[Libraries of large-insert genomic clones as a tool for molecular cytogenetic analysis of avian genome] Библиотеки протяженных геномных клонов как инструмент молекулярно-цитогенетического анализа генома птиц

Integration of molecular and cytegenetic levels of investigation results in complex understanding of structural and functional genome organization. Gridded libraries of large-insert genomic clones represent a powerful tool of the genome analysis. Their utilization provides coordination of data on molecular organization of nucleic acids with cytogenetic data on the chromosome structure. These libraries played an important role in sequencing of genomes of human, mouse, and other organisms as an instrument linking molecular biological and cytogenetic data via construction of contigs and their localization on the chromosomes. They also enabled analysis of orthology between the mammalian genomes. The existing avian libraries fit molecular cytogenetic analysis of the class Aves genome, and can be successfully used for the isolation and characterization of large genomic fragments. This provides utilization of these libraries not only for the chromosome mapping, but also for positional cloning and search for candidate genes for quantitative traits. Сазанов А.А., Романов М.Н., Смирнов А.Ф. Интеграция молекулярного и цитогенетического уровней исследования хромосом ведет к комплексному пониманию структурно-функциональной организации генома. Гридированные библиотеки протяженных геномных клонов представляют собой мощный инструмент анализа генома. Их использование дает возможность привести в соответствие друг с другом данные по молекулярной организации нуклеиновых кислот и цитогенетические данные по структуре хромосом. Такие библиотеки сыграли большую роль в программах полного секвенирования геномов человека, домовой мыши и других организмов как инструмент связи молекулярно-биологических и цитогенетических данных путем построения контигов и их локализации на хромосомах, а также изучения ортологии между геномами млекопитающих. Существующие геномные библиотеки птиц являются адекватными задачам молекулярно-цитогенетического анализа генома класса Aves и могут быть с успехом использованы для получения и характеристики протяженных участков генома. Это обстоятельство позволяет им найти свое применение не только в области картирования хромосом, но и для позиционного клонирования и поиска генов-кандидатов количественных признаков

Calculations for the Practical Applications of Quadratic Helicity in MHD

For the quadratic helicity χ(2), we present a generalization of the Arnol'd inequality which relates the magnetic energy to the quadratic helicity, which poses a lower bound. We then introduce the quadratic helicity density using the classical magnetic helicity density and its derivatives along magnetic field lines. For practical purposes, we also compute the flow of the quadratic helicity and show that for an α2-dynamo setting, it coincides with the flow of the square of the classical helicity. We then show how the quadratic helicity can be extended to obtain an invariant even under compressible deformations. Finally, we conclude with the numerical computation of χ(2) which show cases the practical usage of this higher order topological invariant

[Genomic assessment of breeding bulls] Геномная оценка племенных быков

The review considers aspects of genomic assessment of breeding bulls based on the use of molecular genetic markers and, in particular, SNP markers for determining the breeding value of animals. В обзоре рассмотрены аспекты геномной оценки племенных быков на основе использования молекулярно-генетических маркеров и, в частности, SNP-маркеров для определения племенной ценности животных

Centrality evolution of the charged-particle pseudorapidity density over a broad pseudorapidity range in Pb-Pb collisions at root s(NN)=2.76TeV

Peer reviewe

Algorithms for Realization of Object-Oriented Method Functional to the Synthesis of Spur Gear Geometric Parameters

Работа посвящена разработке алгоритмов для вычисления значений граничных параметров кривых, входящих в математическую модель для описания формы зуба. Данные алгоритмы и математическая модель описания зубчатого профиля вместе с объектно-ориентированной моделью являются одними из ключевых частей в реализации объектно-ориентированного подхода к синтезу цилиндрических зубчатых передач. На данный момент разработка изделий с высоким коэффициентом тяги, в том числе и для приводов особого назначения, осуществляется с помощью CAD-сред. Однако крайне мало инструментов существует для построения точной геометрии зубчатых передач в этих средах. В свою очередь разработанный программный инструментарий является средством, с помощью которого можно выполнять проектирование зубчатых передач, проверять их взаимодействие с высокой точностью (до 1 мкм) и осуществлять экспорт геометрии полученных передач в CAD-среды в разрабатываемые изделия и исследовать их CAE-средах. Представленные алгоритмы были реализованы в программном комплексе. Предлагаемые алгоритмы и сама методика проектирования зубчатых передач были апробированы в ходе выполнения разработки изделий с высоким тяговым усилиемThis paper is devoted to development of algorithms for calculation of boundary parameters values of curves that are included in the mathematical model [3] for tooth shape description. This algorithms and mathematical model for tooth shape description, union with object-oriented model are some of key parts in realization of object-oriented approach to spur gear synthesis. In this moment products with high traction, including special purpose drives, development using by CAD-systems. But a few tools are developed for building of gear precise geometry in these systems. In turn, developed program complex is the tool with which you can perform spur gear design, verify gear interaction with high precision (to 1 micron) and perform gear geometry export in CAD-systems for placing them in develop products and explore them in CAE-systems. Presented algorithms were realized in program complex. This algorithms and the proposed methodic of spur gear design were tested in development of products with high tractio

Libraries of large-insert genomic clones as a tool for molecular cytogenetic analysis of avian genome

Integration of molecular and cytegenetic levels of investigation results in complex understanding of structural and functional genome organization. Gridded libraries of large-insert genomic clones represent a powerful tool of the genome analysis. Their utilization provides coordination of data on molecular organization of nucleic acids with cytogenetic data on the chromosome structure. These libraries played an important role in sequencing of genomes of human, mouse, and other organisms as an instrument linking molecular biological and cytogenetic data via construction of contigs and their localization on the chromosomes. They also enabled analysis of orthology between the mammalian genomes. The existing avian libraries fit molecular cytogenetic analysis of the class Aves genome, and can be successfully used for the isolation and characterization of large genomic fragments. This provides utilization of these libraries not only for the chromosome mapping, but also for positional cloning and search for candidate genes for quantitative traits