Microbiome overview in swine lungs

Mycoplasma hyopneumoniae is the etiologic agent of swine enzootic pneumonia. However other mycoplasma species and secondary bacteria are found as inhabitants of the swine respiratory tract, which can be also related to disease. In the present study we have performed a total DNA metagenomic analysis from the lungs of pigs kept in a field condition, with suggestive signals of enzootic pneumonia and without any infection signals to evaluate the bacteria variability of the lungs microbiota. Libraries from metagenomic DNA were prepared and sequenced using total DNA shotgun metagenomic pyrosequencing. The metagenomic distribution showed a great abundance of bacteria. The most common microbial families identified from pneumonic swine’s lungs were Mycoplasmataceae, Flavobacteriaceae and Pasteurellaceae, whereas in the carrier swine’s lungs the most common families were Mycoplasmataceae, Bradyrhizobiaceae and Flavobacteriaceae. Analysis of community composition in both samples confirmed the high prevalence of M. hyopneumoniae. Moreover, the carrier lungs had more diverse family population, which should be related to the lungs normal flora. In summary, we provide a wide view of the bacterial population from lungs with signals of enzootic pneumonia and lungs without signals of enzootic pneumonia in a field situation. These bacteria patterns provide information that may be important for the establishment of disease control measures and to give insights for further studies

An emerging clone, KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae ST16, associated with high mortality rates in a CC258 endemic setting

Background Carbapenemase-producing K. pneumoniae have become a global priority, not least in low-middle income countries. Here, we report the emergence and clinical impact of a novel KPC-K. pneumoniae ST16 clone in a Clonal Complex (CC)258 endemic setting. Methods In a teaching Brazilian hospital, a retrospective cohort of adult KPC-KP bloodstream infections (BSI) cases (January 2014 to December 2016) was established to study the molecular epidemiology and its impact on outcome (30-day all-cause mortality). KPC-KP isolates were MLST-typed. Survival analysis between ST/CC groups and risk factors for fatal outcome (logistic regression) were evaluated. Representative isolates underwent whole genome sequencing (WGS), and had their virulence tested in a Galleria larvae model. Results One hundred sixty-five unique KPC-KP BSI cases were identified. CC258 was predominant (66%), followed by ST16 (12%). The overall 30-day mortality rate was 60%; in contrast, 95% of ST16 cases were fatal. Patient’s severity scores were high and baseline clinical variables were not statistically different across ST’s. In multivariate analysis, ST16 (OR 21.4; CI95% 2.3-202.8; p=0,008) and septic shock (OR 11.9; CI95% 4.2-34.1; p<0,001) were independent risk factors for fatal outcome. ST16 clone carried up to 14 resistance genes, including blaKPC-2 in an IncFIBpQIL plasmid, KL51 capsule and Yersiniabactin virulence determinants. ST16 clone was highly pathogenic in the larvae model. Conclusions Mortality rates were high in this KPC-KP BSI cohort, where CC258 is endemic. An emerging ST16 clone was associated with high mortality. Our results suggest that even in endemic settings, highly virulent clones can rapidly emerge demanding constant monitoring

Hemangioblastoma - cordão cervical: Hemangioblastoma - cervical cord

Introdução: Os Hemangioblastomas são tumores de origem vascular que podem prejudicar o sistema nervoso central, com&nbsp; um pico de incidência na quarta década de vida. Apresentação do caso: Paciente de 24 anos, feminino,&nbsp; procedente do centro-oeste do Brasil, apresenta há 2 anos, pequena massa na região cervical com crescimento lento. Há 1 ano, associa-se forte dor nos ombros e cefaleia, além de redução gradual da sensibilidade em mãos e pés. Ao exame, redução da sensibilidade tátil, térmica e dolorosa em membros. Realizada Ressonância magnética com evidência de lesões&nbsp; nodulares de realce homogêneo, associando-se a cisto. Discussão: A clínica dos hemangiomas varia de acordo com a localização do tumor e do efeito de massa, sendo a cefaléia o sintoma mais comum, seguido por náuseas, vertigem, e diplopia. O diagnóstico é realizado através de angiografia, tomografia computadorizada e ressonância magnética. A terapia empregada é a remoção cirúrgica por excisão tumoral. Conclusão: Por meio de uma identificação imediata de infiltração tumoral ou a presença de células tumorais residuais, em que se observa a frequência de uma pequena quantidade de células tumorais pode levar à recorrência tumoral sendo por isso importante remover completamente os hemangioblastomas

Síndrome de Bruns: Bruns Syndrome

Introdução: A síndrome de Bruns é uma manifestação rara de uma neurocisticercose (NCC) intraventricular.&nbsp; A NCC é causada pela larva da Tenia solium, por meio da contaminação fecal-oral, e caracteriza-se como uma das possíveis infecções helmínticas do sistema nervoso central. A doença possui maior prevalência em países de baixa renda, onde há precariedade no sistema de saneamento básico, além de ser uma das causas de convulsões no mundo. Apresentação do caso: Paciente do sexo masculino, 47 anos, admitido no Pronto Socorro da Santa Casa de Campo Grande, após quadro de crise convulsiva tônico-clonica. História pregressa de início há 6 meses de episódios semanais de cefaleia holocraniana intensa, em aperto, associado a náuseas, vômitos e vertigem. Discussão: A síndrome de Bruns consiste em episódios recorrentes de cefaleia intensa, vômitos e vertigens provocadas por movimentos abruptos da cabeça ou pela manobra de Valsava. Tais agravos levam a obstruções periódicas na circulação do líquor e aumentos paroxísticos da pressão intracraniana, devido a uma massa ventricular móvel que provoca hidrocefalia não comunicante. O diagnóstico pode ser difícil, visto que o quadro é inespecífico e depende de fatores como localização&nbsp; das lesões e sistema imune do hospedeiro. Conclusão: Por se tratar de uma forma rara de evolução da neurocisticercose, é necessário atenção quanto a sintomatologia inespecífica. Pois, os casos podem ser negligenciados e evoluírem de forma desfavorável por atraso da terapêutica

The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector

Anopheles darlingi is the principal neotropical malaria vector, responsible for more than a million cases of malaria per year on the American continent. Anopheles darlingi diverged from the African and Asian malaria vectors ∼100 million years ago (mya) and successfully adapted to the New World environment. Here we present an annotated reference A. darlingi genome, sequenced from a wild population of males and females collected in the Brazilian Amazon. A total of 10 481 predicted protein-coding genes were annotated, 72% of which have their closest counterpart in Anopheles gambiae and 21% have highest similarity with other mosquito species. In spite of a long period of divergent evolution, conserved gene synteny was observed between A. darlingi and A. gambiae. More than 10 million single nucleotide polymorphisms and short indels with potential use as genetic markers were identified. Transposable elements correspond to 2.3% of the A. darlingi genome. Genes associated with hematophagy, immunity and insecticide resistance, directly involved in vectorhuman and vectorparasite interactions, were identified and discussed. This study represents the first effort to sequence the genome of a neotropical malaria vector, and opens a new window through which we can contemplate the evolutionary history of anopheline mosquitoes. It also provides valuable information that may lead to novel strategies to reduce malaria transmission on the South American continent. The A. darlingi genome is accessible at www.labinfo.lncc.br/index.php/anopheles- darlingi. © 2013 The Author(s)

A De Novo Cryptic 5p Deletion And 9p Duplication Detected By Subtelomeric Mlpa In A Boy With Cri Du Chat Syndrome.

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Draft Genome Sequences of Six Actinobacillus pleuropneumoniae Serotype 8 Brazilian Clinical Isolates: Insight into New Applications

Actinobacillus pleuropneumoniae is the causative agent of swine pleuropneumonia, a highly contagious disease associated with pigs of all ages that results in severe economic losses to the industry. Here, we report for the first time six genome sequences of A. pleuropneumoniae clinical isolates of serotype 8, found worldwide

Composição química e eficácia do óleo essencial e do extrato etanólico de Alpinia zerumbet sobre Staphylococcus aureus

RESUMO: O presente trabalho descreve a atividade antibacteriana do óleo essencial e do extrato etanólico das folhas de Alpinia zerumbet (colônia) sobre cepas de Staphylococcus aureus isoladas de vacas com mastite subclínica e cepas padrão ATCC 29213 e ATCC 25923, por meio do método de difusão em ágar. Foram utilizados 10 tratamentos contendo diferentes concentrações do óleo essencial e do extrato etanólico (100,0; 50,0; 25,0; 12,5 e 6,3 mg.mL-1) e o grupo controle (álcool etílico a 50% e Tween a 1%). Os constituintes majoritários do óleo essencial foram p -cimeno (32,72%), 1,8-cineol (24,05%) e 4-terpineol (20,23%), sendo esses determinados por cromatografia a gás acoplada a espectrometria de massas e cromatografia a gás com detector de ionização de chama (CG-EM/DIC). No extrato etanólico foi detectado o ácido elágico e três flavonoides: rutina, quercetina e campferol, por meio de cromatografia a líquido de alta eficiência acoplada a detector de arranjo de diodo (CLAE-DAD). Todas as cepas apresentaram sensibilidade aos tratamentos com óleo essencial e extrato etanólico. A melhor resposta foi obtida com o óleo essencial de A. zerumbet que, na concentração de 100 mg.mL-1 proporcionou inibição total do crescimento bacteriano. Esses resultados sugerem o potencial antibacteriano do óleo essencial e do extrato etanólico de A. zerumbet no controle da mastite bovina