Предикторы формирования радиационно-индуцированных кожных реакций у пациентов с Т-клеточными лимфомами кожи после тотального облучения кожи: ретроспективное когортное исследование

INTRODUCTION: Skin reactions negatively affect a patient’s quality of life and may require radiation therapy premature interruption, what impairs illness control. Numerous agents determine tissue radiosensitivity, but demographic and lifestyle factors remain poorly understood. Those kind of patients herapeutic algorithm demands studies.OBJECTIVE: Radiation-induced skin reactions (RISR) formation and severity prognostic factors determination for primary malignant skin lymphomas patients.MATERIALS AND METHODS: 45 patients malignant T-cell skin lymphoma study, aged 38 to 82 years (29 mycosis fungoides patients, 2 lymphomatoid papulosis, 14 patients with primary anaplastic large cell skin lymphoma) received fast electrons total skin irradiation on the basis of the Federal State Institution «Russian Radiology and Surgical Technologies Scientific Center named after Academician A.M.Granov» of the Ministry of Health of the Russian Federation from 2012 to June 2022. Radiation therapy performed in the usual fractionation mode on linear electron accelerators Elekta Precise with 4–6 MeV bremsstrahlung total doses from 14 to 30 Gy (22±2.4 Gy). In order to identify the role of possible prognostic factors of skin toxicity — gender, age, body mass index (BMI), smoking status, lymphoma body surface area (BSA), the presence of concomitant diseases (diabetes mellitus and arterial hypertension) and previous chemotherapy.Statistics: Statistical analysis was performed using the IBM SPSS Statistics v. 26 program (developed by IBM Corporation). The value of p<0.05 was considered statistically significant. Verification of the sample belonging to the normal general population was carried out using the Shapiro–Wilk criterion. Spearman's rank correlation coefficient was used for correlation analysis. The regression parameters were estimated using the least squares method.RESULTS: The analysis revealed positive associations between the severity of RISR and predictor factors: BMI (r=0.799, p<0.01), smoking status (r=0.655, p<0.01), age (r=0.534, p<0.05), presence of diabetes mellitus (r=0.456, p<0.05), arterial hypertension (r=0.227, p<0.05), previous chemotherapy (r=0.422, p<0.01) and lymphoma body surface area (r=0.378, p<0.01). Severity of RISR scale value increase by those parameters. Negative links found between the severity of RISR and the total focal dose (SOD) of the beginning of their formation (r=–0.109, p<0.05).CONCLUSION: Formation and severity prognostic factors for the RCC upon fast electrons total skin exposure for patients with primary malignant T-cell skin lymphomas (mycosis fungoides, lymphomatoid papulosis, primary anaplastic large cell lymphoma of the skin) were identified.ВВЕДЕНИЕ: Кожные реакции негативно влияют на качество жизни пациента и могут быть причиной преждевременного прерывания курса лучевой терапии, что, в свою очередь, может ухудшить контроль над заболеванием. Необходимость индивидуализации терапевтического алгоритма для подобных пациентов закономерно обусловливает потребность в изучении данной проблемы.ЦЕЛЬ: Определить прогностические факторы формирования и степени тяжести радиационно-индуцированных кожных реакций (РИКР) после тотального облучения кожи быстрыми электронами у больных первичными злокачественными лимфомами кожи.МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ: Исследование включало данные о 45 пациентах в возрасте от 38 до 82 лет со злокачественными Т-клеточными лимфомами кожи (грибовидный микоз — 29 пациентов, лимфоматоидный папулез — 2 пациента, первичная анапластическая крупноклеточная лимфома кожи — 14 пациентов), получавших тотальное облучение кожи быстрыми электронами на базе ФГБУ «Российский научный центр радиологии и хирургических технологий имени академика A.M.Гранова» Министерства здравоохранения РФ с 2012 по июнь 2022 г. Лучевую терапию проводили в режиме обычного фракционирования на линейных ускорителях электронов Elekta Precise электронами 4–6 МэВ в суммарных дозах от 14 до 30 Гр (22±2,4 Гр).Статистика. Статистический анализ выполнялся с использованием программы IBM SPSS Statistics v. 26 (разработчик — IВМ Corporation). Значение р<0,05 считалось статистически значимым. Проверка принадлежности выборки к нормальной генеральной совокупности проводилась при помощи критерия Шапиро–Уилка. Для корреляционного анализа применялся коэффициент ранговой корреляции Спирмена. Оценка параметров регрессии осуществлялась методом наименьших квадратов.РЕЗУЛЬТАТЫ: Выявлены положительные связи между степенью РИКР и факторами-предикторами: ИМТ (r=0,799, p<0,01), статус курения (r=0,655, p<0,01), возраст (r=0,534, р<0,05), наличие сахарного диабета (r=0,456, p<0,05), артериальной гипертензии (r=0,227, р<0,05), предшествующей химиотерапии (r=0,422, p<0,01) и площадью поражения кожных покровов лимфомой (r=0,378, p<0,01). С возрастанием значения шкалы данных параметров закономерно увеличивается тяжесть РИКР. Выявлены отрицательные связи между степенью РИКР и суммарной очаговой дозой (СОД) начала их формирования (r=–0,109, p<0,05).ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Выявлены прогностические факторы формирования и степени тяжести РИКР после тотального облучения кожи быстрыми электронами больных первичными злокачественными Т-клеточными лимфомами кожи

Detection of gene orthology from gene co-expression and protein interaction networks

Background Ortholog detection methods present a powerful approach for finding genes that participate in similar biological processes across different organisms, extending our understanding of interactions between genes across different pathways, and understanding the evolution of gene families. Results We exploit features derived from the alignment of protein-protein interaction networks and gene-coexpression networks to reconstruct KEGG orthologs for Drosophila melanogaster, Saccharomyces cerevisiae, Mus musculus and Homo sapiens protein-protein interaction networks extracted from the DIP repository and Mus musculus and Homo sapiens and Sus scrofa gene coexpression networks extracted from NCBI\u27s Gene Expression Omnibus using the decision tree, Naive-Bayes and Support Vector Machine classification algorithms. Conclusions The performance of our classifiers in reconstructing KEGG orthologs is compared against a basic reciprocal BLAST hit approach. We provide implementations of the resulting algorithms as part of BiNA, an open source biomolecular network alignment toolkit

Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

The effectiveness of most cancer targeted therapies is short-lived. Tumors often develop resistance that might be overcome with drug combinations. However, the number of possible combinations is vast, necessitating data-driven approaches to find optimal patient-specific treatments. Here we report AstraZeneca’s large drug combination dataset, consisting of 11,576 experiments from 910 combinations across 85 molecularly characterized cancer cell lines, and results of a DREAM Challenge to evaluate computational strategies for predicting synergistic drug pairs and biomarkers. 160 teams participated to provide a comprehensive methodological development and benchmarking. Winning methods incorporate prior knowledge of drug-target interactions. Synergy is predicted with an accuracy matching biological replicates for >60% of combinations. However, 20% of drug combinations are poorly predicted by all methods. Genomic rationale for synergy predictions are identified, including ADAM17 inhibitor antagonism when combined with PIK3CB/D inhibition contrasting to synergy when combined with other PI3K-pathway inhibitors in PIK3CA mutant cells.Peer reviewe

Obesity related skin disorders

Obesity is a serious global problem. In recent years, it has been an increase in patients with obesity. In a review of literature presents data on the effect of obesity on the skin. It is responsible for the development of a number of dermatological diseases, including acantosis nigricans, akrohordony, follicular hyperkeratosis, infectious diseases of the skin. Against the background of obesity worsens psoriasis. The connection between obesity and atopic dermatitis