Half-Cycle Pulse Acting on a One-Dimensional Rydberg Atom: Semiclassical Transition Amplitudes in Action and Angle Variables

In this paper we derive the expression for the transition coefficient used in the preceding paper [C. D. Schwieters and J. B. Delos, Phys. Rev. A 51, 1023 (1995)] for principal-quantum-number transitions in one-dimensional hydrogen caused by half-cycle pulses. We briefly review the methods of Miller [Adv. Chem. Phys. 25, 69 (1974)] and Marcus [Chem. Phys. Lett. 7, 525 (1970); J. Chem. Phys. 54, 3965 (1971)], and then derive the result using the methods of Maslov and Fedoriuk [Semi-Classical Approximation in Quantum Mechanics, (Reidel, Dordrecht, 1981)]. Also, we examine the approximate reduction of hydrogen from three to one dimension and we find a hitherto unknown correction due to the residual motion of one of the ignored degrees of freedom. We discuss the regime of validity of this one-dimensional approximation

Modelling multi-protein complexes using PELDOR distance measurements for rigid body minimisation experiments using XPLOR-NIH

Crystallographic and NMR approaches have provided a wealth of structural information about protein domains. However, often these domains are found as components of larger multi domain polypeptides or complexes. Orienting domains within such contexts can provide powerful new insight into their function. The combination of site specific spin labelling and Pulsed Electron Double Resonance (PELDOR) provide a means of obtaining structural measurements that can be used to generate models describing how such domains are oriented. Here we describe a pipeline for modelling the location of thio-reactive nitroxyl spin locations to engineered sties on the histone chaperone Vps75. We then use a combination of experimentally determined measurements and symmetry constraints to model the orientation in which homodimers of Vps75 associate to form homotetramers using the XPLOR-NIH platform. This provides a working example of how PELDOR measurements can be used to generate a structural model

Semiclassical Treatment of a Half-Cycle Pulse Acting on a One-Dimensional Rydberg Atom

The final-state distribution of hydrogen, acted upon by a 1/2-cycle pulse, has been calculated semiclassically for a proposed one-dimensional experiment. This work was motivated by the recent experimental realization of half-cycle pulses by Jones, You, and Bucksbaum [Phys. Rev. Lett. 70, 1236 (1993)] in which preliminary studies of ionization and state redistribution for hydrogenlike atoms were carried out. To simplify the situation theoretically, an experiment is proposed in which an additional weak static electric field is imposed and approximately one-dimensional states are selected. Within this one-dimensional approximation the transition probability to various n states (n is the principal quantum number) has been calculated as a function of the amplitude of the half-cycle pulse, using a semiclassical formula due to Miller [Adv. Chem. Phys. 25, 69 (1974)]. A complete derivation of this formula and a discussion of approximations are made in the following paper. We have found that an even number of trajectories always contributes to the transition probability and leads to observable interference effects. In addition, we find that bifurcations of these trajectories can occur, resulting in resonances and more complicated interference structures

Grupos cooperativos y utilización de TIC en cátedras de Estadística y Matemática en carreras de Informática de la Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales (UNaM)

La aplicación de Grupos Cooperativos de Aprendizaje (GCA) en las cátedras Estadística I y II de las carreras Licenciatura en Genética, Profesorado en Biología y Analista en Sistemas de Computación de la FCEQyN desde 1996, y recientemente en la cátedra de Matemática I de las carreras de informática de la FCEQyN ha generado significativos cambios cualitativos en el proceso de enseñanza-aprendizaje de los contenidos. Asimismo, y tal como quedó demostrado en una investigación cualitativa desarrollada en base a testimonios de los estudiantes, la estrategia ha contribuido a consolidar vínculos entre los grupos de ingresantes a dichas carreras, lo cual favoreció la permanencia en la facultad, evitando la deserción estudiantil. En base a estos alentadores resultados, en 2008, desde la cátedra se ha propuesto un Proyecto de Extensión para la promoción de esta estrategia por medio de talleres de capacitación destinados a docentes de nivel medio, terciario y universitario. Actualmente, la implementación de Grupos Cooperativos de Aprendizaje se ve complementada con los recursos de las Tecnologías de Información y Comunicación (TICs) para contribuir en el proceso de enseñanza-aprendizaje de los estudiantes.Experiencias docentes.Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Grupos cooperativos y utilización de TIC en cátedras de Estadística y Matemática en carreras de Informática de la Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales (UNaM)

La aplicación de Grupos Cooperativos de Aprendizaje (GCA) en las cátedras Estadística I y II de las carreras Licenciatura en Genética, Profesorado en Biología y Analista en Sistemas de Computación de la FCEQyN desde 1996, y recientemente en la cátedra de Matemática I de las carreras de informática de la FCEQyN ha generado significativos cambios cualitativos en el proceso de enseñanza-aprendizaje de los contenidos. Asimismo, y tal como quedó demostrado en una investigación cualitativa desarrollada en base a testimonios de los estudiantes, la estrategia ha contribuido a consolidar vínculos entre los grupos de ingresantes a dichas carreras, lo cual favoreció la permanencia en la facultad, evitando la deserción estudiantil. En base a estos alentadores resultados, en 2008, desde la cátedra se ha propuesto un Proyecto de Extensión para la promoción de esta estrategia por medio de talleres de capacitación destinados a docentes de nivel medio, terciario y universitario. Actualmente, la implementación de Grupos Cooperativos de Aprendizaje se ve complementada con los recursos de las Tecnologías de Información y Comunicación (TICs) para contribuir en el proceso de enseñanza-aprendizaje de los estudiantes.Experiencias docentes.Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Grupos cooperativos y utilización de TIC en cátedras de Estadística y Matemática en carreras de Informática de la Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales (UNaM)

La aplicación de Grupos Cooperativos de Aprendizaje (GCA) en las cátedras Estadística I y II de las carreras Licenciatura en Genética, Profesorado en Biología y Analista en Sistemas de Computación de la FCEQyN desde 1996, y recientemente en la cátedra de Matemática I de las carreras de informática de la FCEQyN ha generado significativos cambios cualitativos en el proceso de enseñanza-aprendizaje de los contenidos. Asimismo, y tal como quedó demostrado en una investigación cualitativa desarrollada en base a testimonios de los estudiantes, la estrategia ha contribuido a consolidar vínculos entre los grupos de ingresantes a dichas carreras, lo cual favoreció la permanencia en la facultad, evitando la deserción estudiantil. En base a estos alentadores resultados, en 2008, desde la cátedra se ha propuesto un Proyecto de Extensión para la promoción de esta estrategia por medio de talleres de capacitación destinados a docentes de nivel medio, terciario y universitario. Actualmente, la implementación de Grupos Cooperativos de Aprendizaje se ve complementada con los recursos de las Tecnologías de Información y Comunicación (TICs) para contribuir en el proceso de enseñanza-aprendizaje de los estudiantes.Experiencias docentes.Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Semiclassical Scattering in a Circular Semiconductor Microstructure

The conductance of a microscopic junction shows fluctuations caused by quantum interference of waves that follow different paths between the leads. We give a semiclassical formula for these fluctuations. The theory utilizes trajectories which travel between the centers of the lead apertures; it also incorporates diffraction at these apertures. We extend the theory to include ‘‘ghost paths,’’ which scatter diffractively off the lead mouths. Semiclassical S-matrix elements are computed for a circular junction over a range of Fermi wave numbers, and the large-scale structure of these matrix elements shows good agreement with quantum results. Finally, we propose a hypothesis about the effect of the quantum coherence length on the S matrix and on the semiclassical sum. © 1996 The American Physical Society

Dynamic equilibrium between closed and partially closed states of the bacterial Enzyme I unveiled by solution NMR and X-ray scattering

The bacterial phosphotransferase system couples phosphoryl transfer to sugar transport across the cell membrane. The first protein in the pathway, Enzyme I (EI), undergoes two large rigid body domain reorientations between an autophosphorylation-competent closed state and an open state that allows subsequent phosphoryl transfer to its downstream protein partner. Simultaneous use of solution X-ray scattering and NMR dipolar coupling data to guide simulated annealing refinement reveals the existence of a dynamic equilibrium between closed and partially closed conformations in a complex of a mutant of EI with phosphoenolpyruvate. The partially closed conformation represents an intermediate in the open-to-closed transition