The Λ\LambdaCDM growth rate of structure revisited

We re-examine the growth index of the concordance $\Lambda$ cosmology in the light of the latest 6dF and {\em WiggleZ} data. In particular, we investigate five different models for the growth index $\gamma$, by comparing their cosmological evolution using observational data of the growth rate of structure formation at different redshifts. Performing a joint likelihood analysis of the recent supernovae type Ia data, the Cosmic Microwave Background shift parameter, Baryonic Acoustic Oscillations and the growth rate data, we determine the free parameters of the $\gamma(z)$ parametrizations and we statistically quantify their ability to represent the observations. We find that the addition of the 6dF and {\em WiggleZ} growth data in the likelihood analysis improves significantly the statistical results. As an example, considering a constant growth index we find $\Omega_{m0}=0.273\pm 0.011$ and $\gamma=0.586^{+0.079}_{-0.074}$.Comment: 8 pages, 5 figures, Accepted for publication by International J. of Modern Physics D (IJMPD). arXiv admin note: substantial text overlap with arXiv:1203.672

Structure calculation, refinement and validation using CcpNmr Analysis

CcpNmr Analysis provides a streamlined pipeline for both NMR chemical shift assignment and structure determination of biological macromolecules. In addition, it encompasses tools to analyse the many additional experiments that make NMR such a pivotal technique for research into complex biological questions. This report describes how CcpNmr Analysis can seamlessly link together all of the tasks in the NMR structure-determination process. It details each of the stages from generating NMR restraints [distance, dihedral,hydrogen bonds and residual dipolar couplings (RDCs)],exporting these to and subsequently re-importing them from structure-calculation software (such as the programs CYANA or ARIA) and analysing and validating the results obtained from the structure calculation to, ultimately, the streamlined deposition of the completed assignments and the refined ensemble of structures into the PDBe repository. Until recently, such solution-structure determination by NMR has been quite a laborious task, requiring multiple stages and programs. However, with the new enhancements to CcpNmr Analysis described here, this process is now much more intuitive and efficient and less error-prone

The growth index of matter perturbations and modified gravity

We place tight constraints on the growth index $\gamma$ by using the recent growth history results of 2dFGRS, SDSS-LRG, VIMOS-VLT deep Survey (VVDS) and {\em WiggleZ} datasets. In particular, we investigate several parametrizations of the growth index $\gamma(z)$, by comparing their cosmological evolution using observational growth rate data at different redshifts. Utilizing a standard likelihood analysis we find that the use of the combined growth data provided by the 2dFGRS, SDSS-LRG, VVDS and {\em WiggleZ} galaxy surveys, puts the most stringent constraints on the value of the growth index. As an example, assuming a constant growth index we obtain that $\gamma=0.602\pm 0.055$ for the concordance $\Lambda$CDM expansion model. Concerning the Dvali-Gabadadze-Porrati gravity model, we find $\gamma=0.503\pm 0.06$ which is lower, and almost $3\sigma$ away, from the theoretically predicted value of $\gamma_{DGP}\simeq 11/16$. Finally, based on a time varying growth index we also confirm that the combined growth data disfavor the DGP gravity.Comment: 8 pages, 5 figures. Revised version accepted in MNRAS. arXiv admin note: text overlap with arXiv:1202.163

Solution structure of the inner DysF domain of myoferlin and implications for limb girdle muscular dystrophy type 2b

Mutations in the protein dysferlin, a member of the ferlin family, lead to limb girdle muscular dystrophy type 2B and Myoshi myopathy. The ferlins are large proteins characterised by multiple C2 domains and a single C-terminal membrane-spanning helix. However, there is sequence conservation in some of the ferlin family in regions outside the C2 domains. In one annotation of the domain structure of these proteins, an unusual internal duplication event has been noted where a putative domain is inserted in between the N- and C-terminal parts of a homologous domain. This domain is known as the DysF domain. Here, we present the solution structure of the inner DysF domain of the dysferlin paralogue myoferlin, which has a unique fold held together by stacking of arginine and tryptophans, mutations that lead to clinical disease in dysferlin

Binding, domain orientation, and dynamics of the Lck SH3-SH2 domain pair and comparison with other Src-family kinases

The catalytic activity of Src-family kinases is regulated by association with its SH3 and SH2 domains. Activation requires displacement of intermolecular contacts by SH3/SH2 binding ligands resulting in dissociation of the SH3 and SH2 domains from the kinase domain. To understand the contribution of the SH3-SH2 domain pair to this regulatory process, the binding of peptides derived from physiologically relevant SH2 and SH3 interaction partners was studied for Lck and its relative Fyn by NMR spectroscopy. In contrast to Fyn, activating ligands do not induce communication between SH2 and SH3 domains in Lck. This can be attributed to the particular properties of the Lck SH3-SH2 linker which is shown to be extremely flexible thus effectively decoupling the behavior of the SH3 and SH2 domains. Measurements on the SH32 tandem from Lck further revealed a relative domain orientation that is distinctly different from that found in the Lck SH32 crystal structure and in other Src kinases. These data suggest that flexibility between SH2 and SH3 domains contributes to the adaptation of Src-family kinases to specific environments and distinct functions

N-acetilcisteína: presente y futuro.

Introducción: La N-acetilcisteína constituye el derivado N-acetilado del aminoácido cisteína. Es ampliamente conocida por sus aplicaciones terapéuticas como mucolítico y como antídoto en la sobredosis por paracetamol. En relación a su efecto mucolítico, se ha probado su eficacia en la reducción del número de exacerbaciones en la Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica estable. Su capacidad antioxidante como precursora del glutatión celular ha dado lugar al estudio de la misma en patologías muy diversas. El objetivo de la presente revisión consiste en agrupar la evidencia existente sobre la eficacia de la N-acetilcisteína en la Nefropatía Inducida por Contraste, en los trastornos neurodegenerativos y en los trastornos por abuso de sustancias. Material y métodos: Se ha realizado una revisión sistemática de la literatura relacionada con el empleo de la N-acetilcisteína en distintos campos de la medicina a través de la base de datos PubMed. Resultados: Se ha observado que para la prevención de la Nefropatía Inducida por Contraste en sujetos sometidos a angiografía coronaria y Tomografía Computarizada, el empleo de N-acetilcisteína es beneficioso, sobre todo en pacientes con disfunción renal y aquellos que reciben altas dosis de agente de contraste. Por otro lado, se ha encontrado que los pacientes con Enfermedad de Parkinson tratados con N- acetilcisteína a lo largo de 3 meses, presentan un aumento del transportador de dopamina (DAT) lo que puede mejorar la función del neurotransmisor. Además, existe una extensa literatura preclínica que destaca el papel del tratamiento con N- acetilcisteína en la dependencia a sustancias adictivas, que en humanos se ha relacionado con una reducción de la actividad del glutamato en la corteza cingulada. Conclusiones: La participación de la N-acetilcisteína en la síntesis de uno de los principales antioxidantes celulares, como es el glutatión, le confiere unas propiedades que están siendo estudiadas. En este trabajo se han revisado varias de las distintas aplicaciones que se están investigando para la N-acetilcisteína. La evidencia indica que se recomienda el empleo de la N-acetilcisteína en la prevención de Nefropatía Inducida por Contraste en pacientes de riesgo y que la terapia con N-acetilcisteína podría ser beneficiosa en la Enfermedad del Parkinson y en los trastornos por abuso de sustancias. Palabras clave: N-acetilcisteína. Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica. Nefropatía Inducida por Contraste. Trastornos neurodegenerativos. Trastornos por abuso de sustancias

The anti-sigma factor RsrA responds to oxidative stress by reburying its hydrophobic core

Redox-regulated effector systems that counteract oxidative stress are essential for all forms of life. Here we uncover a new paradigm for sensing oxidative stress centred on the hydrophobic core of a sensor protein. RsrA is an archetypal zinc-binding anti-sigma factor that responds to disulfide stress in the cytoplasm of Actinobacteria. We show that RsrA utilizes its hydrophobic core to bind the sigma factor σ R preventing its association with RNA polymerase, and that zinc plays a central role in maintaining this high-affinity complex. Oxidation of RsrA is limited by the rate of zinc release, which weakens the RsrA-σ R complex by accelerating its dissociation. The subsequent trigger disulfide, formed between specific combinations of RsrA's three zinc-binding cysteines, precipitates structural collapse to a compact state where all σ R-binding residues are sequestered back into its hydrophobic core, releasing σ R to activate transcription of anti-oxidant genes

Revisión, auditoría y actualización a nuevas directrices del sistema de Garantía Interna de la Calidad de la Escuela de Ingeniería y Arquitectura

El Sistema de Garantía Interna de Calidad (SGIC) implantado en la Escuela de Ingeniería y Arquitectura (EINA) de Zaragoza cuenta con el certificado de calidad otorgado por la Agencia Nacional de Evaluación de la Calidad y Acreditación (ANECA), desde Noviembre de 2013. Para mantener esta certificación y que continúe siendo un Sistema fiable y evolutivo es necesario realizar una actualización y revisión constante del mismo, con el fin de reflejar la realidad de la institución y la actividad que se desarrolla en el centro. De esta manera, se logrará renovar la acreditación del Sistema, prevista para este año 2017. Es esta necesidad de mejora continua y de renovación de la acreditación el motivo de creación de este Trabajo de Fin de Grado, cuyo objetivo principal es la revisión del SGIC del centro y actualización y/o adaptación de los principales documentos que lo describen, prestando especial énfasis en los procedimientos. El método seguido para lograr esta revisión se ha centrado principalmente en la realización de una auditoría interna inicial, con objeto de conocer los puntos débiles y trabajar más profundamente en ellos, y en la actualización individual de los procedimientos, con la consiguiente adaptación de sus Anexos, del Mapa de Procesos del Sistema, e incluso del Manual de Calidad del centro. Además, se realiza una auditoría final con el fin de comprobar las mejoras implantadas y se plantea una propuesta de modificación de la sección de Garantía de la Calidad de la Página Web de la EINA

Single-molecule analysis of CD9 dynamics and partitioning reveals multiple modes of interaction in the tetraspanin web

Tetraspanins regulate cell migration, sperm–egg fusion, and viral infection. Through interactions with one another and other cell surface proteins, tetraspanins form a network of molecular interactions called the tetraspanin web. In this study, we use single-molecule fluorescence microscopy to dissect dynamics and partitioning of the tetraspanin CD9. We show that lateral mobility of CD9 in the plasma membrane is regulated by at least two modes of interaction that each exhibit specific dynamics. The majority of CD9 molecules display Brownian behavior but can be transiently confined to an interaction platform that is in permanent exchange with the rest of the membrane. These platforms, which are enriched in CD9 and its binding partners, are constant in shape and localization. Two CD9 molecules undergoing Brownian trajectories can also codiffuse, revealing extra platform interactions. CD9 mobility and partitioning are both dependent on its palmitoylation and plasma membrane cholesterol. Our data show the high dynamic of interactions in the tetraspanin web and further indicate that the tetraspanin web is distinct from raft microdomains

Complicación durante la extubación con TET reforzado

Los tubos endotraqueales reforzados han sido en muchas ocasiones protagonistas de complicaciones durante el manejo de la vía aérea y la ventilación mecánica. Presentamos 2 casos en los que, tras realizar una intubación fibrobroncoscópica, surgieron complicaciones durante la extubación al utilizar un tubo endotraqueal reforzado. En ambos casos se produjo una sección completa del tubo tras ser mordido durante la extubación, quedando un segmento en el interior de la boca de la paciente unido al resto del tubo por el anillo metálico que lo refuerza. Debido al gran riesgo de producir lesión de la cavidad orotraqueal, recomendamos colocar un dispositivo antimordida durante la extubación para evitar este tipo de complicaciones