The role of Rac1-modulated gene transcription in tumorigenesis

Dissertation presented to obtain the Ph.D degree in BiologyGene expression regulation is a dynamic and multi-step process, in which transcription plays a major role. Transcription initiation depends on binding of transcription regulators to DNA elements located in promoter or enhancer regions, a process often controlled by signalling pathways. One such pathway is regulated by Rac1, a member of the Rho family of small GTPases involved in cell proliferation, adhesion and migration. In this work, novel links between Rac1 signalling and transcriptional regulation in colorectal tumour cells are described. First, it is shown that Rac1 activation leads to PAK1-mediated phosphorylation of the transcriptional repressor BCL-6 in colorectal cancer cells, inactivating its repressor function. In the presence of active Rac1, BCL-6 redistribution within the nucleus, a reduction in its affinity to chromatin and increased expression of the endogenous target genes NFKB1 and CD44, and of a BCL-6-controlled luciferase reporter construct were observed. Next, it was found that Rac1 signalling promotes gene transcription by inducing a transcriptional switch from the repressor BCL-6 to the activator STAT5A at the promoter of certain target genes. Using chromatin immunoprecipitation, it is demonstrated in different colorectal cell lines that active Rac1 promotes release of BCL-6 with concomitant nuclear translocation and binding of STAT5A at the same promoter site. Three endogenous cell-cycle-related genes (CCND2, CDKN2B, SUMO1) were identified to be inversely regulated by BCL-6 and STAT5A and shown to respond to Rac1 signalling with promoter occupancy switches that correlate directly with changes in their expression levels.(...)This work was supported by a PhD fellowship (SFRH/BD/29789/2006) awarded to Patrícia Barros by the Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT)

Design´s intrinsic influence in the creation of reality. A semiotic analysis on the relation between design and reality within the context of our current hypermobile era

À medida que as inovações tecnológicas se multiplicam a um ritmo acelerado, é possível observar como as fronteiras entre o mundo físico e o mundo do ciberespaço estão se a tornar cada vez mais tênues. Ao observar como os dispositivos tecnológicos se vão fundindo em nossa sociedade, percebe-se como os seres humano tem vindo a evoluir como seres ubíquos, capazes de estar em vários lugares ao mesmo tempo. Tendo entrado nesta chamada era da Hipermobilidade, não somos mais capazes de apenas nos movimentar nos espaços físicos, mas viemos ganhar também a capacidade de navegar pelos ciberespaços. À medida que a tecnologia se complexifica, o espaço vai ganhando um aspeto multidimensional, desencadeando mudanças nas regras espaciais como as conhecemos. Levantando ao mesmo tempo questões sobre a nossa perceção da própria realidade. O design, também desempenha um papel importante na vida humana, tanto na forma como percebemos o nosso mundo, como na forma como o navegamos e experienciamos. Assim, esta investigação busca explorar essa relação intrínseca que o design tem com a criação da realidade em que vivemos. Para tanto, realiza-se a análise de um estudo de caso, propondo a semiótica de Charles S. Peirce como metodologia de análise científica.As technological innovations multiply at fast rates, it can be observed how the borders between the physical world and the cyber world are becoming blurry. When observing how technological devices keep blending within our society, it can be perceived how human kind has evolved into ubiquitous beings, who are able to be at multiple places at the same time. As we entered this so called era of hypermobility, not only are we able to move around physical spaces, but we also gained the ability to navigate through cyberspaces. As technology complexifies, a multidimensional aspect of space emerges, triggering changes within the spatial rules as we know them, while also rising questions about our perception of reality itself. Design, also plays an important role in human life, both in how we perceive our world, as well as how we navigate and experience it. Therefore, this investigation seeks to explore this intrinsic relation that design has with the creation of the reality we live in. To do so, the analysis of a case study is conducted by proposing Charles S. Peirce’s semiotic as a scientific analysis methodology

Juventude cibernativa e as novas relações com o ensino e a aprendizagem

Anais do XVII Congresso Internacional das Jornadas de Educaão História - teoria, pesquisa e prática - I Encontro da AIPEDH - Associação Iber-Americana de Pesquisadores em Educação História, realizado pela Universidade Federal da Integração Latino-Americana, entre 02, 03 e 04 de agosto de 2017.O presente trabalho tem como objetivo geral analisar o processo de ensino e aprendizagem no contexto da cibercultura, formadora de uma nova subjetividade coadunada a pós- modernidade, expressa pela juventude contemporânea. A juventude atrelada à cultura digital apresenta expectativas e saberes diferenciados das gerações anteriores em relação ao processo educacional. Para a realização do presente estudo, de cunho qualitativo, serão estabelecidas interlocuções com a psicologia, a comunicação, a sociologia e a história, a exemplo, perscrutando as novas relações educacionais frente ao horizonte de possibilidades do devir. Tratamos aqui, de repensar o processo ensino-aprendizagem sob a égide das mudanças paradigmáticas postuladas pela cibercultura, conferindo novos sentidos, reconfigurando espaços e, também, reagindo à liquidez da pós-modernidade em prol de uma educação não apenas consonante às tecnologias, mas também humanista e aberta à complexidade e diversidade dos “meios e mensagens” que a contemporaneidade nos trazUNESPAR-Paranagu

The pricing of secured non-performing loans: lessons from an internship

The present document refers to a study conducted at Arrow Global Group - White Star Asset Solutions (WS), in the form of an internship. The subject was the pricing of secured Non-performing loans (NPL), in particular, the time to recover debt. The methodology selected was to follow a statistical approach, recurring to external and internal data to elaborate estimations. In particular, external factors such as macroeconomics, judicial procedures, civil law and court type are considered in the analysis, and the parameters, that were part of the time matrix in use, are revisited from a different perspective to compile a new time matrix. Relying on this time matrix one can predict the debt recovery moment, which has a direct influence on the pricing of the portfolios under management by WS. This is an important topic since it is at the core of WS’ activities. At a more general level, the work undertaken during the internship is valuable to the investment community at large. In particular, investors operating in this market seek to acquire portfolios with a good recovery percentage and high return on investment. The methodology employed and the results uncovered seem to suggest that the new time matrix, that was developed, may help achieve these two objectives.O presente relatório refere ao estágio efetuado na empresa Arrow Global Group – Whitestar Asset Solutions (WS), tendo como objetivo o estudo de Non-performing Loans (NPL) Pricing e fatores preponderantes no cálculo do valor recuperável da dívida em mora, como parte integrante de uma carteira de crédito. O fator de maior foco foi o tempo de recuperação de dívida, sendo este primordial para a tomada de decisão de investimento. Os investidores, que adquirem estas carteiras de crédito, procuram informação a respeito dos montantes expectáveis de retorno, com incidência no ponto da linha temporal em que ocorre o retorno do seu investimento. Estas estimativas são, portanto, pontos de interesse do trabalho desenvolvido na WS. A WS é uma empresa de gestão de carteiras de crédito e imobiliário, líder em Portugal, e a única capaz de oferecer um serviço integrado e completo de gestão de ativos para investidores e originadores. Trata-se uma empresa especializada na gestão de crédito, oferecendo um serviço completo e integrado de gestão de portfólios. As carteiras incluem NPL, sendo, na sua maioria secured NPL. Assim, o estudo incide em secured NPL, que se pode resumir como NPL garantido por bens imobiliários. A recuperação da dívida, incluída nestes portfólios, constitui o principal negócio da WS. Nesta medida, a estimativa dos valores passíveis de serem recuperados e o tempo de recuperação de dívida, são, necessariamente, parte integrante das mais eminentes atividades para investimento de recursos de natureza técnica e humana. A estrutura organizacional da WS identifica-se pela cooperação entre departamentos chave visando a criação de lucros. A WS tem um departamento de Due Diligence dedicado somente a esta área de negócio. Nestas equipas incluem-se advogados que monitorizam e incitam os processos judiciais, com a finalidade de recuperar dívida. A metodologia escolhida para formalizar estimativas de preço e tempo de recuperação de dívida pode variar. A WS desenvolveu modelos de pricing apoiados em estudos realizados na empresa; os acedidos diferem em resultados e assunções, embora a metodologia não difira significativamente. Procura-se, no presente estudo, analisar outras perspetivas e correlacionar outros fatores, de modo a afinar a estimativa. Os principais alvos deste estudo sofrem a influência de fatores macroeconómicos. Esta evidência é identificada por diversa pesquisa na matéria e as correlações entre indicadores macroeconómicos e NPL são muito significativas. Os fatores macroeconómicos são apontados como determinantes para a evolução de NPL, verificando-se que indicadores macroeconómicos desfavoráveis potenciam o aumento de NPL. A existência de extensa investigação, nesta matéria, espelha o interesse que provoca. Os estudos indicam relações diretas entre fatores macroeconómicos e NPL, nomeadamente, Produto Interno Produto (PIB), taxa de desemprego e taxa de juro. O pricing de NPL é, também, incluído nesta dinâmica. Sabendo-se que para o pricing de NPL contribuem grandezas como o tempo, pode-se inferir que o tempo de recuperação de dívida está diretamente relacionado com a macroeconomia de um país. Alguns investigadores apontam para uma ligação entre os tempos judiciais e a situação macroeconómica, bem como a quantidade de NPL. Com efeito, verifica-se que nos países onde a economia é menos pujante, e portanto apresentando fatores macroeconómicos mais débeis, a percentagem de NPL é superior, à semelhança dos respetivos tempos de resolução e recuperação de dívida. O estudo que agora se apresenta define matrizes de tempo de retorno de investimento, em termos de recuperação de dívida, seguindo um processo judicial. Assim, as matrizes foram agrupadas por fases do processo litigioso; desta forma, a estimativa torna-se mais aproximada e perceciona-se quais as fases mais morosas. Adicionalmente, é possível verificar o investimento, em termos temporais, que uma determinada fase implica e carece. Esta informação traduz-se numa mais-valia, aquando a gestão de um portfólio, uma vez que os trâmites legais exigem recursos monetários. Esta escalpelização tem particular relevância na determinação de Cash-Flows ao longo do período de gestão do portfólio, não obstante, este cálculo não foi incluído no estudo. A metodologia selecionada debruça-se em métodos estatísticos, os dados recolhidos são tratados estatisticamente, de modo a produzir estimativas do tempo que decorre em cada fase judicial. Dados internos e externos são combinados para melhorar esta estimativa. Relativamente às metodologias e processos para estimar estas grandezas, podem-se identificar alternativas àquela que foi utilizada. Outro método passível de ser adotado é o recurso a software dedicado, sendo os dados tratados e analisados por esta ferramenta, produzindo relatórios Ad hoc e manipulando os dados de forma traduzir a informação em gráficos e tabelas, que evidenciam a sua leitura. Estas ferramentas informáticas permitem criar o que é denominado de business intelligence, suportando as decisões de negócio. Tal abordagem de tratamento de informação constitui uma mais-valia, especialmente, se produzida com a combinação de dados internos e externos, criando uma espécie de inteligência. No entanto, são conhecidas as limitações destas ferramentas, apoiam-se em dados e informação do passado para identificar padrões e efetuar estimativas e previsões. Existem ainda fatores que não são passíveis de ser manipulados por estas ferramentas, deixando, portanto, ainda espaço para o erro. Os algoritmos utilizados para estas aplicações são insuficientes, em termos de capacidade de produção de resultados mais abrangentes; o algoritmo aprende apenas aquilo a que está destinado. Em termos de estimativa e previsão, está-se ainda aquém do que poderia ser considerado um resultado exato. A expetativa é que no futuro (próximo) se possa recorrer ao que neste momento está a ser desenvolvido e se denomina por ‘algoritmo mestre’, parte da aprendizagem das máquinas, também considerada inteligência artificial. Considerando o espetro disponível, a abordagem escolhida foi a mais conservadora e parca em recursos externos, justificada pela natureza do estudo. Consequentemente foi possível definir matrizes, com adequado grau de rigor, em termos de estimativa. Os resultados destas matrizes diferem de outros obtidos anteriormente na WS. Estas diferenças podem ser explicadas pela utilização de premissas diferentes, baseadas em informação recolhida em departamentos cujo espectro de ação não inclui análise de negócio, com efeito, o departamento legal. A identificação da realidade, significado dos processos legais e respetivos trâmites possibilitou a afinação do modelo. A acumulação de mais dados internos contribuiu também para produzir uma melhoria da qualidade do seu processamento

Analysis of the unpleasantness of sounds by schizophrenic patients

Para aceder aos ficheiros de som, que fazem parte deste documento recomendo: http://hdl.handle.net/10451/1011No presente trabalho estudámos o processamento emocional de sons desagradáveis em doentes esquizofrénicos, em fases iniciais da doença. O estudo decorreu em doentes pertencentes à consulta externa dos Serviços de Psiquiatria do Hospital de Santa Maria e Hospital Júlio de Matos e a amostra consistiu em 29 doentes e 29 controlos emparelhados para o sexo e idade. As avaliações realizadas incluíram uma escala de Avaliação Breve do Estado Mental (MMSE), uma escala de gravidade dos sintomas positivos e negativos da esquizofrenia (PANSS) e uma bateria de sons desagradáveis desenvolvida para este estudo, intitulada de Newcastle Battery of Unpleasant Sounds (NBUS). Os resultados mostraram que os doentes esquizofrénicos têm uma percepção emocional preservada dos sons desagradáveis, na fase inicial da doença. Não se observaram correlações significativas entre medidas de gravidade clínica (duração da doença e sub escalas da PANSS) e os valores da avaliação dos referidos sons. Observou-se ainda que a bateria de sons apresentada revelou grande variabilidade nos valores obtidos na avaliação. Associações semânticas, assim como certas características acústicas dos sons poderão ter influenciado a percepção e avaliação emocional dos mesmos.In the present study, we evaluated the emotional processing of unpleasant sounds in schizophrenic patients in early stages of the disease. This study was performed on schizophrenic outpatients from the Psychiatry Departments of Hospital Santa Maria and Hospital Júlio de Matos. The sample group comprised 29 schizophrenic patients and 29 matched healthy controls, equal in sex and age. Evaluations included the Mini Mental State Examination, the Positive and Negative Syndrome Scale (PANSS) and the Newcastle Battery of Unpleasant Sounds, which we developed to study this issue. Results showed that schizophrenic patients in early stages of the disease have a preserved emotional perception of unpleasant sounds. No correlation was found between clinical severity measures (disease duration, PANSS total and sub scores) and mean unpleasantness rating, which suggests that the emotional processing of unpleasant sounds is rather stable during the first five years of illness. We observed that the sound set presented varied widely in perceived unpleasantness. Semantic associations as well as certain acoustic features may have had an effect upon unpleasantness ratings of sounds

Analysis of the unpleasantness of sounds by psychiatric patients

Tese de mestrado em Neurociências, apresentada à Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa, 2008No presente trabalho estudámos o processamento emocional de sons desagradáveis em doentes esquizofrénicos, em fases iniciais da doença. O estudo decorreu em doentes pertencentes à consulta externa dos Serviços de Psiquiatria do Hospital de Santa Maria e Hospital Júlio de Matos e a amostra consistiu em 29 doentes e 29 controlos emparelhados para o sexo e idade. As avaliações realizadas incluíram uma escala de Avaliação Breve do Estado Mental (MMSE), uma escala de gravidade dos sintomas positivos e negativos da esquizofrenia (PANSS) e uma bateria de sons desagradáveis desenvolvida para este estudo, intitulada de Newcastle Battery of Unpleasant Sounds (NBUS). Os resultados mostraram que os doentes esquizofrénicos têm uma percepção emocional preservada dos sons desagradáveis, na fase inicial da doença. Não se observaram correlações significativas entre medidas de gravidade clínica (duração da doença e subescalas da PANSS) e os valores da avaliação dos referidos sons. Observou-se ainda que a bateria de sons apresentada revelou grande variabilidade nos valores obtidos na avaliação. Associações semânticas, assim como certas características acústicas dos sons poderão ter influenciado a percepção e avaliação emocional dos mesmos.In the present study, we evaluated the emotional processing of unpleasant sounds in schizophrenic patients in early stages of the disease. This study was performed on schizophrenic outpatients from the Psychiatry Departments of Hospital Santa Maria and Hospital Júlio de Matos. The sample group comprised 29 schizophrenic patients and 29 matched healthy controls, equal in sex and age. Evaluations included the Mini Mental State Examination, the Positive and Negative Syndrome Scale (PANSS) and the Newcastle Battery of Unpleasant Sounds, which we developed to study this issue. Results showed that schizophrenic patients in early stages of the disease have a preserved emotional perception of unpleasant sounds. No correlation was found between clinical severity measures (disease duration, PANSS total and sub scores) and mean unpleasantness rating, which suggests that the emotional processing of unpleasant sounds is rather stable during the first five years of illness. We observed that the sound set presented varied widely in perceived unpleasantness. Semantic associations as well as certain acoustic features may have had an effect upon unpleasantness ratings of sounds.União Europeia, Fundo Social Europeu; Programa Operacional Plurifundos da Região Autónoma da Madeira; Centro de Ciência e Tecnologia da Madeir

Plasma membrane-specific interactome analysis reveals calpain 1 as a druggable modulator of rescued Phe508del-CFTR cell surface stability

Cystic fibrosis (CF) is a genetic disease caused by mutations in the gene encoding CF transmembrane conductance regulator (CFTR), a chloride channel normally expressed at the surface of epithelial cells. The most frequent mutation, resulting in Phe-508 deletion, causes CFTR misfolding and its premature degradation. Low temperature or pharmacological correctors can partly rescue the Phe508del-CFTR processing defect and enhance trafficking of this channel variant to the plasma membrane (PM). Nevertheless, the rescued channels have an increased endocytosis rate, being quickly removed from the PM by the peripheral protein quality-control pathway. We previously reported that rescued Phe508del-CFTR (rPhe508del) can be retained at the cell surface by stimulating signaling pathways that coax the adaptor molecule ezrin (EZR) to tether rPhe508del–Na+/H+-exchange regulatory factor-1 (NHERF1) complexes to the actin cytoskeleton, thereby averting the rapid internalization of this channel variant. However, the molecular basis for why rPhe508del fails to recruit active EZR to the PM remains elusive. Here, using a proteomics approach, we characterized and compared the core components of wt-CFTR– or rPhe508del–containing macromolecular complexes at the surface of human bronchial epithelial cells. We identified calpain 1 (CAPN1) as an exclusive rPhe508del interactor that prevents active EZR recruitment, impairs rPhe508del anchoring to actin, and reduces its stability in the PM. We show that either CAPN1 downregulation or its chemical inhibition dramatically improves the functional rescue of Phe508del-CFTR in airway cells. These observations suggest that CAPN1 constitutes an attractive target for pharmacological intervention, as part of CF combination therapies restoring Phe508del-CFTR function.This work was supported by a center grant UID/MULTI/04046/2019 to BioISI and project PTDC/BIA-CEL/28408/2017 and IF2012 to PM, both from FCT, Portugal. AMM was recipient of fellowship SFRH/BD/52490/2014 from BioSYS PhD programme PD65-2012, and PB of fellowship SFRH/BPD/94322/2013.N/

Uma Cuba é o Bastante: Segurança Coletiva na América Latina Durante a Guerra Fria

Despite the contribution of new streams in international law scholarship, the decades of the Cold War remain underexplored in Latin American current historiography. Removing the geopolitical conflict from the centrality of historiographic analysis, the present article aims to understand the operation of international law in the Cold War through Latin American regional dynamics. Through the reading of the articles on “collective security” published in some international law journals during the period of the Cold War (American Journal of International Law and the Mexican Foro Internacional), this article recounts the history of the jurisdictional conflict between regional and universal organizations. It demonstrates that the history of collective security in the hemisphere begins as experiment in formalization of the long and distinct American tradition in international law.  The defense of this tradition served as a basis to formalize or legalize the projection of US power in the Americas. Latin Americans responded to this push first by endorsing the creation of a regional organization and a collective security arrangement, later by using law as a strategy to advance their position. However, as collective security increasingly became a justification for violations of the UN Charter, solidarity among American republics faded and cooperation, despite a regional treaty, became virtually impossible. The regional agreement thus proved to be both an enabler and an obstacle for this strategy. Thus, we conclude that the history of the International Law in Latin American during the Cold War was also the history of the demise of American International Law. KEYWORDS: Cold War. Latin America; International Law; Collective Security.Apesar de novas contribuições aos estudos de direito internacional, as décadas da Guerra Fria continuam subexploradas na historiografia atual da América Latina. Removendo o conflito geopolítico da centralidade da análise historiográfica, o presente artigo visa entender o funcionamento do direito internacional na Guerra Fria através da dinâmica regional latinoamericana. Através da leitura dos artigos sobre "segurança coletiva" publicados em algumas revistas de direito internacional durante o período da Guerra Fria (em especial o American Journal of International Law e o mexicano Foro Internacional mexicano), este artigo relata a história do conflito jurisdicional entre organizações regionais e universais. Ele demonstra que a história da segurança coletiva no hemisfério começa como uma experiência de formalização da longa e distinta tradição americana no direito internacional. A defesa desta tradição serviu como base para formalizar e legalizar a projeção do poder americano nas Américas. Os latino-americanos responderam a este impulso primeiro endossando a criação de uma organização regional e de um acordo de segurança coletiva, e mais tarde usando a lei como estratégia para avançar sua posição. Entretanto, à medida que a segurança coletiva se tornou cada vez mais uma justificativa para violações da Carta da ONU, a solidariedade entre as repúblicas americanas se desvaneceu e a cooperação, apesar de um tratado regional, tornou-se virtualmente impossível. Assim, o acordo regional provou ser tanto um facilitador quanto um obstáculo para esta estratégia. Conclui-se, pois, que a história do Direito Internacional na América Latina durante a Guerra Fria foi também a história do desaparecimento do Direito Internacional Americano.  PALAVRAS-CHAVE: Guerra Fria. América Latina. Direito Internacional. Segurança coletiva

Oral health literacy: a community-based learning experience at the Faculty of Dental Medicine of the Universidade Católica Portuguesa

info:eu-repo/semantics/publishedVersio

A novel Rac1/PAK1/BCL-6/STAT5 pathway modulates the expression of cell-cycle-associated genes

Gene expression depends on binding of transcriptional regulators to gene promoters, a process controlled by signalling pathways. The transcriptional repressor BCL-6 downregulates genes involved in cell cycle progression and becomes inactivated following phosphorylation by the Rac1 GTPase activated protein kinase PAK1. Interestingly, the DNA motifs recognized by BCL-6 and STAT5 are similar. Because STAT5 stimulation in epithelial cells can also be triggered by Rac1 signalling, we asked whether both factors have opposing roles in transcriptional regulation and whether Rac1 signalling may coordinate a transcription factor switch. We used chromatin immunoprecipitation to show that active Rac1 promotes release of the repressor BCL-6 while increasing binding of STAT5A to a BCL-6-regulated reporter gene. We further show in colorectal cell lines that the endogenous activation status of the Rac1/PAK1 pathway correlated with the phosphorylation status of BCL-6 and STAT5A. Three cellular genes (cyclin D2, p15INK4B, SUMO1) were identified to be inversely regulated by BCL-6 and STAT5A and responded to Rac1 signalling with increased expression and corresponding changes in promoter occupancy. Together, our data show that Rac1 signalling controls a group of target genes that are repressed by BCL-6 and activated by STAT5A, providing novel insights into the modulation of gene transcription by GTPase signalling