Mutations and migration : molecular and epidemiological aspects of HIV-1 in Sweden

The Swedish HIV-1 epidemic is characterized by a wide variation in subtypes due to migration and travel. The aims of this thesis were to investigate molecular methods for estimating time to diagnosis and epidemiological tools for estimating the proportion of undiagnosed individuals with HIV-1 in Sweden, as well as to update the knowledge on transmitted and pre-treatment drug resistance (TDR and PDR) among persons living with HIV-1 in Sweden. In Paper I we found that viral diversity estimated by the proportion of mixed base calls in pol gene sequences is an indicator of whether a HIV-1 infection is recent (≤1 year) or chronic. A cutoff of 0.47% mixed base calls identified recent infections with a sensitivity of 89% and a specificity of 75%. In Paper II we studied TDR in newly diagnosed individuals (n=1,713, 71% coverage) in 2010-2016 in Sweden. The prevalence of TDR was 7.1% (95% CI 5.8-8.3%) and resistance to non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTI) increased significantly from 1.5% in 2010 to 6.2% in 2016 and was related to infection/origin in sub-Saharan Africa. A transmission cluster in men having sex with men with the M41L mutation was traced back to the 1990´s. In Paper III we evaluated two mathematical models for estimation of the proportion of undiagnosed individuals with HIV-1 in Sweden, SSOPHIE and the ECDC Modelling tool. The model estimates for 2013 were 26% (n=2,100; 90% plausibility range 900-5,000) and 21% (n=2,013; 95% CI 1,831-2,189), respectively. The wide confidence bounds and problems to account for migration limited the value of the results. We concluded that improvements of models and better data on migration are needed. In Paper IV we investigated PDR in individuals diagnosed in Sweden 2017-2019 (n=224) using an in-house high-throughput sequencing (HTS) assay with a detection limit of 1% for minority viral variants. HTS was successful in 87% of samples and failure was associated with low viral loads. Drug resistance mutations (DRMs) in protease/reverse transcriptase were detected in 49% of patients and in 18% of patients the DRMs were at levels ≥20% of the viral population. DRMs above 20% were mainly towards NNRTIs and correlated with previous ART exposure (p=0.001) and origin in Asia (p=0.007). Integrase strand transfer inhibitor (INSTI) DRM were rare and only found in levels <20% of the total viral population. In conclusion, we have confirmed that viral diversity is a useful biomarker of time to diagnosis in HIV-infection and have identified important complications with estimating the proportion of undiagnosed HIV-1 infections in settings with high levels of migration. We have shown that the global increase in NNRTI-resistance is mirrored among HIV-positive migrants in Sweden and we have contributed to the knowledge about the utility of HTS in drug resistance testing of HIV-1

Det svenska CSR-landskapet. En kartläggning av svenska, börsnoterade företags CSR-arbete

Syfte: Syftet med denna studie är att göra en kartläggning över hur svenska, börsnoterade företag arbetar med CSR. Ambitionen är att undersöka huruvida graden av CSR skiljer sig åt mellan stora och små företag respektive tillverkande och tjänsteföretag. Metod: Studien är kartläggande och således av bred karaktär med beskrivande ambitioner. Ett egenkonstruerat mätverktyg har använts för att göra en innehållsanalys av slumpmässigt utvalda börsbolag. Teoretiska perspektiv: Grunden i den teoretiska referensramen bygger på teorier om CSR såsom Triple Bottom Line och Carrolls pyramid. Ramverket utgörs även av teorier med ett strategiperspektiv, nämligen stakeholderteorin, legitimitetsteorin och teorier om konkurrensfördelar. Empiri: Det empiriska materialet som undersökningen bygger på består av de 100 slumpmässigt utvalda, svenska, börsbolagens hemsidor. Resultat: Studien visar att det finns en skillnad i graden av CSR mellan stora och små företag på Stockholmsbörsen där stora företag visar en betydligt högre grad av CSR jämfört med små företag. Det finns dock inte någon statistiskt säkerställd skillnad i CSR-grad mellan tillverkande och tjänsteföretag

Ehdotus pysyväksi avustusmekanismiksi journalismin tukemiseksi

On 25 June 2020, the Ministry of Transport and Communications appointed a working group with representatives of the media sector and experts in the field to assist in the further preparation of a temporary government grant in support of journalism and to reflect on a permanent aid mechanism for this purpose. The working group also discussed the feasibility of public support for media that produce multilingual and multicultural journalism. Members of the working group: Hanne Aho, Chair, Union of Journalists in Finland; Marko Ala-Fossi, Media Researcher, University of Tampere; Mikko Grönlund, Research Manager, University of Turku; Jukka Holmberg, CEO, Finnish Media Federation; Mikko Villi, Professor, University of Jyväskylä; and Päivi Korpisaari, Professor in Communication Law, University of Helsinki. The working group proposes editorial production support as the main form of assistance. Another proposed form of assistance is development support that could be granted not only to newly established media companies but also for development projects of an established media company. Both forms of assistance are intended to support media that provide news and current affairs content. The working group also proposes specific support for community media. The proposed model would promote reliable, multi-faceted and socially significant communication as a whole.</p

Ehdotus pysyväksi avustusmekanismiksi journalismin tukemiseksi

Liikenne- ja viestintäministeriö asetti 25.6.2020 media-alan toimijoita edustavista tahoista ja alan asiantuntijoista koostuvan työryhmän avustamaan journalismin tukemiseen tarkoitetun väliaikaisen valtionavustuksen valmistelussa sekä pohtimaan pysyväisluonteista avustusmekanismia journalismin tukemiseksi. Osana työryhmän työtä on tarkasteltu myös mahdollisuutta tukea monikielistä ja monikulttuurista journalismia tuottavia tiedotusvälineitä. Työryhmän jäseninä ovat toimineet: Hanne Aho, puheenjohtaja, Journalistiliitto; Marko Ala-Fossi, yliopistonlehtori Tampereen yliopisto; Mikko Grönlund, tutkimuspäällikkö, Turun yliopisto; Jukka Holmberg, toimitusjohtaja, Medialiitto; Mikko Villi, professori, Jyväskylän yliopisto sekä Päivi Korpisaari, viestintäoikeuden professori, Helsingin yliopisto. Työryhmä ehdottaa pääasiallisena journalismin tukimuotona toimituksellista tuotantotukea. Toisena tukimuotona ehdotetaan kehittämistukea, jota voitaisiin myöntää paitsi aloitteleville tiedotusvälineille myös olemassa olevan tiedotusvälineen kehittämishankkeisiin. Molempien tukien tarkoituksena olisi uutis- ja ajankohtaissisältöjä tarjoavien tiedotusvälineiden tukeminen. Lisäksi työryhmä ehdottaa erityistä yhteisömedioiden tukea. Malli edistäisi kokonaisuudessaan luotettavaa, monipuolista ja yhteiskunnallisesti merkittävää tiedonvälitystä

Drug Resistant Mycobacterium tuberculosis of the Beijing Genotype Does Not Spread in Sweden

BACKGROUND: Drug resistant (DR) and multi-drug resistant (MDR) tuberculosis (TB) is increasing worldwide. In some parts of the world 10% or more of new TB cases are MDR. The Beijing genotype is a distinct genetic lineage of Mycobacterium tuberculosis, which is distributed worldwide, and has caused large outbreaks of MDR-TB. It has been proposed that certain lineages of M. tuberculosis, such as the Beijing lineage, may have specific adaptive advantages. We have investigated the presence and transmission of DR Beijing strains in the Swedish population. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: All DR M. tuberculosis complex isolates between 1994 and 2008 were studied. Isolates that were of Beijing genotype were investigated for specific resistance mutations and phylogenetic markers. Seventy (13%) of 536 DR strains were of Beijing genotype. The majority of the patients with Beijing strains were foreign born, and their country of origin reflects the countries where the Beijing genotype is most prevalent. Multidrug-resistance was significantly more common in Beijing strains than in non-Beijing strains. There was a correlation between the Beijing genotype and specific resistance mutations in the katG gene, the mabA-inhA-promotor and the rpoB gene. By a combined use of RD deletions, spoligotyping, IS1547, mutT gene polymorphism and Rv3135 gene analysis the Beijing strains could be divided into 11 genomic sublineages. Of the patients with Beijing strains 28 (41%) were found in altogether 10 clusters (2-5 per cluster), as defined by RFLP IS6110, while 52% of the patients with non-Beijing strains were in clusters. By 24 loci MIRU-VNTR 31 (45%) of the patients with Beijing strains were found in altogether 7 clusters (2-11 per cluster). Contact tracing established possible epidemiological linkage between only two patients with Beijing strains. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Although extensive outbreaks with non-Beijing TB strains have occurred in Sweden, Beijing strains have not taken hold, in spite of the proximity to high prevalence countries such as Russia and the Baltic countries. The Beijing sublineages so far introduced in Sweden may not be adapted to spread in the Scandinavian population

Influence of antisynthetase antibodies specificities on antisynthetase syndrome clinical spectrum time course

Antisynthetase syndrome (ASSD) is a rare clinical condition that is characterized by the occurrence of a classic clinical triad, encompassing myositis, arthritis, and interstitial lung disease (ILD), along with specific autoantibodies that are addressed to different aminoacyl tRNA synthetases (ARS). Until now, it has been unknown whether the presence of a different ARS might affect the clinical presentation, evolution, and outcome of ASSD. In this study, we retrospectively recorded the time of onset, characteristics, clustering of triad findings, and survival of 828 ASSD patients (593 anti-Jo1, 95 anti-PL7, 84 anti-PL12, 38 anti-EJ, and 18 anti-OJ), referring to AENEAS (American and European NEtwork of Antisynthetase Syndrome) collaborative group's cohort. Comparisons were performed first between all ARS cases and then, in the case of significance, while using anti-Jo1 positive patients as the reference group. The characteristics of triad findings were similar and the onset mainly began with a single triad finding in all groups despite some differences in overall prevalence. The "ex-novo" occurrence of triad findings was only reduced in the anti-PL12-positive cohort, however, it occurred in a clinically relevant percentage of patients (30%). Moreover, survival was not influenced by the underlying anti-aminoacyl tRNA synthetase antibodies' positivity, which confirmed that antisynthetase syndrome is a heterogeneous condition and that antibody specificity only partially influences the clinical presentation and evolution of this condition

Influence of Antisynthetase Antibodies Specificities on Antisynthetase Syndrome Clinical Spectrum TimeCourse

Introduction: Increased cardiovascular (CV) morbidity and mortality is observed in inflammatory joint diseases (IJDs) such as rheumatoid arthritis, ankylosing spondylitis, and psoriatic arthritis. However, the management of CV disease in these conditions is far from being well established.Areas covered: This review summarizes the main epidemiologic, pathophysiological, and clinical risk factors of CV disease associated with IJDs. Less common aspects on early diagnosis and risk stratification of the CV disease in these conditions are also discussed. In Europe, the most commonly used risk algorithm in patients with IJDs is the modified SCORE index based on the revised recommendations proposed by the EULAR task force in 2017.Expert opinion: Early identification of IJD patients at high risk of CV disease is essential. It should include the use of complementary noninvasive imaging techniques. A multidisciplinary approach aimed to improve heart-healthy habits, including strict control of classic CV risk factors is crucial. Adequate management of the underlying IJD is also of main importance since the reduction of disease activity decreases the risk of CV events. Non-steroidal anti-inflammatory drugs may have a lesser harmful effect in IJD than in the general population, due to their anti-inflammatory effects along with other potential beneficial effects.This research was partially funded by FOREUM—Foundation for Research in Rheumatolog

2013 WSES guidelines for management of intra-abdominal infections

Peer reviewe

ISBAR -tarkistuskortti raportoinnin tueksi kirurgian vuodeosastolle

Opinnäytetyön aiheena oli ISBAR -tarkistuskortin kehittäminen Satakunnan keskus-sairaalan kirurgian vuodeosastolle. Projektin tarkoituksena oli yhdenmukaistaa ja te-hostaa suullista raportointia hoitovastuun siirtyessä hoitohenkilöltä toiselle ja siten parantaa raportointiin liittyvää potilasturvallisuutta. Tavoitteena oli tuoda ISBAR- raportointikortti kirurgian vuodeosaston käyttöön niin hoitajien taskuun kuin kanslian pöytiin ja pitää aiheeseen liittyvä osastotunti. Opinnäytetyö toteutettiin projektina ja se oli yrityksen sisäinen kehitysprojekti, joka toteutettiin yhteistyössä Satakunnan keskussairaalan kanssa. Menetelmänä projekti sopi opinnäytetyöhön, koska tuotettiin uusi toimintatapa, joka otettiin käyttöön pro-jektin seurauksena. Opinnäytetyön aihe oli ajankohtainen, koska potilasturvallisuu-teen on alettu viime vuosina kiinnittää yhä enemmän huomiota niin kansallisesti kuin kansainvälisesti. Projektin ja opinnäytetyön keskeisimmät käsitteet olivat potilasturvallisuus, ISBAR -raportointimenetelmä ja tiedonkulku. Projekti alkoi aiheen valinnalla, jonka jälkeen tehtiin alustava tiedonhaku ja perehdyttiin aiheeseen kirjallisuuden avulla. Seuraavana kirjoitettiin projektin teoreettiset lähtökohdat. Teoreettisten lähtökohtien taustalta suunniteltiin ISBAR -raportointikortti osaston käyttöön. Lisäksi suunniteltiin ISBAR -aiheinen osastotunti ja sen tueksi Power Point -esitys. Tuotoksena syntyi ISBAR -raportointikorttimalli hoitajien taskuihin sekä kanslian pöytiin kiinnitettäviksi ja ISBAR -aiheinen osastotunti. Osastotunnilla esitetty Power Point -esitys tulostettiin osastolle kansioon tulevia työntekijöitä ja opiskelijoita varten. Projektin päätyttyä osasto huolehtii itse raportointikortin käyttökoulutuksista ja kortin käytön seurannasta.The subject of the thesis was to develope an ISBAR reporting card to the surgical ward in Satakunta central hospital. The purpose of the project was to standardize and intensify oral reporting when the care responsibility moves from the nursing staff to other and thus to improve the patient safety which is related to the reporting. The ob-jective was to bring the ISBAR reporting card to the nurses' pocket as well as the ta-bles of the office into use of the surgical ward and to keep an ISBAR training hour to the staff. The thesis was carried out as a project and it was the internal development project of the company which was carried out in cooperation with the Satakunta central hospi-tal. The project was suitable for the thesis as a method because a new way of action was produced and it was brought into use as a consequence of the project. The sub-ject of the thesis was topical because the paying of more and more attention has been begun to the patient safety nationally as well as internationally during the past few years. The most central concepts of the project and of the thesis were patient safety, ISBAR reporting method and flow of information. The project began with the choice of the subject after which the preliminary information retrieval was made and the subject was studied with the help of the literature. The theoretical background to the project was written following. The ISBAR reporting method was created based on the theoretical background. The ISBAR training was held to the nursing staff and a Power Point presentation was used to clarify the recital. ISBAR reporting model was created as an output and the reporting model will be taken into use in the ward. The Power Point presentation was printed for the later use of novice nursing staff and students. The department will manage the user trainings of the reporting method and from the follow-up of the use of the card after the pro-ject has ended itself

Nuorten päihteiden käytön ehkäisy toiminnallisen intervention avulla

Tämän opinnäytetyön tarkoituksena oli edistää 12-18-vuotiaiden nuorten päihteetöntä hyvinvointia ehkäisevässä päihdeillassa Tikkurilassa helmikuussa 2019. Opinnäytetyön tavoitteena oli saada nuoret pohtimaan omaa mahdollista päihteiden käyttöä ja sen haittoja järjestetyn väittämäpelin avulla. Lisäksi tavoitteena oli kehittää Suomen Punaisen Ristin Nuorten turvatalon (Vantaa) ja Päihdetyön toimintaryhmä Huppelin yhteistyötä ehkäisevässä päihdetyössä. Opinnäytetyö toteutettiin käyttäen toiminnallista tutkimusmenetelmää, yhteistyössä Suomen Punaisen Ristin (SPR), Päihdetyön toimintaryhmä Huppelin sekä Vantaalla sijaitsevan Suomen Punaisen Ristin Nuorten turvatalon kanssa. Opinnäytetyön teoreettinen viitekehys käsitteli ehkäisevää päihdetyötä, päihdekasvatusta koulussa, nuorten päihteiden käyttöä Suomessa sekä päihteiden käytön syitä ja seurauksia. Käsiteltäviin päihteisiin laskettiin alkoholi, kannabis, tupakka ja nuuska. Toiminnalliseen osuuteen kuului kohderyhmään kuuluville, 12-17-vuotiaille nuorille järjestetty ehkäisevä päihdeilta, joka toteutettiin yhteistyössä Suomen Punaisen Ristin ja Huppelin kanssa. Ilta koostui pääosin väittämäpelistä ja päihdekyselystä. Huppelilla oli aiheena syrjinnän ehkäisy ja Suomen Punainen Risti järjesti oman päihdetietovisan. Väittämäpeliin laadittiin 11 päihteisiin liittyvää väittämää, joista nuoret ympyröivät vastaukseksi “oikein” tai “väärin”. Peliin osallistui 17 nuorta. Väittämäpelin vastaukset käytiin yhdessä läpi ja oikeat vastaukset perusteltiin nuorille tutkitulla tiedolla. Väittämäpelissä eniten oikeita vastauksia oli 16-17-vuotiailla ja vähiten oikeita vastauksia oli 14-15-vuotiailla. Päihdekyselyn vastauksista ilmeni, että hieman yli puolet nuorista ei käyttänyt alkoholia tai nuuskaa ja alle puolet nuorista ei tupakoinut. Kuitenkin huumeiden näkyvyys nuorten keskuudessa oli melko suurta. Kohderyhmä osoittautui haastavaksi levottomuutensa vuoksi, joten ohjaus oli ikätasoista ja joustavaa. Nuorten palaute väittämäpelistä oli suurimmaksi osaksi positiivista. Huppelin ja Suomen Punaisen Ristin työntekijöiden suullinen palaute koko illasta oli myös positiivista. Illan aikana ehkäisevä päihdetyö toteutui onnistuneesti kokonaisvaltaisena ohjauksena Suomen Punaisen Ristin ja Huppelin kanssa. Opinnäytetyön tuotos, nuorten illan ehkäisevä päihdetyö, sai palautetta sekä nuorilta että työelämäkumppaneilta. Työn tavoitteet ja tarkoitus toteutuivat onnistuneesti. Huppelin ja Suomen Punaisen Ristin Nuorten turvatalon työntekijät tulevat tekemään jatkossa yhteistyötä ja nuoret pääsivät pohtimaan omaa mahdollista päihteidenkäyttöään, saaden samalla uutta tietoa sen haitoista. Kyselyn vastausten perusteella tietovisat tai muut pelit ovat mieluisin tapa saada tietoa päihteiden käytön haitoista; jatkossa voisi käyttää erilaisia pelejä monialaisessa yhteistyössä