two treatment groups. The treatment groups included: (1) Non-challenged (NC, n = 5 replicate pens); and (2) challenged control (PC, n = 7 replicate pens) with 20 chickens/pen. Pen weights were recorded at d0, d16, d31, d42, and d52 to determine average body weight (BW) and (BWG). Feed intake was measured at d16, d31, d42, and d52 to calculate feed conversion ratio (FCR). Four diet phases included a starter d0–16, grower d16–31, finisher d31–42, and withdrawal d42–52 diet. At d18, chickens were orally challenged with 200 EA, 3,000 EM, and 500 ET sporulated oocysts/chicken. At d24 (6-day post-challenge) and d37 (19-day post-challenge), intestinal lesion scores were recorded. Additionally, at d24, FITC-d was used as a biomarker to evaluate intestinal permeability and ileal tissue sections were collected for histopathology and gene expression of tight junction proteins. Ileal and cecal contents were also collected to assess the impact of challenge on the microbiome. BWG and FCR from d16–31 was significantly (p < 0.05) reduced in PC compared to NC. At d24, intestinal lesion scores were markedly higher in the PC compared to the NC. Intestinal permeability was significantly increased in the PC group based on serum FITC-d levels. Cadherin 1 (CDH1), calprotectin (CALPR), and connexin 45 (Cx45) expression was also upregulated in the ileum of the PC group at d24 (6-day post-challenge) while villin 1 (VIL1) was downregulated in the ileum of the PC group. Additionally, Clostridium perfringens (ASV1) was enriched in the cecal content of the PC group. This model could be used to assess the effect of alternative coccidiosis control methods during the post-challenge with EA, EM, and ET

A communal catalogue reveals Earth's multiscale microbial diversity

Our growing awareness of the microbial world's importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth's microbial diversity.Peer reviewe

A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity

Our growing awareness of the microbial world’s importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth’s microbial diversity

O 6º objetivo da agenda dos ODS da ONU: Debates sobre água segura y saneamento básico universalizado.

El proyecto de Trabajo Comunal Universitario (TCU) No. 540: Procesos pedagógicos y didácticos para la enseñanza de los derechos humanos y la convivencia pacífica, coordinado por la Dra. Marcela Moreno Buján, con la cooperación académica del proyecto de extensión docente Grupo de Pesquisa Derecho y Sustentabilidad (GPDS), coordinado por el Dr. Carlos Peralta Montero, han unido esfuerzos para organizar y publicar la Colección “Comunidad Académica y COVID 19”. Esta colección, conformada por tres volúmenes, forma parte de la sistematización de experiencias relacionadas con las temáticas abordadas por el TCU No. 540 y el GPDS. Este volumen está compuesto por doce capítulos, desarrollados por veintiocho académicos costarricenses, brasileños y colombianos donde se reflexiona de manera interdisciplinaria sobre el sexto objetivo de la agenda de los Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS) de la ONU en el contexto de pandemia actual.UCR::Vicerrectoría de Acción Social::Trabajo Comunal Universitario (TCU

Uma abordagem Bayesiana para dados censurados à esquerda baseada em modelos de mistura e semi-contínuos usando a estrutura Tobit

The main objective of this thesis is to introduce a left-censored data analysis using the tobit model for univariate and multivariate data. The tobit model can be used as an alternative to the least squares regression model when the assumption of linearity is not satisfied. The tobit model is able to fit the data adequately by formulating a regression model for which the response is pre-fixed to a limit value. In this thesis we present five chapters, each considering a manuscript submitted for publication and with different approaches and applications. The estimation of the model parameters is performed using Bayesian inference methods. The summaries a posteriori of interest are obtained using existing MCMC (Monte Carlo on Markov Chains) simulation methods, as Gibs and Metropolis-Hasting. In the first paper (Chapter 2) we present the tobit-Weibull mixture model to analyze environmental data under the left censoring scheme. The considered dataset is related to ammonia nitrogen concentrations in rivers. In the second paper (Chapter 3), the bivariate tobit-Weibull model under a hierarchical Bayesian analysis is presented considering a dataset in stellar astronomy where a fragility or latent variable is considered to capture the possible correlation between the bivariate responses for the same sample unit; applications of the univariate and bivariate tobit-Weibull model are also presented in Chapter 4, considering two medical datasets (cancer survival data and vaccine data). The tobit-Weibull model in the presence of some covariates with linear and quadratic effects, under the left censoring scheme, is presented in Chapter 5 considering a dataset concerning total daily precipitation collected at a weather station located in the city of São Paulo, Brazil. In Chapter 6 we present a generalized form of the tobit-Weibull model in the presence of covariates and excess zeros; the application was performed using data concerning total daily precipitation. Chapter 7 concludes this thesis with general conclusions showing the usefulness of the proposed model fot analyzing left-censored data or with an excess of zero-valued observations.O principal objetivo desta tese é introduzir uma análise de dados censurada à esquerda usando o modelo tobit para dados univariados e multivariados. O modelo tobit pode ser usado como uma alternativa ao modelo de regressão de mínimos quadrados quando a suposição de linearidade não é satisfeita. O modelo proposto é capaz de se ajustar adequadamente aos dados, formulando um modelo de regressão para o qual a resposta é préfixada a um valor limite. Nesta tese, apresentamos cinco capítulos, cada um considerando um manuscrito submetido para publicação e com diferentes abordagens e aplicações. A estimativa dos parâmetros do modelo é feita usando métodos de inferência Bayesianos. Os resumos a posteriori de interesse são obtidos usando os métodos de simulação existentes MCMC (Monte Carlo on Markov Chains), como Gibs e Metropolis-Hasting. No primeiro trabalho (Capítulo 2) apresentamos o modelo de mistura tobit-Weibull para analisar os dados ambientais. O conjunto de dados considerado está relacionado às concentrações de nitrogênio amônia em rios. No segundo trabalho (Capítulo 3), é apresentado o modelo tobit-Weibull bivariado sob uma análise Bayesiana hierárquica considerando um conjunto de dados em astronomia estelar onde uma variável de fragilidade ou latente é considerada para capturar a possível correlação entre as respostas bivariadas para a mesma unidade amostral. Aplicações do modelo univariado e bivariado tobit-Weibull também são apresentadas no Capítulo 4, considerando dois conjuntos de dados médicos (dados de sobrevivência ao câncer e dados de vacinas). O modelo tobit-Weibull na presença de alguns covariáveis com efeitos lineares e quadráticos é apresentado no Capítulo 5, considerando um conjunto de dados referentes à precipitação total diária coletada em uma estação meteorológica localizada na cidade de São Paulo, Brasil. No Capítulo 6 apresentamos uma forma generalizada do modelo tobit-Weibull na presença de covariáveis e excesso de zeros; a aplicação foi realizada utilizando dados referentes à precipitação total diária. O Capítulo 7 conclui esta tese com conclusões gerais mostrando a utilidade do modelo proposto para análise de dados censurados à esquerda ou com um excesso de observações com valor nulo

O jornalismo impresso na comunidade universitária

This article has aimed to know the opinion of the academic community about the Informative UEM through a quantitative survey among the university community of the Universidade Estadual de Maringá. To obtain the information the instrument used was a questionnaire and the type of interview was straightforward. The type of survey was stratified proportional sampling. The survey was conducted from August to October 2011. The type of survey was stratified proportional sampling. For the analyzes used descriptive statistics and investigated the association between variables using non-parametric statistical tests. The results showed that most of the academic community read the informative, the print medium being the most used. The main reason for interest in reading the Informative UEM is the search for information / solutions to your needs. It can be concluded that the majority of faculty and staff considered both the content and the look of the printed newsletter as wellEste artigo teve com objetivo conhecer a opinião da comunidade acadêmica sobre o Informativo UEM por meio de uma pesquisa quantitativa junto a comunidade universitária da Universidade Estadual de Maringá. Para a obtenção das informações o instrumento utilizado foi um questionário e o tipo de entrevista foi direta. O tipo de levantamento foi por amostragem estratificada proporcional. O levantamento de dados foi realizado no período de agosto a outubro de 2011. O tipo de levantamento foi por amostragem estratificada proporcional. Para as análises utilizou-se a estatística descritiva e investigou-se a associação entre variáveis por meio de testes estatísticos não paramétricos. Os resultados mostraram que a maioria da comunidade universitária lê o Informativo, sendo o meio impresso o mais utilizado. O principal motivo de interesse em ler o Informativo UEM é a busca por informações/soluções para suas necessidades. Pode-se concluir que a maioria dos docentes e agentes considerou tanto o conteúdo quanto o visual do Informativo impresso como bom

O Jornalismo Impresso na Comunidade Universitária

Este artigo teve com objetivo conhecer a opinião da comunidade acadêmica sobre o Informativo UEM por meio de uma pesquisa quantitativa junto a comunidade universitária da Universidade Estadual de Maringá. Para a obtenção das informações o instrumento utilizado foi um questionário e o tipo de entrevista foi direta. O tipo de levantamento foi por amostragem estratificada proporcional. O levantamento de dados foi realizado no período de agosto a outubro de 2011. O tipo de levantamento foi por amostragem estratificada proporcional. Para as análises utilizou-se a estatística descritiva e investigou-se a associação entre variáveis por meio de testes estatísticos não paramétricos. Os resultados mostraram que a maioria da comunidade universitária lê o Informativo, sendo o meio impresso o mais utilizado. O principal motivo de interesse em ler o Informativo UEM é a busca por informações/soluções para suas necessidades. Pode-se concluir que a maioria dos docentes e agentes considerou tanto o conteúdo quanto o visual do Informativo impresso como bom

Mucinous Cystadenoma: A Rare Hepatic Tumor in a Child.

Mucinous cystadenomas (MCAs) of the liver (also called hepatic biliary cystadenomas) are rare tumors that comprise about 5% of cystic masses of the liver in adults. These slow-growing lesions most commonly occur in middle-aged individuals, with a female sex predominance. Herein, we present a MCA in a 6-year-old male, one of only very few such cases described in the pediatric literature to date. Although MCAs are generally considered benign lesions, malignant transformation rarely occurs. The recurrence rate is high when partial cyst excision is performed. Therefore, complete surgical cyst resection with clinical follow-up, including imaging, is warranted