Diagnostyczna przydatność detekcji genu RHD w osoczu ciężarnych w profilaktyce konfliktu matczyno-płodowego na tle antygenu D z układu Rh

Objectives: The aim of the study was analytical validation of prenatal noninvasive fetal RHD detection in maternal plasma and the preliminary assessment of its clinical utility. Introduction of this noninvasive test into routine diagnostic use is important for more rational and safe immunoprophylaxis. Material and methods: RHD gene was detected using real-time PCR. Primers and probes complementary to sequence on exons 7 and 10 were chosen. Samples with RHD-negative results were examined with additional tests to confirm the proper isolation of cell-free fetal DNA (cffDNA). For male fetuses, the presence of fetal DNA was confirmed by detection of the male genetic marker (SRY gene) using Quantifiler DuoR kit. In the case of SRY-negative result we used mini SGM test, which is based on the detection of short-tandem repeat polymorphism differences between maternal and fetal DNA. Results: Diagnostic accuracy of RHD test was 96.82%, while diagnostic value of SRY determination was lower (87.50%). Mini SGM test was able to confirm the presence of fetal DNA in 77% of the cases. Conclusions: Effectiveness of the proposed procedure of prenatal noninvasive RHD determination and cffDNA confirmation is high, on condition proper control samples and suitable verifying tests are used.Cel pracy: Celem badań była walidacja oraz wstępna ocena przydatności testu do prenatalnego określania genu RHD pochodzenia płodowego w osoczu ciężarnej w rutynowej praktyce laboratoryjnej i klinicznej. Wprowadzenie do diagnostyki nieinwazyjnych badań prenatalnych ma na celu bardziej racjonalne i bezpieczne stosowanie immunoprofilaktyki. Materiał i metody: Badanie genu RHD w osoczu ciężarnych wykonano techniką real-time PCR z zastosowaniem starterow i sond specyficznych do sekwencji eksonow 7 i 10 genu RHD. Wyniki ujemne badania na obecność genu RHD weryfikowano dodatkowymi testami, ktore miały na celu potwierdzenie udanej izolacji i obecności DNA płodowego w probce. W pierwszej kolejności wykonywano oznaczenie markera płci męskiej (genu SRY), ktore potwierdzało obecność płodowego DNA w przypadku płodow płci męskiej. Badanie wykonywano testem QuantifilerR Duo. Probki z ujemnym wynikiem poddawano dalszej analizie poprzez oznaczanie polimorfizmow typu STR (ang. short tandem repeat) metodą mini SGM, rożnicując DNA pochodzenia matczynego i płodowego. Wyniki: Dokładność diagnostyczna testu do oznaczania genu RHD w osoczu wynosiła 96,82%. Wartość diagnostyczna oznaczania genu SRY była niższa i wynosiła 87,50%. Testem mini SGM udało się znaleźć marker rożnicujący w 77% przypadkow. Wnioski: Opracowany algorytm badania DNA płodowego metodami biologii molekularnej ma wysoką wartość diagnostyczną przy wykrywaniu genu RHD w osoczu i potwierdzaniu obecności DNA płodowego oraz umożliwia weryfikację wynikow ujemnych, pod warunkiem zastosowania właściwych badań kontrolnych

Genetic variants in transforming growth factor-β gene (TGFB1) affect susceptibility to schizophrenia

Immense body of evidence indicates that dysfunction of immune system is implicated in the etiology of schizophrenia. The immune theory of schizophrenia is supported by alterations in cytokine profile in the brain and peripheral blood. Given the strong genetic background of schizophrenia, it might be assumed that aberrant production of cytokines might be the consequence of genetic factors. This study aimed at investigating the association between schizophrenia susceptibility and selected functional polymorphisms in genes encoding cytokines including: interleukin-2 (IL2 −330T>G, rs2069756), interleukin-6 (IL-6 −174G>C, rs1800795), interferon-γ (IFNG +874T>A, rs2430561) as well as for the first time transforming growth factor-β1 (TGFB1 +869T>C, rs1800470 and +916G>C, rs1800471). We recruited 151 subjects with schizophrenia and 279 controls. There was a significant difference in the genotype distribution and allelic frequency of the TGFB1 +869T>C between patients with schizophrenia and healthy controls (p < 0.05). The risk of schizophrenia was more than two-fold higher in carriers of T allele (CT+TT genotypes) than individuals with CC genotype. Given documented gender differences in incidence of schizophrenia, we conducted separate analyses of male and female participants. We have shown that the association was significant in females, while in males it reached a trend toward statistical significance. To the best of our knowledge, it is the first report showing the association between TGFB1 +869T>C polymorphism and schizophrenia

Wydarzenia

Nagroda przyznawana w sześciu kategoriach (estrada, film, lite-ratura, muzyka poważna, plastyka – sztuki wizualne, teatr oraz nagroda specjalna kreator kultury). Została ustanowiona w 1993 r. przez tygodnik „Polityka”. Za rok 2010 w kategorii literatura zostali nominowani: Justyna Bargielska, Ignacy Karpowicz oraz Tomasz Piątek. Nominacje zostały przyznane przez jury w składzie: Przemysław Czapliński, Paweł Dunin Wąsowicz, Grzegorz Jankowicz, Piotr Kofta, Anna Nasiłowska, Robert Ostaszewski, Marta..

Polimorfizmy typu SNP w obrębie genu LGALS3BP u chorych z łagodnymi i złośliwymi nowotworami tarczycy

Introduction: The aim of the study was estimation of occurrence of SNP (single nucleotide polymorphism) sites in LGALS3BP gene in patients with benign and malignant thyroid tumors and analysis of correlation between their frequency and the histological type of thyroid lesions. Material and methods: The studied group consisted of 58 patients, 24 with papillary thyroid carcinomas, 19 with nodular goiters and 15 with follicular adenomas. Control group included 180 healthy volunteers. Four different SNP polymorphisms were analysed in PCR products using the SNaPshot test, on genetic analyser ABI Prism 310; these can be found in NCBI database under rs numbers: 1803938 (a/g), 11024 (g/c), 1801463 (a/c) and 1131516 (c/t). Results: In all patients analysis of SNP sites revealed: lack of polymorphism in a/g rs 18039380; polymorphism identical to database in g/c rs 11024 and polymorphism different from database in a/g rs 1801463 and c/g rs 131516. There were no significant differences between patients with thyroid lesions and group of healthy controls. Conclusion: Single nucleotide polymorphism (SNP) of LGALS3BP gene (found in NCBI) database are not characteristic for papillary thyroid cancer, follicular adenomas and nodular goiter.Wstęp: Badanie polimorfizmu genetycznego jest w ostatnich latach coraz częściej wykorzystywane w ocenie predyspozycji dziedzicznej do chorób nowotworowych i metabolicznych. Gen LGALS3BP kodujący galektynę-3 (Gal-3), białko ulegające nadekspresji w komórkach raka brodawkowatego tarczycy (PTC, papillary thyroid carcinoma), posiada w swym obrębie kilka miejsc polimorficznych typu SNP (single nucleotide polymorphism). Poznanie ewentualnych zależności pomiędzy zmianami patologicznymi w gruczole tarczowym a polimorfizmem omawianego genu może mieć znaczenie w badaniu patogenezy raka tarczycy. Cel pracy: Ocena występowania wybranych miejsc polimorficznych typu SNP genu LGALS3BP u pacjentów z łagodnymi i złośliwymi guzami tarczycy oraz analiza korelacji pomiędzy częstością występowania danej formy allelicznej genu a typem histologicznym zmiany w obrębie gruczołu tarczowego. Materiał i metody: Badana grupa obejmowała 58 osób, w tym 24 chorych z rakiem brodawkowatym, 19 chorych z wolem guzowatym i 15 chorych z gruczolakiem pęcherzykowym. Grupę kontrolną stanowiło, w zależności od konkretnie badanego polimorfizmu, 130-180 osób zdrowych. DNA izolowano z leukocytów krwi obwodowej i z guzów tarczycy pacjentów oraz z krwi grupy kontrolnej za pomocą zestawu "Sherlock" do izolacji DNA. Po dokonaniu oceny ilościowej i jakościowej, DNA posłużył jako matryca do amplifikacji in vitro wybranego fragmentu genu za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR, polymerase chain reaction). Produkty PCR analizowano w kierunku polimorfizmu typu SNP techniką "SNaPshot", wykorzystując analizator genetyczny ABI Prism 310. Do porównania otrzymanych sekwencji użyto programu SeqEval (Applied Biosystems). Oceniono 4 miejsca polimorficzne typu SNP genu LGALS3BP znalezione w bazie danych NCBI o numerach rs: 1803938 (a/g), 11024 (g/c), 1801463 (a/c) i 1131516 (c/t). W badanych grupach w analizowanych miejscach polimorficznych stwierdzono: brak polimorfizmu (a/g rs 18039380), polimorfizm zgodny z bazą danych (g/c rs 11024 ), a u pozostałych niezgodny z bazą danych (a/g rs 1801463) i (c/g rs 1131516). Nie stwierdzono istotnych różnic w występowaniu zbadanych polimorfizmów genu LGALS3BP pomiędzy analizowanymi grupami. Wnioski: Wykazane w bazie danych NCBI polimorfizmy SNP genu LGALS3BP nie są charakterystyczne dla raka brodawkowatego tarczycy, gruczolaka pęcherzykowego i wola guzowatego

Heart ventricular activation in VAT difference maps from children with chronic kidney disease

Children with chronic kidney disease (CKD) are affected by cardiovascular complications, including disturbances in the intraventricular conduction system. Body surface potential mapping (BSPM) is a non-invasive method of assessing the cardioelectrical field. Our aim was to investigate conduction disturbances in young CKD patients using ventricular activation time (VAT) maps. Our study comprised 22 CKD children (mean age: 13.1 ± 2.5 years) treated conservatively and 29 control patients. For each child 12-lead electrocardiogram (ECG) readings were taken, and blood pressure and serum concentrations of iPTH, Pi, t-Ca, creatinine, Fe+3, ferritin, and Hb, as well as eGFR were measured. All children underwent registration in the 87-lead BSPM system, and group-mean VAT maps and a difference map, which presents statistically significant differences between the groups, were created. The VAT map distribution in CKD patients revealed abnormalities specific to left anterior fascicle block. The difference map displays the areas of intergroup VAT changes, which are of discriminative value in detecting intraventricular conduction disturbances. Intraventricular conduction impairments in the left bundle branch may occur in children with CKD. BSPM enables conduction disturbances in CKD children to be detected earlier than using 12-lead ECG. The difference map derived from the group-mean isochrone maps precisely localizes the sites of disturbed conduction in the heart intraventricular conduction system

Serotonin-Related Gene Variants in Patients with Irritable Bowel Syndrome and Depressive or Anxiety Disorders

Aim. To assess the association of six polymorphisms in serotonin-related genes with depressive or anxiety disorders in patients with irritable bowel syndrome (IBS). Methods. The lifetime prevalence of depressive and anxiety disorders was assessed in 95 IBS patients (85% women) using the Munich version of the Composite International Diagnostic Interview (CIDI). IBS was diagnosed according to the Rome III criteria. SCL6A4 HTTLPR polymorphism (rs4795541) was determined using PCR-based method. Single-nucleotide polymorphisms in HTR1A (rs6295), HTR2A (rs6313 and rs6311), HTR2C (rs6318), and TPH1 (rs1800532) were detected by minisequencing method. Results. IBS patients with depressive disorders were characterized by higher frequency of 5-HTTLPR L allele in comparison to IBS patients with anxiety disorders. The lower frequency of 1438 A allele in HTR2A was found in IBS patients with depressive disorders in comparison to IBS patients without mental disorders. The lower G allele frequency in HTR2C rs6318 polymorphism among IBS patients with anxiety disorders was also observed. Conclusions. Our results provide further evidence for the involvement of SLC6A4 rs4795541 and HTR2A rs6311 polymorphisms in the pathophysiology of depressive disorders in IBS patients. The new findings indicate that HTR2C rs6318 polymorphism may be associated with the susceptibility to anxiety disorders in IBS patients

Variations in Suppressor Molecule CTLA-4 Gene Are Related to Susceptibility to Multiple Myeloma in a Polish Population

Various phenotype and functional T-cell abnormalities are observed in multiple myeloma (MM) patients. The aim of this study was to investigate the association between polymorphisms in the gene encoding cytotoxic T-lymphocyte antigen-4 (CTLA-4), a negative regulator of the T-lymphocyte immune response and susceptibility to multiple myeloma in a Polish population. Two hundred MM patients and 380 healthy subjects were genotyped for the following polymorphisms: CTLA-4c.49A>G, CTLA-4g.319C>T, CTLA-4g.*642AT(8_33), CT60 (CTLA-4g.*6230G>A), Jo31 (CTLA-4g.*10223G>T). Our study is the largest and most comprehensive evaluation to date of the association between genetic polymorphisms in the CTLA-4 molecule and multiple myeloma. It was found that CTLA-4c.49A>G[G], CT60[G], and Jo31[G] alleles were more frequently observed in MM patients than in controls (0.50 vs. 0.44, p = 0.03, 0.65 vs. 0.58, p = 0.04, and 0.63 vs. 0.57, p = 0.03, respectively). Moreover, the haplotype CTLA-4c.49A>G[G], CTLA-4g.319C>T[C], CTLA-4g.*642AT(8_33) [8], CT60[G], Jo31[G] including all susceptibility alleles increases the risk of MM about fourfold (OR: 3.79, 95%CI: 2.08–6.89, p = 0.00001). These findings indicate that genetic variations in the CTLA-4 gene play role in susceptibility to multiple myeloma and warrant further investigation through replication studies

A global analysis of Y-chromosomal haplotype diversity for 23 STR loci

In a worldwide collaborative effort, 19,630 Y-chromosomes were sampled from 129 different populations in 51 countries. These chromosomes were typed for 23 short-tandem repeat (STR) loci (DYS19, DYS389I, DYS389II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS385ab, DYS437, DYS438, DYS439, DYS448, DYS456, DYS458, DYS635, GATAH4, DYS481, DYS533, DYS549, DYS570, DYS576, and DYS643) and using the PowerPlex Y23 System (PPY23, Promega Corporation, Madison, WI). Locus-specific allelic spectra of these markers were determined and a consistently high level of allelic diversity was observed. A considerable number of null, duplicate and off-ladder alleles were revealed. Standard single-locus and haplotype-based parameters were calculated and compared between subsets of Y-STR markers established for forensic casework. The PPY23 marker set provides substantially stronger discriminatory power than other available kits but at the same time reveals the same general patterns of population structure as other marker sets. A strong correlation was observed between the number of Y-STRs included in a marker set and some of the forensic parameters under study. Interestingly a weak but consistent trend toward smaller genetic distances resulting from larger numbers of markers became apparent.Peer reviewe

Wpływ wzrostu wartości rzeczowych aktywów na poprawę produktywności pracy

Modern views define capital as the ability to perform labour. These two terms: capital and labour, are intertwined. Capital is an abstract and potential category, while work, however, represents the transfer of capital to the objects of labour that create its value. In an economy saturated with assets, labour is highly productive, which increase the level of welfare. This article analyses the growth of fixed assets in the economy against labour productivity and welfare level. Moreover, it presents the quandaries of economic growth acceleration, analysing the historical position of Poland.Współczesne poglądy określają kapitał, jako zdolność do wykonywania pracy. Te dwa pojęcia kapitał i praca stanowią tandem. Kapitał to kategoria abstrakcyjna i potencjalna, natomiast praca przedstawia transfery kapitału do obiektów pracy, co kreuje ich wartość. W gospodarce nasyconej aktywami, praca jest wysoce produktywna, co przyczynia się do wzrostu poziomu dobrobytu. W opracowaniu analizuje się wpływ wzrostu wartości aktywów na produktywność pracy. Ponadto przedstawia się dylematy przyspieszenia rozwoju gospodarczego, analizując sytuację historyczną Polski