Rapport intermédiaire

Les acteurs de la filière céréale wallonne sont actuellement confrontés à une série de modifications comprenant notamment : l’évolution de la législation, l’arrivée en fin de validité des permis d’environnement ou d’exploiter d’une série de sites de stockage, l’augmentation des volumes stockés au sein de ces sites, l’urbanisation à proximité de ceux-ci…. Ces éléments pourraient impliquer la fermeture de certains sites de stockage. Simultanément, la localisation de nouveaux sites de stockage est confrontée à des défis tels que la croissance du phénomène NIMBY, l’entrée en vigueur du Code de Développement Territorial (CoDT) et la protection du paysage. Pourtant, traditionnellement, la production céréalière occupe une place importante dans la production agricole belge. Cette filière s’est développée au cours du temps au point de faire de la Belgique un leader européen dans la production de céréales. Afin de concentrer une production initialement dispersée dans l’espace, des infrastructures de stockage sont nécessaires pour le développement de la filière. Ces espaces de stockage sont d’autant plus importants pour la filière que les demandes en céréales portent sur de grands volumes. Le calendrier agronomique et les conditions météorologiques impliquent une proximité entre les sites de collecte de céréales et les zones de production. Ce besoin de sites de stockage de proximité avec des volumes importants a entrainé la mutualisation de ressources entre agriculteurs et donné naissance aux coopératives agricoles spécialisées dans ce stockage. Ces organismes coexistent avec des négociants qui remplissent le même rôle. En s’adaptant au développement de la filière, ces entreprises se sont diversifiées et ont accru leurs capacités de stockage. Nombre d’entre elles fournissent maintenant des engrais ou des produits phytosanitaires, réalisent des activités de transforma-tion… Elles sont devenues des acteurs clés de la filière à l’interface entre les agriculteurs et le monde agro-industriel (localisés respectivement en amont et en aval de la production de céréales). Ces évolutions doivent être confrontées aux objectifs politiques décrits dans le Code Wallon de l’Agriculture (CWA) et du CoDT. Le CWA prévoit que les politiques agricoles wallonnes doivent « encourager et soutenir la structuration des agriculteurs afin de renforcer leur pouvoir de négociation au sein des filières et d'obtenir une meilleure appropriation par les agriculteurs de la valeur ajoutée aux produits agricoles » et « favoriser l'autonomie des agriculteurs et des exploitations agricoles, individuellement ou collectivement, en termes de production, de transformation et de commercialisation, en ce compris en favorisant le modèle coopératif ». En parallèle, le CoDT a pour objectif « d’assurer un développement durable et attractif du territoire ». Il décrit aussi les objectifs régionaux suivants : « la lutte contre l’étalement urbain et l’utilisation rationnelle des territoires et des ressources », « le développement socio-économique et de l’attractivité territoriale », « la gestion qualitative du cadre de vie » et « la maîtrise de la mobilité ». Dans ce contexte, et pour assurer l’atteinte des objectifs des deux codes précités, il est nécessaire d’: • objectiver les risques et les nuisances causés par l’activité de stockage de céréales ; • objectiver les besoins en sites de stockage ; • identifier des zones autorisant ce type d’activité à proximité des zones de production ; • identifier les critères de localisation optimale des sites de stockage de céréales. La recherche est donc composée de deux parties. La première partie, plus exploratoire, réalise un examen de la filière, ainsi que des conditions administratives et pratiques liées aux sites de stockage de céréales, afin de déboucher sur une liste de critères et types de localisation envisageables. La deuxième partie recensera les sites qui risquent de ne plus pouvoir être exploités, testera, dans ces zones, les critères et conditions mis en évidence dans la première partie et aboutira à une méthodologie applicable à toutes les zones. Ce rapport intermédiaire présente l’état d’avancement de la première partie, ainsi que les résultats préliminaires du workshop, qui réalise l’articulation entre les deux parties de la recherche. Le rapport est structuré en six chapitres. Les cinq premiers chapitres présentent les avancements réalisés dans les cinq phases de la première partie. Le premier chapitre décrit la structuration de la filière céréalière wallonne ainsi que les activités de stockage et leurs nuisances. Le deuxième chapitre éclaire la position des différents acteurs par rapport à la problématique étudiée. Le chapitre 3 décortique les conditions administratives influençant la localisation des sites de stockage de céréales. Le chapitre 4 décrit la localisation des cultures céréalières en Wallonie et, donc, le besoin en sites de stockage. Le chapitre 5 caractérise les sites de stockage de céréales présents dans les données en notre possession. Il décrit donc l’offre en stockage de céréales. Le sixième chapitre présente la manière dont a été réalisé le workshop et ses premiers résultats.Localisation des zones pouvant accueillir des activités agro-économiques de proximit

Infrastructures vertes : Pourvoyeuses de services écosystémiques

Le concept d’infrastructure verte s’inscrit dans une logique intégratrice et vise à offrir de multiples avantages, à la fois écologiques, sociaux et économiques, sur un même territoire. Il s’appuie sur les services offerts par les écosystèmes. Par son déploiement stratégique dans l’espace, l’infrastructure verte présente des liens étroits avec l’aménagement du territoire. C’est ainsi que le CoDT fait référence à la structure écologique et aux liaisons écologiques dans les différents schémas territoriaux, alors que le SDT mentionne explicitement l’intérêt des infrastructures vertes. Il s’agit aujourd’hui de traduire ces dispositions à l’ensemble des échelles d’action, depuis le niveau régional jusqu’aux projets d’urbanisation. L’objectif de ce vade-mecum est d’offrir un référentiel synthétique, qui permette aux acteurs du territoire de s’inscrire dans cette démarche. Il propose une définition d’infrastructure verte et de services écosystémiques et fournit des pistes opérationnelles pour mettre en place de telles infrastructures à travers les outils d’aménagement du territoire (SDT, SOL, GCU). Il couvre l’ensemble du processus de mise en œuvre d’une infrastructure verte, depuis sa planification jusqu’à sa réalisation et à sa maintenance. Ce vade-mecum, réalisé dans le cadre d’une recherche CPDT de 2019, est destiné à l’ensemble des acteurs locaux, à savoir les administrations et autorités communales, les auteurs de projets, des collectifs de citoyens ou encore des entreprises. Nous espérons qu’il constituera une base utile pour une concertation efficace et soutenue entre ces différents acteurs, élément fondamental pour la mise en œuvre réussie d’une infrastructure verte.Opérationnalisation d'une infrastructure verte pourvoyeuse de services écosystémique

Tourisme et territoire : gérer le passé et préparer l'avenir

Tourisme et territoire : gérer le passer pour préparer l'aveni

Contribution of copy number variants to schizophrenia from a genome-wide study of 41,321 subjects

Copy number variants (CNVs) have been strongly implicated in the genetic etiology of schizophrenia (SCZ). However, genome-wide investigation of the contribution of CNV to risk has been hampered by limited sample sizes. We sought to address this obstacle by applying a centralized analysis pipeline to a SCZ cohort of 21,094 cases and 20,227 controls. A global enrichment of CNV burden was observed in cases (OR=1.11, P=5.7×10−15), which persisted after excluding loci implicated in previous studies (OR=1.07, P=1.7 ×10−6). CNV burden was enriched for genes associated with synaptic function (OR = 1.68, P = 2.8 ×10−11) and neurobehavioral phenotypes in mouse (OR = 1.18, P= 7.3 ×10−5). Genome-wide significant evidence was obtained for eight loci, including 1q21.1, 2p16.3 (NRXN1), 3q29, 7q11.2, 15q13.3, distal 16p11.2, proximal 16p11.2 and 22q11.2. Suggestive support was found for eight additional candidate susceptibility and protective loci, which consisted predominantly of CNVs mediated by non-allelic homologous recombination

No Reliable Association between Runs of Homozygosity and Schizophrenia in a Well-Powered Replication Study

It is well known that inbreeding increases the risk of recessive monogenic diseases, but it is less certain whether it contributes to the etiology of complex diseases such as schizophrenia. One way to estimate the effects of inbreeding is to examine the association between disease diagnosis and genome-wide autozygosity estimated using runs of homozygosity (ROH) in genome-wide single nucleotide polymorphism arrays. Using data for schizophrenia from the Psychiatric Genomics Consortium (n = 21,868), Keller et al. (2012) estimated that the odds of developing schizophrenia increased by approximately 17% for every additional percent of the genome that is autozygous (β = 16.1, CI(β) = [6.93, 25.7], Z = 3.44, p = 0.0006). Here we describe replication results from 22 independent schizophrenia case-control datasets from the Psychiatric Genomics Consortium (n = 39,830). Using the same ROH calling thresholds and procedures as Keller et al. (2012), we were unable to replicate the significant association between ROH burden and schizophrenia in the independent PGC phase II data, although the effect was in the predicted direction, and the combined (original + replication) dataset yielded an attenuated but significant relationship between Froh and schizophrenia (β = 4.86,CI(β) = [0.90,8.83],Z = 2.40,p = 0.02). Since Keller et al. (2012), several studies reported inconsistent association of ROH burden with complex traits, particularly in case-control data. These conflicting results might suggest that the effects of autozygosity are confounded by various factors, such as socioeconomic status, education, urbanicity, and religiosity, which may be associated with both real inbreeding and the outcome measures of interest

Targeted Sequencing of 10,198 Samples Confirms Abnormalities in Neuronal Activity and Implicates Voltage-Gated Sodium Channels in Schizophrenia Pathogenesis

Background Sequencing studies have pointed to the involvement in schizophrenia of rare coding variants in neuronally expressed genes, including activity-regulated cytoskeleton-associated protein (ARC) and N-methyl-D-aspartate receptor (NMDAR) complexes; however, larger samples are required to reveal novel genes and specific biological mechanisms. Methods We sequenced 187 genes, selected for prior evidence of association with schizophrenia, in a new dataset of 5207 cases and 4991 controls. Included among these genes were members of ARC and NMDAR postsynaptic protein complexes, as well as voltag

Age at first birth in women is genetically associated with increased risk of schizophrenia

Prof. Paunio on PGC:n jäsenPrevious studies have shown an increased risk for mental health problems in children born to both younger and older parents compared to children of average-aged parents. We previously used a novel design to reveal a latent mechanism of genetic association between schizophrenia and age at first birth in women (AFB). Here, we use independent data from the UK Biobank (N = 38,892) to replicate the finding of an association between predicted genetic risk of schizophrenia and AFB in women, and to estimate the genetic correlation between schizophrenia and AFB in women stratified into younger and older groups. We find evidence for an association between predicted genetic risk of schizophrenia and AFB in women (P-value = 1.12E-05), and we show genetic heterogeneity between younger and older AFB groups (P-value = 3.45E-03). The genetic correlation between schizophrenia and AFB in the younger AFB group is -0.16 (SE = 0.04) while that between schizophrenia and AFB in the older AFB group is 0.14 (SE = 0.08). Our results suggest that early, and perhaps also late, age at first birth in women is associated with increased genetic risk for schizophrenia in the UK Biobank sample. These findings contribute new insights into factors contributing to the complex bio-social risk architecture underpinning the association between parental age and offspring mental health.Peer reviewe

Genetic correlation between amyotrophic lateral sclerosis and schizophrenia

A. Palotie on työryhmän Schizophrenia Working Grp Psychiat jäsen.We have previously shown higher-than-expected rates of schizophrenia in relatives of patients with amyotrophic lateral sclerosis (ALS), suggesting an aetiological relationship between the diseases. Here, we investigate the genetic relationship between ALS and schizophrenia using genome-wide association study data from over 100,000 unique individuals. Using linkage disequilibrium score regression, we estimate the genetic correlation between ALS and schizophrenia to be 14.3% (7.05-21.6; P = 1 x 10(-4)) with schizophrenia polygenic risk scores explaining up to 0.12% of the variance in ALS (P = 8.4 x 10(-7)). A modest increase in comorbidity of ALS and schizophrenia is expected given these findings (odds ratio 1.08-1.26) but this would require very large studies to observe epidemiologically. We identify five potential novel ALS-associated loci using conditional false discovery rate analysis. It is likely that shared neurobiological mechanisms between these two disorders will engender novel hypotheses in future preclinical and clinical studies.Peer reviewe

Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia

Schizophrenia has a heritability of 60-80%1, much of which is attributable to common risk alleles. Here, in a two-stage genome-wide association study of up to 76,755 individuals with schizophrenia and 243,649 control individuals, we report common variant associations at 287 distinct genomic loci. Associations were concentrated in genes that are expressed in excitatory and inhibitory neurons of the central nervous system, but not in other tissues or cell types. Using fine-mapping and functional genomic data, we identify 120 genes (106 protein-coding) that are likely to underpin associations at some of these loci, including 16 genes with credible causal non-synonymous or untranslated region variation. We also implicate fundamental processes related to neuronal function, including synaptic organization, differentiation and transmission. Fine-mapped candidates were enriched for genes associated with rare disruptive coding variants in people with schizophrenia, including the glutamate receptor subunit GRIN2A and transcription factor SP4, and were also enriched for genes implicated by such variants in neurodevelopmental disorders. We identify biological processes relevant to schizophrenia pathophysiology; show convergence of common and rare variant associations in schizophrenia and neurodevelopmental disorders; and provide a resource of prioritized genes and variants to advance mechanistic studies

Evidence for Genetic Overlap Between Schizophrenia and Age at First Birth in Women

Importance A recently published study of national data by McGrath et al in 2014 showed increased risk of schizophrenia (SCZ) in offspring associated with both early and delayed parental age, consistent with a U-shaped relationship. However, it remains unclear if the risk to the child is due to psychosocial factors associated with parental age or if those at higher risk for SCZ tend to have children at an earlier or later age. Objective To determine if there is a genetic association between SCZ and age at first birth (AFB) using genetically informative but independently ascertained data sets. Design, Setting, and Participants This investigation used multiple independent genome-wide association study data sets. The SCZ sample comprised 18 957 SCZ cases and 22 673 controls in a genome-wide association study from the second phase of the Psychiatric Genomics Consortium, and the AFB sample comprised 12 247 genotyped women measured for AFB from the following 4 community cohorts: Estonia (Estonian Genome Center Biobank, University of Tartu), the Netherlands (LifeLines Cohort Study), Sweden (Swedish Twin Registry), and the United Kingdom (TwinsUK). Schizophrenia genetic risk for each woman in the AFB community sample was estimated using genetic effects inferred from the SCZ genome-wide association study. Main Outcomes and Measures We tested if SCZ genetic risk was a significant predictor of response variables based on published polynomial functions that described the relationship between maternal age and SCZ risk in offspring in Denmark. We substituted AFB for maternal age in these functions, one of which was corrected for the age of the father, and found that the fit was superior for the model without adjustment for the father’s age. Results We observed a U-shaped relationship between SCZ risk and AFB in the community cohorts, consistent with the previously reported relationship between SCZ risk in offspring and maternal age when not adjusted for the age of the father. We confirmed that SCZ risk profile scores significantly predicted the response variables (coefficient of determination R2 = 1.1E-03, P = 4.1E-04), reflecting the published relationship between maternal age and SCZ risk in offspring by McGrath et al in 2014. Conclusions and Relevance This study provides evidence for a significant overlap between genetic factors associated with risk of SCZ and genetic factors associated with AFB. It has been reported that SCZ risk associated with increased maternal age is explained by the age of the father and that de novo mutations that occur more frequently in the germline of older men are the underlying causal mechanism. This explanation may need to be revised if, as suggested herein and if replicated in future studies, there is also increased genetic risk of SCZ in older mothers