FISHprep: A Novel Integrated Device for Metaphase FISH Sample Preparation

We present a novel integrated device for preparing metaphase chromosomes spread slides (FISHprep). The quality of cytogenetic analysis from patient samples greatly relies on the efficiency of sample pre-treatment and/or slide preparation. In cytogenetic slide preparation, cell cultures are routinely used to process samples (for culture, arrest and fixation of cells) and/or to expand limited amount of samples (in case of prenatal diagnostics). Arguably, this expansion and other sample pretreatments form the longest part of the entire diagnostic protocols spanning over 3–4 days. We present here a novel device with an integrated expansion chamber to culture, arrest and fix metaphase cells followed by a subsequent splashing protocol leading to ample metaphase chromosome spreads on a glass slide for metaphase FISH analysis. The device provides an easy, disposable, low cost, integrated solution with minimal handling for metaphase FISH slide preparation

Dynamics of quercetin formation in onion (Allium cepa L.) during vegetation

Onion bulbs (Allium cepa L.) are good sources of flavonoids. The aim of this study was to analyse the changes in dynamics of quercetin formation in three varieties of onions (white, yellow, and red) during the vegetation period. Quercetin content was determined after acid hydrolysis (1.2 M HCl in 50% aqueous methanol) by high-performance liquid chromatography (HPLC). The content of total phenolics was determined using Folin-Ciocalteu reagent (FCR) according to LACHMAN and co-workers (2003). The content of polyphenols in onion ranged from 2893 to 6052 mg kg–1 and the content of quercetin ranged from 52.44 to 280.72 mg kg–1 in fresh matter. The highest content of polyphenols and quercetin was found in the red variety. According to statistical analysis the dynamic of quercetin formation in all cultivars had statistically moderate (P<0.05) increasing tendency. Increasing content of polyphenols was accompanied with slight increase of quercetin, but the differences remained insignificant (P<0.05)

Recent Advances on the Multiplex Molecular Detection of Plant Viruses and Viroids

[EN] Plant viruses are still one of the main contributors to economic losses in agriculture. It has been estimated that plant viruses can cause as much as 50 billion euros loss worldwide, per year. This situation may be worsened by recent climate change events and the associated changes in disease epidemiology. Reliable and early detection methods are still one of the main and most effective actions to develop control strategies for plant viral diseases. During the last years, considerable progress has been made to develop tools with high specificity and low detection limits for use in the detection of these plant pathogens. Time and cost reductions have been some of the main objectives pursued during the last few years as these increase their feasibility for routine use. Among other strategies, these objectives can be achieved by the simultaneous detection and (or) identification of several viruses in a single assay. Nucleic acid-based detection techniques are especially suitable for this purpose. Polyvalent detection has allowed the detection of multiple plant viruses at the genus level. Multiplexing RT polymerase chain reaction (PCR) has been optimized for the simultaneous detection of more than 10 plant viruses/viroids. In this short review, we provide an update on the progress made during the last decade on techniques such as multiplex PCR, polyvalent PCR, non-isotopic molecular hybridization techniques, real-time PCR, and array technologies to allow simultaneous detection of multiple plant viruses. Also, the potential and benefits of the powerful new technique of deep sequencing/next-generation sequencing are described.This work was funded by grant BIO2017-88321-R from the Spanish Direccion General de Investigacion Cientifica y Tecnica (DGICYT) and the Prometeo Program GV2014/010 from the Generalitat Valenciana.Pallás Benet, V.; Sanchez Navarro, JÁ.; James, D. (2018). Recent Advances on the Multiplex Molecular Detection of Plant Viruses and Viroids. Frontiers in Microbiology. 9. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02087S

Exkursioner - ett viktigt inslag på högstadiet? : Lärare och elevers upplevelser av exkursioner i biologi.

Syftet med denna studie är att undersöka hur lärare och elever upplever exkursioner i ämnet biologi och frågeställningarna i denna studie är: Vilka mål har lärarna med exkursioner? Vilka möjligheter och begränsningar upplever de att de har för att uppnå dessa mål? Hur upplever eleverna exkursioner? Vilka mål tror eleverna att lärarna har med exkursioner? Tycker eleverna att de lär sig något under exkursionerna? Detta undersöks genom kvalitativa intervjuer av både lärare och elever på en medelstor högstadieskola i södra Sverige. Lärarnas mål är att få eleverna att känna sig bekväma i naturen samt att de ska förstå hur naturen hänger ihop i ett sammanhang. Samtidigt som de vill att exkursioner ska vara ett roligt sätt att variera undervisningen på. Eleverna upplever exkursioner som roliga och omväxlande samtidigt som de känner en viss rädsla för skog och småkryp. Eleverna uppfattar även lärarnas mål om att de ska bli mer bekanta med naturen. Både lärarna och eleverna upplever en viss kunskapsökning genom att de minns händelser bättre när de får uppleva dem. Lärarna ser vissa problem med exkursioner såsom tidsbrist, schematekniska problem och en viss problematik med koncentrationen bland eleverna på grund av många oväntade störmoment. Lärarna påpekar vikten av deras motivation som den största begränsningen. Tidigare forskning visar på en hel del likheter med denna studies resultat av lärares mål och syn på exkursioner den visar också att exkursioner leder till ökat lärande samt att de förbättrar elevernas attityder gentemot ämnet. Både lärare och elever i denna studie är överens om att exkursioner är något som de borde göra oftare eftersom de upplever att eleverna är ovana i naturen. Trots att både lärarna och eleverna är överens om att det behövs fler exkursioner så utförs det inte så många exkursioner som lärarna önskar. Skolan borde ha ett informationsmöte för lärare där vikten av att utföra exkursioner framhålls för att öka motivationen hos lärarna

Nattaktivitet hos Dvärgflodhästar (Hexaprotondon liberiensis) på Parken Zoo i Eskilstuna våren 2010.

Dvärgflodhästen (Hexaprotondon liberiensis) lever i Västafrika där den upptäcktes på 1800-talet, men det var inte förrän på 1900- talen som de introducerades första gången i djurpark. Studier på vilda dvärgflodhästen har visat sig vara svåra att genomföra, därför har de flesta studier gjorts på dvärgflodhästar i fångenskap. Dvärgflodhästen är ett mycket skyggt djur som lever i regnskogarna runt floder, träsk och sumpmarker. Den är ett nattlevande djur som ofta lever solitärt.   I den här studien studeras tre utvalda dvärgflodhästar på parken zoo i Eskilstuna, vad de har för nattaktivitet och hur de använder sig utav miljöberikningen. Leah, Anton och Krakunia var de tre observerade dvärgflodhästarna.     Videokameror sattes upp för att filma fyra nätter för varje individ från kl. 16.00- 03.00. Ett protokoll fördes vart tionde minut och deras aktivitet antecknades. Dessa resultat sammanställdes i beskrivande text och jämfördes sedan med varandra i diagram. Diagram visade bland annat att Leah använde sin pool mest av alla, Anton var den mest aktiva och nyfikna medan Krakunia knappt rörde sin miljöberikning.   Varför finns dessa skillnader? Har deras ålder, kön eller utseende på rummet någon betydelse? Hur skulle man kunna förbättra miljöberikningen i dvärgflodhästarnas rum? Eftersom de är utrotningshotade är det viktigt att man gör några åtgärder och försöker bevara deras naturliga miljö i den mån det är möjligt. Kan man med hjälp av djurparken återinföra dvärgflodhästar i naturen? Enligt en artikel skulle det kunna vara möjligt.

Factors affecting heavy metals accumulation in potato tubers / Czynniki wpływające na akumulację metali ciężkich w bulwach ziemniaka

Badano wpływ wybranych czynników agrochemicznych na akumulację metali ciężkich w bulwach ziemniaka. Gleby uprawne mogą być zanieczyszczone metalami ciężkimi. Pierwiastki, które występują w glebach w formach biodostępnych (mobilnych) mogą zostać włączone do obiegu biologicznego, mając tym samym negatywny wpływ na jakość plonów i zdrowie konsumentów/ człowieka. W badanych glebach oznaczono całkowitą zawartość: Zn, Cu, Ni, Pb, Cd oraz udział tych pierwiastków w formach mobilnych. Spośród badanych pierwiastków najbardziej mobilnym metalem był ołów, którego zakres zawartości w formach mobilnych wynosił: 0,100-0,295 mg∙kg-1, przekraczając dopuszczalne wartości dla tego pierwiastka. Zawartość ołowiu w ziemniakach wynosiła: 0.244-0.855 mg∙kg-1 FM. Analiza statystyczna wykazała istotną korelację pomiędzy zawartością pierwiastków w formach mobilnych i ich zawartością w ziemniakach oraz między odczynem badanych gleb, a całkowitą zawartością ołowiu w ziemniakach. Nie zaobserwowano istotnej statystycznie korelacji pomiędzy zawartością próchnicy w glebach a zawartością ołowiu w ziemniakac

Changes of Polyphenolic Substances in the Anatomical Parts of Buckwheat (Fagopyrum esculentum Moench.) during Its Growth Phases

In this study the changes of total polyphenolics in different anatomical parts (stems, leaves, flowers and seeds) of common buckwheat (Fagopyrum esculentum Moench.) during vegetation period were analysed. The content of total polyphenolics was evaluated in growth phase I (formation of buds), phase II (at the beginning of flowering), phase III (full blossoming) and phase IV (full ripeness). In all growth phases (GP) the stems and leaves were evaluated and statistically significant differences in polyphenolics content between the two parts were confirmed. Statistically significant differences (p &lt; 0.01) in polyphenolics content (in GP II and III) between stems and leaves; and between stems and flowers were found. In flowers an average of 13.8 times higher and in leaves 6 times higher concentration of polyphenolics in comparison with stems was measured. In GP III the content of polyphenolics in common buckwheat was following: flowers &gt; leaves &gt; achene &gt; stems. In flowers an average of 11.9 times higher, in leaves 8.3 times higher and in achenes 5.9 times higher contents of polyphenolics compared with stems were found. In GP III and IV (leaves, achenes, stems) the leaves contained in average 20 times higher and achenes 5.6 times higher polyphenolics than stems