13 research outputs found
Transcriptional regulation in Salmonella enterica by the Lysr-type factor LeuO
En Salmonella enterica serovar Typhimurium, igual que en el resto de procariotas, el cromosoma se encuentra compactado en una región del citoplasma denominada nucleoide. Esta compactación es debida, en parte, a la presencia de proteínas asociadas al nucleoide (NAPs), entre las cuales destaca H-NS, que además de conferir estructura al cromosoma tiene un papel esencial en la regulación de genes situados en las zonas a las que se une. Dichas zonas poseen un bajo porcentaje de G+C, que es una característica habitual de regiones adquiridas por transferencia horizontal.
H-NS actúa habitualmente reprimiendo la expresión génica. Sin embargo, en determinadas circunstancias los genes reprimidos por H-NS deben ser expresados. Para ello, la célula posee mecanismos para evitar la represión por H-NS, y entre ellos se encuentra la proteína LeuO.
LeuO es una proteína reguladora perteneciente a la familia LysR. En un principio se describió como una proteína implicada en el superenrollamiento del cromosoma y posteriormente se estudió su función reguladora como antagonista de H-NS. En esta Tesis se han caracterizado los sitios de unión de LeuO en el cromosoma de S. Typhimurium usando coinmunoprecipitación de cromatina asociada a un chip. Se ha detectado un elevado número de dianas, la mayoría de las cuales son a su vez dianas de la ARN polimerasa. Hay que destacar que, a pesar de que muchos puntos de unión de LeuO coinciden con los de H-NS, corroborando su función como antagonista, se han encontrado numerosas dianas no relacionadas con H-NS, lo que sugiere una función reguladora independiente de H-NS en determinadas circunstancias.
Se detectaron dianas en genes adquiridos por transferencia horizontal. Entre ellos se encontraban genes relacionados con la virulencia, como es el caso de la isla de patogenicidad 1 (SPI-1).
La isla de patogenicidad 1 de Salmonella contiene los genes necesarios para invadir el epitelio intestinal. Esta región está sometida a una estricta regulación transcripcional y posttranscripcional. Debido a la presencia de genes de SPI-1 entre las dianas de LeuO, se estudió la implicación de LeuO en la expresión de dichos genes. Mediante aproximaciones genéticas, como análisis de epistasia o escrutinios genéticos, y moleculares, como retardo en gel o análisis de footprinting, se determinó que la represión de SPI1 se realizaba a través de dos vías independientes, siendo una de ellas la activación de la transcripción del represor HilE. Además, se observó una drástica disminución en la capacidad invasiva de S. Typhimurium en condiciones de expresión de LeuO.
S. Typhimurium posee un plásmido de virulencia (pSLT). Este plásmido contiene genes implicados en virulencia (spv) necesarios para la infección sistémica en ratones, genes relacionados con la adhesión celular al epitelio intestinal (pef) y un operón tra que contiene todos los elementos necesarios para la transferencia conjugativa. Tras el análisis de los puntos de unión de LeuO en el cromosoma se realizó una búsqueda de las posibles dianas en pSLT, obteniéndose el mayor número dentro del operón tra y observándose una disminución en la frecuencia conjugativa en presencia de LeuO.
Entre las posibles dianas de LeuO se encontraba la región promotora de finP, a la que se comprobó que se unía mediante técnicas de retardo en gel. El sistema FinOP o sistema de inhibición de la fertilidad es clave en la regulación de la transferencia conjugativa. En presencia de LeuO aumentaba la expresión de finP causando una represión de la transcripción de tra y por tanto, inhibiendo la transferencia del plásmido de virulencia mediante conjugación
Small RNA-based feedforward loop with AND-gate logic regulates extrachromosomal DNA transfer in Salmonella
Horizontal gene transfer via plasmid conjugation is a major driving force in microbial evolution but constitutes a complex process that requires synchronization with the physiological state of the host bacteria. Although several host transcription factors are known to regulate plasmid-borne transfer genes, RNA-based regulatory circuits for host-plasmid communication remain unknown. We describe a posttranscriptional mechanism whereby the Hfq-dependent small RNA, RprA, inhibits transfer of pSLT, the virulence plasmid of Salmonella enterica. RprA employs two separate seed-pairing domains to activate the mRNAs of both the sigma-factor σS and the RicI protein, a previously uncharacterized membrane protein here shown to inhibit conjugation. Transcription of ricI requires σS and, together, RprA and σS orchestrate a coherent feedforward loop with AND-gate logic to tightly control the activation of RicI synthesis. RicI interacts with the conjugation apparatus protein TraV and limits plasmid transfer under membrane-damaging conditions. To our knowledge, this study reports the first small RNA-controlled feedforward loop relying on posttranscriptional activation of two independent targets and an unexpected role of the conserved RprA small RNA in controlling extrachromosomal DNA transfer.Bildung und Forschung Project eBio:RNAsys BIO2013-44220-RMinisterio de Economía y Competitividad CSD2008-00013Junta de Andalucía CVI-587
Tendencias y retos de la geografía en América Latina en el siglo XXI: una perspectiva desde el VII CGAL
Su estructura contempla siete capítulos: en el primero denominado Origen y devenir histórico del Coloquio Geográfico sobre América Latina de la Facultad de Geografía de la UAEM de los autores Carlos Reyes Torres, Agustín Olmos Cruz y Fernando Carreto Bernal, integrantes del Cuerpo Académico en Educación y Enseñanza de la Geografía, da cuenta del origen de los Coloquios Geográficos de AL, estableciendo sus etapas de desarrollo desde 1993 al 2014, caracterizando sus comités organizadores, ejes temáticos, así como la representación de los ponentes de las instituciones y países participantes. La relevancia de estos estudios radica en la recuperación de la historia de los eventos para fomentar la identidad y sentido de pertenencia con la disciplina y con la institución.El presente libro intitulado Tendencias y retos de la geografía en América Latina en el siglo XXI: una perspectiva desde el VII CGAL, es un producto derivado del 7° Coloquio Geográfico sobre América Latina, celebrado en desde hace ya dos décadas en la Facultad de Geografía de la Universidad Autónoma del Estado de México, convocando con el eje temático sobre “Las Tendencias y retos de la Geografía en América Latina en el siglo XXI”Universidad Autónoma del Estado de México Facultad de Geografí
POR UNA CULTURA DE PAZ: UNA MIRADA DESDE LAS CIENCIAS DE LA CONDUCTA
En
virtud
de
lo
anterior,
los
estudiosos
de
las
ciencias
de
la
conducta
de
la
Universidad
Autónoma
del
Estado
de
México,
ante
la
persistencia
y
proliferación
de
estos
hechos
en
diversas
partes
del
Mundo
y
de
nuestro
país
en
particular, se
convocó
a
los
estudiosos
interesados
y
a
la
sociedad
en
general
a
presentar
trabajos
para
analizar,
debatir
y
proponer
estrategias
de
acción
y
dirección,
que
fortalezcan
una
convivencia y bienestar con sentido humanista para una cultura de paz.
El
presente
texto
es
producto
de
esta convocatoria
que
recoge
los
trabajos
de
los
interesados
en
la
temática,
de
diferentes
países
(España,
Argentina,
Cuba,
Brasil,
Costa
Rica
y
México)
retomando
con
ello
sus
experiencias
relativas
al
estudio,
análisis,
comprensión
e
instrumentación
de
la
cultura
de
paz
en
los
distintos
ámbitos
institucionales
en
los
que
participan:
educativo,
salud,
penitenciario,
social,
laboral,
familia,
alimentario,
psicológico,
por
mencionar
algunos.
El
presente
libro,
propicia
un
espacio
de
reflexión,
diálogo
y
posicionamiento
de
las
ciencias
de
la
conducta
para
la
apropiación,
análisis,
debate
y
propuestas
que
fortalezcan
una
cultura
de
paz
a
través
de
la
convivencia
y
el
bienestar
social
con
sentido
humanista.
El
sistema
económico
neoliberal
y
el
proceso
de
globalización
han
contribuido
al
logro
de
avances
significativos
en
la
ciencia
y
la
tecnología,
pero
también
han
propiciado
la
polarización
de
las
sociedades
lo
que
ha
impactado
de
manera
negativa
a
la
sociedad
en
su
conjunto,
pero
en
mayor
medida
a
los grupos
vulnerables. Dicha
polarización
ha
traído
consigo
un
desarrollo
desigual
del
mundo
que
se
expresa
de
diferentes
maneras
tanto
en
países
desarrollados
como
en
los
llamados
del
tercer
mundo,
en
donde
no
están
satisfechas
las
necesidades
humanas
elementales
de
todos
los
sectores
de
la
población,
siempre
falta
algo.
Si
a
esto
le
sumamos
los
conflictos
internacionales por
diferentes
motivos
que
enfrentan
algunas
naciones,
una
insuficiente
cobertura
educativa
y
de
salud,
desempleo
y
pobreza
extrema,
entre
otras
cosas;
estamos
frente
a
retos
de
gran
envergadura
para
los
gobiernos,
para
los
estudiosos
y
para
la
sociedad
civil
en
general. Uno
de
los
intentos
para
frenar
y prevenir
la
agudización
de
estas
problemáticas
es
la
cultura
de
paz,
cuyo
estudio
y propuestas
han
ido
avanzando
en
diferentes
sentidos
y
de
manera
favorable,
el
tema
está
presente
en
diferentes
Organismos
Internacionales
como
la
ONU,
la
UNESCO,
la
OCDE,
El
Banco
Mundial,
entre
otros.
Pero
falta
mucho
por
hacer.Universidad Autónoma del Estado de Méxic
una mirada desde las Ciencias de la Conducta
Este libro es el resultado de los trabajos presentados en el 1er Congreso Internacional "Convivencia y bienestar con sentido humanista para una cultura de paz"
Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2
The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality
Elective cancer surgery in COVID-19-free surgical pathways during the SARS-CoV-2 pandemic: An international, multicenter, comparative cohort study
PURPOSE As cancer surgery restarts after the first COVID-19 wave, health care providers urgently require data to determine where elective surgery is best performed. This study aimed to determine whether COVID-19–free surgical pathways were associated with lower postoperative pulmonary complication rates compared with hospitals with no defined pathway. PATIENTS AND METHODS This international, multicenter cohort study included patients who underwent elective surgery for 10 solid cancer types without preoperative suspicion of SARS-CoV-2. Participating hospitals included patients from local emergence of SARS-CoV-2 until April 19, 2020. At the time of surgery, hospitals were defined as having a COVID-19–free surgical pathway (complete segregation of the operating theater, critical care, and inpatient ward areas) or no defined pathway (incomplete or no segregation, areas shared with patients with COVID-19). The primary outcome was 30-day postoperative pulmonary complications (pneumonia, acute respiratory distress syndrome, unexpected ventilation). RESULTS Of 9,171 patients from 447 hospitals in 55 countries, 2,481 were operated on in COVID-19–free surgical pathways. Patients who underwent surgery within COVID-19–free surgical pathways were younger with fewer comorbidities than those in hospitals with no defined pathway but with similar proportions of major surgery. After adjustment, pulmonary complication rates were lower with COVID-19–free surgical pathways (2.2% v 4.9%; adjusted odds ratio [aOR], 0.62; 95% CI, 0.44 to 0.86). This was consistent in sensitivity analyses for low-risk patients (American Society of Anesthesiologists grade 1/2), propensity score–matched models, and patients with negative SARS-CoV-2 preoperative tests. The postoperative SARS-CoV-2 infection rate was also lower in COVID-19–free surgical pathways (2.1% v 3.6%; aOR, 0.53; 95% CI, 0.36 to 0.76). CONCLUSION Within available resources, dedicated COVID-19–free surgical pathways should be established to provide safe elective cancer surgery during current and before future SARS-CoV-2 outbreaks
Elective Cancer Surgery in COVID-19-Free Surgical Pathways During the SARS-CoV-2 Pandemic: An International, Multicenter, Comparative Cohort Study.
PURPOSE: As cancer surgery restarts after the first COVID-19 wave, health care providers urgently require data to determine where elective surgery is best performed. This study aimed to determine whether COVID-19-free surgical pathways were associated with lower postoperative pulmonary complication rates compared with hospitals with no defined pathway. PATIENTS AND METHODS: This international, multicenter cohort study included patients who underwent elective surgery for 10 solid cancer types without preoperative suspicion of SARS-CoV-2. Participating hospitals included patients from local emergence of SARS-CoV-2 until April 19, 2020. At the time of surgery, hospitals were defined as having a COVID-19-free surgical pathway (complete segregation of the operating theater, critical care, and inpatient ward areas) or no defined pathway (incomplete or no segregation, areas shared with patients with COVID-19). The primary outcome was 30-day postoperative pulmonary complications (pneumonia, acute respiratory distress syndrome, unexpected ventilation). RESULTS: Of 9,171 patients from 447 hospitals in 55 countries, 2,481 were operated on in COVID-19-free surgical pathways. Patients who underwent surgery within COVID-19-free surgical pathways were younger with fewer comorbidities than those in hospitals with no defined pathway but with similar proportions of major surgery. After adjustment, pulmonary complication rates were lower with COVID-19-free surgical pathways (2.2% v 4.9%; adjusted odds ratio [aOR], 0.62; 95% CI, 0.44 to 0.86). This was consistent in sensitivity analyses for low-risk patients (American Society of Anesthesiologists grade 1/2), propensity score-matched models, and patients with negative SARS-CoV-2 preoperative tests. The postoperative SARS-CoV-2 infection rate was also lower in COVID-19-free surgical pathways (2.1% v 3.6%; aOR, 0.53; 95% CI, 0.36 to 0.76). CONCLUSION: Within available resources, dedicated COVID-19-free surgical pathways should be established to provide safe elective cancer surgery during current and before future SARS-CoV-2 outbreaks
Por una cultura de paz, una mirada desde las Ciencias de la Conducta
Este libro es el resultado de los trabajos presentados en el 1er Congreso Internacional "Convivencia y bienestar con sentido humanista para una cultura de paz"
Humans with inherited MyD88 and IRAK-4 deficiencies are predisposed to hypoxemic COVID-19 pneumonia
X-linked recessive deficiency of TLR7, a MyD88- and IRAK-4–dependent endosomal ssRNA sensor, impairs SARS-CoV-2 recognition and type I IFN production in plasmacytoid dendritic cells (pDCs), thereby underlying hypoxemic COVID-19 pneumonia with high penetrance. We report 22 unvaccinated patients with autosomal recessive MyD88 or IRAK-4 deficiency infected with SARS-CoV-2 (mean age: 10.9 yr; 2 mo to 24 yr), originating from 17 kindreds from eight countries on three continents. 16 patients were hospitalized: six with moderate, four with severe, and six with critical pneumonia, one of whom died. The risk of hypoxemic pneumonia increased with age. The risk of invasive mechanical ventilation was also much greater than in age-matched controls from the general population (OR: 74.7, 95% CI: 26.8–207.8, P < 0.001). The patients’ susceptibility to SARS-CoV-2 can be attributed to impaired TLR7-dependent type I IFN production by pDCs, which do not sense SARS-CoV-2 correctly. Patients with inherited MyD88 or IRAK-4 deficiency were long thought to be selectively vulnerable to pyogenic bacteria, but also have a high risk of hypoxemic COVID-19 pneumonia