Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma

Objectives The neurological disorders in HIV-1-infected patients remain prevalent. The HIV-1 resistance in plasma and CSF was compared in patients with neurological disorders in a multicentre study. Methods Blood and CSF samples were collected at time of neurological disorders for 244 patients. The viral loads were >50 copies/mL in both compartments and bulk genotypic tests were realized. Results On 244 patients, 89 and 155 were antiretroviral (ARV) naive and ARV treated, respectively. In ARV-naive patients, detection of mutations in CSF and not in plasma were reported for the reverse transcriptase (RT) gene in 2/89 patients (2.2%) and for the protease gene in 1/89 patients (1.1%). In ARV-treated patients, 19/152 (12.5%) patients had HIV-1 mutations only in the CSF for the RT gene and 30/151 (19.8%) for the protease gene. Two mutations appeared statistically more prevalent in the CSF than in plasma: M41L (P = 0.0455) and T215Y (P = 0.0455). Conclusions In most cases, resistance mutations were present and similar in both studied compartments. However, in 3.4% of ARV-naive and 8.8% of ARV-treated patients, the virus was more resistant in CSF than in plasma. These results support the need for genotypic resistance testing when lumbar puncture is performe

Antibiothérapie chez des sujets obèses : enquête de pratique auprès des membres de la SNFMI et de la Spilf

National audienceIntroduction Les posologies recommandées pour les antibiotiques reposent sur des études faites avec des sujets de poids normal. Bien qu’un traitement sous optimal soit reconnu comme facteur de risque indépendant de mauvaise réponse, peu de recommandations existent (hors antibioprophylaxie) pour l’adaptation des antibiotiques au surpoids. Nous avons proposé une enquête auprès des membres de la Société nationale française de médecine interne (SNFMI) et de la Société de pathologie infectieuse française (Spilf), pour mieux connaître les habitudes de prescription chez les patients obèses. Patients et méthodes Nous avons utilisé un questionnaire anonyme en ligne, complété entre septembre 2014 et décembre 2015 par des internistes et/ou infectiologues, portant sur leur structure hospitalière et sa consommation d’ antibiotiques, les pathologies infectieuses prises en charge, le recours au dosage d’ antibiotiques et 3 cas cliniques simples avec choix de posologies chez des patients obèses. Résultats 117 questionnaires ont été analysés, en provenance d’établissements pour moitié universitaires, de plus de 400 lits dans 77 % des cas, disposant d’un référent antibiotiques dans 90 % des cas, de chirurgie bariatrique dans 68 % des cas, avec une consommation d’ antibiotiques de 534 doses définies journalières pour 1000 jours d’hospitalisations en moyenne. Deux tiers des répondeurs étaient des praticiens hospitaliers. L’existence d’un indice de masse corporelle (IMC) de plus de 30 ou 40 kg/m2 influait essentiellement sur le choix de la posologie (93 % et 90 % des cas, respectivement), moins sur celui de la molécule (33 % et 48 %), rarement sur la durée de traitement. Le calcul de la posologie se faisait le plus souvent à partir du poids réel : 52 % pour la vancomycine, 46 % pour les aminoglycosides, 53 % pour bêtalactamines, 39 % pour fluoroquinolones, plus rarement sur le poids ajusté (26 à 35 %), ou le poids idéal (10 à 15 %). Les dosages de vancomycine et d’aminoglycosides étaient effectués pour 94 % et 72 %, sur place, avec un résultat en règle disponible en moins de 24 h. Les dosages de bêtalactamines et de fluoroquinolones étaient plus rarement demandés (respectivement, 58 % et 32 %, surtout en cas d’insuffisance rénale ou hépatique ou d’intolérance), réalisés le plus souvent à l’extérieur (67 %), avec des résultats obtenus en plus de 48 h. Le choix des posologies en situation clinique était très hétérogène avec, pour l’érysipèle (poids = 120 kg, IMC= 39) des doses d’amoxicilline allant de 3 à 12 g/24 h (6à8 g par injection intraveineuse pour 60 % des prescripteurs, 4 à 6 g per os pour 18 %, maintien posologie à 3 g/24 h pour 10 %) ; pour la pyélonéphrite aiguë (poids =105 kg, IMC =41), des doses de ceftriaxone de 1 à 4 g/24 h initialement associée ou non à la gentamycine de 3 à 8 mg/kg/24 h, et pour la sigmoïdite diverticulaire (poids =120 kg, IMC= 39), ofloxacine 400 à 600 mg/j per os seul ou avec métronidazol 1,5 g/24 h per os. Discussion Malgré la présence d’un référent dans 9 centres sur 10, celui-ci n’est sollicité que dans 57 % des cas pour la prise en charge infectieuse chez l’obèse. L’adaptation des posologies antibiotiques au surpoids est très souvent réalisée mais de manière variable (poids réel/idéal/ajusté), témoignant de l’absence de référentiel sur le sujet. Le suivi pharmacologique est réalisé en routine pour la vancomycine et les aminoglycosides mais reste difficile pour les autres molécules (envoi extérieur, délai). Conclusion Cette enquête permet une « photographie informative » de nos pratiques à l’égard des antibiotiques. Sans être forcément représentative (biais de prescripteurs motivés par cette problématique), elle montre cependant, à travers la diversité des réponses, le manque de recommandations claires pour ce type de population et souligne la nécessité de travaux plus larges, en particulier dans le domaine pharmacologiqu

One-day prevalence of asymptomatic carriage of toxigenic and non-toxigenic Clostridioides difficile in 10 French hospitals

International audienceBackground: Asymptomatic faecal carriage of Clostridioides difficile has been widely evaluated, but its prevalence across a wide range of clinical departments and related risk factors are not well described. The objectives of the PORTADIFF study were to evaluate the prevalence and identifying risk factors leading to asymptomatic carriage of both toxigenic and non-toxigenic C. difficile.Methods: The PORTADIFF study was a 1-day prevalence study carried out in 10 different French hospitals. Adult patients, who agreed to participate, were included in this study and provided a fresh stool sample. C. difficile strains isolated from carriage were characterized by polymerase chain reaction (PCR) detection of tcdA, tcdB, cdtA and cdtB, and PCR ribotyping.Results: In total, 721 patients were included in this study. The median age was 73 years (range 18-101 years) and the male/female ratio was 1.06. C. difficile (either toxigenic or non-toxigenic strains) was isolated from 79 (11%) patients; 42 (5.8%) strains were toxigenic. The prevalence rates of asymptomatic carriage ranged from 5% on surgical wards to 19% on long-term care wards. The main risk factors associated with asymptomatic carriage were antibiotic treatment within the preceding 3 months (81.8% vs 53.7%; P<0.01), hospitalization within the preceding 2 months (55.8% vs 33%; P<0.01), cumulative duration of hospital stay before study inclusion (mean 50.1 vs 34.5 days; P<0.047), and hospitalization on a ward with high global incidence of C. difficile infection.Conclusion: Eleven percent of hospitalized patients were asymptomatic carriers of toxigenic or non-toxigenic C. difficile, and may constitute a potential reservoir of C. difficile strains

Outcomes in Patients With COVID-19 With Acute Encephalopathy and Coma: An International Prospective Study

International audienceBackground and ObjectivesTo report the prevalence of acute encephalopathy and outcomes in patients with severe coronavirus disease 2019 (COVID-19) and to identify determinants of 90-day outcomes.MethodsData from adults with severe COVID-19 and acute encephalopathy were prospectively collected for patients requiring intensive care unit management in 31 university or university-affiliated intensive care units in 6 countries (France, United States, Colombia, Spain, Mexico, and Brazil) between March and September of 2020. Acute encephalopathy was defined, as recently recommended, as subsyndromal delirium or delirium or as a comatose state in case of severely decreased level of consciousness. Logistic multivariable regression was performed to identify factors associated with 90-day outcomes. A Glasgow Outcome Scale-Extended (GOS-E) score of 1-4 was considered a poor outcome (indicating death, vegetative state, or severe disability).ResultsOf 4,060 patients admitted with COVID-19, 374 (9.2%) experienced acute encephalopathy at or before the intensive care unit (ICU) admission. A total of 199/345 (57.7%) patients had a poor outcome at 90-day follow-up as evaluated by the GOS-E (29 patients were lost to follow-up). On multivariable analysis, age older than 70 years (odds ratio [OR] 4.01, 95% CI 2.25-7.15), presumed fatal comorbidity (OR 3.98, 95% CI 1.68-9.44), Glasgow coma scale score <9 before/at ICU admission (OR 2.20, 95% CI 1.22-3.98), vasopressor/inotrope support during ICU stay (OR 3.91, 95% CI 1.97-7.76), renal replacement therapy during ICU stay (OR 2.31, 95% CI 1.21-4.50), and CNS ischemic or hemorrhagic complications as acute encephalopathy etiology (OR 3.22, 95% CI 1.41-7.82) were independently associated with higher odds of poor 90-day outcome. Status epilepticus, posterior reversible encephalopathy syndrome, and reversible cerebral vasoconstriction syndrome were associated with lower odds of poor 90-day outcome (OR 0.15, 95% CI 0.03-0.83).DiscussionIn this observational study, we found a low prevalence of acute encephalopathy at ICU admission in patients with COVID-19. More than half of patients with COVID-19 presenting with acute encephalopathy had poor outcomes as evaluated by GOS-E. Determinants of poor 90-day outcome were dominated by older age, comorbidities, degree of impairment of consciousness before/at ICU admission, association with other organ failures, and acute encephalopathy etiology.Trial Registration InformationThe study is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT04320472

Impact of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Minority Variants on the Virus Response to a Rilpivirine-Based First-line Regimen

International audienc

Impact of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Minority Variants on the Virus Response to a Rilpivirine-Based First-line Regimen

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