Motivos C-terminais do HIV-1 gp41 como Possíveis Determinantes da Patogênese Viral

Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) is the etiological agent of acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), a pandemic with high economic and social costs. The envelope glycoprotein (env) of the virus mediates the infectious process by binding to and entering the host cell, one of the main target components of studies since its discovery. Its endodomain or C-terminal tail (CTT) participates in late replicative cycle processes, such as intracellular trafficking, activation, and cell death, which occurs because it interacts with multiple cellular factors through motifs or signal sequences present throughout its structure. Although these interactions have not been fully understood at specific levels, studies over more than three decades leave no doubt that this domain plays a fundamental role in the biology of the virus and probably the development of the disease. This review describes the studies carried out to date that demonstrate the importance of the CTT, focusing on the motifs responsible for its interactions and its possible roles in the pathogenicity of the infection.El virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) es el agente etiológico del síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA), una pandemia con altos costos económicos y sociales. La glicoproteína de la envoltura (env) del virus media el proceso infeccioso al unirse a la célula huésped y entrar en ella, uno de los principales componentes objetivo de los estudios desde su descubrimiento. Su endodominio o cola C-terminal (CTT) participa en procesos tardíos del ciclo replicativo, como tráfico intracelular, activación y muerte celular, lo que ocurre porque interactúa con múltiples factores celulares a través de motivos o secuencias señal presentes en toda su estructura. Aunque estas interacciones no se han entendido completamente a niveles específicos, los estudios durante más de tres décadas no dejan dudas de que este campo juega un papel fundamental en la biología del virus y probablemente en el desarrollo de la enfermedad. Esta revisión describe los estudios realizados hasta la fecha que demuestran la importancia de la CTT, centrándose en los motivos responsables de sus interacciones y sus posibles roles en la patogenicidad de la infección.O vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) é o agente etiológico da síndrome da imunodeficiência adquirida (AUXILIA), uma pandemia com elevados custos económicos e sociais. A glicoproteína do envelope (env) do vírus media o processo infeccioso ligando-se e entrando na célula hospedeira, um dos principais componentes alvo dos estudos desde sua descoberta. Seu endo domínio ou cauda C-terminal (CTT) participa de processos do ciclo replicativo tardio, como tráfego intracelular, ativação e morte celular, que ocorre porque interage com múltiplos fatores celulares por meio de motivos ou sequências-sinal presentes em toda a sua estrutura. Embora essas interações não tenham sido totalmente compreendidas em níveis específicos, estudos ao longo de mais de três décadas não deixam dúvidas de que esse domínio desempenha um papel fundamental na biologia do vírus e provavelmente no desenvolvimento da doença. Esta revisão descreve os estudos realiza- dos até o momento que demonstram a importância da CTT, com foco nos motivos responsáveis por suas interações e seus possíveis papéis na patogenicidade da infecção

Reacción en cadena de la polimerasa para la detección de Salmonella sp. en leche en polvo: Optimización del método en 12 horas

Resumen Los métodos tradicionales para identificar Salmonella sp. se basan en el empleo demedios de cultivo que permiten la recuperación del microorganismo, el aislamiento en medios selectivos, la identificación bioquímica y caracterización serológica. Estos métodos son dispendiosos, tienen baja especificidad, baja sensibilidad y consumen mucho tiempo. El principal objetivo de este trabajo fue estandarizar y optimizar la técnica de PCR para detectar Salmonella sp. en 12 horas, a partir de ADN de cultivos puros y en muestras de leche en polvo, inoculadas intencionalmente con 200, 20 y 2 UFC/mL. Para la extracción del ADN se estudió la conveniencia de fenol:cloroformo:alcohol isoamílico y Chelex® 100. La temperatura de hibridización y las concentraciones de cloruro de magnesio, empleando un diseño factorial incompleto 6x7, permitieron establecer un límite de detección de hasta 10 pg de ADN en cultivos puros de Salmonella typhi. La PCR se basó en la exclusividad de los oligonucleótidos 139-141, los cuales amplificaron una banda de 284 pb para la identificación de género. Los resultados muestran que: (I) la adición de Novobiacina (45 mg/L) o de verde brillante (10 mg/L) como inhibidores de flora acompañante, después de las primeras tres horas del pre-enriquecimiento no selectivo de 6 horas, no influye significativamente en la recuperación de las células bacterianas; (II) obtener biomasa de la primera dilución en base 10 y emplear la técnica de fenol:cloroformo:alcohol isoamílico para la obtención de ADN, se pueden detectar 2 UFC/mL de Salmonella sp. en leche en polvo y que el tiempo de detección se reduce considerablemente. Palabras claves: Salmonella sp., leche en polvo, PCR, diagnóstico molecular, diagnóstico microbiológico, optimización. Abstract The traditional methods to identify Salmonella sp. are based on the culture medium use that allows the recovery of the micro organism, isolation in selective media, biochemical and serologic characterization. These methods are tedious, have a low specificity and sensitivity and they generally consume a long time. The main objective of this study was to standardize and to optimize the PCR technique to detect Salmonella sp. in 12 hours, from DNA of pure cultures and from powdered milk samples, intentionally inoculated with 200, 20 and 2 CFU/mL. For the extraction of DNA, two methods were used: phenol:chloroform:isoamyl alcohol and chelex® 100. The optimization of the temperature of hibridización and the concentrations of Magnesium Chloride, using an incomplete factorial desing 6x7 allowed to establish a detection limit of up to 10 pg of DNA from pure cultures of Salmonella typhi. The PCR was based on the specificity of oligonucleotidos the 139-141, that amplified a band of 284 pb for the gender identification. The results show that: (I) the inhibitor addition of accompanying flora like Novobiocin (45 mg/L) or brilliant green (10 mg/L) as inhibitors of accompanying flora, after the first three hours in the nonselective pre-enrichment of 6 hours, does not significantly influence in the recovery of the bacterial cells, (II) when obtaining biomass of the first dilution in base 10 and using the phenol:chloroform:isoamyl alcohol technique for the extraction of DNA; can be detected 2 CFU/mL Salmonella s.p. from powdered milk and that the PCR technique reduces the time of test considerably. Key words: Salmonella sp., powdered milk, PCR, molecular diagnosis, microbiologist diagnosis, optimization

Relationship of troponins with in-hospital mortality in adults with covid-19 in a colombian caribbean city: a nested case-control study

Background: myocardial injury, characterized by elevated cardiac troponin levels, is a common finding in severe COVID-19 cases, occurring in up to 38% of patients. It has been identified as an independent predictor of mortality. Objective: our aim is to assess the predictive value of cardiac troponin levels for in-hospital mortality among adults hospitalized with COVID-19 in Barranquilla, Colombia, during the period from January to June 2021. Methods: this study is a nested case-control analysis within a retrospective cohort. It encompasses individuals aged 18 and older with a confirmed diagnosis of COVID-19 who were hospitalized between January and June 2021 (n = 358). We describe the demographic and paraclinical characteristics of the patients and their association with outcomes at the time of discharge. We also estimate the diagnostic accuracy, including sensitivity, specificity, and predictive values, of elevated troponin levels in predicting in-hospital mortality. Results: patients with elevated troponin levels demonstrated a significantly increased risk of in-hospital mortality (OR: 9.4; 95% CI: 5.5-16.0; p < 0.05) and had a notably higher in-hospital mortality rate (55.6%) compared to those with non-elevated troponin levels (11.7%). The troponin biomarker exhibited a sensitivity of 77.9% and specificity of 72.7%, with positive and negative predictive values of 55.6% and 88.3%, respectively, for in-hospital mortality. Conclusion: troponin elevation in subjects with COVID-19 is positively related to in-hospital mortality, independently of other conditions such as age group, comorbidities, or oxygen therapy requirement

I.amAble: la ciencia (química) al alcance de toda la sociedad

En este proyecto de innovación, que nace con vocación de continuar en años sucesivos, se persigue mejorar la calidad de la formación de los estudiantes de la Facultad de Ciencias Químicas (F. CC.QQ.) en el ámbito de la docencia teórico-práctica y de la divulgación científica. El trabajo ha consistido en la preparación de unos experimentos prácticos para llevarlos a cabo en centros educativos no universitarios en los que se ha tenido en cuenta la participación conjunta de personas con y sin diversidad funcional, desde una perspectiva inclusiva colaborativa. Estas actividades las han realizado los estudiantes bajo la supervisión de profesores (PDI) y personal de administración y servicios (PAS). Los experimentos se han recogido en fichas didácticas para facilitar su desarrollo y aplicación por parte de otros usuarios. En estas fichas se explica detalladamente cómo realizar las experiencias en formato de taller. Las fichas de los talleres realizados están disponibles en una página web vinculada a la Universidad Complutense bajo el título I.amAble (iamable.ucm.es). Está página ha sido construida por un estudiante de la Facultad de Informática , bajo la supervisión de profesionales, tanto de esa facultad como del Instituto de Tecnología del Conocimiento, y está abierta a contribuciones similares de otras facultades y otras instituciones. La página web está diseñada de manera que resulte lo más intuitiva y accesible posible para todo tipo de público. Entre todos los experimentos se han elegido cuatro para llevarlos a la práctica en centros educativos como actividades inclusivas en las que han participado conjuntamente personas con y sin discapacidad. Con este proyecto se pretende mejorar la calidad docente al ofrecer a los estudiantes la posibilidad de aprender enseñando mediante una actividad semipresencial. El desarrollo por parte de los estudiantes de competencias transversales en educación y en divulgación de la ciencia facilitarán algunas salidas profesionales en el ámbito educativo formal (centros de enseñanza) o informal (museos, animación sociocultural). Otro aspecto importante a resaltar es la potenciación de la colaboración entre todos los miembros de la institución universitaria. Este proyecto pretende contribuir a la mejora de la cultura científica, así como al establecimiento de puentes entre la UCM y la sociedad a la que debe servir. Finalmente, es importante subrayar que incidirá en la inclusión de las personas con discapacidad como parte de la sociedad, a través del acercamiento compartido a la ciencia (Dimensiones de inclusión social y derechos de Schalock; NAVAS MACHO, P. y otros, 2012. Derechos de las personas con discapacidad intelectual: implicaciones de la Convención de Naciones Unidas. Siglo Cero. 43 (243): 7-28.)

Association of Candidate Gene Polymorphisms With Chronic Kidney Disease: Results of a Case-Control Analysis in the Nefrona Cohort

Chronic kidney disease (CKD) is a major risk factor for end-stage renal disease, cardiovascular disease and premature death. Despite classical clinical risk factors for CKD and some genetic risk factors have been identified, the residual risk observed in prediction models is still high. Therefore, new risk factors need to be identified in order to better predict the risk of CKD in the population. Here, we analyzed the genetic association of 79 SNPs of proteins associated with mineral metabolism disturbances with CKD in a cohort that includes 2, 445 CKD cases and 559 controls. Genotyping was performed with matrix assisted laser desorption ionizationtime of flight mass spectrometry. We used logistic regression models considering different genetic inheritance models to assess the association of the SNPs with the prevalence of CKD, adjusting for known risk factors. Eight SNPs (rs1126616, rs35068180, rs2238135, rs1800247, rs385564, rs4236, rs2248359, and rs1564858) were associated with CKD even after adjusting by sex, age and race. A model containing five of these SNPs (rs1126616, rs35068180, rs1800247, rs4236, and rs2248359), diabetes and hypertension showed better performance than models considering only clinical risk factors, significantly increasing the area under the curve of the model without polymorphisms. Furthermore, one of the SNPs (the rs2248359) showed an interaction with hypertension, being the risk genotype affecting only hypertensive patients. We conclude that 5 SNPs related to proteins implicated in mineral metabolism disturbances (Osteopontin, osteocalcin, matrix gla protein, matrix metalloprotease 3 and 24 hydroxylase) are associated to an increased risk of suffering CKD

4to. Congreso Internacional de Ciencia, Tecnología e Innovación para la Sociedad. Memoria académica

Este volumen acoge la memoria académica de la Cuarta edición del Congreso Internacional de Ciencia, Tecnología e Innovación para la Sociedad, CITIS 2017, desarrollado entre el 29 de noviembre y el 1 de diciembre de 2017 y organizado por la Universidad Politécnica Salesiana (UPS) en su sede de Guayaquil. El Congreso ofreció un espacio para la presentación, difusión e intercambio de importantes investigaciones nacionales e internacionales ante la comunidad universitaria que se dio cita en el encuentro. El uso de herramientas tecnológicas para la gestión de los trabajos de investigación como la plataforma Open Conference Systems y la web de presentación del Congreso http://citis.blog.ups.edu.ec/, hicieron de CITIS 2017 un verdadero referente entre los congresos que se desarrollaron en el país. La preocupación de nuestra Universidad, de presentar espacios que ayuden a generar nuevos y mejores cambios en la dimensión humana y social de nuestro entorno, hace que se persiga en cada edición del evento la presentación de trabajos con calidad creciente en cuanto a su producción científica. Quienes estuvimos al frente de la organización, dejamos plasmado en estas memorias académicas el intenso y prolífico trabajo de los días de realización del Congreso Internacional de Ciencia, Tecnología e Innovación para la Sociedad al alcance de todos y todas

Reducing the environmental impact of surgery on a global scale: systematic review and co-prioritization with healthcare workers in 132 countries

Abstract Background Healthcare cannot achieve net-zero carbon without addressing operating theatres. The aim of this study was to prioritize feasible interventions to reduce the environmental impact of operating theatres. Methods This study adopted a four-phase Delphi consensus co-prioritization methodology. In phase 1, a systematic review of published interventions and global consultation of perioperative healthcare professionals were used to longlist interventions. In phase 2, iterative thematic analysis consolidated comparable interventions into a shortlist. In phase 3, the shortlist was co-prioritized based on patient and clinician views on acceptability, feasibility, and safety. In phase 4, ranked lists of interventions were presented by their relevance to high-income countries and low–middle-income countries. Results In phase 1, 43 interventions were identified, which had low uptake in practice according to 3042 professionals globally. In phase 2, a shortlist of 15 intervention domains was generated. In phase 3, interventions were deemed acceptable for more than 90 per cent of patients except for reducing general anaesthesia (84 per cent) and re-sterilization of ‘single-use’ consumables (86 per cent). In phase 4, the top three shortlisted interventions for high-income countries were: introducing recycling; reducing use of anaesthetic gases; and appropriate clinical waste processing. In phase 4, the top three shortlisted interventions for low–middle-income countries were: introducing reusable surgical devices; reducing use of consumables; and reducing the use of general anaesthesia. Conclusion This is a step toward environmentally sustainable operating environments with actionable interventions applicable to both high– and low–middle–income countries

Obtención de BACs basados en el virus de la pseudorrabia sin las secuncias de empaquetamiento por recombinaciín homóloga en E. Coli

The herpes simplex virus-based vectors have great advantages such as being neurotropic, efficient infection, es- tablishment of latency, capacity to transport large amounts of DNA, but also have a major drawback being a pathogenic virus for humans, even undergoing modification to alter its virulence it can never be ruled out. Pack- aging sequences (pac) are necessary for correct cutting and packaging of the virus and are located in BamHI fragments 13 and 14’ respectively with a size of 3.2 Kpb. The objective of the study was to obtain BACs based on pseudorabies virus without packaging sequences (pac). PRV BACs modifying was made using homologous recom- bination into DH10B cells and recombination was verified by hybridization analysis.Los vectores basados en herpes simplex presentan grandes ventajas, tales como ser neurotrópicos, eficiente infec- ción, establecimiento de latencia, capacidad para transportar grandes cantidades de ADN, pero también presen- tan un gran inconveniente al ser un virus patogénico para humanos, que aunque sufra modificaciones para alterar su virulencia esta nunca puede ser descartada. Las secuencias de empaquetamiento (pac) son necesarias para el correcto corte y empaquetado del virus y se encuentran ubicadas en los fragmentos BamHI-13 y 14’ respectiva- mente, con un tamaño de 3,2 Kpb. El objetivo del estudio fue obtener BACs basados en el virus de la pseudorrabia sin las secuencias de empaquetamiento (pac). La modificación de los BACs de PRV se hizo por recombinación homóloga en células DH10B y la recombinación se comprobó por análisis de hibridación. &nbsp

Obtención de BACs basados en el virus de la pseudorrabia sin las secuncias de empaquetamiento por recombinaciín homóloga en E. Coli

The herpes simplex virus-based vectors have great advantages such as being neurotropic, efficient infection, es- tablishment of latency, capacity to transport large amounts of DNA, but also have a major drawback being a pathogenic virus for humans, even undergoing modification to alter its virulence it can never be ruled out. Pack- aging sequences (pac) are necessary for correct cutting and packaging of the virus and are located in BamHI fragments 13 and 14’ respectively with a size of 3.2 Kpb. The objective of the study was to obtain BACs based on pseudorabies virus without packaging sequences (pac). PRV BACs modifying was made using homologous recom- bination into DH10B cells and recombination was verified by hybridization analysis.Los vectores basados en herpes simplex presentan grandes ventajas, tales como ser neurotrópicos, eficiente infec- ción, establecimiento de latencia, capacidad para transportar grandes cantidades de ADN, pero también presen- tan un gran inconveniente al ser un virus patogénico para humanos, que aunque sufra modificaciones para alterar su virulencia esta nunca puede ser descartada. Las secuencias de empaquetamiento (pac) son necesarias para el correcto corte y empaquetado del virus y se encuentran ubicadas en los fragmentos BamHI-13 y 14’ respectiva- mente, con un tamaño de 3,2 Kpb. El objetivo del estudio fue obtener BACs basados en el virus de la pseudorrabia sin las secuencias de empaquetamiento (pac). La modificación de los BACs de PRV se hizo por recombinación homóloga en células DH10B y la recombinación se comprobó por análisis de hibridación. &nbsp

Bases conceptuales del diagnóstico de intolerancia a lactosa, hipolactasia y mala digestión de lactosa.

Se revisa la fisiopatología de hipolactasia, mala digestión de lactosa e intolerancia a lactosa para aclarar confusiones conceptuales y puntualizar diagnósticos. La lactasa es la enzima que digiere la lactosa de la leche, liberando galactosa y glucosa. En adultos con fenotipo Hipolactasia Primaria Tipo Adulto (No persistencia de Lactasa), la actividad enzimática es el 10 % de la máxima, propia de la infancia; en los de fenotipo Persistencia de Lactasa se mantiene elevada. En europeos, los fenotipos están estrechamente asociados al polimorfismo C/T-13910; por consiguiente, su genotipificación constituye prueba diagnóstica; no así en caribeños colombianos por presentar moderada asociación. El diagnóstico directo de hipolactasia/persistencia es el enzimático; un índice lactasa/sacarasa&lt; 0,3 indica hipolactasia. Mala digestión de lactosa, la incapacidad de digerir cierta cantidad, se evalúa con la prueba de hidrógeno en el aliento o con la de tolerancia a lactosa, las cuales permiten inferir si el sujeto es probable persistente (digestor) o probable hipolactásico (mal digestor). Intolerancia a lactosa es el síndrome clínico digestivo que, tras ingerirla, puede sobrevenir por causa de hipolactasia o de mala absorción de glucosa-galactosa; se diagnostica si al excluir la leche de la dieta durante dos semanas el cuadro desaparece y luego, al restituirla, reaparece. Mala absorción de lactosa es una irrealidad fisiológica porque la lactosa no se absorbe. No existe sinonimia entre hipolactasia, mala digestión de lactosa e intolerancia a lactosa. Son estados fisiopatológicos diferentes, no siempre asociados entre sí. La comprensión de la identidad conceptual de cada uno es fundamental para diagnosticarlos acertadamente