Conditionally specified distributions: an introduction

A bivariate distribution can sometimes be characterized completelybyproperties of its conditional distributions. The present article surveys available research in this area. Questions of compatibility of conditional specifications are addressed as are characterizations of distributions based on their having conditional distributions that are members of prescribed parametric families of distributions. The topics of compatibilityand near compatibilityof conditional distributions are discussed. Estimation strategies for conditionallyspecified distributions are summarized. Additionally, certain conditionally specified densities are shown to provide convenient flexible conjugate prior families in certain multiparameter Bayesian settings

Pleistocene climate fluctuations drove demographic history of African golden wolves (Canis lupaster)

Pleistocene climate change impacted entire ecosystems throughout the world. In the northern hemisphere, the distribution of Arctic species expanded during glacial periods, while more temperate and mesic species contracted into climatic refugia, where isolation drove genetic divergence. Cycles of local cooling and warming in the Sahara region of northern Africa caused repeated contractions and expansions of savannah‐like environments which connected mesic species isolated in refugia during interglacial times, possibly driving population expansions and contractions; divergence and geneflow in the associated fauna. Here, we use whole genome sequences of African golden wolves (Canis lupaster), a generalist mesopredator with a wide distribution in northern Africa to estimate their demographic history and past episodes of geneflow. We detect a correlation between divergence times and cycles of increased aridity‐associated Pleistocene glacial cycles. A complex demographic history with responses to local climate change in different lineages was found, including a relict lineage north of the High Atlas Mountains of Morocco that has been isolated for more than 18,000 years, possibly a distinct ecotype.CS was supported by a PhD fellowship from Programa Internacional de Becas “La Caixa-Severo Ochoa” of the Spanish Ministerio de Economía y Competitividad and La Caixa bank (BES-2015-074331). This project was funded by the Frontera grant P18-FR-5099 from the Junta de Andalucia. EBD-CSIC received support from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness under the ‘Centro de Excelencia Severo Ochoa 2013-2017’ program, SEV-2012-0262

The Second Generalized Hamming Weight of Some Evaluation Codes Arising from Complete Bipartite Graphs

Abstract In this paper we compute the second generalized Hamming weight of the evaluation codes associated to complete bipartite graphs. The main result depends on the minimum distance and second generalized Hamming weight of the generalized Reed-Solomon codes. Mathematics Subject Classification: 94B27, 94B6

Bayesian estimation of incomplete data using conditionally specified priors

In this paper, a class of conjugate prior for estimating incomplete count data based on a broad class of conjugate prior distributions is presented. The new class of prior distributions arises from a conditional perspective, making use of the conditional specification methodology and can be considered as the generalisation of the form of prior distributions that have been used previously in the estimation of in- complete count data well. Finally, some examples of simulated and real data are given

Desarrollo de herramientas de búsqueda en los archivos históricos de la CompañÍa de Jesús

El trabajo de los historiadores es pesado y difícil ya que consiste, fundamentalmente, en la localización, análisis e interpretación de documentos antiguos. Estos documentos, cuando están disponibles para su consulta, deben ser leídos uno por uno y todas las posibles referencias cruzadas, revisadas una por una. La Compañía de Jesús llegó a la Nueva España en el siglo XV y trabajó en colegios, misiones, parroquias y hospitales a lo largo de todo el continente hasta la expulsión de la Orden en 1767. Durante este tiempo, la Compañía de Jesús puso en marcha un sistema de comunicación conocido como las Cartas Anuales o Cartas Annuas que el Provincial enviaba al General de la Compañía en Roma. Cada una de las Cartas Anuales relataba las actividades llevadas a cabo por miembros de la Compañía. Para ayudarse a redactar cada Carta y con el fin de circular la información en toda la Provincia de la Nueva España, cada uno de los encargados de las obras enviaba al Provincial una o varias cartas conocidas como Puntos de Annua. La Compañía de Jesús, junto con el Archivo General de la Nación y el Instituto Nacional de Antropología e Historia se dio a la tarea de recopilar todas las Cartas Anuales escritas desde que los jesuitas llegaron a la Nueva España hasta su expulsión en 1767. Esta búsqueda resultó en más de 13000 folios que debieron paleografiarse para ayudar a la investigación histórica sobre la Compañía de Jesús. Como resultado de este trabajo de recuperación y paleografía y para facilitar el acceso y manejo de los documentos, se decidió crear una herramienta informática que ofreciera a los investigadores un motor de búsqueda para hacer referencias cruzadas rápida y fácilmente, así como el acceso a los documentos a través de índices temáticos. El desarrollo de esta herramienta presentó varios problemas técnicos que se han ido solucionando. Por ejemplo, la necesidad de que los documentos en formato electrónico siguieran fielmente las reglas de la paleografía. Este requerimiento hizo necesaria la realización de un filtro para manipular los archivos en formato XML. Se desarrolló también la interfaz gráfica para acceder a los índices temáticos y el motor de búsqueda para realizar referencias cruzadas en una o varias palabras, continuas o discontinuas en el texto del documento. La herramienta ha sido bien recibida por los investigadores y se ha decido aumentarla con algoritmos de Text-Mining para aumentar las capacidades de la búsqueda así como la generación de referencias cruzadas entre los documentos.ITESO, A.C

The Degree and regularity of vanishing ideals of algebraic toric sets over finite fields

Let X* be a subset of an affine space A^s, over a finite field K, which is parameterized by the edges of a clutter. Let X and Y be the images of X* under the maps x --> [x] and x --> [(x,1)] respectively, where [x] and [(x,1)] are points in the projective spaces P^{s-1} and P^s respectively. For certain clutters and for connected graphs, we were able to relate the algebraic invariants and properties of the vanishing ideals I(X) and I(Y). In a number of interesting cases, we compute its degree and regularity. For Hamiltonian bipartite graphs, we show the Eisenbud-Goto regularity conjecture. We give optimal bounds for the regularity when the graph is bipartite. It is shown that X* is an affine torus if and only if I(Y) is a complete intersection. We present some applications to coding theory and show some bounds for the minimum distance of parameterized linear codes for connected bipartite graphs

Utilidad diagnóstica de los marcadores de estrés oxidativo en artritis reumatoide precoz en pacientes no fumadores y anti-CCP negativos

Fundamento. A pesar del desarrollo de nuevos marcadores y cri- terios diagnósticos para la artritis reumatoide (AR), todavía mu- chos pacientes son diagnosticados tras varios años de síntomas. Los marcadores de estrés oxidativo se incrementan ya en una fase temprana de la enfermedad. El objetivo del presente estudio fue evaluar el valor diagnóstico adicional de estos marcadores. Método. Se realizó un estudio de casos y controles. Los pacien- tes reclutados para el estudio cumplían los criterios para AR de la ACR 1987, todos ellos tenían menos de 2 años de síntomas y sin tratamiento previo con fármacos modificadores de la enfer- medad antirreumática (DMARD), esteroides o vitamina E. Los controles fueron seleccionados de los familiares del paciente y pareados (1:1) por sexo, edad, hábito tabáquico actual. Los marcadores de daño oxidativo que se midieron fueron malo- nildialdehído (MDA), hidroperóxidos lipídicos (LOOH) y pro- teínas carboniladas (CP). El Análisis estadístico se realizó de acuerdo con la STARD. resultados. Se incluyeron sesenta y cinco pacientes con AR sin tratamiento y 65 controles sanos. LOOH, CP, los anticuerpos con péctidos citrulinados (anti-CCP) y el factor reumatoide (FR) fueron significativamente mayores en los pacientes, y MDA fue mayor en los controles. Los mismos resultados se obtuvieron en los subgrupos de pacientes que fuman o no, y en anti-CCP positivos o negativos. El valor diagnóstico de los marcadores tradicionales mostró una buena especificidad pero una baja sensibilidad. La construcción de los modelos logísti- cos con la adicción de LOOH y CP aumenta la sensibilidad y el área bajo la curva ROC, especialmente en los no fumadores (66%) y los pacientes negativos ante-CCP (51%). conclusiones. Al incorporar LOOH o CP a los marcadores de la enfermedad tradicionales en AR, bien por separado o ambos conjuntamente, mejoró el diagnóstico de AR, especialmente en los pacientes no fumadores o aquellos con anticuerpos anti- CCP negativos.background. Besides the development of new markers and di- agnostic criteria for rheumatoid arthritis (RA), many patients are still diagnosed after several years of symptoms. Oxidative stress markers are already increased at an early stage of RA. Our aim was to evaluate the additional diagnostic value of these markers. Methods. A case-control study was performed. Patients met the 1987 RA ACR criteria, less than 2 years of symptoms and no previous treatment with disease-modifying anti-rheumatic drugs (DMARD), steroids or vitamin E. Controls were select- ed from patient’s relatives and matched (1:1) by gender, age, and current smoking habit. Oxidative damage markers were malonyldialdehyde (MDA), Lipid hydroperoxides (LOOH) and Carbonyl proteins (CP). Statistical analysis was performed in agreement with the STARD initiative. results. Sixty-five RA patients without treatment and 65 healthy controls were included. LOOH, CP, antibodies against citrullinated peptides (anti-CCP) and rheumatoid factor (RF) were significantly higher in patients, and MDA higher in con- trols. The same results were obtained in the subgroups of pa- tients who smoke or not, and in anti-CCP positive or negative. The diagnosis performance of traditional markers showed good specificity but low sensitivity. The addition of LOOH and CP increased the sensitivity and the area under the receiving operating characteristic (ROC) curve especially in non-smok- ing (66%) and negative anti-CCP (51%) patients. conclusions. The separate or combined addition of LOOH or CP to the traditional disease markers improved the diag- nosis of RA, especially in non-smoking or negative anti-CCP patients

Real-Time optimization using the Modifier Adaptation methodology

[ES] La gestión óptima de las plantas de proceso normalmente se lleva a cabo en una capa de optimización en tiempo real (Real Time Optimization, RTO) que actúa sobre la capa de control y que toma decisiones considerando objetivos económicos en base a un  modelo del proceso, normalmente estacionario. Sin embargo, dicha operación óptima no está garantizada debido a la presencia de incertidumbre entre el modelo usado para la toma de decisiones y el proceso real. Con la idea de conducir el proceso a su punto de operación óptimo usando un modelo que se sabe incierto o erróneo, surge la metodología de adaptación de modificadores (Modifier Adaptation o MA). En dicha metodología, el problema de optimización económica de la capa RTO es modificado mediante unos términos correctores, conocidos como modificadores, estimados a partir de medidas de la planta, con el objetivo de conducir el proceso a su punto de operación óptimo. El presente artículo hace una revisión de las técnicas desarrolladas hasta el momento dentro de la metodología MA analizando sus características y modos de implementación.[EN] Optimal process operation is carried out by a Real-Time Optimization (RTO) layer which operates above the control layer and takes decisions based on steady-state plant models by considering economic objectives. However, this optimal operation is not guaranteed due to the presence of plant-model mismatch. To bring the process to the optimum operating point, the economic optimization problem solved in the RTO layer is changed following the Modifier Adaptation methodology (MA). This methodology changes the economic optimization problem solved in the RTO layer by adding some corrector terms or modifiers estimated from plant measurements to bring the process to the real optimum. This article presents a review of the different MA techniques developed until now and analyzing their features and the way to implement them.Este trabajo ha sido realizado gracias al proyecto DPI2015-70975-P del MINECO del Gobierno de España bajo la beca FPI BES-2013-062737.Rodríguez-Blanco, T.; Sarabia, D.; De Prada, C. (2018). Optimización en Tiempo Real utilizando la Metodología de Adaptación de Modificadores. Revista Iberoamericana de Automática e Informática industrial. 15(2):133-144. https://doi.org/10.4995/riai.2017.8846OJS13314415

Multivariate order statistics via multivariate concomitants

AbstractLet X¯1,…,X¯n denote a set of n independent identically distributed k-dimensional absolutely continuous random variables. A general class of complete orderings of such random vectors is supplied by viewing them as concomitants of an auxiliary random variable. The resulting definitions of multivariate order statistics subsume and extend orderings that have been previously proposed such as norm ordering and N-conditional ordering. Analogous concepts of multivariate record values and multivariate generalized order statistics are also described

Determination of dichlobenil and its major metabolite (BAM) in onions by PTV–GC–MS using PARAFAC2 and experimental design methodology

The optimization of a GC–MS analytical procedure which includes derivatization, Quick Easy Cheap Effective Rugged and Safe (QuEChERS) and programmed temperature vaporization (PTV) using design of experiments is performed to determine 2,6-dichlorobenzonitrile (dichlobenil) and 2,6-dichlorobenzamide (BAM) in onions, using 3,5-dichlorobenzonitrile and 2,4-dichlorobenzamide as internal standards. The use of a central composite design and two D-optimal designs, together with the desirability function, makes it possible to significantly reduce the economic, time and environmental cost of the study. The usefulness of PARAFAC2 for solving problems as the interference of unexpected derivatization artifacts unavoidably linked to some derivatization agents, or the presence of coeluents from the complex matrix, which share m/z ratios with the target compounds, is shown. The limits of decision (CCα) of the optimized procedure, 5.00 μg kg− 1 for dichlobenil and 1.55 μg kg− 1 for BAM (α = 0.05), are below the maximum residue limit (MRL) established by the EU for dichlobenil (20 μg kg− 1) in this commodity.Ministerio de Economía y Competitividad (CTQ2011-26022) and Junta de Castilla y León (BU108A11-2