Global Regulatory Functions of the Staphylococcus aureus Endoribonuclease III in Gene Expression

RNA turnover plays an important role in both virulence and adaptation to stress in the Gram-positive human pathogen Staphylococcus aureus. However, the molecular players and mechanisms involved in these processes are poorly understood. Here, we explored the functions of S. aureus endoribonuclease III (RNase III), a member of the ubiquitous family of double-strand-specific endoribonucleases. To define genomic transcripts that are bound and processed by RNase III, we performed deep sequencing on cDNA libraries generated from RNAs that were co-immunoprecipitated with wild-type RNase III or two different cleavage-defective mutant variants in vivo. Several newly identified RNase III targets were validated by independent experimental methods. We identified various classes of structured RNAs as RNase III substrates and demonstrated that this enzyme is involved in the maturation of rRNAs and tRNAs, regulates the turnover of mRNAs and non-coding RNAs, and autoregulates its synthesis by cleaving within the coding region of its own mRNA. Moreover, we identified a positive effect of RNase III on protein synthesis based on novel mechanisms. RNase III–mediated cleavage in the 5′ untranslated region (5′UTR) enhanced the stability and translation of cspA mRNA, which encodes the major cold-shock protein. Furthermore, RNase III cleaved overlapping 5′UTRs of divergently transcribed genes to generate leaderless mRNAs, which constitutes a novel way to co-regulate neighboring genes. In agreement with recent findings, low abundance antisense RNAs covering 44% of the annotated genes were captured by co-immunoprecipitation with RNase III mutant proteins. Thus, in addition to gene regulation, RNase III is associated with RNA quality control of pervasive transcription. Overall, this study illustrates the complexity of post-transcriptional regulation mediated by RNase III

Domicile : où sont les freins ? enquête auprès des néphrologues Français

Home dialysis, which includes Peritoneal Dialysis and Home Hemodialysis, provides lots of profit to patients suffering of Chronic Kidney Disease, especially in terms of comfort, life quality and autonomy. However, its use is marginal in France, with an inhomogenous distributaion according to geographical regions. We conducted a French national survey of nephrologists to assess the barriers to the development of home dialysis. After analyzing the responses of the 230 participating nephrologists, the main obstacles to the development of the two techniques were identified and classified according to their reporting rate. The major obstacles that emerge from the survey are : the lack of information among the general public, a lack of acknowledgement of nurses specializing in these techniques, the limited number of structures that practice dialysis at home, and information difficulties among patient about dialysis techniques. The specific peritoneal dialysis-related difficulties reported are : difficulties in management of follow-up care and rehabilitation, the fear of insufficient purification and the difficulties related to the dialysis catheter. Concerning home hemodialysis, the barriers concern fear of autopunction and the need for a third party. This study helps to identify the representations of nephrologists on the major obstacles to the development of home dialysis to develop lines of thought for its promotion, both in terms of training, institutional acknowledgement, and the necessary regulatory evolution.La dialyse à domicile, représentée par l’hémodialyse et la dialyse péritonéale, peut apporter de nombreux bénéfices aux patients atteints d’insuffisance rénale chronique terminale, particulièrement en termes de confort, de qualité de vie et d’autonomie. Cependant son utilisation reste marginale en France, avec une répartition inhomogène sur le territoire. Nous avons réalisé une enquête nationale française auprès des néphrologues pour évaluer les freins au développement de la dialyse à domicile. Après analyse des réponses des 230 néphrologues ayant participé, les principaux obstacles au développement des deux techniques ont été identifiés et classés selon leur taux de déclaration. Les freins majeurs qui ressortent de l’enquête sont : le manque de médiatisation auprès du grand public, un défaut de reconnaissance des infirmières spécialisées dans ces techniques, le nombre limité de structures pratiquant la dialyse à domicile, et les difficultés relatives à l’information pré-dialyse. Les freins spécifiques à la dialyse péritonéale déclarés sont : les difficultés de prise en charge en Soins de suite et de réadaptation (SSR), la crainte d’une épuration insuffisante et les difficultés liées à l’abord de dialyse. Concernant l’hémodialyse à domicile (HDD), les freins portent sur la peur de l’autoponction et la nécessité d’une tierce personne. Cette étude permet d’identifier les représentations des néphrologues sur les freins majeurs au développement de la dialyse à domicile pour développer des pistes de réflexion pour sa promotion, tant sur le plan de la formation, de la reconnaissance institutionnelle, que de la nécessaire évolution règlementaire

Guerres et reconnaissance

L’optique de ce numéro de Cultures & Conflits consacré à la guerre et à la reconnaissance est d'ouvrir de nouvelles pistes de réflexion, ou de montrer comment certains concepts mobilisés par les théories de la reconnaissance peuvent trouver une pertinence dans l'étude des relations internationales, et plus spécifiquement dans celle des conflits armés. Contre la réduction faite par les théories utilitaristes des causes de la guerre à la recherche de la sécurité (homo politicus) ou du profit (homo economicus), nous partons de l’hypothèse selon laquelle les responsables d’une entité politique, lorsqu’ils s’engagent dans des hostilités armées, cherchent aussi à faire valoir une certaine image d’eux-mêmes et de leur collectivité (homo symbolicus). Certes, le désir des acteurs politiques d’affirmer une image valorisée d’eux-mêmes peut être motivé par des raisons stratégiques : leur légitimité interne et internationale, et donc leur survie politique, tiennent aussi à leur capital symbolique, comme le démontrent les cas libyen et syrien de 2011. Toutefois, nous défendons la thèse selon laquelle les dénis de reconnaissance sont également susceptibles de produire des affrontements armés à travers leurs dimensions pragmatique, émotionnelle et morale

Les « sciences » de l'action publique

Que le monde de la recherche scientifique collabore à la mise en oeuvre des politiques publiques : voilà un fait ancien et bien connu. Pourtant, les formes prises par cette «participation» savante appellent de nos jours une réflexion spécifique. En raison, d'abord, d'un contexte : à la période des Trente Glorieuses et de la guerre froide, vouée à la «modernisation», à la «société de consommation» ou à la «planification», a succédé un mode d'intervention marqué par ce qui a pu être caractérisé comme un tournant néo-libéral. Avec pour résultat des liens nouveaux entre production de connaissances et pratiques de gouvernement. Il suffirait pour rapidement s'en convaincre de suivre les heurs et malheurs de structures d'expertise comme le CERC (Centre d'Etudes des Revenus et des Coûts) ou le Commissariat au Plan en France, le CPRS (Central Policy Review Straff) ou le Center for Policy Studies en Grande Bretagne ou encore le SRV (Sachverständigenrat zur Begutachtung der gesamwirtschaftlichen Enwicklung : Conseil des Experts Economiques) en Allemagne. Ensuite, les savoirs de l'action publique, bien qu'habilités par l'Etat, sont de plus en plus contestés. Accusés de mettre en péril les règles de la représentation politique, voire de «confisquer» les décisions, ils sont mis en cause. Ces ingénieries d'Etat ? Elles ne feraient qu'encourager une conversion rampante à un modèle managérial. Pire : masquer les intérêts de groupes sociaux aveuglés par les critères d'»efficacité» et de «solvabilité». Derrière ce débat aux formes multiples, une question revient de façon lancinante : comment les savoirs de l'action publique hérités des Trente Glorieuses se sont-ils recomposés ? Comment ont-ils affronté l'européanisation des politiques publiques et la redéfinition du rôle de l'Etat face au marché

Mondes en narration

avec la collaboration de Sidonie Kellerer et Alexandra Richter

Clinical reporting following the quantification of cerebrospinal fluid biomarkers in Alzheimer's disease: An international overview

International audienceIntroduction: The current practice of quantifying cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers as an aid in the diagnosis of Alzheimer's disease (AD) varies from center to center. For a same biochemical profile, interpretation and reporting of results may differ, which can lead to misunderstandings and raises questions about the commutability of tests.Methods: We obtained a description of (pre-)analytical protocols and sample reports from 40 centers worldwide. A consensus approach allowed us to propose harmonized comments corresponding to the different CSF biomarker profiles observed in patients.Results: The (pre-)analytical procedures were similar between centers. There was considerable heterogeneity in cutoff definitions and report comments. We therefore identified and selected by consensus the most accurate and informative comments regarding the interpretation of CSF biomarkers in the context of AD diagnosis.Discussion: This is the first time that harmonized reports are proposed across worldwide specialized laboratories involved in the biochemical diagnosis of AD

Prehospital Lyophilized Plasma Transfusion for Trauma-Induced Coagulopathy in Patients at Risk for Hemorrhagic Shock

International audienceIMPORTANCE Blood transfusion is a mainstay of therapy for trauma-induced coagulopathy, but the optimal modalities for plasma transfusion in the prehospital setting remain to be defined. OBJECTIVE To determine whether lyophilized plasma transfusion can reduce the incidence of trauma-induced coagulopathy compared with standard care consisting of normal saline infusion. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS This randomized clinical trial was performed at multiple centers in France involving prehospital medical teams. Participants included 150 adults with trauma who were at risk for hemorrhagic shock and associated coagulopathy between April 1, 2016, an