SalivaPrint as a non-invasive diagnostic tool

Currently, the molecular diagnosis is based on the quantification of RNA, proteins and metabolites because they present changes in their quantity related to clinical situations. The same molecules are not generally suitable for early diagnosis or to follow clinical evolution, making necessary strategies to evaluate the complete molecular scenario. There are already experimental strategies that allow the determination of total protein profiles from saliva samples (the SalivaPrint). The goal of this work is to identify a profile of saliva proteins (similar to a fingerprint) and, using computational methods, identify how this profiles changes with age and gender. So far it has been possible to collect 79 samples as well as the metadata associated with each sample using an electronic questionnaire developed by us. A total protein profile was obtained and their association with gender was verified using statistical methods. Currently we are developing the Python scripts for automatic data acquiring and normalization. Total protein profiles annotation on a database (SalivaPrintDB) and their integration with the factors that affects them using machine learning strategies can empower the use of the approach proposed on this work as a tool for monitoring the individual's health status.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Regeneração do conjunto patrimonial da cidadela de Peniche

Dissertação de Mestrado Integrado em Arquitetura, com a especialização em Arquitetura apresentada na Faculdade de Arquitetura da Universidade de Lisboa para obtenção do grau de Mestre.O presente trabalho partiu do interesse pelo património esquecido, no qual se insere a Fortaleza de São Francisco, em Peniche. Debruçada sobre o mar e de atmosfera singular, ela interpela-nos à descoberta da sua história e das camadas que a constroem. Considerada uma das praças-fortes mais importantes do reino, fez parte do conjunto de defesa costeiro da capital e um dos maiores exemplares de arquitetura militar portuguesa que prevaleceu, não intacta, ao passar do tempo. Dos seus apoios defensivos, pouco ou nada resta. Parte-se da reflexão sobre o seu valor patrimonial, do carácter e da sua essência. Da ligação entre o património e o espaço que o envolve. Do que o lugar quer ser, do que se pode tornar. Estuda-se a sua evolução, como se alterou no tempo e explora-se as valências que contem, a singularidade do lugar. Numa tentativa de reavivar a sua importância, de compreender de que modo se reergue um monumento perdido no tempo, apresenta-se uma proposta que assume a sua regeneração, através da ligação entre as suas pré-existências e a atribuição de uma nova linguagem arquitetónica. Concede-se um novo uso, uma nova vivência, como resposta ponderada às fragilidades do lugar.ABSTRACT: The present work started from the interest in the forgotten heritage, in which the Fortress of San Francisco, in Peniche, is located. Leaning over the sea and with a unique atmosphere, it challenges us to discover its history and the layers that build it. Considered one of the most important strongholds of the kingdom, it was part of the coastal defense complex of the capital and one of the largest examples of portuguese military architecture that prevailed, not intact, over time. Of its defensive supports, little or nothing remains. It starts from the reflection on its patrimonial value, the character and its essence; the link between heritage and the space that surrounds it. What the place wants to be, what it can become. Its evolution is studied, as it has changed over time and explores the valences that it contains, the singularity of the place. In an attempt to revive its importance, to understand how a monument lost in time retains, a proposal that assumes its regeneration, through the link between its pre-existences and the attribution of a new architectural language is presented. A new use, a new experience, is given as a pondered response to the fragility of the place.N/

Participants performance in the First Financial Education Olympiad in Rio Grande do Sul

A Educação Financeira permite escolhas conscientes e seguras sobre finanças, oportunidades e futuro. Este estudo objetivou analisar o desempenho dos participantes da I Olimpíada de Educação Financeira no Rio Grande do Sul (I OBEF RS) relacionado aos conteúdos de Educação Financeira. Realizou-se a análise das provas aplicadas em 2019 nas três fases, para os cinco níveis. Quanto aos procedimentos metodológicos, é uma pesquisa quantitativa, descritiva e documental. Participaram desta pesquisa 2.948 alunos, de escolas públicas e privadas, do 2º ano do ensino fundamental ao 3º do ensino médio, dos quais se constatou melhora no desempenho ao longo da olimpíada. Na primeira fase, as escolas públicas apresentaram o maior percentual de participantes classificados, 52,1% em relação a 47,9% das privadas, e o nível um pontuou o maior percentual de aprovados. Na segunda fase, embora as escolas privadas tenham apresentado o maior percentual de classificados (53,3%), não houve diferenças significativas. Os níveis três a cinco apresentaram o maior percentual de aprovação. Na terceira fase, que premiou os medalhistas nacionais, predominou as escolas públicas, com 81,8% dos alunos. Dentre os nove medalhistas das escolas públicas, sete são de escola militar e foram os que apresentaram o melhor desempenho, sendo estes dos níveis três a cinco. Em relação ao gênero, não foram identificadas diferenças estatisticamente significativas. Este estudo promoveu a inserção do tema Educação Financeira no contexto escolar, destacando a importância da participação dos alunos na I Olimpíada Brasileira de Educação Financeira (I OBEF) e fortalecendo o mapeamento das habilidades sobre assuntos relacionados à Educação Financeira.Financial education allows conscious and secure choices about finances, opportunities and future. This study aimed to analyze participants performance in Olympiad of Financial Education in Rio Grande do Sul (I OBEF RS), in relation to Financial Education contents. An analysis of the three phases tests applied in 2019 to five levels of students was carried out. As for the methodological procedures, it is a quantitative, descriptive and documentary research. There were 2,948 pupils participating, from public and private schools, from the 2nd year of elementary school up to the 3rd year of high school. It was noticed their performance’s improvement throughout the Olympiad. In the first stage, public schools had the highest percentage of participants classified (52.1%), and private schools had 47.9%, and level one had the highest percentage of those approved. In the second stage, although the private schools showed the highest percentage of students classified (53.3%), the differences found were not significant. Levels 3 to 5 had the highest approval percentage. In the third stage, which gave rise to the national medalists, public schools predominated, with 81.8% of the students. Among the nine public schools’ medalists, seven were from military school, and they performed better in comparison with the total medal-winners, from levels 3 to 5. Regarding gender, there were no statistically significant differences. This study promoted the inclusion of this theme in the classrooms, highlighting the importance of pupils’ participation in the I Brazilian Olympiad of Financial Education (I OBEF) and strengthening the skills mapping of financial education matters

Reabilitação versus desconstrução em redes de abastecimento e distribuição de água

Mestrado em Engenharia CivilNo mundo actual, onde o crescimento económico se baseia num consumo crescente e não sustentável dos recursos, todos os dias são desperdiçadas matérias-primas sem qualquer racionalização. Este problema torna-se ainda mais grave quando se refere a recursos não renováveis. Neste contexto, é importante intervir em todos os domínios, incluindo os sistemas de abastecimento e distribuição de água, que, para além do desperdício do recurso água que se observa em redes degradadas e em fim de vida, cria oportunidades de reutilização e reciclagem de materiais e/ou resíduos provenientes da intervenção nessas redes, permitindo deste modo a diminuição da extracção de novas matérias-primas e a redução da quantidade de resíduos que seguem para aterro. A presente dissertação incide sobre as intervenções possíveis no âmbito da desconstrução ou reabilitação destas redes, destacando os materiais que podem ser encontrados nas redes de abastecimento e distribuição de água, as técnicas de intervenção e o encaminhamento mais correcto a dar aos resíduos e materiais daí resultantes.In today’s world, where economic growth is based on an increasing and unsustainable consumption of resources, raw materials are wasted every day without any rationalization. This problem becomes even worse when it is related to non-renewable resources. In this context, it is important to intervene in all domains, including the supplying and water distribution systems, which, beyond the waste of water observed in degraded and at the end of life water networks, creates opportunities (chances) to reuse and recycle materials and/or residues proceeding from the intervention in these networks, thus enabling the extraction reduction of new raw materials and also the quantity reduction of residues that go to landfill. This dissertation focuses on the possible interventions in the scope of deconstruction or rehabilitation of these water networks, detaching the materials that can be found in the supplying and distribution water systems, the intervention techniques and the most appropriate routing to be given to all the materials and residues that drift from that intervention

A step forward to implement saliva as diagnostic fluid

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Intervenção de Enfermagem à Pessoa com Doença Oncológica em Fase Agónica, no Internamento Hospitalar de Cirurgia

A doença oncológica em Portugal tem vindo a revelar-se uma das principais causas de morte no nosso país, apresentando um progressivo aumento da sua incidência, com uma previsão de 50000 novos casos até 2030, (Direção Geral da Saúde, 2014). A existência do paradigma biomédico, incute um espirito curativo e declina a visão paliativa do cuidar da pessoa atrasando na maior parte das vezes os cuidados de conforto previstos para as pessoas com doença oncológica nesta fase. A fase agónica da pessoa com doença oncológica é o tema central deste trabalho, por ser uma fase de intenso sofrimento para a pessoa doente e para os que a rodeiam, que requer um trabalho intenso para a promoção do seu conforto. A intervenção major de enfermagem nesta fase prende-se com a avaliação das necessidades de conforto da pessoa com doença oncológica e sua família, de forma a intervir sobre estas necessidades colmatando-as. Este conforto é defendido pela Teoria de Conforto de Kolcaba (1991; 1994; 2003) e pela filosofia dos cuidados paliativos que assume a importância das intervenções promotoras de conforto, baseando o cuidar em quatro pilares fundamentais, também eles a base de todo este trabalho, o controlo sintomático, a comunicação, a família e o trabalho em equipa. Neste sentido, foi abordado o estertor como principal sintoma da pessoa em fase agónica com o intuito de dar resposta às necessidades da equipa de enfermagem, tendo sido implementadas Linhas Orientadoras do Cuidar da Pessoa em Fase agónica com estertor, de forma a avaliar o impacto da utilização destas na promoção do conforto nas pessoas nesta fase. Como metodologia de projeto, partiu-se da elaboração de uma Revisão Integrativa da Literatura que permitiu a análise e síntese da informação encontrada de forma a aplicá-la na prática

O efeito do stress ambiental na fidelidade da síntese de proteínas

Doutoramento em BioquímicaEstudos recentes estabelecem uma ligação entre erros na tradução do mRNA e cancro, envelhecimento e neurodegeneração. RNAs de transferência mutantes que introduzem aminoácidos em locais errados nas proteínas aumentam a produção de espécies reactivas de oxigénio e a expressão de genes que regulam autofagia, ribofagia, degradação de proteínas não-funcionais e protecção contra o stress oxidativo. Erros na tradução do mRNA estão portanto relacionados com stress proteotóxico. Sabe-se agora que o mecanismo de toxicidade do crómio está associado à diminuição da fidelidade de tradução e à agregação de proteínas com malformações que destabilizam a sua estrutura terciária. Desta forma, é possível que os efeitos do stress ambiental ao nível da degeneração celular possam estar relacionados com a alteração da integridade da maquinaria da tradução. Neste estudo procedeu-se a uma avaliação alargada do impacto do stress ambiental na fidelidade da síntese de proteínas, utilizando S. cerevisiae como um sistema modelo. Para isso recorreu-se a repórteres policistrónicos de luciferase que permitiram quantificar especificamente a supressão de codões de terminação e o erro na leitura do codão AUG em células exposta a concentações não letais de metais pesados, etanol, cafeína e H2O2. Os resultados sugerem que a maquinaria de tradução é na generalidade muito resistente ao stress ambiental, devido a uma conjugação de mecanismos de homeostase que muito eficientemente antagonizam o impacto negativo dos erros de tradução. A nossa abordagem quantitativa permitiu-nos a identificar genes regulados por uma resposta programada ao stress ambiental que são também essenciais para mitigar a ocorrência de erros de tradução, nomeadamente, HSP12, HSP104 e RPN4. A exposição prolongada ao stress ambiental conduz à saturação dos mecanismos de homeostase, contribuindo para a acumulação de proteínas contendo erros de tradução e diminuindo a disponibilidade de proteínas funcionais directamente envolvidas na manutenção da fidelidade de tradução e integridade celular. Ao contrário de outras Hsps, a Hsp12p adopta normalmente uma localização membranar em condições de stress, que pode modular a fluidez e estabilidade membranar, sugerindo que a membrana plasmática é um alvo preferencial da perda de fidelidade da tradução. Para melhor compreender as respostas celulares aos erros de tradução, células contendo deleções em genes codificadores das Hsps foram transformadas com tRNAs mutantes que introduzem alterações no proteoma. Os nossos resultados demonstram que para além da resposta geral ao stress, estes tRNAs induzem alterações a nível do metabolismo celular e um aumento de aminoacilação com Metionina em vários tRNAs, sugerindo um mecanismo de protecção contra espécies reactivas de oxigénio. Em conclusão, este estudo sugere um papel para os erros de tradução na gestão de recursos energéticos e na adaptação das células a ambientes desfavoráveis.Recent studies link mRNA mistranslation to cancer, neurodegeneration, aging and metabolic imbalances. It was shown previously that mutant tRNAs that mutagenise the proteome via mRNA misreading increase production of reactive oxygen species and up-regulate the expression of oxidative stress, autophagy and ribophagy genes, indicating that mistranslation is an important cause of proteotoxic stress. Interestingly, chromium toxicity is linked to increased mistranslation and protein aggregation suggesting that environmental stressors may cause cell degeneration and human disease through deregulation of protein synthesis fidelity. In this study, we investigate the impact of environmental on the fidelity of protein synthesis using S.cerevisiae as a model system. We used a dual luciferase reporter to quantify both AUG misreading and stop codon readthrough in cells exposed to sub-lethal concentrations of heavy metals, ethanol, caffeine and hydrogen peroxide. Our results suggest that the translational machinery is in general very resistant to environmental stress, due to a conjugation of homeostasis mechanisms that effectively antagonize the negative impact of protein synthesis errors to a level tolerated by cells. Additionally, our quantitative approach allowed us to identify genes under the control of the environmental stress response (ESR) that are essential to cope with induced amino acid misincorporation, namely HSP12, HSP104 and RPN4. Prolonged stress exposure drives saturation of protein homeostasis mechanisms, which contributes to accumulation of mistranslated protein into the cytoplasm and thereby decreases the availability of functional proteins directly involved in translational fidelity and cellular integrity. Unlike all other Hsps, Hsp12p associates with the plasma membrane under stress, which may help modulate membrane fluidity and stability, suggesting that protein synthesis errors target membrane components. To further understand the cellular responses to mistranslation and proteotoxic stress, cells harboring deletions in genes coding for small heat-shock proteins were transformed with a misreading tRNA. The data showed that besides a wide response to stress, constitutive mistranslation also promoted a shift in cellular metabolism. Finally, cells expressing misreading tRNAs show increased Met-misacylation, suggesting that methionine misincorporation into proteins protects against ROS. This study strongly supports a role for mistranslation in energy management and cell adaptation to suboptimal environmental conditions

The Usefulness Of Social Exclusion As A Theoretical Concept To Inform Social Policy In Transport

Institute of Transport and Logistics Studies. Faculty of Economics and Business. The University of Sydne

A protein profiling strategy for periodontal disease applications: the Perio-SalivaPRINT

Objectives: It is known that several clinical situations have characteristic molecular deregulations. Some molecular data underlying these deregulations can be found in saliva and have been annotated in databases (SalivaTecDB). Strategies are needed to identify the phenotypes characteristic of these deregulations. Our group has developed a strategy that allows the establishment of saliva protein profiles reflecting different conditions (health and disease). These profiles can be integrated to clinical data (SalivaPRINT Toolkit). The present work aims to identify the Periodontal Diseases (PD)-specific protein profiles. Methods: Unstimulated whole saliva was collected from a group of healthy subjects and a group of PD patients (with gingivitis, periodontitis or periimplantitis). Salivary proteins were separated by the Experion™ automated capillary electrophoresis. The protein profiles of each condition were integrated with the corresponding protein data retrieved from our in-house database (SalivaTecDB). Results: The strategy used enabled the determination of a total protein profile from saliva characteristic of each PDs -the Perio-SalivaPrint. The use of the SalivaPrint Toolkit allowed the identification of molecular weight ranges altered in PD. Using SalivaTecDB we were able to suggest proteins potentially involved in the underlying dysregulated mechanisms of the disease. Conclusions: This approach enabled the determination of a Perio-SalivaPrint – protein profiles specific for gingivitis, periodontitis or periimplantitis - that could empower the use of saliva as a simple and less expensive diagnostic and monitoring fluid. The strategy presented could be an important tool for future applications in the early diagnostic/ screening of Periodontal Disease patients with applications in chairside monitoring.info:eu-repo/semantics/publishedVersio