The Digital Fish Library: Using MRI to Digitize, Database, and Document the Morphological Diversity of Fish

Museum fish collections possess a wealth of anatomical and morphological data that are essential for documenting and understanding biodiversity. Obtaining access to specimens for research, however, is not always practical and frequently conflicts with the need to maintain the physical integrity of specimens and the collection as a whole. Non-invasive three-dimensional (3D) digital imaging therefore serves a critical role in facilitating the digitization of these specimens for anatomical and morphological analysis as well as facilitating an efficient method for online storage and sharing of this imaging data. Here we describe the development of the Digital Fish Library (DFL, http://www.digitalfishlibrary.org), an online digital archive of high-resolution, high-contrast, magnetic resonance imaging (MRI) scans of the soft tissue anatomy of an array of fishes preserved in the Marine Vertebrate Collection of Scripps Institution of Oceanography. We have imaged and uploaded MRI data for over 300 marine and freshwater species, developed a data archival and retrieval system with a web-based image analysis and visualization tool, and integrated these into the public DFL website to disseminate data and associated metadata freely over the web. We show that MRI is a rapid and powerful method for accurately depicting the in-situ soft-tissue anatomy of preserved fishes in sufficient detail for large-scale comparative digital morphology. However these 3D volumetric data require a sophisticated computational and archival infrastructure in order to be broadly accessible to researchers and educators

Real-time ultrasound (RTU) imaging methods for quality control of meats

In this chapter the use of real-time ultrasonography to predict in vivo carcass composition and meat traits will be reviewed. The chapter begins by discussing background and principles of ultrasound. Then aspects affecting the suitability of realtime ultrasonography and image analysis for predicting carcass composition and meat traits of meat producing species and fish will be presented. This chapter also provides an overview of the present and future trends in the application of real-time ultrasonography in the meat industry. © 2012 Woodhead Publishing Limited All rights reserved.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

ExploreLCA – A Web Application for Exploring Systematised Life Cycle Assessments of Buildings

Denne studien presenterer ExploreLCA, en webapplikasjon for utforskning av systematiserte livssyklusanalyser (LCA) av bygninger funnet i building LCA database (bLCAd)-verktøyet. bLCAd-verktøyet er en MySQL-database for systematisk organisering og lagring av LCA-er av bygninger. Systematiserte LCA-er hjelper med å legge til rette for statistiske analyser og generering av pålitelige utslippstall, som er nødvendige for å gjennomføre pålitelige sammenligninger av utslipp på tvers av bygninger. Per i dag finnes det ingen måte å bla gjennom de ulike typene bygningsdata som er tilstede i bLCAd-verktøyet uten å måtte manuelt skrive en rekke SQL-spørringer, enten gjennom et kommandolinjegrensesnitt eller via et dedikert verktøy – dette kan oppleves som en utfordring av brukere som mangler nødvendig teknisk kompetanse. Denne studien utforsker hvordan systematiserte LCA-resultater lagret i bLCAd-verktøyet kan tilgjengeliggjøres gjennom en interaktiv webapplikasjon. I denne sammenhengen betyr tilgjengelig både "enkel å bruke", "enkel å forstå" og "enkel å få tilgang til". Design science research-metodikken ble brukt til å designe og utvikle ExploreLCA. Applikasjonen ble evaluert gjennom brukervennlighetstesting, spørreundersøkelser og intervjuer, der deltagerne besto av 33 studenter fra masterprogrammet i bærekraftig arkitektur ved NTNU, samt én energi- og miljørådgiver fra arkitektfirmaet Asplan Viak. Kvalitative data som ble utledet fra evalueringene ble videre analysert ved hjelp av grounded theory-metoden. Applikasjonens suksess ble målt ved hjelp av Technology Acceptance-modellen sine to hovedvariabler, opplevd nytteverdi og opplevd brukervennlighet. Resultatene viser at ExploreLCA har et generelt høyt nivå av opplevd nytteverdi og opplevd brukervennlighet, noe som indikerer at de systematiserte LCA-ene av bygningene funnet i bLCAd-verktøyet blir gjort tilgjengelige på en tilfredsstillende måte. Disse resultatene tyder på at ExploreLCA virker som en lovende og verdifull applikasjon for brukere som ønsker å utforske og få tilgang til systematiserte LCA-er av bygninger på en interaktiv og fleksibel måte

Fangstbasert akvakultur. Mellomlagring, oppfôring og foredling av villfanget fisk

Prosjektet ”Mellomlagring, oppfôring og foredling av villfanget fisk” er en del av FHFs hovedsatsing innen fangstbasert akvakultur (FBA) sammen med prosjektet ”Teknologiutvikling for fangst, håndtering og føring av levende villfisk” ledet av Havforskningsinstituttet. Prosjektet omhandler villfanget torsk og tilvenning til fôr i oppdrett. Betydning av fiskens skadestatus ved mottak er evaluert, og operasjonelle sorteringskriterier foreslått. Kun moderate skader vurderes som akseptable; ingen åpne sår, kun liten grad av finneerosjon, om fisken skal være i stand til å hele skadene innen rimelig tid. Fisk som ansees å ha god kvalitet og være godt egnet for oppfôring viser betydelig variasjon i appetitt. Rundt 20 % av torsken spiste ikke i fangenskap, selv når den ble tilbudt naturlige (men døde) byttedyr. Forsøk på å tilvenne torsken formulert fôr viste at så mye som 60 % ikke ville spise i fangenskap. Fisken som spiste vokste i samsvar med forventninger ut i fra tabelltilvekst hos oppdrettstorsk. Andelen som begynte å spise skilte seg ikke fra annen fisk, enten i form av størrelse eller kondisjonsfaktor, og sortering av fisken på bakgrunn av størrelse bidro ikke til bedret resultat under tilvenning til å spise lodde. Maskinell sortering av fisk som spiser fra fisk som ikke spiser kan være en mer presis og raskere metode for sortering. Flere alternative løsninger er skissert og evaluert, og det er sannsynliggjort at maskinell sortering av fisken er innen rekkevidde.Fangstbasert akvakultur. Mellomlagring, oppfôring og foredling av villfanget fiskpublishedVersio

Fangstbasert akvakultur. Mellomlagring, oppfôring og foredling av villfanget fisk

Prosjektet ”Mellomlagring, oppfôring og foredling av villfanget fisk” er en del av FHFs hovedsatsing innen fangstbasert akvakultur (FBA) sammen med prosjektet ”Teknologiutvikling for fangst, håndtering og føring av levende villfisk” ledet av Havforskningsinstituttet. Prosjektet omhandler villfanget torsk og tilvenning til fôr i oppdrett. Betydning av fiskens skadestatus ved mottak er evaluert, og operasjonelle sorteringskriterier foreslått. Kun moderate skader vurderes som akseptable; ingen åpne sår, kun liten grad av finneerosjon, om fisken skal være i stand til å hele skadene innen rimelig tid. Fisk som ansees å ha god kvalitet og være godt egnet for oppfôring viser betydelig variasjon i appetitt. Rundt 20 % av torsken spiste ikke i fangenskap, selv når den ble tilbudt naturlige (men døde) byttedyr. Forsøk på å tilvenne torsken formulert fôr viste at så mye som 60 % ikke ville spise i fangenskap. Fisken som spiste vokste i samsvar med forventninger ut i fra tabelltilvekst hos oppdrettstorsk. Andelen som begynte å spise skilte seg ikke fra annen fisk, enten i form av størrelse eller kondisjonsfaktor, og sortering av fisken på bakgrunn av størrelse bidro ikke til bedret resultat under tilvenning til å spise lodde. Maskinell sortering av fisk som spiser fra fisk som ikke spiser kan være en mer presis og raskere metode for sortering. Flere alternative løsninger er skissert og evaluert, og det er sannsynliggjort at maskinell sortering av fisken er innen rekkevidde.Fangstbasert akvakultur. Mellomlagring, oppfôring og foredling av villfanget fiskpublishedVersio