Detection of transposons modifying genome background in probiotics

The study of probiotic microorganisms is very interesting in the aquaculture field. Administration of live microorganisms in adequate amounts confers some benefits to the host (Kechagia et al. 2013). Even if Shewanella putrafaciens include pathogens and saprophytic strains related to fish spoilage and fish infection (Esteve, Merchán, and Alcaide 2016). The Pdp11 strain of Shewanella putrefaciens has been proved to provide beneficial effects in Sparus aurata (Chabrillón et al. 2005) and Solea senegalensis (Rodrigáñez et al. 2008). Studies focused on Pdp11 could hed light on the origin of this probiotic character. We have designed a bioinformatic workflow to detect transposons in the newly sequenced Pdp11 genome (Tapia-Paniagua et al, in press). Their presence interrupting genes account for a contribution to its probiotic character due to the lost of virulence or the gain of probiotic effect. The workflow was developed in Ruby programming language and provides: the genomic localisation of known transposons, host coding regions disrupted by complete transposons or their repeated insertion sequences, and transposons and coding regions disrupted identifiers, to stablish the putative functions of Pdp11 that could be affect by the transposons disruption. These results would support new possible hypothesis about the Pdp11 probiotic character since 14 coding regions related to S. putrefaciens were disrupted by transposons, 4 of which are directly involved in pathogenic mechanisms. This work was supported by co-funding by the European Union through the European Regional Development Fund (ERDF) 2014-2020 "Programa Operativo de Crecimiento Inteligente" together with Spanish AEI "Agencia Estatal de Investigación" to grants RTA2013-00068-C03, AGL2017-83370-C3-3-R and RTA2017-00054-C03-03.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Detección automática de landmarks para evaluación objetiva de la reconstrucción mamaria post-mastectomía

Este trabajo presenta un método para la detección automática de un conjunto de landmarks o puntos de referencia (escotadura supraesternal, axilas, pezones y surco submamario) útiles para la evaluación de la reconstrucción mamaria post-mastectomía a partir de imágenes clínicas. Este método está basado en el análisis morfológico y de la iluminación, así como en el algoritmo de Dijkstra. Se ha llevado a cabo una evaluación del método desarrollado en términos de precisión y rendimiento sobre un conjunto de 21 imágenes. El método propuesto presenta una buena precisión en general, aunque aún hay margen de mejora para la detección de algunas de las landmarks. El rendimiento está condicionado por el tiempo de Actualmente, cirujanos, médicos y pacientes a menudo evalúan la simetría y proporcionalidad de la reconstrucción de forma subjetiva y cualitativa [3]. Sin embargo, estos métodos son altamente dependientes de la variabilidad inter e intra-observador, y su naturaleza cualitativa limita posteriores análisis. Los métodos cuantitativos actuales tienen en cuenta medidas antropométricas [4], bidimensionales [5-6] o tridimensionales [7-8]. Los resultados estéticos satisfactorios están relacionados con la forma y tamaño de la mama, así como con su ejecución, que depende del tamaño de la imagen. En el caso de que se desee utilizar este método para programas de cribado, se recomienda trabajar con un tamaño de imagen de 100 píxeles de alto.Junta de Andalucía PI-0223/201

La narrativa en experiencias de realidad mixta para desarrollar cultura de prevención de riesgos laborales en construcción

La creciente digitalización en la construcción, especialmente impulsada a través del Modelado de información de construcción (Building Information Modeling, BIM) pero que también incluye monitorización, visión por computador y virtualización, entre otras, conduce a la reflexión y renovación de los procesos para la prevención de riesgos laborales (PRL). La tríada Tecnología-Procesos-Personas permite anticipar y diseñar de forma holística esta transformación digital que se viene produciendo en la industria. Como ejemplo, se está intensificando la trazabilidad de las actividades cotidianas para el estudio de nuevos procedimientos encaminados a erradicar los accidentes. Se busca optimizar procesos, como las trayectorias de vehículos y personas, el horario previsto para ciertas tareas simultáneas, con el fin de evitar la probabilidad de colisión entre maquinaria y trabajadores. A pesar de ello, en los últimos años el índice de incidencia de siniestros no solo no experimenta mejora, sino que muestra un cierto repunte, ya sea porque estas innovaciones no se están desplegando debidamente, porque se requiera de mayor madurez tecnológica o por no atender debidamente el comportamiento humano, clave en los índices de accidentabilidad. Así, más allá de la tecnología, es crucial el desarrollo de una cultura de prevención. En particular, el uso de la realidad mixta se plantea como un canal que permite al trabajador interiorizar la prevención como pilar fundamental no solo para su supervivencia, sino también para su calidad de vida sin secuelas debidas a accidentes o a malos hábitos laborales. La realidad virtual y aumentada permite situar al usuario en una gran variedad de escenarios y circunstancias peligrosas, prácticamente ilimitada, tales como laderas deslizantes, maquinaria descontrolada o clima adverso, de acuerdo con el tipo de obra y criterio del experto prevencionista. Existe aún un paso más allá del realismo de los escenarios virtuales: el mensaje a transmitir. Con estas experiencias se puede facilitar la transferencia de conocimiento entre trabajadores, por ejemplo, entre un minero a punto de jubilarse que relata su angustia ante una caída desde una gran altura y un joven que termina de incorporarse y que solo conoce peligros desde la teoría. Este enfoque permite estudiar el rol de las emociones y factores culturales como determinantes del comportamiento de las personas. El uso de la narrativa (storytelling) como medio bien conocido del cine y teatro para transmitir sentimientos a las audiencias, puede ayudar a profundizar en la concienciación de los usuarios que están experimentando los contenidos en primera persona (storyliving) y que tengan un significado emocional más allá del contenido teórico sobre los protocolos PRL. Disminuir el índice de accidentabilidad implica aprender a identificar los riesgos, saber valorarlos en su gravedad y estar capacitados para reaccionar ante ellos para erradicarlos o, cuando menos, para minimizar su probabilidad de ocurrencia. El objetivo es pasar de un sistema preventivo que descansa sobre todo en la legislación y supervisión a otro basado en la cultura, evolucionar de sistemas de vigilancia al desarrollo de narrativas convincentes, donde el factor humano ocupa un lugar central

Evaluación del estado nutricional en pacientes trasplantados renales durante 5 años de seguimiento

Introducción: El aumento de peso y la malnutrición después del trasplante renal es frecuente, y el sobrepeso y la obesidad resultante se asocia con complicaciones graves de salud. Por el contrario, la prevalencia de la desnutrición en pacientes con trasplante renal y sus efectos en el resultado del trasplante de riñón se subestima. Objetivos: El objetivo de este trabajo fue evaluar el estado nutricional de pacientes trasplantados renales y determinar si en el periodo de cinco años de seguimiento, estos pacientes sufren alteraciones que sugieran deterioro nutricional. Métodos: La muestras estuvo formada por 119 pacientes trasplantados renales, que asistieron durante cinco años a la consulta postrasplante. A todos los pacientes se realizaron determinaciones de colesterol total, lipoproteínas de baja densidad (LDL), lipoproteínas de alta densidad (HDL), concentraciones de triglicéridos y ferritina (Ft), y se les efectuaron mediciones antropométricas de peso, altura e IMC. Los pacientes fueron divididos en tres grupos según la tasa de filtración glomerular : Grupo 1: < 60 mL/min, Grupo 2: 89–60 mL/min Grupo 3: ≥ 90 mL/min. Resultados: El peso e IMC tiende a disminuir en el grupo 3 mientras aumenta en el resto de grupos. Se produce una disminución de Colesterol total, HDL, LDL, Trigliceridos y Ferritina menos acusado en el grupo 3. Conclusiones: Tras cinco años se puede observar una reducción significativa de los parametros bioquímicos nutricionales en general, así mismo el estado nutricional esta estrechamente relacionado y es directamente proporcional a la función del injerto.Introduction: Weight gain and malnutrition after kidney transplantation is common and the resulting overweight and obesity is associated with serious health complications. By contrast, the prevalence of malnutrition in patients with renal transplantation and its impact on the outcome of kidney transplantation is underestimated. Objectives: The aim of this study was to evaluate the nutritional status of renal transplant patients and determine if the five-year follow-up, these patients undergo alterations that suggest nutritional deterioration. Methods: The sample consisted of 119 renal transplant patients who attended for five years post-transplant consultation. All patients measurements of total cholesterol, low density lipoprotein (LDL), high density lipoprotein (HDL), triglycerides and ferritin (Ft) were performed. and anthropometric measurements were made of weight, height and BMI. Patients were divided into three groups according to GFR Group 1: <60 mL / min, Group 2: 89-60 mL / min Group 3: ≥ 90 mL / min. Results: The weight and BMI tended to decrease in group 3 while increasing in the other groups. A decrease in total cholesterol, HDL, LDL, Triglycerides and Ferritin less pronounced in group 3 occurs. Conclusions: After five years you can see a significant reduction in nutritional biochemical parameters in general, likewise the nutritional status is closely related, and is directly proportional to the function of the graft

Wind and turbulence relationship with NO2 in an urban environment: a fine-scale observational analysis

It is well known that meteorology plays an important role in the diurnal evolution of pollutants, especially those variables related to atmospheric dispersion. Most studies typically relate the concentration of some pollutants with wind speed from conventional anemometers; however, the use of turbulence variables is less common, in part because the needed instruments are not so typical in standard air-quality stations. In this work, we compare the wind-NO2 relationship with the turbulence-NO2 one using observational data from two field campaigns developed in Madrid (winter and summer). The turbulence data comes from two sonic anemometers deployed at different locations: one close to the street and the other at the top of a nearby tall building. The results indicate that the turbulent variables correlate better with the pollutant concentration than the wind speed when using data from the street sonic, while the contrary is found when using the terrace sonic. These data are also used to perform a fine-scale analysis of the turbulent diffusion-NO2 behaviour during a very-stable period in winter, when the turbulence typically shows a decrease in the evening transition, causing the highestNO2 concentrations. Conversely, under these conditions, the formation of thermally-driven winds is also favoured later in the night, which favours the pollutant dispersion and cleaning of the air. The important role of these dynamical processes on the NO2 evolution highlights the importance of the correct understanding of small-scale atmospheric processes to understand their relationship with the concentration of pollutants

Effectiveness of an intervention for improving drug prescription in primary care patients with multimorbidity and polypharmacy:Study protocol of a cluster randomized clinical trial (Multi-PAP project)

This study was funded by the Fondo de Investigaciones Sanitarias ISCIII (Grant Numbers PI15/00276, PI15/00572, PI15/00996), REDISSEC (Project Numbers RD12/0001/0012, RD16/0001/0005), and the European Regional Development Fund ("A way to build Europe").Background: Multimorbidity is associated with negative effects both on people's health and on healthcare systems. A key problem linked to multimorbidity is polypharmacy, which in turn is associated with increased risk of partly preventable adverse effects, including mortality. The Ariadne principles describe a model of care based on a thorough assessment of diseases, treatments (and potential interactions), clinical status, context and preferences of patients with multimorbidity, with the aim of prioritizing and sharing realistic treatment goals that guide an individualized management. The aim of this study is to evaluate the effectiveness of a complex intervention that implements the Ariadne principles in a population of young-old patients with multimorbidity and polypharmacy. The intervention seeks to improve the appropriateness of prescribing in primary care (PC), as measured by the medication appropriateness index (MAI) score at 6 and 12months, as compared with usual care. Methods/Design: Design:pragmatic cluster randomized clinical trial. Unit of randomization: family physician (FP). Unit of analysis: patient. Scope: PC health centres in three autonomous communities: Aragon, Madrid, and Andalusia (Spain). Population: patients aged 65-74years with multimorbidity (≥3 chronic diseases) and polypharmacy (≥5 drugs prescribed in ≥3months). Sample size: n=400 (200 per study arm). Intervention: complex intervention based on the implementation of the Ariadne principles with two components: (1) FP training and (2) FP-patient interview. Outcomes: MAI score, health services use, quality of life (Euroqol 5D-5L), pharmacotherapy and adherence to treatment (Morisky-Green, Haynes-Sackett), and clinical and socio-demographic variables. Statistical analysis: primary outcome is the difference in MAI score between T0 and T1 and corresponding 95% confidence interval. Adjustment for confounding factors will be performed by multilevel analysis. All analyses will be carried out in accordance with the intention-to-treat principle. Discussion: It is essential to provide evidence concerning interventions on PC patients with polypharmacy and multimorbidity, conducted in the context of routine clinical practice, and involving young-old patients with significant potential for preventing negative health outcomes. Trial registration: Clinicaltrials.gov, NCT02866799Publisher PDFPeer reviewe

Role of age and comorbidities in mortality of patients with infective endocarditis

[Purpose]: The aim of this study was to analyse the characteristics of patients with IE in three groups of age and to assess the ability of age and the Charlson Comorbidity Index (CCI) to predict mortality. [Methods]: Prospective cohort study of all patients with IE included in the GAMES Spanish database between 2008 and 2015.Patients were stratified into three age groups:<65 years,65 to 80 years,and ≥ 80 years.The area under the receiver-operating characteristic (AUROC) curve was calculated to quantify the diagnostic accuracy of the CCI to predict mortality risk. [Results]: A total of 3120 patients with IE (1327 < 65 years;1291 65-80 years;502 ≥ 80 years) were enrolled.Fever and heart failure were the most common presentations of IE, with no differences among age groups.Patients ≥80 years who underwent surgery were significantly lower compared with other age groups (14.3%,65 years; 20.5%,65-79 years; 31.3%,≥80 years). In-hospital mortality was lower in the <65-year group (20.3%,<65 years;30.1%,65-79 years;34.7%,≥80 years;p < 0.001) as well as 1-year mortality (3.2%, <65 years; 5.5%, 65-80 years;7.6%,≥80 years; p = 0.003).Independent predictors of mortality were age ≥ 80 years (hazard ratio [HR]:2.78;95% confidence interval [CI]:2.32–3.34), CCI ≥ 3 (HR:1.62; 95% CI:1.39–1.88),and non-performed surgery (HR:1.64;95% CI:11.16–1.58).When the three age groups were compared,the AUROC curve for CCI was significantly larger for patients aged <65 years(p < 0.001) for both in-hospital and 1-year mortality. [Conclusion]: There were no differences in the clinical presentation of IE between the groups. Age ≥ 80 years, high comorbidity (measured by CCI),and non-performance of surgery were independent predictors of mortality in patients with IE.CCI could help to identify those patients with IE and surgical indication who present a lower risk of in-hospital and 1-year mortality after surgery, especially in the <65-year group

Actas del V Congreso ISUF-H Costa Rica 2021: Ciudades espontáneas versus ciudades planificadas: distintos retos, distintas realidades

En el año 2021 celebramos en Costa Rica la V edición del Congreso ISUF-H, los días 1, 2 y 3 de diciembre, con la Escuela de Arquitectura de la Universidad de Costa Rica como anfitriona del evento. El congreso “Ciudades espontáneas versus ciudades planificadas: distintos retos, distintas realidades” propuso como eje central una reflexión crítica sobre los procesos de urbanización planificada y urbanización espontánea, en el cual se fomente un abordaje de las ciudades como expresión de organización social, económica, ambiental y cultural, enfatizando el carácter ideológico de la urbanización y subrayando su continua construcción como resultado de construcciones complejas. La celebración de un nuevo congreso en América Latina, permitió reforzar la tradición crítica en el abordaje de las ciudades, y reforzar también la necesidad de plantear una perspectiva latinoamericana de los estudios urbanos, y por consiguiente de una teoría urbana latinoamericana. En esta ocasión el congreso se centró en ahondar en la temática de la forma urbana, desde perspectivas transversales que involucren las amplias disciplinas que asumen como objeto de discusión las problemáticas de la ciudad contemporánea y cuestionan la dicotomía planteada entre lo espontáneo y lo planificado. Para la Escuela de Arquitectura de la Universidad de Costa Rica y su Laboratorio de Ciudad y Territorio es un honor haber podido llevar a cabo esta nueva edición del congreso de la Asociación ISUF-H como segunda sede en un país latinoamericano. Relevante para fortalecer la temática de la forma urbana en la región, reforzando alianzas y estableciendo nuevas redes que permitan compartir conocimientos a partir de las experiencias de esas diversidades urbanas. Auspiciar el debate en torno a la morfología urbana y las diferencias entre esas ciudades espontáneas y las planificadas, fue una oportunidad para reunir a expertos de las distintas latitudes hispánicas.UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ingeniería::Facultad de Ingeniería::Escuela de Arquitectur

Pasados y presente. Estudios para el profesor Ricardo García Cárcel

Ricardo García Cárcel (Requena, 1948) estudió Historia en Valencia bajo el magisterio de Joan Reglà, con quien formó parte del primer profesorado de historia moderna en la Universidad Autónoma de Barcelona. En esta universidad, desde hace prácticamente cincuenta años, ha desarrollado una extraordinaria labor docente y de investigación marcada por un sagaz instinto histórico, que le ha convertido en pionero de casi todo lo que ha estudiado: las Germanías, la historia de la Cataluña moderna, la Inquisición, las culturas del Siglo de Oro, la Leyenda Negra, Felipe II, Felipe V, Austrias y Borbones, la guerra de la Independencia, la historia cultural, los mitos de la historia de España... Muy pocos tienen su capacidad para reflexionar, ordenar, analizar, conceptualizar y proponer una visión amplia y llena de matices sobre el pasado y las interpretaciones historiográficas. A su laboriosidad inimitable se añade una dedicación sin límites en el asesoramiento de alumnos e investigadores e impulsando revistas, dosieres, seminarios o publicaciones colectivas. Una mínima correspondencia a su generosidad lo constituye este volumen a manera de ineludible agradecimiento

Gestión del conocimiento: perspectiva multidisciplinaria. Volumen 11

El libro “Gestión del Conocimiento. Perspectiva Multidisciplinaria”, Volumen 11, de la Colección Unión Global, es resultado de investigaciones. Los capítulos del libro, son resultados de investigaciones desarrolladas por sus autores. El libro cuenta con el apoyo de los grupos de investigación: Universidad Sur del Lago “Jesús María Semprúm” (UNESUR), Zulia – Venezuela; Universidad Politécnica Territorial de Falcón Alonso Gamero (UPTAG), Falcón – Venezuela; Universidad Politécnica Territorial de Mérida Kleber Ramírez (UPTM), Mérida – Venezuela; Universidad Guanajuato (UG) - Campus Celaya - Salvatierra - Cuerpo Académico de Biodesarrollo y Bioeconomía en las Organizaciones y Políticas Públicas (C.A.B.B.O.P.P), Guanajuato – México; Centro de Altos Estudios de Venezuela (CEALEVE), Zulia – Venezuela, Centro Integral de Formación Educativa Especializada del Sur (CIFE - SUR) - Zulia - Venezuela, Centro de Investigaciones Internacionales SAS (CIN), Antioquia - Colombia.y diferentes grupos de investigación del ámbito nacional e internacional que hoy se unen para estrechar vínculos investigativos, para que sus aportes científicos formen parte de los libros que se publiquen en formatos digital e impreso