DIFFERENCES BETWEEN AGAR DILUTION, BROTH MACRODILUTION (CLSI M27-A3) AND E TEST (AB BIODISK) FOR FLUCONAZOLE RESISTANCE IN CLINICAL CANDIDA ALBICANS ISOLATES

Ensayos de susceptibilidad realizadas por dilución en agar (AD) se compararon con M27-A3 macrodilución de caldo (BMD) metodología (Clinical Laboratory Standards Institute y) y la prueba E (AB BIODISK) con el fin de determinar la viabilidad y la fiabilidad de dilución en agar como una prueba de unexpensive para ensayos de susceptibilidad a fluconazol (FLC) contra Candida albicans. Un total de 40 cepas fueron utilizados. Todos los aislamientos resultaron en un acuerdo para la DMO y la prueba de evaluación. 19 aislados mostraron concordancia entre los tres métodos. De los 21 resultados divergentes, 20 resultaron en una mayor MIC para la EA y 15 de ellos fueron ≥ 64 mg / ml. La densidad de células debido a un contacto proporcional de las células con el fármaco en el medio puede ser responsable de los resultados obtenidos y la divergencia de AD en comparación con las otras pruebas. AD no son capaces de sustituir ni la DMO ni prueba E, pero puede ser útil como una prueba de resistencia a la tensión preliminar para la clasificación de susceptibilidad en la investigación de laboratorio. Abstract Susceptibility assays performed by agar dilution (AD) were compared to M27-A3 broth macrodilution (BMD) methodology (Clinical Laboratory and Standards Institute) and E test (AB BIODISK) in order to determine the feasibility and reliability of agar dilution as an unexpensive test for fluconazole (FLC) susceptibility assays against Candida albicans. A total of 40 strains were used. All of the isolates resulted in agreement for BMD and E test. 19 isolates showed agreement between all three methods. Of the 21 divergent results, 20 resulted in higher MIC for AD and 15 of those were ≥64 μg/ml. Cell density due to proportional contact of cells with the drug in medium may be responsible for the results obtained and the divergence of AD compared to the other tests. AD can’t reliably substitute neither BMD nor E test, but it may be helpful as a preliminary resistance test for strain susceptibility classification in laboratory research. Palabras clave: Candida albicans, hongo, resitencia de droga

Growth of Chlorella vulgaris and Nannochloris oculata in effluents of Tilapia farming for the production of fatty acids with potential in biofuels

The use of microalgae in wastewater treatment and its biotechnological exploitation for the production of biofuels is a potential environmental application. Some species of microalgae are notable due to their lipid composition and fatty acid profile suitable for biofuel production. During the present study, a factorial 23 experimental design was conducted, which assessed three factors: i) two species of microalgae (Chlorella vulgaris and Nannochloris oculata), ii) two types of culture media [wastewater of tilapia farming (WTF) and bold’s basal medium (BB)], and iii) two types of lighting (multi-LED lamps and white light). Microalgae were inoculated in photobioreactors in 6 L of medium (WTF or BBM) at an initial concentration of 1.0 × 106 cells ml-1 at 20 ± 2°C. The highest average cell density as well as the highest productivity of biomass observed in the treatments was C. vulgaris treatment in BBM and multi-LED lighting (8.83 × 107 cells ml-1 and 0.0854 g l-1 d-1, respectively). Although the majority of lipid productivity was obtained in the exponential phase of N. oculata cultivated in multi-LEDs in both treatments (BBM with 58% and WTF with 52%), cultivation of both species was generally maintained in WTF and were those that presented the major lipid productivity (2-18 mg l-1 d-1) in comparison with those cultivated in BBM. Palmitic, stearic, oleic, linoleic, linolenic and eicosanoic (C16–C20) fatty acids were present in both species of microalgae in concentrations between 26 and 74%. Based on the results of the present study, we conclude that cultivation of N. oculata and/or C. vulgaris in WTF illuminated with multi-LEDs is an economic and sustainable alternative for biodiesel production because it can represent up to 58% of lipids with a fatty acid profile optimal up to 74% of the total fatty acids.Key words: Chlorella vulgaris, Nannochloris oculata, production of fatty acids, wastewater of tilapia farming, production of biofuels

Nanotecnología aplicada al desarrollo de películas inteligentes para la conservación de productos hortofrutícolas.

La calidad de productos hortofrutícolas se ve afectada por el crecimiento de microorganismos, entre los principales se encuentran hongos fitopatógenos del género Penicillum, Fusarium, Alternaria, Geotrichum y Rhizopus. Datos emitidos tras el programa federal “Cruzada nacional contra el hambre” muestran que es uno de los productos con mayor porcentaje de merma, hasta del 30 % de la producción. Para mantener la calidad de estos productos se evalúa el uso de activos naturales de piel de Punica granatum incorporados en micropartículas poliméricas sensibles a pH ácido, por lo que se aprovecha la acidez provocada por la infección. La extracción se realizó mediante la técnica de maceración con agitación en sistema metanol – agua 7:3 y etanol – agua en la misma proporción, se eliminó el solvente orgánico utilizando un rotavapor. Para la formulación de las micropartículas de 1 µm de tamaño promedio, se implementó la técnica de doble emulsión (w/o/w)- evaporación, usando el polímero Eudragit E-100. Se evaluó la actividad antifúngica contra Geotrichum candidum causante de la pudrición ácida en jitomate in vitro mediante la técnica de microdiluciones en microplaca (extracto libre y encapsulado). La formulación de micropartículas incorporadas con extracto permitirá lograr una liberación prolongada, además de ser fácilmente lavable e inocua

Actividad antagónica de levaduras Killer contra Alternaria spp. in vitro.

Un total de 24 cepas de levaduras con el fenotipo killer (varias especies) fueron analizadas in vitro para detectar su actividad antagónica contra seis cepas diferentes de Alternaria spp. aisladas de muestras vegetales infectadas con este patógeno considerado como el agente causal de la enfermedad del “punto negro” en solanáceas y del “tizón temprano” en cultivos de la papa y el tomate. Seis cepas de levaduras produjeron una reducción significativa del micelio de Alternaria spp.; cuatro de ellas pertenecientes al género Pichia guilliermondii y una a Pichia kluyveri (dos cepas aún no se han identificado). Especialmente P. kluyveri mostró una reducción del crecimiento micelial del hongo en un porcentaje mayor al 50% en todas las cepas del hongo y la cepa VG032 mostró un buen poder de inhibición al tener un porcentaje de reducción ≥45 en cuatro cepas de Alternaria spp., estos resultados indican que algunas cepas de levaduras poseen toxinas que se pueden utilizar como agentes de biocontrol contra Alternaria spp. y así evitar la contaminación producida por fungicidas y agentes químicos

Actividad antagónica de levaduras Killer frente ahongos del género Aspergillus sección nigri.

Una batería de 50 cepas de levaduras obtenidas de diversas fuentes naturales fue evaluada para detectar su fenotipo killer, probando cada cepa contra las 49 restantes. Se encontraron 25 cepas killer, que fueron probadas de forma cualitativa contra 10 cepas de Aspergillussección nigri, depositando alícuotas de 15µl de 105 células/mL en agar PDA previamente embebido con una concentración de 105 conidias/mL. Las placas se incubaron por 5 días a 25°C. Las cepas de levadura que inhibieron a 5 o más cepas de Aspergillus, fueron seleccionadas para establecer el porcentaje de reducción de crecimiento radial de dichos mohos. Para esto, se inocularon placas de PDA con las cepas de Aspergillus en el centro, flanqueadas por 2 estrías lineales paralelas de cada levadura. Después de incubar se midieron los diámetros coloniales en 2 ejes, incluyendo al control, para calcular la reducción de crecimiento en términos de porcentaje. El promedio de reducción varió entre 28 a 44%, siendo la levadura 1025 la más efectiva. La cepa M4 fue la que resultó con una menor inhibición, mientras que la cepa 117 fue la más susceptible. Esto demuestra el potencial de las levaduras killer en el biocontrol de alimentos en poscosecha

Aislamiento de Levaduras Killer en Alimentos.

Las levaduras killer, se caracterizan por secretar una toxina proteica, llamada “toxina killer” que es letal para cepas sensibles de su misma especie o especies de diferentes géneros, pero siendo ellas mismas inmunes a sus propias toxinas. Estas pueden ser utilizadas como biocontrol en la poscosecha de alimentos. Se tomaron muestras de tepache y queso fresco del cual se aislaron 7 y 8 levaduras en el medio YEPD (Extracto de levadura, peptona, dextrosa y agar bacteriológico) se incubaron a 25ºC por 48h. Se realizó el ensayo Killer para dichas levaduras en placas con agar YEPD-MB (Extracto de levadura, peptona, dextrosa, agar bacteriológico con azul de metileno), realizando 8 divisiones en la placa cada levadura susceptible del panel se inoculó a manera de césped (ATCC26609, Ca023, VG028, Derma5, RG001 y WG002) para posteriormente agregar en cada división una levadura aislada y la levadura control LALVIN (Killer) y se incubaron a 25ºC por 48 horas. Obteniendo 6 levaduras con el fenotipo Killer para el tepache y 7 levaduras en el queso fresco, la conservación de las cepas se llevó a cabo en tubos falcón con una solución de glicerol 20% y agua destilada 80%. Posteriormente permanecenen congelación a 4º C

Global economic burden of unmet surgical need for appendicitis

Background: There is a substantial gap in provision of adequate surgical care in many low-and middle-income countries. This study aimed to identify the economic burden of unmet surgical need for the common condition of appendicitis. Methods: Data on the incidence of appendicitis from 170 countries and two different approaches were used to estimate numbers of patients who do not receive surgery: as a fixed proportion of the total unmet surgical need per country (approach 1); and based on country income status (approach 2). Indirect costs with current levels of access and local quality, and those if quality were at the standards of high-income countries, were estimated. A human capital approach was applied, focusing on the economic burden resulting from premature death and absenteeism. Results: Excess mortality was 4185 per 100 000 cases of appendicitis using approach 1 and 3448 per 100 000 using approach 2. The economic burden of continuing current levels of access and local quality was US $92 492 million using approach 1 and$73 141 million using approach 2. The economic burden of not providing surgical care to the standards of high-income countries was $95 004 million using approach 1 and$75 666 million using approach 2. The largest share of these costs resulted from premature death (97.7 per cent) and lack of access (97.0 per cent) in contrast to lack of quality. Conclusion: For a comparatively non-complex emergency condition such as appendicitis, increasing access to care should be prioritized. Although improving quality of care should not be neglected, increasing provision of care at current standards could reduce societal costs substantially

Pooled analysis of WHO Surgical Safety Checklist use and mortality after emergency laparotomy

Background The World Health Organization (WHO) Surgical Safety Checklist has fostered safe practice for 10 years, yet its place in emergency surgery has not been assessed on a global scale. The aim of this study was to evaluate reported checklist use in emergency settings and examine the relationship with perioperative mortality in patients who had emergency laparotomy. Methods In two multinational cohort studies, adults undergoing emergency laparotomy were compared with those having elective gastrointestinal surgery. Relationships between reported checklist use and mortality were determined using multivariable logistic regression and bootstrapped simulation. Results Of 12 296 patients included from 76 countries, 4843 underwent emergency laparotomy. After adjusting for patient and disease factors, checklist use before emergency laparotomy was more common in countries with a high Human Development Index (HDI) (2455 of 2741, 89.6 per cent) compared with that in countries with a middle (753 of 1242, 60.6 per cent; odds ratio (OR) 0.17, 95 per cent c.i. 0.14 to 0.21, P <0001) or low (363 of 860, 422 per cent; OR 008, 007 to 010, P <0.001) HDI. Checklist use was less common in elective surgery than for emergency laparotomy in high-HDI countries (risk difference -94 (95 per cent c.i. -11.9 to -6.9) per cent; P <0001), but the relationship was reversed in low-HDI countries (+121 (+7.0 to +173) per cent; P <0001). In multivariable models, checklist use was associated with a lower 30-day perioperative mortality (OR 0.60, 0.50 to 073; P <0.001). The greatest absolute benefit was seen for emergency surgery in low- and middle-HDI countries. Conclusion Checklist use in emergency laparotomy was associated with a significantly lower perioperative mortality rate. Checklist use in low-HDI countries was half that in high-HDI countries.Peer reviewe

Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals &lt;1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data