Testing optically stimulated luminescence dating on sand-sized quartz of deltaic deposits from the Sperchios delta plain, central Greece

This study reports on the first investigation into the potential of luminescence dating to establish a chronological framework for the depositional sequences of the Sperchios delta plain, central Greece. A series of three borehole cores (20 m deep) and two shallow cores (4 m deep), from across the delta plain, were extracted, and samples were collected for luminescence dating. The luminescence ages of sand-sized quartz grains were obtained from small aliquots of quartz, using the Single-Aliquot Regenerative-dose (SAR) protocol. The equivalent dose determination included a series of tests and the selection of the Minimum Age Model (MAM) as the most appropriate statistical model. This made it possible to confirm the applicability of quartz Optically Stimulated Luminescence (OSL) dating to establish absolute chronology for deltaic sediments from the Sperchios delta plain.Testing age results of the five cores showed that the deltaic sediments were deposited during the Holocene. A relatively rapid deposition is implied for the top ∼14 m possibly as a result of the deceleration in the rate of the sea-level rise and the transition to terrestrial conditions, while on the deeper parts, the reduced sedimentation rate may indicate a lagoonal or coastal environment

Population viability and conservation strategies for the Eurasian Black Vulture (Aegypius monachus) in Southeast Europe

The Eurasian Black Vulture is a globally threatened raptor that in Southeast Europe only occurs in an isolated population in Greece. We examined the population viability for the species under demographic fluctuations and conservation scenarios. The current population showed no possibility of extinction for the next 100 years. However, simulated scenarios showed that the most important factor affecting the viability of the species was medium and high poisoning, leading to 94.8% and 100% probability of extinction, respectively. Furthermore, high reduction of supplementary feeding highlighted an 18.6% extinction possibility. Also, a high increase of wind farms in the area may result in 17.4% extinction possibility. Additionally, the non-establishment of the feeding station in 1987 in the study area would have resulted in an extinction risk of 7%. The species can be translocated to the Olympus National Park by releasing 80 juveniles over 10 years. The implementation of the conservation scenarios concerning the establishment of a supplementary feeding site network, and the reintroduction of the Eurasian Black Vulture in its historic range, along with the elimination of threats posed by poisoning, low food availability, and wind farms would increase the probability of the species persistence and allow the population to become a source for dispersal across Southeast Europe

Implementation of GIS technologies for planning the valorisation of agricultural waste: the TANGO-Circular Project

The volume of waste produced by agricultural activities is constantly rising, due to the continuous increase of crop and livestock production, aimed to cover the nutritional needs of the accreting population of the Planet. According to recent estimations, the total amount of waste produced in the whole EU by the agricultural sector during the period 2010-2016, has been around 18.4 billion tons, which represents an average of 2.6 billion tons/year. This number is slightly exceeding the amount of waste from all other sectors combined. This enormous mass of waste has a significant environmental impact, which needs suitable solutions to reduce the carbon footprint of agriculture, while increasing the economic income for farmers. A promising way to reduce agricultural waste, passes through the valorization of agricultural co-products, by-products and residues, as well as other non-organic materials - such as plastics, widely used in crop cultivation and animal production - after the end of their working life. In order to involve farmers to play an active role on this issue, contributing to transform what they currently consider as a “waste” into a new “resource”, under the perspective of a circular economy and for a more sustainable agriculture, the Project TANGO-Circular has been financed by the EU Erasmus+ Programme. Aim of this Project is to train farmers and other agricultural stakeholders to be involved in finding viable solutions to exploit unusable remains of crops or animal farms, so as to enhance their financial input, while simultaneously contribute to reducing the environmental impact of their agro-livestock activities. With the aim to plan the valorization of agricultural waste, under the TANGO-Circular Project, a Geographical Information System (GIS) has been implemented through an open-access software (Q-GIS). This GIS has been structured into a first part dedicated to the quantification of agricultural waste flows – both organic, coming from agroindustrial activities, and not-organic, such as plastics - and a second part, focused on the spatial distribution of these flows in the study area of the project partners. Through GIS, the areas with high density of agricultural waste have been pointed out, and the suitable location of potential collection centres has been proposed. The maps that have been produced, as well as the GIS database, are always updatable tools, useful also for monitoring and optimizing the sorting and collection of agricultural waste from the farms, their suitable treatments and transport to the collection centers or recycling stations. The implemented GIS methodology has revealed very useful to support farmers and their associations, as well as all public bodies interested to govern the agricultural waste flows, to individuate possible solutions designed for the valorization of these flows, in the perspective of a circular economy. The sustainability and economic, territorial, environmental and social convenience of each form of valorization designed have been investigated, and criticalities associated with each phase of the process and consequent implementation of appropriate solutions to each problem have been addressed. Finally, further possible solutions, aimed at an increasingly better valorization of these flows, have been proposed as well

New genetic loci link adipose and insulin biology to body fat distribution.

Body fat distribution is a heritable trait and a well-established predictor of adverse metabolic outcomes, independent of overall adiposity. To increase our understanding of the genetic basis of body fat distribution and its molecular links to cardiometabolic traits, here we conduct genome-wide association meta-analyses of traits related to waist and hip circumferences in up to 224,459 individuals. We identify 49 loci (33 new) associated with waist-to-hip ratio adjusted for body mass index (BMI), and an additional 19 loci newly associated with related waist and hip circumference measures (P < 5 × 10(-8)). In total, 20 of the 49 waist-to-hip ratio adjusted for BMI loci show significant sexual dimorphism, 19 of which display a stronger effect in women. The identified loci were enriched for genes expressed in adipose tissue and for putative regulatory elements in adipocytes. Pathway analyses implicated adipogenesis, angiogenesis, transcriptional regulation and insulin resistance as processes affecting fat distribution, providing insight into potential pathophysiological mechanisms

Contribution to the study of growth and behaviour of the sea bream (Sparus aurata L.) in the Messolonghi-Etoliko lagoons

The study concerns the biology and behaviour of Sparus aurata during its presence in the lagoons of the Messolonghi – Etoliko (Western Greece). The following four components are included: o Spatial variability and temporal fluctuations of the abiotic parameters in the area of the lagoons o Elements of the biology and behaviour of the species in the different lagoons of the area o Exploitation pattern of the lagoons and their contribution to the recorded landings o A first approach to estimate the influence of the of the intensive fish farming in the area on the wild populations of the species in the lagoons The last 60 years important anthropogenic changes in the region of the lagoons, led to a noticeable decrease of the lagoons surface of about 40% and also they are responsible for the formation of 6 well identified specific lagoons. In parallel with the changes in the lagoons, a lot of intense agricultural activities were developed around the lagoons. The lagoons of the area have now their specific character and dynamics which are obvious in the morphology, hydrology and water quality and also they are detected through the analysis of the salinity fluctuations and the water level tidal dynamics. The landings composition is lagoon specific with different dominant species in each lagoon. The last 10 years the sea bream landings show an increasing trend in contrast with the generalised decreasing landings of the rest of the species. The young sea bream specimens of 0+ group are mainly present in the lagoons. Only 10% of the fishes are older than 2 years. The sex ratio is naturally dominated by males, as the species is protandric. The study of the scales revealed very interesting elements concerning the origin of the specimens which can be supplied by enhancement trials or accidental escapement from the fish farms. Moreover, the fact that the R1 ray of the 0-group fishes caught in the lagoons was larger than the R1 ray of older specimens suggest that the majority of the last group was distributed outside the lagoons where the environment was less favorable for their growth. Finally, the form of the scales can be used as criterion for the origin of the specimens. Scales comprising two parts, an internal one without rings and an external with well developed strings characterize fishes originated from aquaculture activities. A great diversity of the fish growth was observed both between lagoons and between years for the same lagoon. Heterogeneity characterize also the size and species composition of different fishing gears used in the lagoons. This diversity is not due only to the gear selectivity but is enhanced by the migratory behaviour of the fishes. This remark is important because this aspect contributes to the species composistion revealed by the fishery landings and also affects the growth estimates provided by mixed fishery data. The influence of the fish eating birds of the species Phalacrocorax carbo on the fishes remaining during the winter in the lagoons following the “modern” exploitation patterns, keeping the fishes in the lagoon during the winter, revealed very important independantly on the fish size. The influence of the aquaculture on the wild populations in the lagoons is the result of enhancement trials but also accidental escapements from the farms. The growth and survival of the introduced specimens depends on the size of the fish, the season and the state of the environment. Tagging experiments revealed interesting elements about the negative influence of the tag on the fish growth and also the performance of the enhancement as a function of fish size and season. More than 25% of the Greek sea farms and 20% of the hatcheries of sea bream and sea bass (Dicentrarchus labrax) of the country are located close to the lagoon area. Sea bream represents 60% of the total production. The last decade a spectacular increase of the number and size of farms and also of the farming processes were observed. These changes led to the maintenance of specimens more than 500 g in cages. These fishes are large and old enough to observe sex changes leading to an important presence of females in the cages. These fishes are potential spawners. The study, based on the study of the sex ratio and the sexual maturity stage of the fishes in the cages confirms this fact. In addition, the last 5 years a spectacular increase of about 80% of the sea bream landings in the lagoons was recorded. This increase was accompanied by a decrease in the mean size and consequently the market price of the 0+ group individuals producing substantial decrease in the earnings of the lagoon fisheries. The linkage between these opposite trends and the role of the aquaculture is discussed.Η παρούσα μελέτη αναφέρεται στη βιολογία και την ηθολογία του είδους Sparus aurata στη διάρκεια της διαβίωσής του στο σύμπλεγμα των λιμνοθαλασσών Μεσολογγίου Αιτωλικού. Περιλαμβάνει τέσσερις ενότητες o Βιοτικοί και αβιοτικοί παράγοντες του συμπλέγματος, και οι χωρικές και χρονικές διαφοροποιήσεις τους. o Στοιχεία της βιολογίας και της ηθολογίας του είδους στις διαφορετικές λιμνοθάλασσες του συμπλέγματος. o Πρότυπα εκμετάλλευσης Λ/Θ και η επίδρασή τους στα αποτελέσματα της αλιείας. o Μια πρώτη αξιολόγηση της επίδρασης που έχει η ανάπτυξη της εντατικής καλλιέργειας στην ευρύτερη περιοχή πάνω στους φυσικούς πληθυσμούς του είδους στο λιμνοθαλάσσιο σύμπλεγμα. Τα τελευταία 60 χρόνια έχουν γίνει σημαντικές παρεμβάσεις στο σύμπλεγμα που έχουν μειώσει κατά 40% την έκτασή του και το έχουν διαχωρίσει σε έξη λιμνοθάλασσες. Συγχρόνως πλήθος εντατικών γεωργικών κυρίως δραστηριοτήτων έχουν αναπτυχθεί στις ζώνες που το περιβάλλουν. Οι Λ/Θ του συμπλέγματος Μεσολογγίου–Αιτωλικού είναι διαφορετικές μεταξύ τους γεγονός που διαπιστώνεται από την μορφολογία τους αλλά και εκφράζεται σε συγκρίσεις ταυτόχρονων ωριαίων μετρήσεων τιμών αλατότητας ή στάθμης παλίρροιας. Όσον αφορά στη σύνθεση της αλιευτικής παραγωγής διαχωρίζονται σε ομάδες στις οποίες κυριαρχούν διαφορετικά είδη. Οι διαφοροποιήσεις αυτές σχετίζονται με την μορφολογία, την περιβαλλοντική τους κατάσταση και τα φυσικοχημικά χαρακτηριστικά τους. Καταγράφεται αύξηση της παραγωγής της τσιπούρας τα τελευταία 10 χρόνια σε αντίθεση με την γενικότερη τάση μείωσης της παραγωγής των άλλων ειδών . Τις λιμνοθάλασσες του συμπλέγματος προτιμούν ως χώρο διαβίωσης ψάρια του είδους στην μεγάλη πλειοψηφία ηλικίας 0+. Ένα ποσοστό λιγότερο από 10% είναι ηλικίας από 2 ετών και άνω. Αντίστοιχα εκφράζεται και η αναλογία των φύλων δεδομένου ότι το είδος είναι πρώτανδρο. Από στοιχεία της δομής των λεπιών προκύπτουν σοβαρές ενδείξεις για την ζωή του ψαριού πριν την είσοδο του στην λιμνοθάλασσα. την προέλευσή τους από εμπλουτισμούς ή διαφυγές από εντατικές ιχθυοκαλλιέργειες. Το γεγονός ότι το ολικό μήκους της ακτίνας του λεπιού στα ψάρια ηλικίας 0+ είναι μεγαλύτερο από το μήκος της R1 ακτίνας των μεγαλύτερης ηλικίας ψαριών δείχνει ότι τα δεύτερα πιθανόν έζησαν σε άλλο περιβάλλον. Όταν η μεγάλη πλειοψηφία των λεπιών ενός ψαριού είναι αναγεννημένα το ψάρι πιθανότατα προέρχεται από εμπλουτισμούς ή διαφυγές από εντατικές ιχθυοκαλλιέργειες. Παρουσιάζονται σημαντικές διαφορές στην αύξηση των ψαριών στις ίδιες λιμνοθάλασσες ανάμεσα στα διάφορα έτη και ανάμεσα στις διαφορετικές λιμνοθάλασσες τα ίδια έτη. Τα αποτελέσματα της αλιείας τόσο ως προς τη σύνθεση των ειδών όσο και ως προς τα μεγέθη των αλιευμάτων, μεταξύ εργαλείων που χρησιμοποιούνται στην λιμνοθάλασσα είναι διαφορετικά. Τα αποτελέσματα δεν οφείλονται στην επιλεκτικότητα των εργαλείων αλλά στην μεταναστευτική συμπεριφορά των ψαριών και την τακτική που ακολουθείται στην αλιεία. Η διαπίστωση αυτή είναι σημαντική για τη μεθοδολογία των μελετών της ποιοτικής σύνθεσης των αλιευμάτων των λιμνοθαλασσών και για τη μελέτη της αύξησης των ειδών. Η επίδραση των ψαροφάγων πουλιών του είδους Phalacrocorax carbo στους ιχθυοπληθυσμούς στις βελτιωμένες μορφές διαχείρισης είναι σημαντικότατη. Επιθέσεις που οδηγούν σε τραυματισμούς δέχονται ακόμα και ψάρια που τα πουλιά αποτυγχάνουν να φάνε λόγω μεγάλου μεγέθους. Η επίδραση της εντατικής ιχθυοκαλλιέργειας στην αφθονία των φυσικών πληθυσμών γίνεται με δύο τρόπους. Τους εμπλουτισμούς και τις ακούσιες εισαγωγές. Η εποχή εισόδου των ψαριών, ο χρόνος που απαιτείται για την προσαρμογή τους στην διατροφή και εν γένει στο φυσικό περιβάλλον η ποιότητα του γόνου και η φέρουσα ικανότητα του οικοσυστήματος, καθορίζουν σε μεγάλο βαθμό το αποτέλεσμα. Τα αποτελέσματα αυτά επιβεβαιώθηκαν σε μαρκαρισμένα ψάρια. Στα ψάρια αυτά προσδιορίστηκε η επίδραση στην αύξηση του τραυματισμού που προκαλεί η διαδικασία του μαρκαρίσματος και ο χρόνος που απαιτείται για προσαρμογή σε σχέση με το μέγεθος τους και την εποχή εισόδου Περισσότερο από 25% των Ελληνικών ιχθυοκαλλιεργειών και 20% των Ελληνικών εκκολαπτηρίων τσιπούρας και λαυρακιού (Dicentrarchus labrax) βρίσκονται κατά μήκος των ακτών της δυτικής Ελλάδας. Η παραγωγή της τσιπούρας είναι περίπου το 60% του συνόλου της παραγωγής αυτών των ειδών. Κατά τη διάρκεια της τελευταίας δεκαετίας έχει καταγραφεί μια θεαματική αύξηση στον αριθμό των μονάδων όσο και στην παραγωγής τους, που αλληλοεπηρεάστηκε από την μείωση τιμών και την τροποποίηση της δομής των εκτρεφόμενων πληθυσμών. Αυτές οι αλλαγές οδήγησαν στη συντήρηση στα κλουβιά ατόμων τσιπούρας μεγέθους πάνω από 500g που έτσι έχουν την δυνατότητα να συμμετέχουν ως θηλυκά στο πληθυσμό του είδους που αναπαράγεται. Η μελέτη,βασισμένη στα στάδια ωριμότητας και στη μείωση του βάρους των πληθυσμών στα κλουβιά κατά τη διάρκεια της αναπαραγωγικής περιόδου διατυπώνει την εκτίμηση της αναπαραγωγικής δραστηριότητας σε αυτά. Παράλληλα, κατά τη διάρκεια των τελευταίων πέντε ετών καταγράφηκε σημαντική αύξηση (περίπου 80%) στα συλλαμβανόμενα άτομα του είδους . Η αύξηση συνοδεύθηκε από μια μείωση και στην τιμή και στο μέγεθος των ατόμων ηλικίας 0+. Το γεγονός ερμηνεύεται σαν αποτέλεσμα της αναπαραγωγικής δραστηριότητας στα κλουβιά και των διαφυγών ατόμων από αυτά

Kernel Support Vector Machine learning of imbalanced classes with application to reproductive medicine on the UK population

Το θέμα της εργασίας αναφέρεται στην κατηγορία αλγορίθμων Μηχανικής Μάθησης Support Vector Machines (SVM) με την μέθοδο των πυρήνων (Kernel Support Vector Machines) για την ταξινόμηση δεδομένων που ανήκουν σε δύο κατηγορίες (τάξεις). Η μέθοδος εφαρμόζεται σε δεδομένα προερχόμενα από τον τομέας της υποβοηθούμενης αναπαραγωγής με σκοπό την πρόβλεψη επιτυχούς γέννησης νεογνού. Αρχικά, μελετώνται οι αλγόριθμοι Kernel SVM και τα προβλήματα που μπορεί να παρουσιαστούν όταν οι τάξεις έχουν διαφορετικό μέγεθος. Στην συνέχεια συζητούνται πιθανές μέθοδοι αντιμετώπισης του προβλήματος όπως αυτές εντοπίστηκαν στην βιβλιογραφία, υπογραμμίζονται τα πλεονεκτήματα και τα μειονεκτήματα κάθε μεθόδου. Προτείνεται επίσης μια νέα μεθοδολογία μείωσης των παρατηρήσεων (under-sampling) με βάση το cosine similarity, ένα μέτρο ομοιότητας μεταξύ των παρατηρήσεων. Στην συνέχεια, εφαρμόζονται οι παραπάνω μέθοδοι, τόσο οι προϋπάχουσες όσο και η νέα μέθοδος, σε δεδομένα που προέρχονται από τον τομέα της αναπαραγωγικής ιατρικής στον πληθυσμό του Ηνωμένου Βασιλείου, ώστε να προβλεφθεί το αποτέλεσμα της επιτυχούς γέννησης μετά από τεχνικές υποβοηθούμενης αναπαραγωγής. Συγκεκριμένα, τα δεδομένα παρέχονται από την Αρχή Ανθρώπινης Αναπαραγωγής και Εμβρυολογίας του Ηνωμένου Βασιλείου (Human Fertilization and Embryology Authority) και αφορούν κύκλους θεραπειών γονιμότητας που λαμβάνουν χώρα κάθε χρόνο στο Ηνωμένο Βασίλειο. Τα δεδομένα από την συγκεκριμένη αρχή συλλέγονται από το 1991 έως σήμερα και εφόσον είναι ανώνυμα, είναι διαθέσιμα για ερευνητικούς σκοπούς. Στα δεδομένα αυτά εφαρμόζονται επίσης κλασικές μέθοδοι ταξινόμησης της στατιστικής όπως η λογιστική παλινδρόμηση (logistic regression). Οι μέθοδοι που χρησιμοποιούνται για την ταξινόμηση των δεδομένων υποβοηθούμενης αναπαραγωγής εφαρμόζονται επίσης σε προσομοιωμένα δεδομένα, τόσο συνεχή όσο και μικτού τύπου (συνεχή και διακριτά) ώστε να επιβεβαιωθεί την απόδοση τους. Οι διαφορετικές μέθοδοι συγκρίνονται με την χρήση κατάλληλων μετρικών αξιολόγησης (evaluation metrics) καταλήγοντας στο συμπέρασμα ότι η προτεινόμενη μέθοδος υπερτερεί έναντι των άλλων κατά την ταξινόμηση του μικτού τύπου δεδομένων και των δεδομένων υποβοηθούμενης αναπαραγωγής, ενώ κατά την ταξινόμηση των συνεχών προσομοιωμένων δεδομένων έρχεται δεύτερη αποδοτικά.The subject of this project is the category of Machine Learning algorithms called Kernel Support Vector Machines (SVM) for the classification of data that belong to two classes. The method is applied to data that come from the field of Reproductive Medicine with the objective of predicting the Live Birth Occurrence of patients that undergo IVF treatment. Firstly, the Kernel SVM algorithms and the problems they face when the two classes are imbalanced are investigated. Next, various solutions of the literature to face the class imbalance problem are discussed, underlining the advantages and disadvantages of these methods. A new under-sampling method, called Cosine similarity Under-Sampling (CUS), based on the cosine similarity of the data, which is a similarity metric, is also proposed. Secondly, those methods are applied to data that come from the field of Reproductive Medicine in order to predict the Live Birth Occurrence of UK patients that undergo IVF treatment. Specifically, the data are collected by the Human Fertilization and Embryology Authority (HFEA) and are related to IVF cycles that take place every year in the UK. The data are collected from 1991 until today and provided that they are anonymized, they are available for research purposes. Other than the machine learning algorithms, classic classification methods, such as logistic regression, are also applied. The methods mentioned above are also applied to simulated data, continuous and mixed-type (continuous and discrete) in order to verify their performance. The different algorithms are compared with the use of appropriate evaluation metrics, leading to the conclusion that the novel method proposed (CUS) is better than other approaches when classifying mixed-type data and the IVF data, while it comes second when classifying the continuous simulated data

Report of 7 Uterine Rupture Cases After Laparoscopic Myomectomy: Update of the Literature

The objective of this article is to report 7 previously unpublished uterine rupture cases in pregnancy after laparoscopic myomectomy and to update the medical literature. All cases were reported to the Board of Endoscopic Gynecologic Surgery (Athens, Greece) from 1998 to 2011. Myomas were single in 85.7% of patients, subserosal or pedunculated in 85.7%, and ≤5 cm in 71.4%. Bipolar diathermy was the sole method used for hemostasis in 28.6%, and could be characterized as excessive in 85.7%. A 2-layer closure with stitches of the myometrium was performed in just 14.3% of cases. Mean (SD) time between surgery and pregnancy was 1.4 (0.5) years. Uterine rupture occurred at 34 weeks of gestation or later in 85.7%, and during labor in 14.3% of cases. All women survived. Fetal demise was reported in 1 twin pregnancy (both fetuses) with rupture at 24 weeks of gestation. Laparoscopic myomectomy should be performed by adequately trained and experienced surgeons. Excessive use of diathermy for hemostasis should be avoided, and multiple-layer suturing should always be used for repairing the myometrial defect in cases of intramural and subserosal myomas with deep intrusion. © 2012 AAGL.SCOPUS: ar.jinfo:eu-repo/semantics/publishe