Systématique, biogéographie et diversification du genre Crudia (Leguminosae, Detarioideae)

In the subfamily Detarioideae (Leguminosae), the genus Crudia Schreb. shows an unusual pantropical distribution and high species richness compared to closely related genera. Crudia species, spread throughout South America, West Africa and Southeastern Asia, have been the focus of independent taxonomic studies conducted by several consecutive authors. To date, however, the evolution and biogeographic history of this genus remain poorly understood. We propose a multidisciplinary approach to study this poorly known genus and to improve our understanding of its evolutionary history. First, we conducted a taxonomic revision of Asian species within the genus Crudia, in accordance with the recent revisions of African and American species. We used traditional taxonomic methods by compiling morphological data based on the study of herbarium specimens. From an initial description of thirty five species from the literature, we retained fourteen species and synonymized the others except for one we consider as a doubtful species. A newly described species was also added. Species geographic distributions were reevaluated and new conservation statuses were suggested. Second, we established a conceptual framework to study the evolution, biogeographic history, and relationship between species of this genus. We sequenced five nuclear regions (ITS, ETS, AGT1, CALTL, and AIGP) on numerous sampled herbarium specimens (K, US, P, L, WAG, U). The phylogenetic analyses resolve Crudia as monophyletic with a well-identified internal structure composed of one clade grouping all Asian species and one clade grouping both African and American species, with the American species grouped in a single clade. Reconstructions of biogeographic history and an associated divergence time analysis calibrated with macrofossils show Crudia originated in Africa during the Eocene and underwent two independent dispersal events during mid-Eocene: from Africa to South America and from Africa to Southeastern Asia. Third, we tested if species richness in the genus Crudia is associated with changes in diversification rates through time and with ecological niche shifts throughout its global distribution. We used species occurrence data, carefully selected to avoid identification errors, associated with environmental data retrieved from the literature. Diversification rates were studied both at the scale of the genus Crudia and the Detarioideae subfamily. We conclude that ecological niches differ from one continent to another and no diversification rates changes were detected in the genus Crudia. Our finding suggest that the greater species richness in Crudia compared to sister genera may be the consequence of relatively older age of this genus.Le genre Crudia Schreb. présente une distribution pantropicale et une richesse spécifique élevée, inhabituelles pour un genre appartenant à la sous famille des Detarioideae (Leguminosae). Les espèces de Crudia, réparties en Amérique du Sud, en Afrique de l’Ouest et en Asie du Sud Est, ont fait l’objet de plusieurs études de taxonomie indépendantes, réalisées par plusieurs auteurs successifs. En revanche, l’évolution et l’histoire biogéographique du genre sont inconnues à ce jour. Afin de mieux comprendre l’histoire évolutive de Crudia, nous proposons une approche pluridisciplinaire visant à mettre à jour les connaissances à propos de ce genre méconnu. La première partie de cette étude a pour objectif de réaliser une révision taxonomique des espèces asiatiques du genre Crudia, les espèces africaines et américaines ayant déjà été traitées par d’autres auteurs. Nous avons pour cela utilisé des méthodes de taxonomie traditionnelle en compilant des données morphologiques sur un grand nombre de spécimens d’herbier. Sur les trente-cinq espèces initiales décrites en Asie, nous en avons retenu quatorze et avons ajouté une nouvelle espèce. Les autres espèces ont été mises en synonymie pour la plupart, exceptée l’une d’entre elle qui est à présent considérée comme douteuse. Suite à ces réassignations taxonomiques, les distributions géographiques respectives des espèces ont été réévaluées et des nouveaux statuts de conservation ont été proposés. La seconde partie de cette étude a pour objectif de poser un cadre conceptuel afin d’étudier dans le détail l’évolution de ce genre, son histoire biogéographique et les relations entre espèces. Nous avons pour cela séquencé cinq régions nucléaires (ITS, ETS, AGT1, CALTL, AIGP) pour de nombreux spécimens, principalement prélevés sur des échantillons d’herbiers (K, US, P, L, WAG, U). Les phylogénies réalisées montrent que Crudia est monophylétique et possède une structure interne bien définie, avec un clade regroupant toutes les espèces asiatiques et un autre regroupant les espèces africaines et américaines, ces dernières formant elles-mêmes un clade clairement identifiable. La reconstruction de l’histoire biogéographique, associée à la datation à l’aide d’un macrofossile, montre que Crudia trouve son origine en Afrique au cours de l’Éocène, puis subit deux évènements indépendants de dispersion vers l’Amérique du Sud et vers l’Asie au cours de l’Éocène moyen. La troisième partie de cette étude a pour objectif d’identifier si la richesse spécifique du genre Crudia pouvait être associée à un évènement de changement des taux de diversification au cours du temps, mais également savoir si les niches écologiques des différentes espèces étaient semblables à travers l’aire de distribution du genre au complet. Nous avons utilisé pour cela des données d’occurrences des espèces, ainsi que des données reliées au régime de précipitations et à la température. Parallèlement, les taux de diversification ont été étudiés à l’échelle du genre et à l’échelle des Detarioideae. Au final, il s’est avéré que les niches écologiques différaient d’un continent à l’autre, et qu’il n’existait pas de changement des taux de diversification dans le genre Crudia pouvant être relié précisément à la richesse spécifique. Le nombre élevé d’espèces au sein du genre Crudia pourrait en revanche être lié à un âge relativement plus vieux de ce genre, comparé aux autres genres évolutivement proches

Aplicación de la topología molecular en la búsqueda de nuevos compuestos derivados del 4-nitro-imidazol activos frente al Tripanosoma brucei

Human African Trypanosomiasis, caused by the protozoan parasite Trypanosoma brucei, is characterized by a disabling chronic infectious process affecting millions of people worldwide. The therapeutic arsenal against this disease usually requires intravenous suministración, hindering accessibility and adherence to therapy. It has developed a topological mathematical model aimed to finding new compounds derived from 1-aryl-4-nitro-1H-imidazol with potential anti-trypanosome activity. Using linear discriminant analysis (LDA) was obtained a model capable of predicting correctly the activity of 93% of the studied compounds. The model has been subjected to an internal validation using the jack-knife test or leave-one-out and an internal cross-validation. Following a virtual sweep or virtual screening ten new imidazole derivatives are proposed, with potential anti-trypanosome activity.La Tripanosomiasis Humana Africana, causada por el parásito protozoario de la especie Trypanosoma brucei, está caracterizada por un proceso infectivo crónico discapacitante que afecta a millones de personas en todo el mundo. El arsenal terapéutico frente a esta enfermedad, requiere generalmente suministración por vía parenteral, lo que dificulta la adhesión y accesibilidad del paciente al tratamiento. Se ha desarrollado un modelo topológico-matemático encaminado a buscar nuevos compuestos derivados del 1-aril-4-nitro-1H-imidazol con potencial actividad anti-tripanosómica. Utilizando el análisis lineal discriminante se ha obtenido un modelo capaz de predecir correctamente la actividad del 93% de los compuestos estudiados. Se ha sometido al modelo a una validación interna por medio del test de Jack-knife y de una validación cruzada. Tras realizar un cribado molecular virtual se proponen diez nuevos derivados imidazólicos con potencial actividad anti-tripanosómica

La gamificación en la educación universitaria: aplicación a asignaturas de programación

Informe sobre la experiencia de aplicar técnicas de gamificación en la asignatura “Estructura de Datos y Algoritmos”, obligatoria de 2º curso en los grados impartidos en la Facultad de Informática de la UCM

Reducing the environmental impact of surgery on a global scale: systematic review and co-prioritization with healthcare workers in 132 countries

Abstract Background Healthcare cannot achieve net-zero carbon without addressing operating theatres. The aim of this study was to prioritize feasible interventions to reduce the environmental impact of operating theatres. Methods This study adopted a four-phase Delphi consensus co-prioritization methodology. In phase 1, a systematic review of published interventions and global consultation of perioperative healthcare professionals were used to longlist interventions. In phase 2, iterative thematic analysis consolidated comparable interventions into a shortlist. In phase 3, the shortlist was co-prioritized based on patient and clinician views on acceptability, feasibility, and safety. In phase 4, ranked lists of interventions were presented by their relevance to high-income countries and low–middle-income countries. Results In phase 1, 43 interventions were identified, which had low uptake in practice according to 3042 professionals globally. In phase 2, a shortlist of 15 intervention domains was generated. In phase 3, interventions were deemed acceptable for more than 90 per cent of patients except for reducing general anaesthesia (84 per cent) and re-sterilization of ‘single-use’ consumables (86 per cent). In phase 4, the top three shortlisted interventions for high-income countries were: introducing recycling; reducing use of anaesthetic gases; and appropriate clinical waste processing. In phase 4, the top three shortlisted interventions for low–middle-income countries were: introducing reusable surgical devices; reducing use of consumables; and reducing the use of general anaesthesia. Conclusion This is a step toward environmentally sustainable operating environments with actionable interventions applicable to both high– and low–middle–income countries

Club des Laboratoires Accrédités : partage d’expérience, audits croisés et amélioration de la qualité des mesures

Depuis 2011, le Club de Laboratoires Accrédités se réunit une fois par semestre et le nombre de participants est chaque fois grandissant. Les premières réunions ont regroupé une trentaine de participants venant de laboratoires aussi variés qu’EDF, CEA Cadarache, LDA 13, PROTEC LEA, LASEM Marine nationale, Institut Coopératif du Vin, LERM, SCP, Avepharm, IGNA, Quadlab, ITGA, EUROCOPTER,... Ces laboratoires sont tous accrédités ou en démarche d’accréditation selon l’ISO 17025. La participation au Club des Laboratoires Accrédités est totalement gratuite. Les réunions se font sur une demi-journée dans un laboratoire accueillant qui est différent à chaque fois, et se déroulent en quatre temps : Sans un premier temps : présentation des évolutions de l’accréditation ISO 17025 à travers un thème d’actualité. Dans un deuxième temps, il y a des Echanges entre les laboratoires accrédités sur les relations avec les auditeurs Cofrac et sur les écarts récurrents (à travers la présentation d’écarts d’audits Cofrac des laboratoires participants). Dans un troisième temps, il y a des échanges d’auditeurs et présentation des pages internet du Club des Laboratoires Accrédités dédiées aux audits croisés. Et enfin dans un quatrième et dernier temps, il y a des visites du laboratoire accueillant et plus particulièrement des activités accréditées

A phylogenetic analysis of palm subtribe Archontophoenicinae (Arecaceae) based on 14 DNA regions

International audienceSubtribe Archontophoenicinae belongs to Areceae, the largest of all palm tribes. It includes 15 species distributed in five genera, all found in the south-western Pacific Region. Archontophoenicinae are rather homogeneous in morphology, making phylogenetic relationships problematic to reconstruct using morphological characters. In this study we investigated phylogenetic relationships in Archontophoenicinae based on all 15 species of the subtribe, using a combination of nine plastid and five nuclear DNA sequence markers. The plastid regions used were the coding rbcL, matK, ndhF and rpoC1 (exon 2) and the non-coding rps16 intron, atpF-atpH, psbK-psbI, trnL-trnF and trnQ-rps16. The nuclear regions used were AG1, BRSC, ITS2, PRK and RPB2, which have all proved useful in palm systematics. We compared the phylogenetic hypotheses resulting from the plastid versus nuclear datasets, and combined both datasets to retrieve as much phylogenetic information as possible. Our results strongly support a clade composed of all species of Archontophoenix, Actinokentia, Chambeyronia and Kentiopsis, but raise the question of whether Actinorhytis, the fifth genus, should remain in Archontophoenicinae. Interspecific relationships in ‘core Archontophoenicinae’ still remain incompletely resolved, despite the gene and taxon sampling being substantially greater than in previous studies, and question the monophyly of the New Caledonian genera Chambeyronia and Kentiopsis