Frecuencia de las mutaciones en los genes BRCA en mujeres con agregación familiar de cáncer de glándula mamaria/ovario

Objetivo: Reunir evidencias de la variación en la frecuencia de las mutaciones de BRCA1 y BRCA2 y la historia familiar en pacientes con cáncer de glándula mamaria (CGM) y cáncer de ovario (CO) de diferentes orígenes geográficos. Método: En este trabajo se realizó una revisión sistemática, siguiendo los parámetros del protocolo PRISMA, para estimar la prevalencia de mutaciones en los genes BRCA 1/2 en pacientes con CGM y CO, la incidencia de la historia familiar y la prevalencia observada en casos esporádicos en este tipo de cáncer. Resultados: Se observa una heterogeneidad en la frecuencia de las mutaciones de estos genes en los estudios de historia familiar, con una variación entre 0.0 y 0.48 en pacientes y familiares con CGM y CO similares a los previamente reportados. Discusión: Este amplio rango de la frecuencia se debe al origen de la población estudiada, el número de individuos analizados y la metodología de genotipificación utilizada. La revisión revela que el CGM y CO familiar es dos veces más frecuente, en comparación con los casos de esta misma patología con origen esporádico. Conclusiones: Este tipo de estudios moleculares les permite a las personas que presentan historia familiar con CGM y CO realizarse análisis precoces y chequeos para prevenir en un futuro el desarrollo de alguna de estas neoplasias

Haplotype analysis of the internationally distributed BRCA1 c.3331_3334delCAAG founder mutation reveals a common ancestral origin in Iberia

Background: TheBRCA1c.3331_3334delCAAG founder mutation has been reported in hereditary breast and ovarian cancer families from multiple Hispanic groups. We aimed to evaluateBRCA1c.3331_3334delCAAG haplotype diversity in cases of European, African, and Latin American ancestry. Methods: BC mutation carrier cases from Colombia (n = 32), Spain (n = 13), Portugal (n = 2), Chile (n = 10), Africa (n = 1), and Brazil (n = 2) were genotyped with the genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays to evaluate haplotype diversity aroundBRCA1c.3331_3334delCAAG. Additional Portuguese (n = 13) and Brazilian (n = 18) BC mutation carriers were genotyped for 15 informative SNPs surroundingBRCA1. Data were phased using SHAPEIT2, and identical by descent regions were determined using BEAGLE and GERMLINE. DMLE+ was used to date the mutation in Colombia and Iberia. Results: The haplotype reconstruction revealed a shared 264.4-kb region among carriers from all six countries. The estimated mutation age was similar to 100 generations in Iberia and that it was introduced to South America early during the European colonization period. Conclusions: Our results suggest that this mutation originated in Iberia and later introduced to Colombia and South America at the time of Spanish colonization during the early 1500s. We also found that the Colombian mutation carriers had higher European ancestry, at the BRCA1 gene harboring chromosome 17, than controls, which further supported the European origin of the mutation. Understanding founder mutations in diverse populations has implications in implementing cost-effective, ancestry-informed screening

Fine-mapping of the HNF1B multicancer locus identifies candidate variants that mediate endometrial cancer risk.

Common variants in the hepatocyte nuclear factor 1 homeobox B (HNF1B) gene are associated with the risk of Type II diabetes and multiple cancers. Evidence to date indicates that cancer risk may be mediated via genetic or epigenetic effects on HNF1B gene expression. We previously found single-nucleotide polymorphisms (SNPs) at the HNF1B locus to be associated with endometrial cancer, and now report extensive fine-mapping and in silico and laboratory analyses of this locus. Analysis of 1184 genotyped and imputed SNPs in 6608 Caucasian cases and 37 925 controls, and 895 Asian cases and 1968 controls, revealed the best signal of association for SNP rs11263763 (P = 8.4 × 10(-14), odds ratio = 0.86, 95% confidence interval = 0.82-0.89), located within HNF1B intron 1. Haplotype analysis and conditional analyses provide no evidence of further independent endometrial cancer risk variants at this locus. SNP rs11263763 genotype was associated with HNF1B mRNA expression but not with HNF1B methylation in endometrial tumor samples from The Cancer Genome Atlas. Genetic analyses prioritized rs11263763 and four other SNPs in high-to-moderate linkage disequilibrium as the most likely causal SNPs. Three of these SNPs map to the extended HNF1B promoter based on chromatin marks extending from the minimal promoter region. Reporter assays demonstrated that this extended region reduces activity in combination with the minimal HNF1B promoter, and that the minor alleles of rs11263763 or rs8064454 are associated with decreased HNF1B promoter activity. Our findings provide evidence for a single signal associated with endometrial cancer risk at the HNF1B locus, and that risk is likely mediated via altered HNF1B gene expression

UNA MIRADA A LA COSMOVISIÓN DE LOS HERMANOS WAYUÚ

"Una mirada a la cosmovisión de los hermanos Wayuú es el resultado de aproximadamente una década de trabajo entre indígenas de la etnia Wayuú e investigadores del GCFEP. Tiempo en el cual se establecieron y fortalecieron vínculos humanos basados en la confianza; el entendimiento y la empatía, llegando a sentirse miembros de una misma familia; las ganas de aprender y enseñar sobre las diferentes maneras de ver el mundo de dos culturas que, a pesar de que viven en la misma época y en el mismo país, afrontan realidades particulares a su contexto. De manera que este libro se convierte en un esfuerzo por mostrarle a la comunidad general las implicaciones socioculturales de ser Wayuú, de nacer y crecer en un territorio mágico y a su vez adverso como lo es La Guajira. Mediante este libro, los lectores podrán aprender a apreciar la riqueza cultural que alberga nuestro país y de paso valorar el esfuerzo que estas comunidades indígenas hacen por persistir y transmitir sus saberes ancestrales y tradiciones a través del tiempo y el espacio, transferidos entre individuos a través de los genes que heredan de sus ancestros.Una mirada a la cosmovision de los hermanos Wayuú, es uno d elos productos generado en el marco del proyecto titulado "DIVERSIDAD GENÉTICA POBLACIONAL Y ANCESTRÍA DE CUATRO ETNIAS COLOMBIANAS: PIJAO, NASA-PAÉZ, WAYUÚ Y EMBERA-KATIOS " y la convocatoría 850 del Ministerio de Ciencia y Tecnología (MinCiencias). Contiene el fruto de las vivencias compartidas entre investigadores del GCFEP y miembros d elas comunidades indígenas Wayuú, que a lo largo de los años se han generado de manera genuina., derivados de trabajos de investigación que han trascendido del aspecto cientifico al social. De manera que estas cartillas se convierten en el esfuerxo por mostrar tanto a los Wayuú como a los Alijunas, la experiencia de los investigadores, las implicaciones socioculturales de ser wayuú, de nacer y crecer en un territorio magíco pero a la vez adverso. Se invita a los lectores en estos VIII capitulos a apreciar la riqueza cultural que alberga nuestro país y a valorar el esfuerzo que estas comunidades indígenas hacen porpersistir y transmitir sus saberes ancestralesy tracidiones a través del tiempo. Esta cartilla se presenta en dos idiomas d eforma paralela, español y Wayuúnaiki, esta ultima es la lengua nativa de los Wayuú y es de gran importancia para su identidad.1ª. Ed

Frecuencia de las mutaciones en los genes BRCA en mujeres con agregación familiar de cáncer de glándula mamaria/ovario

Objetivo: Reunir evidencias de la variación en la frecuencia de las mutaciones de BRCA1 y BRCA2 y la historia familiar en pacientes con cáncer de glándula mamaria (CGM) y cáncer de ovario (CO) de diferentes orígenes geográficos. Método: En este trabajo se realizó una revisión sistemática, siguiendo los parámetros del protocolo PRISMA, para estimar la prevalencia de mutaciones en los genes BRCA 1/2 en pacientes con CGM y CO, la incidencia de la historia familiar y la prevalencia observada en casos esporádicos en este tipo de cáncer. Resultados: Se observa una heterogeneidad en la frecuencia de las mutaciones de estos genes en los estudios de historia familiar, con una variación entre 0.0 y 0.48 en pacientes y familiares con CGM y CO similares a los previamente reportados. Discusión: Este amplio rango de la frecuencia se debe al origen de la población estudiada, el número de individuos analizados y la metodología de genotipificación utilizada. La revisión revela que el CGM y CO familiar es dos veces más frecuente, en comparación con los casos de esta misma patología con origen esporádico. Conclusiones: Este tipo de estudios moleculares les permite a las personas que presentan historia familiar con CGM y CO realizarse análisis precoces y chequeos para prevenir en un futuro el desarrollo de alguna de estas neoplasias

Gen?tica del carcinoma colorrectal con agregaci?n familiar, en una muestra de la Regi?n Andina colombiana

346 p. Recurso Electr?nicoEste libro sobre el c?ncer colorrectal (CCR), con agregaci?n familiar, constituye un aporte para quienes se inician en la actividad m?dica, la gen?tica, la investigaci?n y la salud p?blica y tambi?n para aquellos que se encuentran en una etapa m?s avanzada de la misma, quienes muy seguramente despu?s de leerlo, desearan continuar en el ejercicio de la investigaci?n

Carcinoma de gl?ndula mamaria en el Tolima Grande: efecto fundador, mestizaje y factores clinicopatol?gicos Una mirada a la base gen?tica del c?ncer de gl?ndula mamaria

Este libro es el resultado de los trabajos de investigaci?n: 1. An?lisis gen?tico del mestizaje y su relaci?n con el carcinoma de gl?ndula mamaria en dos grupos de mujeres del Tolima y Huila; 2. Estatus de la mutaci?n 3450del4 del gen BRCA1 en relaci?n con el c?ncer familiar, la ancestr?a y el efecto fundador y 3. Genetic analyses of breast cancer in admixed populations (Columbus). Estos proyectos permitieron la formaci?n de Carolina Ram?rez Alfonso como mag?ster en Ciencias Biol?gicas, y apoyaron la formaci?n como ?joven investigadora? de Jennyfer Dahianna Benavides Cerquera. En Latinoam?rica, la mortalidad por CGM ha aumentado en las dos ?ltimas d?cadas, lo que posiciona a este s?ndrome como el m?s com?n y la principal causa de muerte por c?ncer en mujeres hispanas. Espec?ficamente en Colombia, es el c?ncer de mayor incidencia y mortalidad. Con base en lo anterior, dada la condici?n de mestizaje en Colombia, los estudios reunidos en este texto, han estimado la contribuci?n gen?tica, ancestral, en una muestra de dos poblaciones cercanas geogr?fica y ?tnicamente (Tolima y Huila), teniendo en cuenta cuatro (4) haplogrupos fundadores nativos americanos de mtADN (A, B, C, D) y dieciocho (18) marcadores altamente informativos (SNPs) de las poblaciones ancestrales: europea, africana y nativa americana, con el fin de estimar la asociaci?n entre la ancestr?a y la susceptibilidad a desarrollar CGM. Adicionalmente, se analizaron algunos factores ambientales, considerados de riesgo, relacionados con caracter?sticas cl?nico-patol?gicas, de estilo de vida y comportamiento hormonal, que podr?an ser importantes en la prevenci?n y en el aumento de las probabilidades de supervivencia al CGM. Y un posible efecto fundador de la mutaci?n 3450del4 del gen BRCA1 en el Tolima Grande.Las tasas de incidencia, prevalencia y mortalidad, del Carcinoma de Gl?ndula Mamaria (CGM), hacen de esta patolog?a la m?s frecuente en mujeres en todo el mundo, perfil?ndose como un problema de salud p?blica (Bray et al., 2018; Globocan, 2020). Las desigualdades en la incidencia y prevalencia del CGM entre diferentes grupos ?tnicos o en una misma poblaci?n pueden atribuirse tanto a factores de riesgo modificables (ambientales), como a gen?ticos, de origen som?tico o germinal. El riesgo heredable de los s?ndromes con agregaci?n familiar de CGM, se estima en un 5 a 10%. Aproximadamente, el 40% de esos casos ?ndice presentan mutaciones germinales en los genes BRCA. Algunas poblaciones colombianas hacen parte de un grupo mayor, con mutaciones cuya frecuencia refleja un efecto fundador. Entre estas mutaciones se encuentra la 3450 del 4 del gen BRCA1. Con base en lo anterior, el GCFEP ha realizado tres proyectos con dos tipos de estudios: Tipo 1. Casos y controles: Se incluyeron 203 mujeres mestizas diagnosticadas con CGM y 205 mestizas, sanas, provenientes de los departamentos del Tolima y Huila, con el fin de determinar la relaci?n entre el ancestro ?inferido a trav?s un set de 18 marcadores autos?micos y las frecuencias de los haplogrupos de ADNmt (A, B, C y D)-; los factores de riesgo ambientales y la susceptibilidad de CGM en el Tolima Grande: efecto fundador, mestizaje y factores clinicopatol?gicos 14 a desarrollar CGM. Tipo 2. Casos portadores de la mutaci?n BRCA1 3450del4, con agregaci?n familiar: en un total de 590 casos procedentes del Tolima Grande, se encontraron 28 con la mutaci?n 3450del4 del gen BRCA1. Con base en estos casos y en el origen geogr?fico de los pacientes, se plante? un posible efecto fundador, que podr?a estar reflejando alg?n grado de consanguinidad en las familias portadoras de la mutaci?n.1?. Ed.Introducci?n 1. Planteamiento del problema 2. Justificaci?n 3. Objetivos 4. Hip?tesis 5. Marco te?rico y antecedentes 6. Metodolog?a 7. Resultados y discusi?n 8. Conclusiones 9. Recomendaciones 10. Referencia

Genome Sequences of Three Colombian Helicobacter pylori Strains Isolated from Tolimense Patients.

We present the complete genome sequences of three Helicobacter pylori strains isolated from patients who resided in Tolima Department, Colombia, diagnosed with chronic gastritis. The genomes present an average length of 1.6 Mbp and 1,546 genes and correspond to different H. pylori subpopulations

Cáncer Gástrico y la Infección por Helicobacter pylori

"El grupo de investigación en Citogenética, Filogenia y Evolución de Poblaciones (GCFEP), de la Universidad del Tolima (UT), creado en el año 1999, viene desarrollando investigación en genética molecular de poblaciones humanas a partir del año 2005, con proyectos enmarcados en el programa de Investigación Análisis Genético Poblacional de Enfermedades Humanas. Bajo este enfoque se ha profundizado en la identificación y el análisis de pacientes y familias colombianas con distintos tipos de cáncer. Los estudios centrados en el desarrollo del cáncer gástrico (CG), han evaluado aspectos como la condición epidemiológica, factores genéticos asociados con un aumento o disminución del riesgo/protección, la diversidad genética intratumoral y, recientemente, la progresión de las lesiones gástricas premalignas, con el fin de definir diferentes aspectos del desarrollo del cáncer gástrico a partir de la inflamación y la gastritis crónica, así como la incidencia de agentes etiológicos como el virus Epstein-Barr y la bacteria Helicobacter pylori. En el caso de la bacteria H. pylori, los estudios se han enfocado en aportar al esclarecimiento de la relación entre el genotipo de las diferentes cepas infectivas de la bacteria, las enfermedades gástricas y el desarrollo coevolutivo que se presenta en las poblaciones colombianas, con el fin de buscar ampliar la perspectiva que se tiene de dichas enfermedades, algunas de sus causas y su condición en la región, para así lograr a futuro entender cómo estas particularidades inciden en la salud de la población. En este punto, el GCFEP reconoce la importancia de integrar la investigación con el proceso de divulgación y apropiación del conocimiento desde una perspectiva social, fomentando la construcción de éste en la comunidad. Por ello, se considera que un paso crucial en este camino, es la construcción de herramientas que faciliten la transmisión del conocimiento de una manera sencilla y pragmática, plasmando de una manera breve y con un lenguaje apropiado los conceptos y hallazgos más relevantes dentro de los estudios que desde la ciencia, buscan dar respuesta a las incertidumbres que aún son contempladas por la medicina y la sociedad, motivo del presente texto.""Recientemente se ha planteado que existe una relación entre el desarrollo de la gastritis y Helicobacter pylori. Adicionalmente, al no tratarse (con o sin infección), la gastritis puede favorecer la aparición de lesiones, e inclusive el desarrollo de cáncer gástrico (CG). Al igual que con otros tipos de cáncer, aún no se sabe cómo prevenir eficazmente esta enfermedad, ya que la mayoría de personas son diagnosticadas en estadios avanzados, lo que dificulta la identificación de la causa y el momento en que surge, debido a que en las primeras etapas no suelen presentarse síntomas. Desde el Grupo de investigación en Citogenética, Filogenia y Evolución de Poblaciones (GCFEP), se ha estudiado el CG evaluando rasgos de la epidemiología, los factores genéticos asociados, y recientemente, la progresión de las lesiones gástricas. Dentro de esta trayectoria, se ha buscado identificar el desarrollo del CG a partir de la gastritis crónica, así como la incidencia de agentes etiológicos como el virus Epstein-Barr y la bacteria H. pylori. Dado a todos estos factores incidentes sobre la enfermedad, el GCFEP pone a disposición de la comunidad el presente documento, compilado de una manera elocuente y simple los aspectos más relevantes sobre la etiología, la epidemiología, la sintomatología, el diagnóstico y la prevención de la gastritis crónica, el CG y la infección por H. pylori. Esto, considerando que al lograr identificar los diferentes factores de riesgo para estas enfermedades gástricas, se establece un punto de partida para las diferentes medidas que pueden implementarse, así disminuir las probabilidades de padecer esta patología."1ª. Ed.Prólogo Presentación del grupo GCFEP Introducción Capítulo 1. Epidemiología Capítulo 2. Sintomatología Capítulo 3. Diagnóstico Capítulo 4. Prevención Glosario Lecturas complementarias Bibliografí