46 research outputs found

    Biocontrol of potato wilt by selective rhizospheric and endophytic bacteria associated with potato plant

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    Ralstonia solanacearum is the causative agent of wilt disease in plants, which constitutes a severe problem to agricultural crops, particularly for potato production in Madagascar. The present study focuses on the isolation, in vitro and in vivo assays of potential rhizospheric and endophytic bacteria associated with healthy potato plant, capable to inhibit the growth of Ralstonia solanacearum for controlling potato bacterial wilt. A total of 77 bacteria strains were isolated from six soil rhizospheric samples and six vegetal material samples of healthy potatoes in the district of Antsirabe II. Forty of them were telluric actinomycetes, 25 were endophytic actinomycetes and 12 were fluorescent Pseudomonas spp. An additional 30 phytopathogenic isolates were obtained from six rhizopsheric soil samples of diseased potatoes. Morphological, cultural, biochemical characterization and molecular identification with the Ralstonia solanacearum specific primers 759/760 revealed that 24 of the pathogenic isolates belong to the Ralstonia solanacearum species, biovar two; the causal agent of potato bacterial wilt. Isolates from healthy plants were, then, examined in vitro and in vivo for their antagonistic activity against Ralstonia solanacearum strain for their potential to improve potato plant growth. In vitro antagonism of actinomycete and Pseudomonas isolates against Ralstonia solanacearum development was performed using agar diffusion technique, while in vivo tests were conducted under greenhouse conditions. Ten antagonistic strains including two Pseudomonas, four telluric actinomycetes, and four endophytic actinomycetes inhibited the tested Ralstonia strain. Four strains, E7, E13 (endophytic actinomycete from root potatoes), S25 (telluric actinomycetes) and P7 (fluorescent Pseudomonas), showed high antagonistic activity against the pathogen with zones of inhibition from 23 to 40 mm. Of the fours strains tested in greenhouse, E7 significantly reduced (p < 0.05) the percentage of Ralstonia solanacearum that infected plants by 72.04%. The isolates E13 and S25 have also been demonstrated to improve plant growth by increase of plant height to 44.63% and 44.84%, fresh weight to 68.75% and 75.85% and dry weight to 86.17% and 115.42%, respectively compared with non-treated control. Morphological and cultural characterization of these three active isolates showed that they belong to the genus Streptomyces. The antagonism of these isolates against Ralstonia solanacearum according to in vitro and in vivo tests results, along with their high efficiency as regards the improvement of plant development, suggests that these three actinomycete strains E7, E13 and S25 could be useful for biocontrol of potato bacterial wilt.Key words: Potato, Ralstonia, Actinomycetes, Pseudomonas, Biocontrol

    Traces of trauma – a multivariate pattern analysis of childhood trauma, brain structure and clinical phenotypes

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    Background: Childhood trauma (CT) is a major yet elusive psychiatric risk factor, whose multidimensional conceptualization and heterogeneous effects on brain morphology might demand advanced mathematical modeling. Therefore, we present an unsupervised machine learning approach to characterize the clinical and neuroanatomical complexity of CT in a larger, transdiagnostic context. Methods: We used a multicenter European cohort of 1076 female and male individuals (discovery: n = 649; replication: n = 427) comprising young, minimally medicated patients with clinical high-risk states for psychosis; patients with recent-onset depression or psychosis; and healthy volunteers. We employed multivariate sparse partial least squares analysis to detect parsimonious associations between combinations of items from the Childhood Trauma Questionnaire and gray matter volume and tested their generalizability via nested cross-validation as well as via external validation. We investigated the associations of these CT signatures with state (functioning, depressivity, quality of life), trait (personality), and sociodemographic levels. Results: We discovered signatures of age-dependent sexual abuse and sex-dependent physical and sexual abuse, as well as emotional trauma, which projected onto gray matter volume patterns in prefronto-cerebellar, limbic, and sensory networks. These signatures were associated with predominantly impaired clinical state- and trait-level phenotypes, while pointing toward an interaction between sexual abuse, age, urbanicity, and education. We validated the clinical profiles for all three CT signatures in the replication sample. Conclusions: Our results suggest distinct multilayered associations between partially age- and sex-dependent patterns of CT, distributed neuroanatomical networks, and clinical profiles. Hence, our study highlights how machine learning approaches can shape future, more fine-grained CT research

    Activités antibactériennes de l’extrait des feuilles de Dalechampia clematidifolia (Euphorbiaceae)

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    Dans l’optique de rechercher les antibiotiques d’origine naturelle, l’activité antibactérienne des extraits de feuilles de Dalechampia clematidifolia sur certaines bactéries a été étudiée. Dalechampia clematidifolia est une euphorbe endémique de Madagascar ayant de nombreuses vertus. Elle est utilisée en pharmacopée traditionnelle pour traiter les toux, les maux de ventre, toutes infections de la voie respiratoire, la grippe et les suppurations diverses. Ainsi, compte tenu de l’importance biologique et médicale de cette plante et dans le but de sa valorisation, une étude a été menée. Une extraction aqueuse à froid des feuilles nous a permis d’avoir un extrait brut opaque marron foncé, de pH 5,98 et ayant une concentration de 62,39 μg/μl. Des tests d’antibiogramme sur différentes souches bactériennes ont montré que c’est un extrait à large spectre. Cette activité est surtout remarquée vis-à-vis de quelques espèces appartenant à la famille des Enterobactériacées (Shigella boydii, Escherichia coli, Alkalescens dispar, Hafnia alvei et Enterobacter cloaceae), des Micrococacées (Micrococcus luteus, Staphylococcus aureus). La sensibilité de Rhodococcus sp., Listeria monocytogenes, Listeria utelshi, Listeria ivanivii a été également remarquée. Les CMI de cet extrait vis-à-vis de Hafnia alvei, Micrococcus luteus, Staphylococcus aureus, et Listeria utelshi sont respectivement de 15,92 μg/μl, 22,15 μg/μl, 15,92 μg/μl, et 18,50 μg/μl. Sa CMB vis-à-vis de Hafnia alvei et de Staphylococcus aureus est égale à 48 μg/μl. Cependant, cet extrait n’a présenté aucune activité sur les espèces de la famille des Vibrionacées. Son utilisation de façon empirique pour traiter différents maux a été donc justifiée par ces activités biologiques.© 2009 International Formulae Group. All rights reservedMots-clés: Dalechampia clematidifolia, euphorbe endémique, antibiogramme, larges spectres, CMI, CMB

    Yields and Quality of Italian Ryegrass (Lolium multiflorum) and Common Vetch (Vicia sativa) Grown in Monocultures and Mixed Cultures under Irrigated Conditions in the Highlands of Madagascar

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    A field experiment was conducted under irrigated conditions in the highlands of Madagascar to assess the potential of intercropping Italian ryegrass with common vetch for improving yield and quality of forage. Seed proportions studied were ryegrass-vetch 100:0; 0:100; 50:33; 50:50; 50:66; 75:33 and 75:66. Mixtures were sown in alternate rows and the sowing rates of pure stands of ryegrass and vetch were 20 and 60 kg per hectare, respectively. The results showed that all mixtures achieved yield advantage over pure stands with the highest land equivalent ratio value for dry matter yield obtained from the mixture of 75:66 (1.47) followed by 50:50 (1.35). Slight increase of crude protein content and protein digested in the small intestine when rumen-fermentable nitrogen is limiting (PDIN) content were obtained from mixtures compared with pure stand of ryegrass. Vetch rate in dry matter yield of mixtures increased with the increase of vetch seed proportion and ranged from 31 to 44%. Agressivity and competitive ratio indices showed that ryegrass was slightly competitive than vetch. Intercropping Italian ryegrass with common vetch at the seed proportions of 75:66 or 50:50 could be a more sustainable alternative cropping to alleviate dry season feed shortages of dairy livestock in the highlands of Madagascar

    Impact de la fabrication de charbon de bois sur la production et la disponibilité fourragère de pâturage en zone subaride, cas de la commune de Soalara-Sud, Toliara ll: Rapport final

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    Ce projet a pour objectif de (1) décrire la filière charbon dans un terroir de la commune de Soalara, (2) d’identifier les effets des activités de fabrication de charbon de bois sur la végétation des pâturages qui est un fourré épineux et (3) d’estimer la quantité maximale de charbon pouvant être produite sans causer sa dégradation irréversible. Pour ce faire, des enquêtes auprès de la population locale et des relevés écologiques ont été entrepris. La majorité des ménages enquêtés (>80% ; N=56) pratiquent la fabrication de charbon de bois. Environ 41 000 sacs de charbons ont été produits dans le terroir en 2009. L’impact socio-économique de la filière charbon est positif puisqu’elle génère des revenus importants pour ses agents (producteur, transporteur et collecteur). Par contre, l’impact écologique est plutôt négatif puisque les activités charbonnières contribuent à réduire la densité d’arbres et d’arbustes de la végétation des fourrés épineux et sa richesse spécifique même si elles n’affectent pas trop sa disponibilité fourragère. De plus, la quantité de charbon produite (environ 820 t en 2009) dépasse la productivité de la végétation, estimée à 218 t.an-1. Par conséquent, une dégradation du site de production actuel, se traduisant par la disparition des espèces charbonnières, arriverait dans 17 ans au plus tard, si le rythme de production actuel continue. Des mesures de réduction des pressions sur la végétation (professionnalisation des éleveurs, amélioration des rendements de carbonisation et réglementation et contrôle plus strict de la filière charbon) et d’augmentation de sa production et productivité (restauration) doivent être prises pour éviter cette dégradation irréversible qui à terme pourrait être dommageable à l’élevage de petits ruminants même si ce n’est pas encore le cas actuellement
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