Sequence Diversity in the Dickeya fliC Gene: Phylogeny of the Dickeya Genus and TaqMan® PCR for 'D. solani', New Biovar 3 Variant on Potato in Europe

Worldwide, Dickeya (formerly Erwinia chrysanthemi) is causing soft rot diseases on a large diversity of crops and ornamental plants. Strains affecting potato are mainly found in D. dadantii, D. dianthicola and D. zeae, which appear to have a marked geographical distribution. Furthermore, a few Dickeya isolates from potato are attributed to D. chrysanthemi and D. dieffenbachiae. In Europe, isolates of Erwinia chrysanthemi biovar 1 and biovar 7 from potato are now classified in D. dianthicola. However, in the past few years, a new Dickeya biovar 3 variant, tentatively named ‘Dickeya solani’, has emerged as a common major threat, in particular in seed potatoes. Sequences of a fliC gene fragment were used to generate a phylogeny of Dickeya reference strains from culture collections and with this reference backbone, to classify pectinolytic isolates, i.e. Dickeya spp. from potato and ornamental plants. The reference strains of the currently recognized Dickeya species and ‘D. solani’ were unambiguously delineated in the fliC phylogram. D. dadantii, D. dianthicola and ‘D. solani’ displayed unbranched clades, while D. chrysanthemi, D. zeae and D. dieffenbachiae branched into subclades and lineages. Moreover, Dickeya isolates from diagnostic samples, in particular biovar 3 isolates from greenhouse ornamentals, formed several new lineages. Most of these isolates were positioned between the clade of ‘D. solani’ and D. dadantii as transition variants. New lineages also appeared in D. dieffenbachiae and in D. zeae. The strains and isolates of D. dianthicola and ‘D. solani’ were differentiated by a fliC sequence useful for barcode identification. A fliC TaqMan®real-time PCR was developed for ‘D. solani’ and the assay was provisionally evaluated in direct analysis of diagnostic potato samples. This molecular tool can support the efforts to control this particular phytopathogen in seed potato certification

Regulatory T-cells and immune tolerance in pregnancy: a new target for infertility treatment?

BACKGROUND: Adaptation of the maternal immune response to accommodate the semi-allogeneic fetus is necessary for pregnancy success, and disturbances in maternal tolerance are implicated in infertility and reproductive pathologies. T regulatory (Treg) cells are a recently discovered subset of T-lymphocytes with potent suppressive activity and pivotal roles in curtailing destructive immune responses and preventing autoimmune disease. METHODS: A systematic review was undertaken of the published literature on Treg cells in the ovary, testes, uterus and gestational tissues in pregnancy, and their link with infertility, miscarriage and pathologies of pregnancy. An overview of current knowledge on the generation, activation and modes of action of Treg cells in controlling immune responses is provided, and strategies for manipulating regulatory T-cells for potential applications in reproductive medicine are discussed. RESULTS: Studies in mouse models show that Treg cells are essential for maternal tolerance of the conceptus, and that expansion of the Treg cell pool through antigen-specific and antigen non-specific pathways allows their suppressive actions to be exerted in the critical peri-implantation phase of pregnancy. In women, Treg cells accumulate in the decidua and are elevated in maternal blood from early in the first trimester. Inadequate numbers of Treg cells or their functional deficiency are linked with infertility, miscarriage and pre-eclampsia. CONCLUSIONS: The potency and wide-ranging involvement of Treg cells in immune homeostasis and disease pathology indicates the considerable potential of these cells as therapeutic agents, raising the prospect of their utility in novel treatments for reproductive pathologies.Leigh R. Guerin, Jelmer R. Prins and Sarah A. Robertso

Contacts et acculturations en Méditerranée occidentale

La question des contacts entre les différents peuples qui bordent les rives de la Méditerranée nord occidentale est l’un des sujets phares de la recherche archéologique de ces trente dernières années. Que l’on parle d’époque archaïque et classique ou de Protohistoire et d’âge du Fer, les échanges et les processus d’acculturation de ces peuples qui entrèrent alors en contact les uns avec les autres : Grecs, Celtes, Phéniciens, Ibères, Ligures, Étrusques, ont retenu l’attention des chercheurs travaillant sur l’expansion grecque dans ces régions, sur les trafics commerciaux, sur les échanges culturels. L’œuvre de Michel Bats (Directeur de recherche honoraire du CNRS) traverse toutes ces thématiques : la présence des Phocéens et des Étrusques dans le bassin occidental de la Méditerranée, l’acculturation et les identités ethno-culturelles, les recherches sur la céramique et ses usages dans une perspective anthropologique, l’appropriation de l’écriture par les sociétés protohistoriques. Ses collègues et amis, en organisant ce colloque et en participant à ces actes, entendent lui témoigner leur amitié et leur dette intellectuelle. Ce volume réunit des articles des meilleurs spécialistes, actuels de la question - des chercheurs de toute la Méditerranée - autour des quatre grands thèmes que nous venons d’évoquer afin tout à la fois de dresser un bilan et de définir de nouvelles perspectives. Cet ouvrage présente donc aussi bien des synthèses - sur la présence grecque en Espagne, sur l’origine de l’écriture, sur les pratiques funéraires, sur les identités culturelles et ethniques - que des découvertes récentes concernant la thématique des contacts et de l’acculturation en Méditerranée nord occidentale : l’agglomération du Premier âge du Fer de La Cougourlude (Lattes, Hérault) fouillée durant l’été 2010 ; le sanctuaire hellénistique de Cumes et les fouilles récentes de Fratte en Italie ; les ateliers de potiers de Rosas en Espagne ; les dernières découvertes d’Olbia de Provence

Functional Imaging: CT and MRI

SYNOPSIS: Numerous imaging techniques permit evaluation of regional pulmonary function. Contrast-enhanced CT methods now allow assessment of vasculature and lung perfusion. Techniques using spirometric controlled MDCT allow for quantification of presence and distribution of parenchymal and airway pathology, Xenon gas can be employed to assess regional ventilation of the lungs and rapid bolus injections of iodinated contrast agent can provide quantitative measure of regional parenchymal perfusion. Advances in magnetic resonance imaging (MRI) of the lung include gadolinium-enhanced perfusion imaging and hyperpolarized helium imaging, which can allow imaging of pulmonary ventilation and .measurement of the size of emphysematous spaces

Detection par PCR d'Erwinia chrysanthemi (Polymerase Chain Reaction)

National audienc

Detection par PCR d'Erwinia chrysanthemi (Polymerase Chain Reaction)

International audienc

Projet CORDET AAS 93 CD07 CIRAD-FLHOR/INRA : rapport d'exécution : contribution à la lutte contre le dépérissement bactérien, une grave maladie du papayer dans la région Caraïbe

Dans le cadre de la diversification fruitière aux Antilles, le papayer offre des atouts intéressants. Néanmoins, la culture des variétés répondant aux standards de commercialisation s'est soldée par un échec dans les Petites Antilles du fait d'un dépérissement causé par une bactérie du genre Erwinia. L'objectif du projet est de déterminer la répartition géographique du pathogène dans les Caraïbes afin de constituer une collection de souches d'Erwinia du papayer. La caractérisation biochimique et moléculaire des souches a permis d'appréhender la variabilité de ce pathogène. Enfin, un certain nombre de plants issus des semences de papayers collectées au cours de diverses prospections ont fait l'objet d'inoculations en pépinière afin de déterminer leur niveau de résistance à la bactériose (ciblage variétal

Amplification enzymatique in vitro d'ADN et ses applications

International audienc