From basic mechanisms to clinical applications in heart protection, new players in cardiovascular diseases and cardiac theranostics: meeting report from the third international symposium on "New frontiers in cardiovascular research"

In this meeting report, particularly addressing the topic of protection of the cardiovascular system from ischemia/reperfusion injury, highlights are presented that relate to conditioning strategies of the heart with respect to molecular mechanisms and outcome in patients' cohorts, the influence of co-morbidities and medications, as well as the contribution of innate immune reactions in cardioprotection. Moreover, developmental or systems biology approaches bear great potential in systematically uncovering unexpected components involved in ischemia-reperfusion injury or heart regeneration. Based on the characterization of particular platelet integrins, mitochondrial redox-linked proteins, or lipid-diol compounds in cardiovascular diseases, their targeting by newly developed theranostics and technologies opens new avenues for diagnosis and therapy of myocardial infarction to improve the patients' outcome

The ontologies community of practice: a CGIAR initiative for Big Data in agrifood systems

Heterogeneous and multidisciplinary data generated by research on sustainable global agriculture and agrifood systems requires quality data labeling or annotation in order to be interoperable. As recommended by the FAIR principles, data, labels, and metadata must use controlled vocabularies and ontologies that are popular in the knowledge domain and commonly used by the community. Despite the existence of robust ontologies in the Life Sciences, there is currently no comprehensive full set of ontologies recommended for data annotation across agricultural research disciplines. In this paper, we discuss the added value of the Ontologies Community of Practice (CoP) of the CGIAR Platform for Big Data in Agriculture for harnessing relevant expertise in ontology development and identifying innovative solutions that support quality data annotation. The Ontologies CoP stimulates knowledge sharing among stakeholders, such as researchers, data managers, domain experts, experts in ontology design, and platform development teams

Ischaemic conditioning and targeting reperfusion injury: a 30 year voyage of discovery

To commemorate the auspicious occasion of the 30th anniversary of IPC, leading pioneers in the field of cardioprotection gathered in Barcelona in May 2016 to review and discuss the history of IPC, its evolution to IPost and RIC, myocardial reperfusion injury as a therapeutic target, and future targets and strategies for cardioprotection. This article provides an overview of the major topics discussed at this special meeting and underscores the huge importance and impact, the discovery of IPC has made in the field of cardiovascular research

Etude de l'endommagement et de la diffusion de l'hélium dans des fluoroapatites

CAEN-BU Sciences et STAPS (141182103) / SudocSudocFranceF

FTIR study of silicon carbide amorphization by heavy ion irradiations

International audienc

Swift heavy ion-beam induced amorphization and recrystallization of yttrium iron garnet

International audiencePure and (Ca and Si)-substituted yttrium iron garnet (Y3Fe5O12 or YIG) epitaxial layers and amorphous films on gadolinium gallium garnet (Gd3Ga5O12, or GGG) single crystal substrates were irradiated by 50 MeV (32)Si and 50 MeV (or 60 MeV) (63)Cu ions for electronic stopping powers larger than the threshold value (~4 MeV μm(-1)) for amorphous track formation in YIG crystals. Conductivity data of crystalline samples in a broad ion fluence range (10(11)-10(16) cm(-2)) are modeled with a set of rate equations corresponding to the amorphization and recrystallization induced in ion tracks by electronic excitations. The data for amorphous layers confirm that a recrystallization process takes place above ~10(14) cm(-2). Cross sections for both processes deduced from this analysis are discussed in comparison to previous determinations with reference to the inelastic thermal-spike model of track formation. Micro-Raman spectroscopy was also used to follow the related structural modifications. Raman spectra show the progressive vanishing and randomization of crystal phonon modes in relation to the ion-induced damage. For crystalline samples irradiated at high fluences (⩾10(14) cm(-2)), only two prominent broad bands remain like for amorphous films, thereby reflecting the phonon density of states of the disordered solid, regardless of samples and irradiation conditions. The main band peaked at ~660 cm(-1) is assigned to vibration modes of randomized bonds in tetrahedral (FeO4) units

Simulation numérique par FFT de la fissuration des matériaux hétérogènes à inclusions gonflantes

International audienceLes verres nucléaires actuellement utilisés pour le confinement des produits de fission et actinides mineurs peuvent inclure un taux de charge allant jusqu'à 18.5%. Les matériaux vitrocéramiques envisagés pour cette application seraient une alternative intéressante qui permettrait de diminuer le volume de colis. Pendant le stockage, les inclusions de phases cristallines, riches en produits de fission, sont soumises à une auto-irradiation α provoquant un gonflement susceptible d'engendrer une fissuration de la matrice vitreuse. La mise en oeuvre de simulations de grande taille devra permettre d'évaluer l'effet de la microstructure sur la fissuration du matériau en se rattachant à des quantités d'intérêt comme le temps avant la première fissuration ou la surface fissurée. Pour répondre à cette question, on se propose de mettre en place une simulation numérique de la fissuration dans ce type de matériau. Les méthodes numériques s'appuyant sur l'utilisation des Transformées de Fourier Rapide (FFT en anglais), dites « méthodes FFT », sont particulièrement adaptées à la simulation du comportement mécanique de matériaux hétérogènes. En effet, comparés à l'utilisation de codes Élément-Finis « standards », les codes FFT sont souvent bien plus performants et très bien adaptés à une implémentation parallèle en mémoire distribuée. Initialement proposée pour des modèles de comportement locaux, linéaires ou non-linéaires, l'utilisation de ces méthodes s'étend désormais au cadre des modèles non-locaux, tels que la plasticité ou l'endommagement à gradient [4, 9]. Par ailleurs, pour simuler la fissuration, les modèles de champ de phase d'endommagement [6, 2] sont l'objet d'un intérêt croissant dans la communauté mécanicienne. Ainsi, l'implémentation du modèle de champ de phase proposé par Miehe [10] a été récemment proposée au sein de codes FFT [4, 5], et notamment au sein du code massivement parallèle AMITEX_FFTP [1]. L'objet de cette communication est donc de présenter les premiers résultats et améliorations mises en places pour l'étude des matériaux hétérogènes à inclusions gonflantes. La première partie de l'exposé se concentrera sur le cadre de comportements élastiques linéaires (avec gonflement des inclusions). Une attention particulière sera portée ici à l'utilisation de voxels composites [7, 8] afin d'améliorer la qualité des simulations numériques [3]. Les analyses seront réalisées dans un premier temps sur des cellules de taille réduite (une inclusion) puis sur des cellules plus larges avec une distribution aléatoire d'inclusions. On présentera ici brièvement les outils génériques développés au CEA pour générer les microstructures, les voxeliser et identifier les voxels composites. Enfin, ces simulations sur matériaux élastiques seront l'occasion d'analyser les performances du code AMITEX_FFTP en terme de scalabilité (faible et forte). La seconde partie de l'exposé sera consacrée aux premières simulations FFT de la fissuration de matériaux hétérogènes avec inclusion gonflante. Après avoir rappelé le modèle de Miehe [10] on présentera son implémentation au sein d'une méthode FFT et plus particulièrement au sein du code AMITEX_FFTP. Cette première implémentation repose sur l█utilisation d'une variable d'« histoire » visant à assurer une évolution croissante du champ de phase et, côté algorithme, sur un schéma alterné (non itératif), consistant à résoudre un problème de champ de phase, puis un problème de mécanique avant de passer au pas suivant. Ce type d█algorithme nécessite l█utilisation de pas de chargements très fin. Pour le traitement spécifique aux matériaux hétérogènes, l█approche retenue est celle proposée par Ernesti [5]. Enfin, on proposera ici différents choix de discrétisation spatiale des équations (des problèmes mécaniques et de champ de phase) et on discutera l█effet de ce choix sur les résultats de simulations. De même, l█effet positif de la prise en compte des voxels composites démontré pour des comportements linéaires sera discuté ici. Les analyses présentées seront réalisées sur des géométries simples ne considérant qu█une seule inclusion (disque en 2D, sphère en 3D)