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Détermination du débit de filtration glomérulaire chez le chien par le calcul de la clairance plasmatique de la créatinine exogène
Le diagnostic de l’insuffisance rénale chronique (IRC) est souvent tardif et de mauvais pronostic. Les manifestations cliniques apparaissent lorsque 75% de la masse fonctionnelle rénale est lésée. Une exploration fonctionnelle précoce est donc primordiale. Le débit de filtration glomérulaire (DFG) est la variable physiologique d’intérêt pour évaluer la fonction rénale.
Après une étude des principales caractéristiques histologiques et physiologiques de la fonction rénale (et plus précisément de la filtration glomérulaire), l’auteur développe l’évaluation du DFG par la mesure de la clairance urinaire de la créatinine endogène et exogène et par la mesure de la clairance plasmatique de la créatinine exogène. Le principe de clairance étant le plus adapté à la détermination du DFG, les techniques de la réalisation des clairances sont abordées dans le détail.
Dans ce travail, la clairance plasmatique de la créatinine, injectée en bolus par voie intraveineuse, est comparée aux clairances urinaires et plasmatiques des marqueurs les plus conventionnels (inuline, iothalamate).
Les résultats obtenus confirment que la clairance plasmatique de la créatinine exogène est un bon indicateur du DFG chez le chien sain. Ce test est en outre facilement réalisable
Long-Term Intranasal Nerve Growth Factor Treatment Favors Neuron Formation in de novo Brain Tissue
ObjectiveTo date, no safe and effective pharmacological treatment has been clinically validated for improving post-stroke neurogenesis. Growth factors are good candidates but low safety has limited their application in the clinic. An additional restraint is the delivery route. Intranasal delivery presents many advantages.Materials and MethodsA brain lesion was induced in twenty-four rats. Nerve growth factor (NGF) 5 μg/kg/day or vehicle was given intranasally from day 10 post-lesion for two periods of five weeks, separated by a two-week wash out period with no treatment. Lesion volume and atrophy were identified by magnetic resonance imaging (MRI). Anxiety and sensorimotor recovery were measured by behavior tests. Neurogenesis, angiogenesis and inflammation were evaluated by histology at 12 weeks.ResultsRemarkable neurogenesis occurred and was visible at the second and third months after the insult. Tissue reconstruction was clearly detected by T2 weighted MRI at 8 and 12 weeks post-lesion and confirmed by histology. In the new tissue (8.1% of the lesion in the NGF group vs. 2.4%, in the control group at 12 weeks), NGF significantly increased the percentage of mature neurons (19% vs. 7%). Angiogenesis and inflammation were not different in the two groups. Sensorimotor recovery was neither improved nor hampered by NGF during the first period of treatment, but NGF treatment limited motor recovery in the second period.InterpretationThe first five-week period of treatment was very well tolerated. This study is the first presenting the effects of a long treatment with NGF and has shown an important tissue regeneration rate at 8 and 12 weeks post-injury. NGF may have increased neuronal differentiation and survival and favored neurogenesis and neuron survival through subventricular zone (SVZ) neurogenesis or reprogramming of reactive astrocytes. For the first time, we evidenced a MRI biomarker of neurogenesis and tissue reconstruction with T2 and diffusion weighted imaging
Comparing the genetic architecture and potential response to selection of invasive and native populations of reed canary grass
Evolutionary processes such as migration, genetic drift, and natural selection are thought to play a prominent role in species invasions into novel environments. However, few empirical studies have explored the mechanistic basis of invasion in an evolutionary framework. One promising tool for inferring evolutionarily important changes in introduced populations is the genetic variance–covariance matrix (G matrix). G matrix comparisons allow for the inference of changes in the genetic architecture of introduced populations relative to their native counterparts that may facilitate invasion. Here, we compare the G matrices of reed canary grass (Phalaris arundinacea L.) populations across native and invasive ranges, and between populations along a latitudinal gradient within each range. We find that the major differences in genetic architecture occur between populations at the Northern and Southern margins within each range, not between native and invasive populations. Previous studies have found that multiple introductions in introduced populations caused an increase in genetic variance on which selection could act. In addition, we find that differences in the evolutionary potential of Phalaris populations are driven by differences in latitude, suggesting that selection also shapes the evolutionary trajectory of invasive populations
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Cryptic diversity in a fig wasp community-morphologically differentiated species are sympatric but cryptic species are parapatric
A key debate in ecology centres on the relative importance of niche and neutral processes in determining patterns of community assembly with particular focus on whether ecologically similar species with similar functional traits are able to coexist. Meanwhile, molecular studies are increasingly revealing morphologically indistinguishable cryptic species with presumably similar ecological roles. Determining the geographic distribution of such cryptic species provides opportunities to contrast predictions of niche versus neutral models. Discovery of sympatric cryptic species increases alpha diversity and supports neutral models, while documentation of allopatric/parapatric cryptic species increases beta diversity and supports niche models. We tested these predictions using morphological and molecular data, coupled with environmental niche modelling analyses, of a fig wasp community along its 2700 km latitudinal range. Molecular methods increased previous species diversity estimates from eight to eleven species, revealing morphologically cryptic species in each of the four wasp genera studied. Congeneric species pairs that were differentiated by a key morphological functional trait (ovipositor length) coexisted sympatrically over large areas. In contrast, morphologically similar species, with similar ovipositor lengths, typically showed parapatric ranges with very little overlap. Despite parapatric ranges, environmental niche models of cryptic congeneric pairs indicate large regions of potential sympatry, suggesting that competitive process are important in determining the distributions of ecologically similar species. Niche processes appear to structure this insect community and cryptic diversity may typically contribute mostly to beta rather than alpha diversity
Diversification and spatial structuring in the mutualism between Ficus septica and its pollinating wasps in insular South East Asia
Odours in plant-insect interactions beyond communication. Application to the Ficus-pollinator-parasite model and consequences for the understanding of coevolutionary processes
Les odeurs émises par les plantes sont souvent interprétées dans le cadre de leur interaction avec les insectes pollinisateurs, herbivores et ennemis naturels, en tant que signaux de communication dont la fonction est l'attraction ou la répulsion de ces insectes. Pourtant, la communication a une définition précise en biologie évolutive, et le terme « signal » ne doit s'appliquer qu'à des traits de l'émetteur qui ont été sélectionnés dans le cadre de l'interaction avec le récepteur par voie sensorielle. De plus, certaines études démontrent que les Composés organiques volatils (COV) émis par les feuilles participent à la défense des plantes contre divers stress abiotiques (notamment stress oxydant et thermique) et biotiques (pathogènes, induction des défenses). L'idée de cette thèse, c'est d'essayer de faire rentrer l'ensemble de ces contextes et fonctions potentielles dans un cadre commun. En utilisant comme modèle les figuiers, leurs pollinisateur et parasites spécialistes, j'ai choisi comme approche de comparer les variations des odeurs de figue à celles de odeurs de feuille, au cours du développement des figues et au cours d'une journée. Dans les deux cas, les feuilles constituent un témoin permettant de déterminer si les variations observées peuvent être adaptatives vis-à-vis de l'interaction avec les insectes, mais aussi de considérer explicitement les fonctions potentielles des odeurs émises en dehors de la réceptivité. Ainsi, les fonctions de protection contre les stress habituellement attribuées aux odeurs de feuilles sont également pertinentes pour les odeurs de figues. A partir de là, le constat que le concept de communication n'est pas pertinent pour décrire le rôle des odeurs dans les interactions figuier-parasite permet de développer une réflexion sur la manière dont les phytophages et leurs ennemis naturels sont susceptibles d'influer sur l'évolution des odeurs émises par les plantes. Enfin, dans le cas de la communication olfactive figuier-pollinisateur, l'étude du cas de Ficus septica, chez qui deux pollinisateurs écologiquement différenciés coexistent, permet d'imaginer un mécanisme potentiel de co-spéciation écologique dans lequel la divergence des modalités de communication olfactive participerait à la mise en place de l'isolement reproducteur.The scents emitted by plants are often interpreted in the light of their interaction with pollinators, phytophagous insects and their natural ennemies, as communication signals whose function is to attract or repel those insects. However, according to the adaptive definition of communication, a trait can be called “signal” only if it has been selected for the sensory interaction with a receptor. In addition, it has been shown that the volatile organic compounds (VOC) emitted by leaves participate to the defense of the plant against abiotic (especially oxidative/heat stress) and biotic stresses (pathogens, induction of defenses). The idea underlying this thesis it to put all all the contexts of emission and functions together within a common framework. Using the fig-pollinator-parasite model, the approach I choose was to compare the variation of fig scent with that of leaf scent, along their development and daily. In both cases, leaf scent is a control trait that allows to determine if the variations observed in figs are possibly adaptive regarding the interaction with insects, and to explicitely consider the potential functions of the scents emitted out of receptivity. Stress-protective functions that are evidenced in leaf scents are thus also relevant in figs. Then, the fact that communication is not relevant to describe the role of scents in the fig-parasite interaction led me to develop a reflection on the way phytophagous insects and their natural enemies could influence the evolution of plant scents. Finally, in the case of fig-pollinator communication, studying the case of Ficus septica, that is associated to two co-occuring ecologically differenciated pollinators, allows to imagine a potential co-speciation mechanism, where the divergence of communication mode would contribute to the establishment of reproductive isolation
Caractérisations biochimiques et structurales d’une métacaspase et d’une enzyme branchante de glucane en alpha-(1,4) chez Candida glabrata
Infections caused by various Candida species have dramatically increased during the recent years, especially in hospitals where they are held accountable for a high mortality rate. Along with Candida albicans, Candida glabrata is one of the most prevailing pathogenic yeasts to humans. To date, antifungal compounds used in treatment present numerous resistance phenomena requiring the identification of new therapeutic targets. In order to explore new pathways, we focused on a metacaspase from C. glabrata. These cysteine proteases are structural homologues of caspases and effectors of regulated cell death, a physiological process aiming at maintaining cellular homeostasis in metazoans and yeasts. Structural, functional and enzymatic studies have allowed us to elucidate that the maturation process of the enzyme follows a trans mechanism, with the associated structural reorganization and its activation, both processes being dependent on the presence of calcium ions. We also studied an alpha-(1,4)-glucan branching enzyme from the GH13_8 subfamily. This latter is involved in the energy metabolism of glycogen and more precisely in the introduction of alpha-(1,6) glucose branching points. Biochemical and structural studies allowed determining the resolution of the three-dimensional structure of the enzyme in a free form and in complex with a maltotriose. We moreover highlighted structural features of the enzyme only present in yeasts and more particularly in the Saccharomycotina phyllum.Les infections causées par diverses espèces Candida ont considérablement augmenté ces dernières années notamment dans un cadre hospitalier où elles entrainent une forte mortalité. Parallèlement à Candida albicans, Candida glabrata est l’une des levures pathogènes ayant la plus forte prévalence chez l’humain. À ce jour, les composés antifongiques utilisés en traitement présentent de nombreux phénomènes de résistance nécessitant l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques. Afin d’explorer de nouvelles voies, nous nous sommes intéressés à la métacaspase de C. glabrata. Ces protéases à cystéines sont des homologues structuraux des caspases et des effecteurs de la mort cellulaire régulée, un processus physiologique visant à maintenir l’homéostasie cellulaire chez les métazoaires et les levures. L’étude structurale, fonctionnelle et enzymatique a permis d’élucider le déroulement de la maturation de l’enzyme dans un mécanisme trans avec ses changements structuraux associés, ainsi que son activation, les deux processus étant dépendants de la présence d’ions calcium. Nous avons également étudié une enzyme branchante de glucane en alpha-(1,4) de la sous famille des GH13_8. Ces dernières sont impliquées dans le métabolisme énergétique du glycogène et plus particulièrement dans l’introduction de ramifications via la création de liaisons alpha-(1,6). L’étude biochimique et structurale a permis la résolution de la structure tridimensionnelle de l’enzyme sous une forme libre et en complexe avec un maltotriose. Nous avons également mis en évidence des particularités structurales de l’enzyme propres aux levures et plus particulièrement au phyllum des Saccharomycotina
Biochemical and structural characterization of a metacaspase and an alpha-(1,4) glucan branching enzyme
Les infections causées par diverses espèces Candida ont considérablement augmenté ces dernières années notamment dans un cadre hospitalier où elles entrainent une forte mortalité. Parallèlement à Candida albicans, Candida glabrata est l’une des levures pathogènes ayant la plus forte prévalence chez l’humain. À ce jour, les composés antifongiques utilisés en traitement présentent de nombreux phénomènes de résistance nécessitant l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques. Afin d’explorer de nouvelles voies, nous nous sommes intéressés à la métacaspase de C. glabrata. Ces protéases à cystéines sont des homologues structuraux des caspases et des effecteurs de la mort cellulaire régulée, un processus physiologique visant à maintenir l’homéostasie cellulaire chez les métazoaires et les levures. L’étude structurale, fonctionnelle et enzymatique a permis d’élucider le déroulement de la maturation de l’enzyme dans un mécanisme trans avec ses changements structuraux associés, ainsi que son activation, les deux processus étant dépendants de la présence d’ions calcium. Nous avons également étudié une enzyme branchante de glucane en alpha-(1,4) de la sous famille des GH13_8. Ces dernières sont impliquées dans le métabolisme énergétique du glycogène et plus particulièrement dans l’introduction de ramifications via la création de liaisons alpha-(1,6). L’étude biochimique et structurale a permis la résolution de la structure tridimensionnelle de l’enzyme sous une forme libre et en complexe avec un maltotriose. Nous avons également mis en évidence des particularités structurales de l’enzyme propres aux levures et plus particulièrement au phyllum des Saccharomycotina.Infections caused by various Candida species have dramatically increased during the recent years, especially in hospitals where they are held accountable for a high mortality rate. Along with Candida albicans, Candida glabrata is one of the most prevailing pathogenic yeasts to humans. To date, antifungal compounds used in treatment present numerous resistance phenomena requiring the identification of new therapeutic targets. In order to explore new pathways, we focused on a metacaspase from C. glabrata. These cysteine proteases are structural homologues of caspases and effectors of regulated cell death, a physiological process aiming at maintaining cellular homeostasis in metazoans and yeasts. Structural, functional and enzymatic studies have allowed us to elucidate that the maturation process of the enzyme follows a trans mechanism, with the associated structural reorganization and its activation, both processes being dependent on the presence of calcium ions. We also studied an alpha-(1,4)-glucan branching enzyme from the GH13_8 subfamily. This latter is involved in the energy metabolism of glycogen and more precisely in the introduction of alpha-(1,6) glucose branching points. Biochemical and structural studies allowed determining the resolution of the three-dimensional structure of the enzyme in a free form and in complex with a maltotriose. We moreover highlighted structural features of the enzyme only present in yeasts and more particularly in the Saccharomycotina phyllum
Etude comparative de la tomodensitométrie et de l imagerie par résonance magnétique dans le diagnostic des tumeurs intracrâniennes chez le chien et le chat
Les techniques d imagerie médicale modernes sont utilisées dans l exploration des affections intracrâniennes chez l homme et se développent en médecine vétérinaire. Malgré des inégalités d accès dues au manque d infrastructures et au coût élevé de réalisation de ces examens, la tomodensitométrie et l imagerie par résonance magnétique (IRM) sont devenues les examens complémentaires de choix lors de troubles neurologiques d origine centrale intracrânienne chez le chien et le chat. Si la tomodensitométrie (TDM) fournit une représentation précise des détails osseux, l IRM offre une très bonne visualisation de l anatomie des structures parenchymateuses de l encéphale grâce à son excellente résolution en contraste. Cependant, les modalités de réalisation diffèrent entre ces deux techniques. D autre part, l allongement de la durée de vie de nos animaux de compagnie et l implication croissante de leur propriétaire autorisent le diagnostic précis et la prise en charge thérapeutique du patient vétérinaire suspect d affection néoplasique intracrânienne. Afin de mieux connaître les corrélations existant entre les indices fournis par l IRM et la TDM dans le diagnostic des tumeurs intracrâniennes chez le chien et le chat, nous avons comparé les images fournies par ces deux techniques pour une série de cas spontanés de tumeurs intracrâniennes confirmés histologiquement. Nos observations montrent que i) la performance diagnostique globale de ces deux techniques est comparable, ii) l IRM fournit des renseignements plus précis sur l architecture de la tumeur (sauf en ce qui concerne sa minéralisation, mieux représentée en TDM) et les répercussions de sa croissance sur l anatomie de l encéphale (engagements, hydrocéphalie), iii) pour certains types tumoraux (macroadénome hypophysaire, tumeurs de la gaine du nerf trijumeau), les images sont très similaires d un cas à l autre alors qu il est très difficile de dégager des tendances communes pour d autres types tumoraux (gliomes). De plus, nous avons été confrontés (iv) à des lésions très difficilement classables au seul vu de l IRM et de la TDM.TOULOUSE-EN Vétérinaire (315552301) / SudocSudocFranceF
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