Farmakogenetiikka saapuu klinikkaan

English summaryPeer reviewe

Nuclear HER4 mediates acquired resistance to trastuzumab and is associated with poor outcome in HER2 positive breast cancer.

The role of HER4 in breast cancer is controversial and its role in relation to trastuzumab resistance remains unclear. We showed that trastuzumab treatment and its acquired resistance induced HER4 upregulation, cleavage and nuclear translocation. However, knockdown of HER4 by specific siRNAs increased trastuzumab sensitivity and reversed its resistance in HER2 positive breast cancer cells. Preventing HER4 cleavage by a γ-secretase inhibitor and inhibiting HER4 tyrosine kinase activity by neratinib decreased trastuzumab-induced HER4 nuclear translocation and enhanced trastuzumab response. There was also increased nuclear HER4 staining in the tumours from BT474 xenograft mice and human patients treated with trastuzumab. Furthermore, nuclear HER4 predicted poor clinical response to trastuzumab monotherapy in patients undergoing a window study and was shown to be an independent poor prognostic factor in HER2 positive breast cancer. Our data suggest that HER4 plays a key role in relation to trastuzumab resistance in HER2 positive breast cancer. Therefore, our study provides novel findings that HER4 activation, cleavage and nuclear translocation influence trastuzumab sensitivity and resistance in HER2 positive breast cancer. Nuclear HER4 could be a potential prognostic and predictive biomarker and understanding the role of HER4 may provide strategies to overcome trastuzumab resistance in HER2 positive breast cancer

Згортки з неперервними векторними мірами

(uk) Доводяться теореми неперервності згорток для кожної з основних топологій в просторі векторних мір.(en) The theorems of continuity of convolutions for every of the basic topologies in a space of vector measures are proved

A liquid-solid critical point in a simple monatomic system

It is commonly believed that the transition line separating a liquid and a solid cannot be interrupted by a critical point. This opinion is based on the traditional symmetry argument that an isotropic liquid cannot be continuously transformed into a crystal with a discrete rotational and translational symmetry. We present here a molecular-dynamics simulation of a simple monatomic system that demonstrates a liquid-solid spinodal terminating at a critical point. We show that, in the critical region, the isotropic liquid continuously transforms into a phase with a mesoscopic order similar to that of the smectic liquid crystals. We argue that the existence of both the spinodal and the critical point can be explained by the close structural proximity between the mesophase and the crystal. This indicates a possibility of finding a similar thermodynamic behaviour in gelating colloids, liquid crystals and polymers

Comparative analysis of knowledge representation and reasoning requirements across a range of life sciences textbooks.

BackgroundUsing knowledge representation for biomedical projects is now commonplace. In previous work, we represented the knowledge found in a college-level biology textbook in a fashion useful for answering questions. We showed that embedding the knowledge representation and question-answering abilities in an electronic textbook helped to engage student interest and improve learning. A natural question that arises from this success, and this paper's primary focus, is whether a similar approach is applicable across a range of life science textbooks. To answer that question, we considered four different textbooks, ranging from a below-introductory college biology text to an advanced, graduate-level neuroscience textbook. For these textbooks, we investigated the following questions: (1) To what extent is knowledge shared between the different textbooks? (2) To what extent can the same upper ontology be used to represent the knowledge found in different textbooks? (3) To what extent can the questions of interest for a range of textbooks be answered by using the same reasoning mechanisms?ResultsOur existing modeling and reasoning methods apply especially well both to a textbook that is comparable in level to the text studied in our previous work (i.e., an introductory-level text) and to a textbook at a lower level, suggesting potential for a high degree of portability. Even for the overlapping knowledge found across the textbooks, the level of detail covered in each textbook was different, which requires that the representations must be customized for each textbook. We also found that for advanced textbooks, representing models and scientific reasoning processes was particularly important.ConclusionsWith some additional work, our representation methodology would be applicable to a range of textbooks. The requirements for knowledge representation are common across textbooks, suggesting that a shared semantic infrastructure for the life sciences is feasible. Because our representation overlaps heavily with those already being used for biomedical ontologies, this work suggests a natural pathway to include such representations as part of the life sciences curriculum at different grade levels

Co2 trapping in sloping aquafiers: High resolution numerical simulations

publishedVersio

Evidence for compact cooperatively rearranging regions in a supercooled liquid

We examine structural relaxation in a supercooled glass-forming liquid simulated by NVE molecular dynamics. Time correlations of the total kinetic energy fluctuations are used as a comprehensive measure of the system's approach to the ergodic equilibrium. We find that, under cooling, the total structural relaxation becomes delayed as compared with the decay of the component of the intermediate scattering function corresponding to the main peak of the structure factor. This observation can be explained by collective movements of particles preserving many-body structural correlations within compact 3D cooperatively rearranging regions.Comment: 8 pages, 4 figure

Språkväxlingen och dess litterära funktioner i romanerna Gräset är mörkare på andra sidan och Onda boken av Kaj Korkea-aho

Syftet med den här avhandlingen är att undersöka inslagen av språkväxling och vilka litterära funktioner de har i författaren Kaj Korkea-ahos romaner Gräset är mörkare på andra sidan (2012) och Onda boken (2015). Språkväxling omfattar här inslag på andra språk och varieteter men också lånord. Romanerna innehåller 121 manifesta språkväxlingssekvenser på 426 sidor respektive 139 manifesta språkväxlingssekvenser på 303 sidor. I min analys har jag använt mig av Haapamäkis och Erikssons modell för analys av litterär flerspråkighet som redogör för sambandet mellan språkväxlingens form, funktion och kommunikativa kontext. Kontexten presenterar jag med hjälp av en e-postintervju med författaren. För att analysera språkväxlingens litterära funktioner har jag tagit hjälp av Tidigs indelning i inomtextliga funktioner, som består av stilistiska, narrativa och tematiska funktioner, respektive kontextuella funktioner. Min undersökning visar att språkväxlingen sällan markeras typografisk, medan den översätts ibland men inte konsekvent. Undersökningen visar också att författaren är språkligt medveten och använder språkväxlingsstrategier med eftertanke, medan såväl förlag som recensenter har fäst väldigt lite uppmärksamhet vid språkväxlingen. Språkväxlingens funktion i romanerna är inte bara är att skapa illusionen av ett verkligt språkbruk, utan också att bland annat skapa humor och bidra till karaktärsgestaltning. Främst fungerar den som gruppmarkör, och är både en del av ungdomsspråket och markerar socioekonomisk status. Dessutom fyller flerspråkigheten kontextuella eller politiska funktioner genom att kommentera minoritetsfrågor och maktförhållanden. Resultaten är dock inte generaliserbara på grund av att materialet inte omfattar mer än en författare, men speglar språkval och språkattityder i ett minoritetssamhälle och visar exempel på en del av de mer okända funktioner språkväxling kan ha i skönlitteratur.fi=Opinnäytetyö kokotekstinä PDF-muodossa.|en=Thesis fulltext in PDF format.|sv=Lärdomsprov tillgängligt som fulltext i PDF-format

”We are all payed the same for the same work” : Classroom Teachers’ Experiences of The Impact of Three-step Support on Work Tasks, Workload and Well-being

Tavoitteet. Tammikuussa vuonna 2011 voimaan astunut uudistunut perusopetuslaki (624/2010) sekä vuoden 2014 oppilas- ja opiskelijahuoltolaki (1287/2013) ovat uudelleen jäsentäneet suomalaisen koulujärjestelmän toimintaa ja rakennetta. Oppimisen ja koulunkäynnin tueksi, sekä kolmiportaiseksi tueksi lanseerattu järjestelmä rakentuu inkluusioperiaatteiden pohjalle, pyrittäessä muun muassa sijoittamaan tukea tarvitsevat oppilaat tuettuina lähikouluihinsa muun opetuksen yhteyteen. Tämän tutkimuksen tavoitteena on selvittää, miten lakiuudistukset ovat vaikuttaneet luokanopettajien työhön, niin työmäärän, työtehtävien kuin työhyvinvoinnin osalta, sekä tuoda esiin, minkälaisia keinoja luokanopettajat ovat hyödyntäneet sopeutuessaan muutoksiin. Menetelmät. Tutkimuksen ote oli laadullinen, jonka aineisto on kerätty puolistrukturoiduilla teemahaastatteluilla. Aineisto kerättiin haastattelemalla neljää luokanopettajaa. Haastateltavat valittiin tutkimukseen heidän valmistumisvuotensa sekä kunnan perusteella, haastateltavien toimiessa luokanopettajina jo ennen lakimuutoksia, sekä heidän työskennellessä keskenään eri kuntien kouluissa. Aineistonanalyysimetodina käytettiin aineistolähtöistä sisällönanalyysia. Tulokset ja johtopäätökset. Uusia työtehtäviä ei opettajien mukaan ollut tullut, vaan keskeisenä muutoksena oli työmäärän uudenlainen jakautuminen eri työtehtävien kesken. Enemmistö haastateltavista koki kolmiportaisen tuen lisäävän byrokratiaa ja työmäärää, esimerkiksi pedagogisten asiakirjojen laatimisen, moniammatillisen yhteistyön sekä kodin ja koulun välisen yhteistyön muodossa, vaikka kolmiportaisen tuen nähtiinkin tuovan myös paljon positiivisia muutoksia opetustyöhön. Opettajien kokemuksissa työn muutosten sekä työhyvinvoinnin osalta oli merkittäviä henkilökohtaisia eroja, opettajien kokiessa työnsä eri osa-alueiden muutokset eri tavoin. Vastaavasti opettajien sopeutumiskeinot muutoksiin olivat keskenään erilaiset, tutkimuksen tarjotessakin erilaisia näkökulmia opettajien työhyvinvoinnin tarkastelulle ja kehittämiselle.Objectives. The changes to Basic Education Act (624/2010), which came into force on January 2011, as well as the enforcement of the Pupil and Student Welfare Act (1287/2013) in 2014, has restructured the operation of the Finnish education system. The model, known as the support in learning and school attendance, operates on a three-tiered support system, and is based on inclusive principles as one of its goals is to include pupils with special needs to mainstream classes with additional teaching support. This study aims to investigate how the amendments have affected classroom teachers’ work tasks, workload, and well-being at work, and as well as to highlight the ways in which classroom teachers have adapted to the changes. Methods. The research approach of this study was qualitative. The data was collected by interviewing four classroom teachers using semi-structured theme interviews. The participants were selected for the study based on their year of graduation and by municipality, as they had worked as classroom teachers before the enforcement of the previously mentioned amendments, and as they all were working in schools in different municipalities. The data was analysed using a qualitative analysis of content. Results and conclusions. According to the teachers, adoption of the new support model has not created any new work tasks or responsibilities to the teachers although the changes have affected how the workload is divided between different work tasks. Majority of the participants brought up how the adoption of the three-tiered support model had increased work bureaucracy and workload, in the form of preparation of pedagogical documents, multiprofessional cooperation and cooperation between home and school. However, the teachers underlined that the model had created positive developments in teaching as well. There were major differences in teachers’ experiences regarding the changes in the work and well-being at work, as the teachers experienced changes in different areas of their work in different ways. Similarly, teachers' ways of adapting to change were different, where the results of this study can provide different perspectives on examining and developing teachers' well-being at work

"Laajemmin sopimisen" rajoitukset maankäyttösopimuksissa

Maankäyttöä on Suomessa järjestelty kuntien ja maanomistajien välillä solmituilla sopimuksilla vuosikymmeniä. Maankäyttösopimuksia ei säännelty lainsäädännössä nimenomaisesti ennen kuin ensimmäiset niitä koskevat säännökset otettiin maankäyttö- ja rakennuslakiin (132/1999). Sopimusten oikeudellisen luonteen kannalta merkittävä muutos oli uuden 12 a luvun lisääminen maankäyttö- ja rakennuslakiin vuonna 2003. Uudet säännökset muuttivat perustavanlaatuisesti sitä, kuinka sopimuksia on arvioitava esimerkiksi sisältövapauden näkökulmasta. Tässä maisterintutkielmassa tarkastellaan, miten maankäyttösopimuksia koskevaa sopimusva-pautta on arvioitava oikeudessamme. Keskeisenä säädösmateriaalina on maankäyttö- ja raken-nuslain (132/1999) maankäyttösopimuksia, kehittämiskorvauksia ja kaavoitusta koskevat sään-nökset, mutta tutkielmassa analysoidaan myös yleisemmin hallinto-oikeudellisten periaatteiden merkitystä maankäyttösopimuksia koskevan sopimusvapauden kannalta. Tarkoituksena on hahmotella niitä rajoja, joissa kunnan ja maanomistajan välisessä sopimuksessa on voimassa olevan lain mukaan pysyttävä. Tutkimusaihe on tärkeä, koska maankäytön ohjaus on merkittävä kunnallinen tehtävä ja maankäyttösopimuksilla sovitaan sekä kuntien että maanomistajien kan-nalta huomattavista sopimuskorvauksista. Tutkimuksen tulokset ovat hyödyllisiä maankäytön suunnittelun kanssa työskenteleville, mutta erityisesti kunnille ja maanomistajille. Samalla tutki-mus on suunnattu lainsäätäjälle. Tutkimustulosten perusteella maankäyttösopimuksia on pidettävä hallintosopimuksina, joten niitä koskevat riidat tulee ratkaista hallintotuomioistuimissa. Maankäyttösopimuksia on lainsää-dännön näkökulmasta arvioita siten, että niillä voidaan sopia vain kunnalle syntyvien kustannus-ten kattamisesta, ei yleisestä arvonnousun perimisestä. Kolmantena keskeisenä tuloksena tutki-muksessa on, että kunnan laissa säädetty kaavoitusvelvollisuus on otettava huomioon, kun arvi-oidaan kunnan mahdollisuutta vapaasti sopia maankäytöstä maanomistajien kanssa. Tutkimusmenetelmä on lainopillinen, mutta sitä täydentävät lainsäätäjälle osoitetut suositukset täsmentää sääntelyä, sillä tutkimustulosten ja aiempien tutkimusten ja selvitysten perusteella näyttää siltä, että sopimuskäytännössä on tehty linjauksia, joita ei kaikilta osin voi pitää lain mu-kaisina. Tutkielmassa suositellaan, että lainsäätäjä täsmentäisi ainakin toimivaltaisen tuomiois-tuimen maankäyttösopimuksia koskevien riitojen ratkaisemissa sekä sen, voidaanko sopimuksin sopia vapaasti maanomistajan maksuvelvollisuudesta vai rajoittuuko sopimuskorvauksen mah-dollinen taso maankäyttö- ja rakennuslain 12 a luvun tarkoituksen perusteella