Structural Characterization of the Xi Class Glutathione Transferase From the Haloalkaliphilic Archaeon Natrialba magadii

Xi class glutathione transferases (GSTs) are a recently identified group, within this large superfamily of enzymes, specifically endowed with glutathione-dependent reductase activity on glutathionyl-hydroquinone. Enzymes belonging to this group are widely distributed in bacteria, fungi, and plants but not in higher eukaryotes. Xi class GSTs are also frequently found in archaea and here we focus on the enzyme produced by the extreme haloalkaliphilic archaeon Natrialba magadii (NmGHR). We investigated its function and stability and determined its 3D structure in the apo form by X-ray crystallography. NmGHR displays the same fold of its mesophilic counterparts, is enriched in negatively charged residues, which are evenly distributed along the surface of the protein, and is characterized by a peculiar distribution of hydrophobic residues. A distinctive feature of haloalkaliphilic archaea is their preference for γ-glutamyl-cysteine over glutathione as a reducing thiol. Indeed we found that the N. magadii genome lacks a gene coding for glutathione synthase. Analysis of NmGHR structure suggests that the thiol binding site (G-site) of the enzyme is well suited for hosting γ-glutamyl-cysteine

Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018.

Over the past decade, the Nomenclature Committee on Cell Death (NCCD) has formulated guidelines for the definition and interpretation of cell death from morphological, biochemical, and functional perspectives. Since the field continues to expand and novel mechanisms that orchestrate multiple cell death pathways are unveiled, we propose an updated classification of cell death subroutines focusing on mechanistic and essential (as opposed to correlative and dispensable) aspects of the process. As we provide molecularly oriented definitions of terms including intrinsic apoptosis, extrinsic apoptosis, mitochondrial permeability transition (MPT)-driven necrosis, necroptosis, ferroptosis, pyroptosis, parthanatos, entotic cell death, NETotic cell death, lysosome-dependent cell death, autophagy-dependent cell death, immunogenic cell death, cellular senescence, and mitotic catastrophe, we discuss the utility of neologisms that refer to highly specialized instances of these processes. The mission of the NCCD is to provide a widely accepted nomenclature on cell death in support of the continued development of the field

Role of Ser11 in the stabilization of the structure of Ochrobactrum anthropi glutathione transferase

GSTs (glutathione transferases) are a multifunctional group of enzymes, widely distributed and involved in cellular detoxification processes. In the xenobiotic-degrading bacterium Ochrobactrum anthropi, GST is overexpressed in the presence of toxic concentrations of aromatic compounds such as 4-chlorophenol and atrazine. We have determined the crystal structure of the GST from O. anthropi (OaGST) in complex with GSH. Like other bacterial GSTs, OaGST belongs to the Beta class and shows a similar binding pocket for GSH. However, in contrast with the structure of Proteus mirabilis GST, GSH is not covalently bound to Cys10, but is present in the thiolate form. In our investigation of the structural basis for GSH stabilization, we have identified a conserved network of hydrogen-bond interactions, mediated by the presence of a structural water molecule that links Ser11 to Glu198. Partial disruption of this network, by mutagenesis of Ser11 to alanine, increases the Km for GSH 15-fold and decreases the catalytic efficiency 4-fold, even though Ser11 is not involved in GSH binding. Thermal- and chemical-induced unfolding studies point to a global effect of the mutation on the stability of the protein and to a central role of these residues in zippering the terminal helix of the C-terminal domain to the starting helix of the N-terminal domain

Multicohort and cross-platform validation of a prognostic Wnt signature in colorectal cancer

Deregulation of the Wnt pathway is a hallmark of col-orectal cancer (CRC). Nevertheless, the clinical implications of aberrant β-catenin-driven gene transcription remain elusive. We herein present a transcriptional WNT signaturepredicting survival outcomes in metastatic CRC (mCRC)

Multicohort and cross‐platform validation of a prognostic Wnt signature in colorectal cancer

Deregulation of the Wnt pathway is a hallmark of col-orectal cancer (CRC). Nevertheless, the clinical implications of aberrant β-catenin-driven gene transcription remain elusive. We herein present a transcriptional WNT signaturepredicting survival outcomes in metastatic CRC (mCRC)

Cronache meridionali. A. VI, n.1-12 (1959)

N. 1 (gennaio 1959): L'opposizione e le istanze unitarie del Mezzogiorno, P. 1 ; Alinovi, A., Congresso socialista e rinascita meridionale, P. 7 ; Cinanni, P., Un convegno sulla valorizazione della montagna, P. 17 ; Per la costruzione dello stabilimento siderurgico e l’intervento del l'I.r.i. nel Mezzogiorno, P. 26 ; La risoluzione del Convegno di Napoli, P. 35 ; Viviani, L., Poliomielite e vaccino, P. 35 ; Il « simpatico arcivescovo», P. 38 ; Rimborso spese Risorgimento, P. 39 ; Chiaromonte, G., Il piano regolatore di Napoli, P. 47 ; Amore, S., Un'inchiesta sulla piccola e media industria in Campania, P. 64 ; Giudici, S., Il Banco di Sicilia e l'autonomia, P. 72 ; Valenzi, M., Francesco Gabrieli: Il Risorgimento arabo, P. 77 ; Libro bianco sulle illegalità del governo Fanfani, P. 79 ; Ferdinando Bologna: Francesco Solimena, P.80.N. 2 (febbraio 1959): Il governo dell'on. Segni, P. 81 ; Napolitano, G., I contadini e lo sviluppo dell'agricoltura, P. 83 ; Spallone, G., Problemi dell'emigrazione, P. 99 ; Il movimento di rinascita e la crisi governativa, P. 113 ; Lo sviluppo della cooperazione, P. 114 ; Al di fuori delle leggi, P. 116 ; Dal rapporto dell'O.e.c.e. sull'economia italiana, P. 118 ; Un convegno sull' artigianato, P. 119 ; Gramegna, G., L'agricoltura pugliese e l'imponibile di mano d'opera, P. 128 ; Sotgiu, G., Il piano di rinascita della Sardegna, P. 131 ; Villari, R., Alberto Caracciolo: L'inchiesta agraria Jacini, P. 145 ; Libertà e autonomia per la Sicilia (dal Memorandum dei socialisti di Palermo al senatore Codronchi), P. 152.N. 3 (marzo 1959): Amendola, G., Proposte per un programma dell'opinione democratica italiana, P. 161 ; Failla, V., Petrolio e industrializzazione, P. 168 ; Grifone, P., Crisi agraria e trasformazioni colturali, P. 186 ; Riconsacrazione dell'« iniziativa privata» a Brindisi, P. 199 ; L'abbraccio di Castellammare, P. 200 ; Una proposta dell'ono. Fascetti, P. 201 ; Cimino, M., La Sicilia verso le elezioni, P. 214 ; Sansone, N., Professionisti in un paese pugliese, P. 220 ; Basso, L., Gaetano Salvemini, socialista e meridionalista; Villari, R., Enzo Tagliacozzo: Gaetano Salvemini nel cinquantennio liberale, P. 226 ; Daniele, I., Giuseppe Tomasi Di Lampedusa: Il Gattopardo (I.Daniele), P. 229.N. 4 (aprile 1959): Alicata, M., L'Italia e il patto atlantico, P. 233 ; Chiaromonte, G., L'ottavo esercizio della Cassa per ii Mezzogiorno, P. 236 Valenzi, M., Profughi italiani dalla Tunisia e dall'Egitto, P. 247 ; L'Assemblea generale dell'Isveimer, P. 249 ; Napoli e il centenario del 1860, P. 251 ; De Ciampis, M., Note sul movimento socialista tra gli emigrati italiani in U.S.A. (1890-1921), P. 255 ; Amore, S., Le lotte operaie per lo sviluppo delle Manifatture cotoniere meridionali, P. 274 ; Spallone, G., Bilancio e prospettive dell'industrializzazione, P. 285 ; Esposto, A., Movimento contadino e riforma agraria, P. 294 ; Primo Congresso abruzzese dei lauoratori della terra - Sulmona 18 marzo 1917, P. 305.N. 5 (maggio 1959): Colajanni, N., Le elezioni siciliane, P. 317 ; Li Causi, G., Autonomia regionale e partiti politici in Sicilia, P. 322 ; Miceli, G., Prospettive e condizioni di sviluppo della cooperazione, P. 332 ; Villani, P., Di alcuni presupposti del moderatismo napoletano, P. 363 ; Lauro, Covelli e Segni, P. 356 ; I programmi dell'I.r.i. e dell'E.n.i., P. 357 ; Sede vacante, P. 359 ; Servizio a domicilio, P. 361 ; Una proposta di legge per Napoli, P. 370 ; Pistlllo, M., Panorama preelettorale a Bari, P. 383 ; Sansone, N., Il paradosso di Molfetta, P. 391 ; Napolitano, G., Francesco Compagna: Terroni in città, P. 398 ; Villari, R., Luigi De Rosa: Studi sugli arrendamenti del Regno di Napoli, P. 400 ; Ricci, P., Riccardo Raimondi: Degas e la sua famiglia in Napoli, P. 402.N. 6 (giugno 1959): Pajetta, G., Il valore nazionale del voto siciliano, P. L'ingegner La Cavera e la Confindustria, P. 421 ; Caprara, M., Il progetto di legge per Napoli, P. 422 ; De Jaco, A., La stampa italiana e il processo a Pupetta Maresca, P. 424 ; Chiaromonte, G., L'assistenza pubblica a Napoli, P. 449 ; Napolitano, G., Domenico La Cavera:Petrolio e azione di governo ai fini dell'industrializzazione in Sicilia; ID.: Un decennio di travaglio per l'industrializzazione della economia siciliana, P. 457 ; Villari, R., Karl Kautsky: La questione agraria, P. 400 ; Daniele., I., Domenico Rea: Una vampata di rossore, P. 463 ; Causa, R., La mostra celebrativa di Michele Cammarano, P. 464 ; Domanico, G., Discussioni sulla questione agraria e proposte per i contadini, P. 467.N. 7-8 (luglio-agosto 1959): Alinovi, A., Spinta meridionalista, P. 473 ; Natta, A., Il problema della scuola, P. 477 ; D'Antonio, M., e I. Palermo, Il Banco di Napoli e la stampa napoletana , P. 486 ; Villari, R., La polemica antiriiormista di Arturo Labriola, P. 497 ; L'industria di Stato e il Mezzogiorno, P. 506 ; Cutolo e De Micheli, P. 507 ; Formiggini, G., La legge siciliana di riforma amministrativa, P. 512 ; Per una legge organica a favore delle piccole e medie imprese industriali, P. 526 ; Modifiche e integrazioni della legge recante provvedimenti per il Mezzogiorno, P. 538 ; Pirastu, L., La lotta del popolo sardo per il piano di rinascita, P. 545 ; Petrone, I., L'industrializzazione della Lucania, P. 549 ; Berlinguer, G., e S. Delogu, La medicina è malata, P. 555 ; Daniele, I., Ottiero Ottieri: Donnarumma all'assalto, P. 557 ; Rossi, R., Federico De Roberto: I Vicerè, P. 559 ; Labriola, A., La questione meridionale e le riforme del periodo Giolittiano, P. 561.N. 9 (settembre 1959): Calamandrei, F., Il Mezzogiorno e la svolta internazionale, P. 569 ; Chiaromonte, G., e L. Cosenza, Il piano regionale campano, P. 576 ; Gomez, M., I prezzi delle patate, P. 593 ; Caprara, M., Tre proposte di legge per Napoli, P. 604 ; Una inchiesta sulle attrezzature civili del Mezzogiorno, P. 611 ; Iocco, E. Per lo sviluppo della piccola e media industria, P. 622 ; Sommario della legislazione a favore delle industrie, P. 626 ; Cimino, M., I contagiosi casi di Sicilia, P. 635 ; Rizzo, G.,Lo sciopero dei conservieri a Mugnano, P. 641 ; Villari, R., Georges Lefebvre: Les paysans du Nord pendant la Révolution française, P. 645 ; Valenza, P., Michele Lacalamita: La civiltà contadina, P. 648, Daniele, I., Aldo De Jaco: Una settimana eccezionale, P. 650.N. 10 (ottobre 1959): Il Congresso della Democrazia cristiana, P. 653 ; Chiaromonte, G., La pianificazione regionale, P. 656 ; Natta, A., Il progetto Medici per la scuola, P. 662 ; Caprara, M., La tortuosa vicenda del rinino delle elezioni, P. 670 ; Il programma del P.d.i., 677 Corrao, L., Cosa vuole la Sicilia, P. 684 ; Proposte per lo sviluppo economico della Sicilia, P. 700 ; Il metano di Ferrandina, P. 706 ; Maglietta, C., Per lo sviluppo della piccola e media industria, P. 708 ; Sul progetto di legge per fusioni e trasformazioni di società, P. 712 ; D'Antonio, M., e I. Palermo, Confusione e trasformismo nella D.c. a Napoli, P. 719.N. 11 (novembre 1959): Chiaromonte, G., l congressi democristiani nel Mezzogiorno, P. 733 ; Napolitano, G., Dci piani regionali a una nuova politica economica, P. 746 ; Fontani, A., Emigrazione e movimento di popolazione, P. 750 ; Sansone, N., Il processo di Marigliano, P. 767 ; La Cavera, D., e R. Posca (interventi nel dibattito di), Per lo sviluppo della piccola e media industria, P. 771 ; Caprara, M., Il Premio Nobel a Salvatore Quasimodo, P. 778 ; Ziccardi, A., L'Ente di irrigazione appulo-lucano, P.787 ; Pellegrino, G., La pesca nel Canale di Sicilia, P. 793 ; Villari, R., Storia dell'economia italiana, a cura di C. M. Cipolla, P. 799 ; Boeri, E., Theodor Heuss: L'«Acquario» di Napoli e il suo fondatore Antonio Dohrn, P. 802 ; Gaetano Salvemini: Suffragio universale e clericalismo, P. 805.N. 12 (dicembre 1959): Longo, L., Monopoli e industrializzazione in Sicilia, P. 809 ; Valenzi, P., e L. Silipo, L'alluvione in Lucania e Calabria, P. 823 ; Lapiccirella, R., L'incredibile vicenda dell'acquedotto campano, P. 834 ; Napolitano, G., Piani regionali ed attuazione delle Regioni, P. 839 ; Valenzi, M., La terza Conferenza di Belgrado. Anticolonialismo e distensione, P. 847 ; Chiarnomonte, G., Ancora sullalegge speciale per Napoli, P. 849 ; Amore, S., Il M.e.c. e la provincia di Napoli, P. 858 ; Fermariello, C. ( intervento nel dibattito di ) Per lo sviluppo della piccola e media industria, P. 860 ; Progetto di legge per la « Modifica del sistema contributivo delle assicurazioni sociali a favore delle piccole e medie aziende industriali», P. 865 ; Pelella, E., L'industria calzaturiera a Napoli, P. 868 ; Chiaromonte, G., Emilio Luongo - Antonio Oliva: Napoli come è, P. 873 ; Villari, R., Critica sociale, a cura di M. Spinella, A. Caracciolo, H. Amaduzzi, G. Petronio, P. 876

Apoptotic cell death in disease-Current understanding of the NCCD 2023

Apoptosis is a form of regulated cell death (RCD) that involves proteases of the caspase family. Pharmacological and genetic strategies that experimentally inhibit or delay apoptosis in mammalian systems have elucidated the key contribution of this process not only to (post-)embryonic development and adult tissue homeostasis, but also to the etiology of multiple human disorders. Consistent with this notion, while defects in the molecular machinery for apoptotic cell death impair organismal development and promote oncogenesis, the unwarranted activation of apoptosis promotes cell loss and tissue damage in the context of various neurological, cardiovascular, renal, hepatic, infectious, neoplastic and inflammatory conditions. Here, the Nomenclature Committee on Cell Death (NCCD) gathered to critically summarize an abundant pre-clinical literature mechanistically linking the core apoptotic apparatus to organismal homeostasis in the context of disease

Type I IFNs promote cancer cell stemness by triggering the epigenetic regulator KDM1B

Cancer stem cells (CSCs) are a subpopulation of cancer cells endowed with high tumorigenic, chemoresistant and metastatic potential. Nongenetic mechanisms of acquired resistance are increasingly being discovered, but molecular insights into the evolutionary process of CSCs are limited. Here, we show that type I interferons (IFNs-I) function as molecular hubs of resistance during immunogenic chemotherapy, triggering the epigenetic regulator demethylase 1B (KDM1B) to promote an adaptive, yet reversible, transcriptional rewiring of cancer cells towards stemness and immune escape. Accordingly, KDM1B inhibition prevents the appearance of IFN-I-induced CSCs, both in vitro and in vivo. Notably, IFN-I-induced CSCs are heterogeneous in terms of multidrug resistance, plasticity, invasiveness and immunogenicity. Moreover, in breast cancer (BC) patients receiving anthracycline-based chemotherapy, KDM1B positively correlated with CSC signatures. Our study identifies an IFN-I -> KDM1B axis as a potent engine of cancer cell reprogramming, supporting KDM1B targeting as an attractive adjunctive to immunogenic drugs to prevent CSC expansion and increase the long-term benefit of therapy.Type I interferons have been described to have protumor or antitumor functions depending on context. Here the authors show a protumor function for type I interferons in that they promote cancer stem cells by upregulating the chromatin remodeling factor KDM1B

Apoptotic cell death in disease-Current understanding of the NCCD 2023

Apoptosis is a form of regulated cell death (RCD) that involves proteases of the caspase family. Pharmacological and genetic strategies that experimentally inhibit or delay apoptosis in mammalian systems have elucidated the key contribution of this process not only to (post-)embryonic development and adult tissue homeostasis, but also to the etiology of multiple human disorders. Consistent with this notion, while defects in the molecular machinery for apoptotic cell death impair organismal development and promote oncogenesis, the unwarranted activation of apoptosis promotes cell loss and tissue damage in the context of various neurological, cardiovascular, renal, hepatic, infectious, neoplastic and inflammatory conditions. Here, the Nomenclature Committee on Cell Death (NCCD) gathered to critically summarize an abundant pre-clinical literature mechanistically linking the core apoptotic apparatus to organismal homeostasis in the context of disease