The genomic landscape of high hyperdiploid childhood acute lymphoblastic leukemia.

High hyperdiploid (51-67 chromosomes) acute lymphoblastic leukemia (ALL) is one of the most common childhood malignancies, comprising 30% of all pediatric B cell-precursor ALL. Its characteristic genetic feature is the nonrandom gain of chromosomes X, 4, 6, 10, 14, 17, 18 and 21, with individual trisomies or tetrasomies being seen in over 75% of cases, but the pathogenesis remains poorly understood. We performed whole-genome sequencing (WGS) (n = 16) and/or whole-exome sequencing (WES) (n = 39) of diagnostic and remission samples from 51 cases of high hyperdiploid ALL to further define the genomic landscape of this malignancy. The majority of cases showed involvement of the RTK-RAS pathway and of histone modifiers. No recurrent fusion gene-forming rearrangement was found, and an analysis of mutations on trisomic chromosomes indicated that the chromosomal gains were early events, strengthening the notion that the high hyperdiploid pattern is the main driver event in this common pediatric malignancy

Feasibility to use whole-genome sequencing as a sole diagnostic method to detect genomic aberrations in pediatric B-cell acute lymphoblastic leukemia

IntroductionThe suitability of whole-genome sequencing (WGS) as the sole method to detect clinically relevant genomic aberrations in B-cell acute lymphoblastic leukemia (ALL) was investigated with the aim of replacing current diagnostic methods.MethodsFor this purpose, we assessed the analytical performance of 150 bp paired-end WGS (90x leukemia/30x germline). A set of 88 retrospective B-cell ALL samples were selected to represent established ALL subgroups as well as ALL lacking stratifying markers by standard-of-care (SoC), so-called B-other ALL.ResultsBoth the analysis of paired leukemia/germline (L/N)(n=64) as well as leukemia-only (L-only)(n=88) detected all types of aberrations mandatory in the current ALLTogether trial protocol, i.e., aneuploidies, structural variants, and focal copy-number aberrations. Moreover, comparison to SoC revealed 100% concordance and that all patients had been assigned to the correct genetic subgroup using both approaches. Notably, WGS could allocate 35 out of 39 B-other ALL samples to one of the emerging genetic subgroups considered in the most recent classifications of ALL. We further investigated the impact of high (90x; n=58) vs low (30x; n=30) coverage on the diagnostic yield and observed an equally perfect concordance with SoC; low coverage detected all relevant lesions.DiscussionThe filtration of the WGS findings with a short list of genes recurrently rearranged in ALL was instrumental to extract the clinically relevant information efficiently. Nonetheless, the detection of DUX4 rearrangements required an additional customized analysis, due to multiple copies of this gene embedded in the highly repetitive D4Z4 region. We conclude that the diagnostic performance of WGS as the standalone method was remarkable and allowed detection of all clinically relevant genomic events in the diagnostic setting of B-cell ALL

An original phylogenetic approach identified mitochondrial haplogroup T1a1 as inversely associated with breast cancer risk in BRCA2 mutation carriers

Introduction: Individuals carrying pathogenic mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes have a high lifetime risk of breast cancer. BRCA1 and BRCA2 are involved in DNA double-strand break repair, DNA alterations that can be caused by exposure to reactive oxygen species, a main source of which are mitochondria. Mitochondrial genome variations affect electron transport chain efficiency and reactive oxygen species production. Individuals with different mitochondrial haplogroups differ in their metabolism and sensitivity to oxidative stress. Variability in mitochondrial genetic background can alter reactive oxygen species production, leading to cancer risk. In the present study, we tested the hypothesis that mitochondrial haplogroups modify breast cancer risk in BRCA1/2 mutation carriers. Methods: We genotyped 22,214 (11,421 affected, 10,793 unaffected) mutation carriers belonging to the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 for 129 mitochondrial polymorphisms using the iCOGS array. Haplogroup inference and association detection were performed using a phylogenetic approach. ALTree was applied to explore the reference mitochondrial evolutionary tree and detect subclades enriched in affected or unaffected individuals. Results: We discovered that subclade T1a1 was depleted in affected BRCA2 mutation carriers compared with the rest of clade T (hazard ratio (HR) = 0.55; 95% confidence interval (CI), 0.34 to 0.88; P = 0.01). Compared with the most frequent haplogroup in the general population (that is, H and T clades), the T1a1 haplogroup has a HR of 0.62 (95% CI, 0.40 to 0.95; P = 0.03). We also identified three potential susceptibility loci, including G13708A/rs28359178, which has demonstrated an inverse association with familial breast cancer risk. Conclusions: This study illustrates how original approaches such as the phylogeny-based method we used can empower classical molecular epidemiological studies aimed at identifying association or risk modification effects.Peer reviewe

Ofrivilligt gränslöst arbete : En intervjustudie om hemtjänstpersonals upplevelser av arbetsrelaterad digital kommunikation på fritiden

Godkänd: 2023-05-31</p

Ofrivilligt gränslöst arbete : En intervjustudie om hemtjänstpersonals upplevelser av arbetsrelaterad digital kommunikation på fritiden

Godkänd: 2023-05-31</p

Effects of forced air warming on children’s body temperature during the perioperative period

Bakgrund: Perioperativ hypotermi är vanligt i samband med operation vilket ökar morbiditeten och samhällskostnader. Den kan leda till vårdskador, vårdlidande, och äventyra patientsäkerheten. Perioperativ hypotermi kan observeras genom mätning av barnskroppstemperatur. Därefter kan olika värmebevarande insatser sättas in som förebyggande åtgärder. För att kunna möjliggöra detta är det viktigt att arbeta utifrån en evidensbaserad säker vård. Syfte: Var att undersöka effekter av varmluftstäcke på barns kroppstemperatur under det perioperativa förloppet. Metod: En systematisk litteraturöversikt baserad på kvantitativa artiklar vilket resulterade i att tio vetenskapliga artiklar inkluderades i litteraturöversiktens resultat. Resultat: Varmluftstäcke förbättrade barnskroppstemperatur vilket förebyggde perioperativ hypotermi under det perioperativa förloppet. Hög grad av värme på varmluftstäcket kunde dock leda till hypertermi hos barn i den intraoperativa fasen. Komplikationer orsakade av perioperativ hypotermi kunde även undvikas postoperativt. Diskussion: För att förebygga perioperativ hypotermi är det viktigt att anestesisjuksköterskor har en lämplig perioperativ uppvärmningsstrategi. Detta uppnås genom en noggrann mätning av kärntemperatur och kontroll av effekten av uppvärmningsterapi under det perioperativa förloppet

Effects of forced air warming on children’s body temperature during the perioperative period

Bakgrund: Perioperativ hypotermi är vanligt i samband med operation vilket ökar morbiditeten och samhällskostnader. Den kan leda till vårdskador, vårdlidande, och äventyra patientsäkerheten. Perioperativ hypotermi kan observeras genom mätning av barnskroppstemperatur. Därefter kan olika värmebevarande insatser sättas in som förebyggande åtgärder. För att kunna möjliggöra detta är det viktigt att arbeta utifrån en evidensbaserad säker vård. Syfte: Var att undersöka effekter av varmluftstäcke på barns kroppstemperatur under det perioperativa förloppet. Metod: En systematisk litteraturöversikt baserad på kvantitativa artiklar vilket resulterade i att tio vetenskapliga artiklar inkluderades i litteraturöversiktens resultat. Resultat: Varmluftstäcke förbättrade barnskroppstemperatur vilket förebyggde perioperativ hypotermi under det perioperativa förloppet. Hög grad av värme på varmluftstäcket kunde dock leda till hypertermi hos barn i den intraoperativa fasen. Komplikationer orsakade av perioperativ hypotermi kunde även undvikas postoperativt. Diskussion: För att förebygga perioperativ hypotermi är det viktigt att anestesisjuksköterskor har en lämplig perioperativ uppvärmningsstrategi. Detta uppnås genom en noggrann mätning av kärntemperatur och kontroll av effekten av uppvärmningsterapi under det perioperativa förloppet

Upplevelser av symtom och omvårdnadsbehov i det vardagliga livet hos personer med multipel skleros : en deskriptiv litteraturstudie

Bakgrund: Multipel skleros (MS) är en autoimmun inflammatorisk sjukdom med individuellt varierande symtom. Varje person med MS har ett eget omvårdnadsbehov beroende på vilka symtom hen upplever. Personen lever med sjukdomen livet ut och nya symtom uppkommer regelbundet. Syfte: Litteraturstudiens syfte var att beskriva hur personer med MS upplever att symtom och omvårdnadsbehov påverkar deras vardagliga liv samt att beskriva de inkluderade artiklarnas urvalsmetod. Metod: Beskrivande litteraturstudie. Artiklar söktes fram via databasen Cinahl samt via manuella sökningar. Totalt framkom 11 vetenskapliga artiklar, 10 kvalitativa och 1 med mixad metod, som inkluderades i litteraturstudien. Huvudresultat: Symtom och omvårdnadsbehov påverkade personerna med MS vardagliga liv och autonomi. Symtomen som hade störst påverkan var uttalad trötthet och problem med rörelseförmågan, men alla symtom påverkade personerna på ett eller annat sätt. Ingen aspekt av vardagen var opåverkad och utöver symtomen var omvårdnadsbehovet ett hinder för att personerna skulle kunna gör det de ville. Energibristen och att vara beroende av andra för att vardagen skulle gå ihop var ett problem. Personerna hade en stark vilja att göra mer än de klarade av och de ville inte känna sig handikappade. Personerna prioriterade det viktigaste i livet. Det framkom att artiklarna valt liknande urvalsmetoder för att svara på deras syfte. Slutsats: MS är en sjukdom vars symtom och omvårdnadsbehov påverkar personens vardagliga liv på många sätt, framförallt förmågan att leva som tidigare och personens känsla av autonomi. Att göra de aktiviteter som önskades var svårt och personerna blev tvungna att prioritera det som var viktigast för dem.Background: Multiple sclerosis (MS) is an autoimmune inflammatory disease with individually  varying symptoms. Each person with MS has their own care needs, depending on which symptoms he/she experiences. The person live with MS the rest of his/her life and new symptoms occur regularly. Aim: The purpose of this study was to describe how people with MS experience how symptoms and care needs affect their everyday lives and to describe the included articles sample method. Method: Descriptive literature review. Articles were searched out through Cinahl and via manual searches. A total of 11 scientific articles emerged, 10 qualitative and 1 withmixed approach, which was included in the study. Main results: The MS disease symptoms and care needs had a great impact on people's everyday lives and autonomy . The symptoms that had the greatest impact was fatigue and problems with the ability to move. No aspect of daily life was unaffected and in addition to the symptoms, care needs was an obstacle. The lack of energy and to be reliant on others so the daily life would work, was a big problem. They had a strongdesire to do more than they could and they did not want to feel disabled. It appeared that the articles chosen similar selection methods to answer their aim. Conclusion: MS is a disease that affects the person's everyday life in many ways, above all, the ability to live as before and the feeling of autonomy. They had to prioritize what was most important to them