Study of contact rates between domestic and wild ungulates in Doñana National Park

Trabajo Fin de Máster: Máster universitario en investigación básica y aplicada en recursos cinegéticos.Wild boar (Sus scrofa) is currently the most widely distributed species in overall Europe. It is also the more relevant wild reservoir of several diseases shared with livestock and/or humans, including tuberculosis (TB) that is cause by mycobacteria of Mycobaterium tuberculosis complex (MTC). The transmission of MTC is important in areas with high frequency of effective contacts between potential reservoirs, as it is the case of Doñana National Park (DNP), where domestic and wild ungulates cohabit. Different approaches have been used to determine potential contacts between individuals. In this study, using GPS-GSM tracked wild boar (n=18) and cattle (n=12), we aimed to (i) determine intra and interspecific contacts for domestic and wild ungulates; (ii) describe the seasonal contacts rates between wild boar and cattle, but also the intraspecific for wild boar; and (iii) identify the environmental variables increasing the probability of interspecific contacts occurrence. In this study, contacts were defined using two spatial (52 – 127 m) and three temporal (1 – 72 – 288 h) windows, so finally six spatio-temporal windows were used. In addition, contact presence was modelled in order to determine the environmental predictors explaining the contact pattern in DNP and its seasonality. For this purpose, random points were placed within the overlapping areas between seasonal home ranges of each pair of interacting individuals. Our results pin pointed to spring and autumn as the more relevant seasons for establishing interspecific contact. Whether these contacts involve higher potential for pathogen transmission in our study area should be addressed (for instance, less frequency of contact but occurring at localized environmental sources of pathogens may involve more risk in summer season). This study also suggests that contacts do not occur in areas with dense vegetation, as dense shrublands and woodlands but highlights the relevance of the proximity to water points and vera ecotone in explaining contacts patter in DNP. Even our results are relevant to improve the understanding of the epidemiology of TB in DNP and to support intervention measures for minimize the effective contacts between domestic and wild ungulates, a more in detail exploration of the contacts determined in our study is needed. For instance, by determining the contacting individuals, exploring the daily patterns of the contacts, and characterizing the contacts in terms of selected resources would provide better understanding of the seasonal patterns of both intraspecific and interspecific contacts.Peer Reviewe

Agricultura romana de Sierra Morena

Fondo procedente de la donación Marcos-Vicen

I Seminario Hispano-Venezolano. Poder y mentalidad en España e Iberoamérica.

Sin resume

Las migraciones de menores de edad: Menores Extranjeros no acompañados (MENAs)

Las migraciones es un fenómeno que no queda ajeno a los menores de edad, incluso a menores que viajan solos sin un adulto como referente que les acompañe. Mediante esta charla trataremos de hacer un acercamiento a la realidad de los menores extranjeros no acompañados (MENAS), siendo los temas que trataremos los siguientes: o Quiénes son y a quiénes se engloba dentro del concepto de MENAS y su definición legal. o Marco legal: al ser menores existen convenios internacionales que les ampara, además de una legislación específica como menores no acompañados por ningún adulto. o Hechos y cifras, trataremos de hacer un acercamiento con los últimos datos publicados. o Vías de regularización de los MENAS y ex – MENAS (vía extranjería, vía asilo). o Recursos para las necesidades básicas del menor en la localidad de Málaga. o Pisos de ex tutelados: medidas para los mayores de edad. o Retorno a su país, en qué supuestos es posible.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Desarrollo de marcadores genéticos de microsatélites para especies de plantas del género Phlomis mediante técnicas de Next-Generation Sequencing (NGS)

La diversidad genética da lugar a la evolución de las especies, permitiéndoles adaptarse al medio ambiente cambiante, y contribuyendo de este modo a la genética de conservación de las poblaciones de organismos. Esta diversidad genética se mide con marcadores moleculares o genéticos, siendo los marcadores de microsatélites los más empleados. En este trabajo se disponía de una serie de marcadores obtenidos por técnicas de Next-Generation Sequencing (NGS), de dos especies endémicas del género Phlomis: Phlomis lychnitis y Phlomis crinita subsp. Malacitana. De las cuales se quería obtener el potencial de amplificación y variabilidad, además de calcular los parámetros básicos de la diversidad genética para así poder determinar el potencial de estos marcadores para futuros estudios de hibridación. Nuestros resultados muestran un conjunto de 10 marcadores de microsatélites que presentaban variabilidad, es decir, marcadores que presentaban diferentes alelos en las muestras, por tanto, polimórficos; y 12 monomórficos, los cuales presentaban un único alelo en la misma posición por lo que no presentaban variabilidad. Para probar la capacidad diagnóstica de los marcadores que presentaron variabilidad se realizó un análisis de coordenadas principales (PCoA) para ordenar los genotipos multilocus de cada individuo en un espacio multidimensional. Esta representación determinó la capacidad de diferenciar genéticamente las dos especies, al tratarse de dos poblaciones puras. Por ello, podemos afirmar que el conjunto de marcadores empleados es bueno para discernir entre las dos especies estudiadas. En un futuro este estudio se podría transferir a otras especies endémicas del género Phlomis.Universidad de Sevilla. Grado en Farmaci

High Performance Multidimensional Iterative Processes for Solving Nonlinear Equations

[ES] En gran cantidad de problemas de la matemática aplicada, existe la necesidad de resolver ecuaciones y sistemas no lineales, dado que numerosos problemas, finalmente, se reducen a estos. Conforme aumenta la dificultad de los sistemas, la obtención de la solución analítica se vuelve más compleja. Además, con el aumento de las herramientas computacionales, las dimensiones de los problemas a resolver han crecido de manera exponencial, por lo que se vuelve más necesario obtener una aproximación a la solución de manera sencilla y que no requiera mucho tiempo y coste computacional. Esta es una de las razones por las que los métodos iterativos han aumentado su importancia en los últimos años, ya que se han diseñado multitud de procesos con el fin de que converjan rápidamente a la solución y, de esta forma, poder resolver problemas que con las herramientas clásicas resultaría más costoso. La presente Tesis Doctoral, se centra en estudiar y diseñar numerosos métodos iterativos que mejoren a los esquemas clásicos en cuanto a su orden de convergencia, accesibilidad, cantidad de soluciones que obtienen o aplicabilidad a problemas con características especiales, como la no diferenciabilidad o la multiplicidad de las raíces. Entre los procesos que se estudian en esta memoria, se pueden encontrar desde una familia de métodos multipaso óptimos para la resolución de ecuaciones, hasta una familia paramétrica libre de derivadas de esquemas con función peso a la que se introduce memoria para la resolución de sistemas no lineales. Se destacan otros métodos en esta memoria como esquemas iterativos que obtienen raíces con diversas multiplicidades para ecuaciones y procesos que aproximan raíces de forma simultánea, tanto para ecuaciones como para sistemas, y, tanto para raíces simples como para múltiples. Además, parte de esta memoria se centra en cómo realizar el análisis dinámico para métodos iterativos con memoria que resuelven sistemas de ecuaciones no lineales, a la par que se realiza dicho estudio para diversos esquemas iterativos conocidos. Este análisis dinámico permite visualizar y analizar los posibles comportamientos de los procesos iterativos en función de las aproximaciones iniciales. Los resultados anteriormente descritos forman parte de esta Tesis Doctoral para la obtención del título de Doctora en Matemáticas.[CA] En gran quantitat de problemes de la matemàtica aplicada, existeix la necessitat de resoldre equacions i sistemes no lineals, atés que nombrosos problemes, finalment, es redueixen a aquests. Conforme augmenta la dificultat dels sistemes, l'obtenció de la solució analítica es torna més complexa. A més, amb l'augment de les eines computacionals, les dimensions dels problemes a resoldre han crescut de manera exponencial, per la qual cosa es torna més necessari obtindre una aproximació a la solució de manera senzilla i que no requerisca molt temps i cost computacional. Aquesta és una de les raons per les quals els mètodes iteratius han augmentat la seua importància en els últims anys, ja que s'han dissenyat multitud de processos amb la finalitat que convergisquen ràpidament a la solució i, d'aquesta manera, poder resoldre problemes que amb les eines clàssiques resultaria més costós. La present Tesi Doctoral, es centra en estudiar i dissenyar nombrosos mètodes iteratius que milloren als esquemes clàssics en quant al seu ordre de convergència, accessibilitat, quantitat de solucions que obtenen o aplicabilitat a problemes amb característiques especials, com la no diferenciabilitat o la multiplicitat de les arrels. Entre els processos que s'estudien en aquesta memòria, es poden trobar des d'una família de mètodes multipas òptims per a la resolució d'equacions, fins a una família paramètrica lliure de derivades de esquemes amb funció pes a la que s'introdueix memòria per a la resolució de sistemes no lineals. Es destanquen altres mètodes en aquesta memòria com esquemes iteratius que obtenen arrels amb diverses multiplicitats per a equacions i processos que aproximen arrels de manera simultània, tant per a equacions com per a sistemes, i, tant per a arrels simples com per a múltiples. A més, part d'aquesta memòria es centra en com realitzar l'anàlisi dinàmic per a mètodes iteratius amb memòria que resolen sistemes d'equacions no lineals, al mateix temps que es realitza aquest estudi per a diversos esquemes iteratius coneguts. Aquest anàlisi dinàmic permet visualitzar i analitzar els possibles comportaments dels mètodes iteratius en funció de les aproximacions inicials. Els resultats anteriorment descrits formen part d'aquesta Tesi Doctoral per a l'obtenció del títol de Doctora en Matemàtiques.[EN] In a large number of problems in applied mathematics, there is a need to solve nonlinear equations and systems, since many problems eventually are reduced to these. As the difficulty of the systems increases, obtaining the analytical solution becomes more complex. Furthermore, with the growth of computational tools, the dimensions of the problems to be solved have increased exponentially, making it more essential to obtain an approximation to the solution in a simple way that does not require significant time and computational cost. That is one of the reasons why iterative methods have increased their importance in recent years, as a multitude of schemes have been designed to converge rapidly to the solution and, in this way, to be able to solve problems that would be more arduous to solve using classical tools. This Doctoral Thesis focuses on the study and design of numerous iterative methods that improve classical schemes in terms of their order of convergence, accessibility, number of solutions obtained or applicability to problems with special characteristics, such as non-differentiability or multiplicity of roots. The procedures studied in this report range from a family of optimal multi-step methods for solving equations, to a parametric derivative-free family of weight function schemes, to which memory is introduced for solving nonlinear systems. Additional procedures are described in this report such as iterative schemes that obtain roots with different multiplicities for equations and methods that approximate roots simultaneously for equations as well as for systems, and for simple as well as for multiples roots. In addition, part of this report focuses on how to perform the dynamical analysis for iterative schemes with memory that solve systems of nonlinear equations, as well as this study is carried out for different known iterative procedures. This dynamical analysis allows us to visualise and analyse the possible behaviours of the iterative methods depending on the initial approximations. The results described above form part of this Doctoral Thesis to obtain the title of Doctor in Mathematics.Triguero Navarro, P. (2023). High Performance Multidimensional Iterative Processes for Solving Nonlinear Equations [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/19426

Study of conductive polymers, biomolecules and their hybrids through computational approaches

In this thesis, different theoretical approaches designed to study a wide interval of length- and/or time-scales have been used to examine the microscopic properties of chemical systems with varying degrees of complexity and size. Firstly, the conformational preferences and optical properties of a tripeptide derived from the RGD sequence, the unit of a cell adhesive activity domain in adherent proteins, have been analyzed. Calculations on this peptide, which contains an exotic amino acid bearing a 3,4-ethylenedioxythiophene (EDOT) ring as side group, have been performed using DFT and time depending DFT methods. Results indicate that the bioactive characteristics of the RGD sequence become unstable in presence of the new residue because of both the steric hindrance caused by the EDOT side group and the repulsive interactions between the oxygen atoms belonging to the backbone amide groups and the EDOT side group. This information has been used to propose some chemical changes oriented to improve the bioadhesive properties. The interaction of a cell penetrating tetrapeptide, RPAR, adsorbed onto a gold substrate and the deposition of a pre-assembled peptide-polymer conjugate, cyc[(L-Gln-D-Ala-L-Lys-D-Ala)2] coupled with two poly(n-butyl acrylate) blocks, onto a mica substrate have been examined through molecular dynamics (MD). Results indicate that RPAR binds both the (100) and (111) gold surface facets. The conformation of the adsorbed peptide differs considerably from the bioactive conformation. However, the new conformations are not stabilized by strong intramolecular interactions. Accordingly, gold nanoparticles can be considered as suitable vehicles for the transport and targeted delivery of this CendR peptide. For the pre-assembled peptide-polymer conjugate, a theoretical approach that simulates the selective and progressive desolvation of the nanotube-like assembly has been used, demonstrating that the solvent presence during deposition is the main responsible for the unexplained conformational preferences of the acrylate blocks. When the proportion of solvent drops, the loss of many attractive solute-solvent interactions induces a meaningful increase in the number of torsions. MD has been also used to understand the impact of the solvation medium and the action of a detergent in the structure of a representative outer membrane protein (OMP). Calculations show the destabilization of the protein in water, while in presence of detergent molecules in solution or the bilayer induce a partial and complete protective effect, respectively. Combining stochastic algorithms and MD simulations the atomistic details of polymer coatings deposited over metal surfaces have been modeled to reproduce the experimentally observed topographic features of poly(3,4-ethylenedioxythiophene), PEDOT, deposited onto stainless steel. Results have provided an excellent model system to test the developed modeling strategy. Multi-phasic simulations have been conducted to explain the influence of protein···polymer interactions in the antimicrobial biocapacitors activity of lysozyme (LYZ)-containing PEDOT electrodes through atomistic MD calculations. Two models have been investigated: i) a biphasic system in which the protein was adsorbed onto the surface of PEDOT, PEDOT/LYZ; and ii) a biocomposite in which the LYZ was homogeneously distributed inside the PEDOT matrix, P(EDOT-LYZ). MD simulations have been performed in absence and presence of electric fields, the latter mimicking the one originated by the voltage cell difference in biocapacitors. In PEDOT/LYZ electrodes, the loss of biological activity has been attributed to the anisotropy of the PEDOT···LYZ electrostatic interactions. In contrast, anisotropic effects are minimized in P(EDOT-LYZ), conserving activity. The bactericidal activity of PEDOT/LYZ and P(EDOT-LYZ) biocapacitors is independent of the electric field applied or supplied during charge-discharge processes.En esta tesis, diferentes métodos diseñados para estudiar un amplio intervalo de tamaños y/o escalas de tiempo han sido usados para examinar las propiedades microscópicas de sistemas químicos con diferentes grados de complejidad y magnitud. Primeramente, se han analizado las preferencias conformacionales y las propiedades ópticas de un tripéptido derivado de la secuencia RGD, el dominio de actividad adhesiva en proteínas adherentes. Los cálculos de este péptido, que contiene un aminoácido exótico que porta un anillo de 3,4-etilendioxitiofeno (EDOT) como grupo lateral, han sido llevados a cabo usando métodos de DFT y DFT dependiente del tiempo. Los resultados indican que las características bioactivas de la secuencia RGD se vuelven inestables en presencia del nuevo residuo debido tanto a los impedimentos estéricos causados por el EDOT de la cadena lateral como por las interacciones repulsivas entre los átomos de oxígeno de los grupos amida que pertenecen a la cadena principal del péptido y del grupo lateral de EDOT. Esta información ha sido utilizada para proponer algunos cambios en la composición química orientados a mejorar las propiedades bioadhesivas. La interacción de un tetrapéptido permeabilizador vascular, RPAR, que ha sido adsorbido sobre un sustrato de oro y la deposición de un conjugado péptido-polímero pre-ensamblado, cyc[(L-Gln-D-Ala-L-Lys-D-Ala)2] unido a dos poli(n-butil acrilatos), sobre un sustrato de mica han sido examinados a través de dinámica molecular (MD). Los resultados indican que RPAR se une tanto a las caras (100) y (111) del oro. La conformación del péptido adsorbido difiere considerablemente de la conformación bioactiva. Aún así, las nuevas conformaciones no son estabilizadas por fuertes interacciones intramoleculares. De acuerdo a estos resultados, las nanopartículas de oro pueden ser consideradas como vehículos indicados para el transporte y liberación selectiva de este péptido CendR. Para el conjugado péptido-polímero pre-ensamblado, se ha usado un método teórico que simula la desolvatación progresiva del nanotubo, demostrando que la presencia del solvente durante la deposición es el principal responsable para las preferencias conformacionales inexplicadas de los bloques acrílicos. Cuando la proporción de solvente cae, la pérdida de muchas interacciones atractivas entre soluto y solvente induce un significante aumento en el número de torsiones. También se ha usado MD para entender el impacto del medio solvente y la acción de un detergente en la estructura de una proteína de membrana exterior (OMP) representativa. Los cálculos muestran la desestabilización de la proteína en agua, mientras que la presencia de moléculas de detergente en solución o en bicapa inducen un efecto protector parcial y completo, respectivamente. Combinando algoritmos estocásticos y simulaciones de MD, se ha modelado los detalles a nivel atómico de los recubrimientos de poli(3,4-etilendioxitiofeno), PEDOT, sobre acero inoxidable para reproducir las propiedades topográficas observadas experimentalmente. Los resultados han proporcionado un modelo excelente para probar la estrategia de modelado desarrollada. Se han realizado simulaciones multifásicas para explicar la influencia de las interacciones proteína-polímero en la actividad antimicrobiana de los condensadores que contienen electrodos lisozima (LYZ)-PEDOT, a través de cálculos de MD atomísticos. Dos modelos se han investigado: i) un sistema bifásico en los que la proteína ha sido adsorbida sobre la superficie de PEDOT, PEDOT/LYZ; y ii) un biocompuesto en el que la LYZ ha sido distribuida homogéneamente dentro la matriz de PEDOT, P(EDOT-LYZ). Las simulaciones de MD se han realizado tanto en ausencia como en presencia de campos eléctricos, el último para simular los originados por la diferencia de voltaje en los biocondensadores. La iso- y aniso-tropía de las interacciones son claves para la conservaciónPostprint (published version

Las migraciones de menores de edad: Menores Extranjeros no acompañados (MENAs)

Las migraciones es un fenómeno que no queda ajeno a los menores de edad, incluso a menores que viajan solos sin un adulto como referente que les acompañe. Mediante esta charla trataremos de hacer un acercamiento a la realidad de los menores extranjeros no acompañados (MENAS), siendo los temas que trataremos los siguientes: o Quiénes son y a quiénes se engloba dentro del concepto de MENAS y su definición legal. o Marco legal: al ser menores existen convenios internacionales que les ampara, además de una legislación específica como menores no acompañados por ningún adulto. o Hechos y cifras, trataremos de hacer un acercamiento con los últimos datos publicados. o Vías de regularización de los MENAS y ex – MENAS (vía extranjería, vía asilo). o Recursos para las necesidades básicas del menor en la localidad de Málaga. o Pisos de ex tutelados: medidas para los mayores de edad. o Retorno a su país, en qué supuestos es posible.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tec