26 research outputs found
Ătude du mĂ©canisme dâacquisition de lâhĂšme par le rĂ©cepteur Shu1 chez Schizosaccharomyces pombe
LâhĂšme est un micronutriment essentiel Ă virtuellement tous les organismes vivants. En effet,
cette molécule de fer organique est utilisée comme cofacteur par des enzymes impliquées
dans des processus biologiques fondamentaux comme la respiration cellulaire ou encore la
protection contre le stress oxydant. Les levures sont des microorganismes prototrophes pour
lâhĂšme dans la mesure oĂč elles possĂšdent une voie de biosynthĂšse de lâhĂšme. Cependant,
dans un milieu carencĂ© en fer, la biosynthĂšse de lâhĂšme peut devenir dĂ©ficiente et insuffisante
pour nourrir les hémoprotéines. Dans cette situation, les cellules fongiques doivent utiliser
leurs systĂšmes dâacquisition dâhĂšme pour assurer un apport en hĂšme adĂ©quat avec leur survie.
à ce jour cependant, les composantes moléculaires utilisées par les levures pour acquérir de
lâhĂšme en provenance de lâenvironnement sont peu documentĂ©es. Lâutilisation de la levure
modĂšle Schizosaccharomyces pombe a permis de faire dâĂ©normes progrĂšs dans ce domaine.
Effectivement, la voie de biosynthĂšse endogĂšne de S. pombe peut facilement ĂȘtre interrompue
par la délétion du gÚne hem1+ de son génome. La souche hem1D résultante est non-viable,
sauf si le produit de lâenzyme codĂ©e par le gĂšne hem1+, le ALA, est ajoutĂ© dans le milieu.
Lâautre alternative pour maintenir la souche hem1D en vie est de la supplĂ©menter en hĂšme
exogĂšne. Ainsi lâutilisation de la souche hem1D, qui bloque sĂ©lectivement la biosynthĂšse de
lâhĂšme, a permis de dĂ©cortiquer les mĂ©canismes dâacquisition dâhĂšme exogĂšne chez S.
pombe. Nos analyses ont permis dâidentifier la protĂ©ine Shu1. Cette derniĂšre est fortement
induite par la carence de fer et se localise Ă la surface cellulaire. De plus, au niveau de sa
topologie, Shu1 possÚde un arrangement de quatre cystéines qui est connu pour lier de
lâhĂšme. Une souche mutante hem1D shu1D est trĂšs peu efficace pour utiliser lâhĂšme exogĂšne
et croĂźtre. La rĂ©intĂ©gration de lâallĂšle shu1+ dans la souche hem1D shu1D restaure la capacitĂ©
dâutilisation de lâhĂšme exogĂšne et valide le rĂŽle de cette protĂ©ine dans lâacquisition dâhĂšme
chez S. pombe. Au niveau mécanistique, la protéine Shu1 lie directement une molécule
dâhĂšme Ă la surface cellulaire, puis elle subit une relocalisation aux vacuoles en apportant
avec elle, le précieux micronutriment. Au niveau vacuolaire, le transporteur de type ABC
Abc3 contribue Ă lâexport de la molĂ©cule dâhĂšme de la lumiĂšre vacuolaire vers le cytoplasme.
En rĂ©sumĂ©, Shu1 permet Ă la levure S. pombe dâinternaliser la molĂ©cule dâhĂšme prĂ©sente dans
lâenvironnement pour nourrir les hĂ©moprotĂ©ines vitales Ă sa survie et affronter une situation
de carence de fer
Photography-based taxonomy is inadequate, unnecessary, and potentially harmful for biological sciences
The question whether taxonomic descriptions naming new animal species without type specimen(s) deposited in collections should be accepted for publication by scientific journals and allowed by the Code has already been discussed in Zootaxa (Dubois & NemĂ©sio 2007; Donegan 2008, 2009; NemĂ©sio 2009aâb; Dubois 2009; Gentile & Snell 2009; Minelli 2009; Cianferoni & Bartolozzi 2016; Amorim et al. 2016). This question was again raised in a letter supported
by 35 signatories published in the journal Nature (Pape et al. 2016) on 15 September 2016. On 25 September 2016, the following rebuttal (strictly limited to 300 words as per the editorial rules of Nature) was submitted to Nature, which on
18 October 2016 refused to publish it. As we think this problem is a very important one for zoological taxonomy, this text is published here exactly as submitted to Nature, followed by the list of the 493 taxonomists and collection-based
researchers who signed it in the short time span from 20 September to 6 October 2016
Ătude du mĂ©canisme dâacquisition de lâhĂšme par le rĂ©cepteur Shu1 chez Schizosaccharomyces pombe
LâhĂšme est un micronutriment essentiel Ă virtuellement tous les organismes vivants. En effet,
cette molécule de fer organique est utilisée comme cofacteur par des enzymes impliquées
dans des processus biologiques fondamentaux comme la respiration cellulaire ou encore la
protection contre le stress oxydant. Les levures sont des microorganismes prototrophes pour
lâhĂšme dans la mesure oĂč elles possĂšdent une voie de biosynthĂšse de lâhĂšme. Cependant,
dans un milieu carencĂ© en fer, la biosynthĂšse de lâhĂšme peut devenir dĂ©ficiente et insuffisante
pour nourrir les hémoprotéines. Dans cette situation, les cellules fongiques doivent utiliser
leurs systĂšmes dâacquisition dâhĂšme pour assurer un apport en hĂšme adĂ©quat avec leur survie.
à ce jour cependant, les composantes moléculaires utilisées par les levures pour acquérir de
lâhĂšme en provenance de lâenvironnement sont peu documentĂ©es. Lâutilisation de la levure
modĂšle Schizosaccharomyces pombe a permis de faire dâĂ©normes progrĂšs dans ce domaine.
Effectivement, la voie de biosynthĂšse endogĂšne de S. pombe peut facilement ĂȘtre interrompue
par la délétion du gÚne hem1+ de son génome. La souche hem1D résultante est non-viable,
sauf si le produit de lâenzyme codĂ©e par le gĂšne hem1+, le ALA, est ajoutĂ© dans le milieu.
Lâautre alternative pour maintenir la souche hem1D en vie est de la supplĂ©menter en hĂšme
exogĂšne. Ainsi lâutilisation de la souche hem1D, qui bloque sĂ©lectivement la biosynthĂšse de
lâhĂšme, a permis de dĂ©cortiquer les mĂ©canismes dâacquisition dâhĂšme exogĂšne chez S.
pombe. Nos analyses ont permis dâidentifier la protĂ©ine Shu1. Cette derniĂšre est fortement
induite par la carence de fer et se localise Ă la surface cellulaire. De plus, au niveau de sa
topologie, Shu1 possÚde un arrangement de quatre cystéines qui est connu pour lier de
lâhĂšme. Une souche mutante hem1D shu1D est trĂšs peu efficace pour utiliser lâhĂšme exogĂšne
et croĂźtre. La rĂ©intĂ©gration de lâallĂšle shu1+ dans la souche hem1D shu1D restaure la capacitĂ©
dâutilisation de lâhĂšme exogĂšne et valide le rĂŽle de cette protĂ©ine dans lâacquisition dâhĂšme
chez S. pombe. Au niveau mécanistique, la protéine Shu1 lie directement une molécule
dâhĂšme Ă la surface cellulaire, puis elle subit une relocalisation aux vacuoles en apportant
avec elle, le précieux micronutriment. Au niveau vacuolaire, le transporteur de type ABC
Abc3 contribue Ă lâexport de la molĂ©cule dâhĂšme de la lumiĂšre vacuolaire vers le cytoplasme.
En rĂ©sumĂ©, Shu1 permet Ă la levure S. pombe dâinternaliser la molĂ©cule dâhĂšme prĂ©sente dans
lâenvironnement pour nourrir les hĂ©moprotĂ©ines vitales Ă sa survie et affronter une situation
de carence de fer
Involvement of amyloid proteins in the formation of biofilms in the pathogenic yeast Candida albicans
International audienceCandida species represent a major fungal threat for human health. Within the Candida genus, the yeast Candida albicans is the most frequently incriminated species during episodes of candidiasis or candidemia. Biofilm formation is used by C. albicans to produce a microbial community that is important in an infectious context. The cell wall, the most superficial cellular compartment, is of paramount importance regarding the establishment of biofilms. C. albicans cell wall contains proteins with amyloid properties that are necessary for biofilm formation due to their adhesion properties. This review focuses on these amyloid proteins during biofilm formation in the yeast C. albicans
Hummingbird with modern feathering: an exceptionally well-preserved Oligocene fossil from southern France
International audienc
Fra2 is a co-regulator of Fep1 inhibition in response to iron starvation.
Iron is required for several metabolic functions involved in cellular growth. Although several players involved in iron transport have been identified, the mechanisms by which iron-responsive transcription factors are controlled are still poorly understood. In Schizosaccharomyces pombe, the Fep1 transcription factor represses genes involved in iron acquisition in response to high levels of iron. In contrast, when iron levels are low, Fep1 becomes inactive and loses its ability to associate with chromatin. Although the molecular basis by which Fep1 is inactivated under iron starvation remains unknown, this process requires the monothiol glutaredoxin Grx4. Here, we demonstrate that Fra2 plays a role in the negative regulation of Fep1 activity. Disruption of fra2+ (fra2Î) led to a constitutive repression of the fio1+ gene transcription. Fep1 was consistently active and constitutively bound to its target gene promoters in cells lacking fra2+. A constitutive activation of Fep1 was also observed in a php4Î fra2Î double mutant strain in which the behavior of Fep1 is freed of its transcriptional regulation by Php4. Microscopic analyses of cells expressing a functional Fra2-Myc13 protein revealed that Fra2 localized throughout the cells with a significant proportion of Fra2 being observed within the nuclei. Further analysis by coimmunoprecipitation showed that Fra2, Fep1 and Grx4 are associated in a heteroprotein complex. Bimolecular fluorescence complementation experiments brought further evidence that an interaction between Fep1 and Fra2 occurs in the nucleus. Taken together, results reported here revealed that Fra2 plays a role in the Grx4-mediated pathway that inactivates Fep1 in response to iron deficiency
A protocol for ultrastructural study of Candida albicans biofilm using transmission electron microscopy
International audienceThis protocol describes how to analyze C. albicans biofilm using transmission electron microscopy. We present two approaches to observe the ultrastructure of fungal cells within unperturbed biofilms, as well as an immunogold labeling procedure. This approach maintains the architecture of the fungal biofilm close to its native state by growing C. albicans biofilm on a plastic surface. After the freeze substitution procedure, classical transmission electron microscopy or electron tomography will allow the ultrastructural analysis of the microbial community
Hemeprotein Tpx1 interacts with cellâsurface heme transporter Str3 in Schizosaccharomyces pombe
International audienc
Iron starvation-dependent dissociation of Fep1 from its target gene promoter <i>fio1<sup>+</sup></i> requires Fra2.
<p><i>A</i>, ChIP analysis of the <i>fio1<sup>+</sup></i> promoter in a <i>fep1</i>Î <i> php4</i>Î double mutant or a <i>fep1</i>Î <i> php4</i>Î <i> fra2</i>Î triple mutant strain harboring an integrated untagged or TAP-tagged <i>fep1<sup>+</sup></i> allele. Cells were grown to logarithmic phase in the presence of FeCl<sub>3</sub> (100 ”M), and then incubated in the presence of 250 ”M Dip or 250 ”M FeCl<sub>3</sub> (Fe) for 30 min. Chromatin was immunoprecipitated using an anti-mouse IgG antibodies and a specific region of the <i>fio1<sup>+</sup></i> promoter was analyzed by qPCR to determine Fep1 occupancy. Binding of TAP-Fep1 to the <i>fio1<sup>+</sup></i> promoter was calculated as the enrichment of a specific <i>fio1<sup>+</sup></i> promoter region relative to a 18S ribosomal DNA coding region in which no GATA box was present. ChIP data were calculated as values of the largest amount of chromatin measured (fold enrichment). Results are shown as the average +/â standard deviation of a minimum of three independent experiments. <i>B</i>, ChIP analysis was performed on the <i>fio1<sup>+</sup></i> promoter in <i>fep1</i>Î <i>php4</i>Î or <i>fep1</i>Î <i> php4</i>Î <i> grx4</i>Î cells expressing an untagged or TAP-tagged <i>fep1<sup>+</sup></i> allele. This analysis was performed as a control experiment because it is known that deletion of the <i>grx4<sup>+</sup></i> gene leads to constitutive promoter occupancy by Fep1. ChIP data were calculated and presented as described in <i>panel A</i>.</p
BiFC signal of VN-Fep1 and Fra2-VC fusion proteins in the nuclei.
<p>Cells co-expressing VN-Fep1 and Fra2-VC, VN-Fep1 and VC alone, or VN-Fep1 and Ctr4-VC were visualized by fluorescence microscopy using BiFC (center left) and Hoechst stain (center right). The merged images are shown in the far right panels. Nomarski optics were used to examine cell morphology (far left panels). For simplicity, images were taken from iron-starved cells because fluorescent images from iron-replete cells were identical.</p