121 research outputs found
Combined Liver-Kidney Transplantation With Preformed Anti-human Leukocyte Antigen Donor-Specific Antibodies
Introduction: the impact of preformed donor-specific anti-human leukocyte antigen (HLA) antibodies (pDSAs) after combined liver-kidney transplantation (CLKT) is still uncertain. Methods: we conducted a retrospective study in 8 European high-volume transplant centers and investigated the outcome of 166 consecutive CLKTs, including 46 patients with pDSAs. Results: patient survival was lower in those with pDSAs (5-year patient survival rate of 63% and 78% with or without pDSA, respectively; P = 0.04). The presence of pDSAs with a mean fluorescence intensity (MFI) ≥ 5000 (hazard ratio 4.96; 95% confidence interval: 2.3-10.9; P < 0.001) and the presence of 3 or more pDSAs (hazard ratio 6.5; 95% confidence interval: 2.5-18.8; P = 0.05) were independently associated with death. The death-censored liver graft survival was similar in patients with or without pDSAs. Kidney graft survival was comparable in both groups. (The 1- and 5-year death-censored graft survival rates were 91.6% and 79.5%, respectively, in patients with pDSAs and 93% and 88%, respectively, in the donor-specific antibody [DSA]-negative group, P = not significant). Despite a higher rate of kidney graft rejection in patients with pDSAs (5-year kidney graft survival rate without rejection of 87% and 97% with or without pDSAs, respectively; P = 0.04), kidney function did not statistically differ between both groups at 5 years post-transplantation (estimated glomerular filtration rate 45 ± 17 vs. 57 ± 29 ml/min per 1.73 m2, respectively, in patients with and without pDSAs). Five recipients with pDSAs (11.0%) experienced an antibody-mediated kidney rejection that led to graft loss in 1 patient. Conclusion: our results suggest that CLKT with pDSAs is associated with a lower patients' survival despite good recipients', liver and kidney grafts' outcome
Twenty-three unsolved problems in hydrology (UPH) – a community perspective
This paper is the outcome of a community initiative to identify major unsolved scientific problems in hydrology motivated by a need for stronger harmonisation of research efforts. The procedure involved a public consultation through on-line media, followed by two workshops through which a large number of potential science questions were collated, prioritised, and synthesised. In spite of the diversity of the participants (230 scientists in total), the process revealed much about community priorities and the state of our science: a preference for continuity in research questions rather than radical departures or redirections from past and current work. Questions remain focussed on process-based understanding of hydrological variability and causality at all space and time scales.
Increased attention to environmental change drives a new emphasis on understanding how change propagates across interfaces within the hydrological system and across disciplinary boundaries. In particular, the expansion of the human footprint raises a new set of questions related to human interactions with nature and water cycle feedbacks in the context of complex water management problems. We hope that this reflection and synthesis of the 23 unsolved problems in hydrology will help guide research efforts for some years to come
A Solve-RD ClinVar-based reanalysis of 1522 index cases from ERN-ITHACA reveals common pitfalls and misinterpretations in exome sequencing
Purpose
Within the Solve-RD project (https://solve-rd.eu/), the European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies aimed to investigate whether a reanalysis of exomes from unsolved cases based on ClinVar annotations could establish additional diagnoses. We present the results of the “ClinVar low-hanging fruit” reanalysis, reasons for the failure of previous analyses, and lessons learned.
Methods
Data from the first 3576 exomes (1522 probands and 2054 relatives) collected from European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies was reanalyzed by the Solve-RD consortium by evaluating for the presence of single-nucleotide variant, and small insertions and deletions already reported as (likely) pathogenic in ClinVar. Variants were filtered according to frequency, genotype, and mode of inheritance and reinterpreted.
Results
We identified causal variants in 59 cases (3.9%), 50 of them also raised by other approaches and 9 leading to new diagnoses, highlighting interpretation challenges: variants in genes not known to be involved in human disease at the time of the first analysis, misleading genotypes, or variants undetected by local pipelines (variants in off-target regions, low quality filters, low allelic balance, or high frequency).
Conclusion
The “ClinVar low-hanging fruit” analysis represents an effective, fast, and easy approach to recover causal variants from exome sequencing data, herewith contributing to the reduction of the diagnostic deadlock
La place des listes toponymiques dans l’organisation du livre IV des Édifices de Procope
Sur les circonstances intellectuelles et matérielles qui entourèrent la rédaction du Περὶ κτισμάτων, nous ne possédons guère que quelques remarques faites par Procope lui-même. L’occasion immédiate qui suscita les premiers travaux de Procope sur le sujet fut vraisemblablement fournie par une demande personnelle de l’empereur ; cependant, aux yeux de l’auteur, l’ouvrage s’inscrit dans la continuité de pensée des Guerres, sans doute parce que sa mise au point répondait à un projet que Procope g..
Electromagnetic fields, environment and health
A good number of false ideas are circulating on the effects of non-ionizing radiations on our health, which can lead to an oversimplification of the issue, to potentially dangerous misconceptions or to misleading data analysis. Health effects may be exaggerated, or on the contrary underplayed. The authors of this work (doctors, engineers and researchers) have endeavored to supply validated and easily understandable scientific information on the electromagnetic fields and their biological and health effects. After a general review of the physics of the waves and a presentation of non-ionizing
Extraction en phase solide de 22 médicaments d'intérêt en toxicologie médico-légale
De nombreuses colonnes d'extraction en phase solide dédiées à
l'extraction des toxiques et leurs protocoles spécifiques sont
proposées à l'analyste. Nous avons optimisé l'un de ces
protocoles pour l'extraction à partir de sang total – en une seule
étape – de principes actifs de médicaments acides, neutres et
basiques. Chaque niveau du protocole a été conçu de manière
à obtenir les meilleurs rendements d'extraction. L'analyse des extraits
(identification et quantification) a été réalisée à
l'aide d'un système de High Performance Liquid Chromatography system
with Diode Array Detector (HPLC-DAD). La colonne SPE Evolute
ABN (Acid Base Neutral) fournie par Argonaut est celle qui
extrait le mieux les différents composés analysés parmi toutes
les cartouches testées. La colonne Oasis HLB (Hydrophilic
Lipophilic Balance) proposée par Waters permet également
l'extraction de la totalité des molécules mais avec des rendements
inférieurs. Quant aux autres colonnes étudiées (distribuées
par Varian et Phenomenex), elles ont présenté des résultats
insuffisants dans le cadre de ce projet. Les limites de détection et de
quantification obtenues avec ce protocole optimisé ont été
comparées aux concentrations thérapeutiques et toxiques
habituellement retrouvées. La mise au point de cette nouvelle
procédure a permis d'optimiser une méthode de dépistage large
(criblage) de médicaments fréquemment rencontrés dans les
matrices biologiques en toxicologie clinique et médico-légale
Théophile Gautier: une écriture paradoxale de l'histoire
International audienc
Intoxication au méprobamate : à propos de deux cas
Objectif : Dans un contexte de découverte de cadavre dans deux
situations distinctes et après autopsie de ceux-ci, un dépistage
toxicologique a été réalisé sur les prélèvements
effectués et disponibles afin de préciser, si possible, les causes
de la mort.
Méthodes : L'éthanolémie a été
déterminée par CPG/DIF. Le dépistage des xénobiotiques
organiques a été pratiqué après extraction liquide/liquide
à pH acide et pH basique par CPG/SM et CLHP/DAD/SM. Les substances
décelées ont, ensuite, été dosées par CLHP/SM, après
extraction liquide/liquide appropriée et ajout d'étalon interne.
Résultats : Dans les deux cas, de fortes concentrations
sanguines en méprobamate ont été déterminées (78 et 120 g/mL) associées principalement à des benzodiazépines (et
au zolpidem dans le second cas).
Conclusion : La surdose de méprobamate est, en toute
vraisemblance, à l'origine des décès. De plus, les effets
toxiques de celui-ci ont, probablement, été potentialisés par
les benzodiazépines, le zolpidem et l'éthanol présents selon les cas
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