Chronique radiocarbone de la néolithisation en Méditerranée nord-occidentale

International audienceThe aim of this paper is to reassess the Neolithisation in North-western Mediterranean in relation to radiocarbon data. For this purpose, we have collected 471 datings, distributed among the seventh and fifth millennium before Christ. We first sum up the methodology we applied for our dating selection and the graphical representation mode we have chosen. The selected geographical area have allowed us to tackle, on the one hand general questions regarding the first farmers spread, and, on the other hand, on a more local scale of analysis, the chronological articulation between the cultural groups participating in the early Neolithic development. For instance, we investigate the problem of the first Neolithic spread and the possible contacts with the indigenous populations. About this last point, the chronological picture favours the assumption of various ways of expansion of production economy, although the mechanism in which this variety of cases has its origins are still poorly defined. Finally, the study of radiocarbon data, in a more restricted scale, has allowed us not only to validate the pre-established pattern but also, to suggest new hypothesis as for the chronology of the early Neolithic in North-western Mediterranean.Cet article propose une discussion de la néolithisation de la Méditerranée nord occidentale à partir des données du radiocarbone. Pour cela, nous avons réuni un corpus de 471 datations s'organisant entre les septième et cinquième millénaires avant notre ère. Un rappel méthodologique expose en premier lieu les fondements du tri des datations imposé par cette démarche classificatoire ainsi que le mode de représentation graphique utilisé. Le cadre géographique choisi permet ensuite d'aborder d'une part, des questions d'ordre général sur les modalités d'implantation des premières sociétés paysannes et d'autre part, à une échelle d'analyse plus régionale, le problème de l'articulation des faciès culturels prenant part au développement du Néolithique ancien. On examine par exemple la question de la progression du premier Néolithique et des éventuels cas de contact avec les populations autochtones. Sur ce point, l'image chronologique obtenue plaide en faveur d'une différenciation dans les modalités d'expansion de l'économie de production, bien que les mécanismes responsables de cette variabilité soient encore mal définis. Enfin, l'étude des données du radiocarbone à une échelle géographique plus restreinte nous a permis de valider les découpages généralement admis, mais également de proposer de nouvelles hypothèses quant à la position chronologique des faciès du Néolithique ancien de la Méditerranée nord occidentale

Dynamiques fluviales en basse vallée du Vidourle

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Modelling the Guayule plant growth and development with a Functional Structural Plant Model

The Guayule (Parthenium argentatum, Asteraceae), is a small ramified tree native to the northern Mexico and southwestern United States. The guayule shows a growing interest in research and agriculture (Ray, 1993) due to its hypoallergenic latex properties (Taurines et al., 2019), and seems adapted to South France climate (Sfeir and al., 2014). However, the production itineraries in relation to latex production are still not assessed, and so far little studies were done on the plant structure and functioning. This study aims to propose a first FSPM of the species using the GreenLab model, calibrated from data issued from two varieties in different environmental conditions. The studying methodology is first based on a qualitative architectural analysis (Barthelemy and al., 2007). Second, on the various axis typologies, the development and branching stochastic rules can then be retrieved from field internode distributions collections. Finally, the organ source and sink relations parameters can be fitted from dedicated dry weight measurements (Kang et al., 2018). Experimental plots were hold south of France, close to Montpellier on two varieties CL1 and CLA1, with six environmental conditions related to density (9091 and 62500 plants per hectare) and hydric pressure (no stress, low stress and high stress). 50 plants per environmental conditions were measured. The sampling was optimized to the plant structure and to quantify the polyisoprene and resins contents. The guayule shows a sympodial development is composed of modules with terminal inflorescence. Its architecture corresponds to the Leeuwenberg's model (Hallé et al., 1978). The axes are constituted of successive modules. Over a year, the plant produces eight to nine successive modules. Studying the plant structure, we found out that the number of relay axis per module follows a binomial distribution. The modules are ordered from the plant base to the top. And these modules are composed of internodes whose number also follows a binomial law, which parameters are quite stable from one order to another. In the further modelling process, we thus did consider that the plant elementary unit was the module, called as a meta-phytomer. Under this assumption, we summarized the total dry weight of leaves and internodes per module to build the axis organic series (Buis and Barthou, 1984). Field measurements issued from these two series constituted then a target to be adjusted by the structural functional GreenLab model (Kang et al, 2018) in order to calibrate the organ source parameters. An initial analysis calculated the strength sink of leaves and internodes in a context of free growth and analysed the differences between the two varieties. We are currently applying the methodology to assess the impact on the parameters of development and growth, the effects of planting density and irrigation. This first modelling study hold on two varieties on the Guayule tree shows that the plant structure can be efficiently modelled using a simple module approach. The development parameters, defining the module number of phytomers and branching rules are nearly stable and close for both varieties under the various environmental conditions. First functioning parameters were also retrieved from the measurements. These parameters make it possible to obtain the first stochastic 3D simulations of the Guayule's growth and architecture for both varieties

Expression of HLA-G in human cornea, an immune-privileged tissue.

Human leukocyte antigen (HLA)-G retains the capacity to modulate immune responses, favoring the establishment of tolerance in solid-tissue allotransplants. To better understand the mechanisms that promote corneal allograft survival, we investigated whether HLA-G was an immunoregulatory factor involved in corneal immunology. We therefore sought HLA-G expression in corneal tissues. Corneal transplantation consists in replacing the center of a diseased cornea with normal corneal tissue. Two corneal parts are not used in such surgery: diseased central corneal tissue and peripheral normal cornea. For this study, we used healthy corneas obtained from deceased donors and diseased corneas obtained from patients with pseudophakic bullous keratopathy or keratoconus who had undergone corneal transplantation. Immunohistochemical analysis carried out on the cryopreserved corneas showed a positive immunohistochemical staining with anti-HLA-G, anti-HLA-A, -B, and -C, and anti-HLA class I monoclonal antibodies. Staining was obtained for keratocytes, epithelial cells, and endothelial cells from both healthy and pathologic human corneas, revealing the presence of HLA class I proteins, including HLA-G. HLA-G transcripts were detected in normal cornea by reverse transcriptase-polymerase chain reaction with a classical pattern of alternative splicing. The detection of HLA-G protein in adult corneas leads to the conclusion that this protein may contribute to the maintenance of the privileged immune status of cornea

La transposition didactique, pivot d'une analyse de situation professionnelle utilisée comme situation d'enseignement

Cet article présente l'analyse d'une innovation en vue de sa possible insertion dans le système éducatif. Cette innovation, menée dans la formation agricole au niveau BTS, comporte l'introduction d'un système expert d'aide au diagnostic des maladies du porcelet, construit par et pour des professionnels et dont l'utilisation nécessite la visite d'un élevage sur motif d'appel. Ce nouvel enseignement nécessite la mise en oeuvre par l'enseignant de savoirs théorique et pratique pluridisciplinaires avec en toile de fond la référence à une pratique professionnelle. Si notre expérience a montré la faisabilité de l'innovation, notre analyse, menée dans le cadre théorique de l'écologie des savoirs élaboré à partir des travaux sur la transposition didactique, a montré deux difficultés majeures pour l'insertion de cette innovation dans le système éducatif: d'une part l'interdisciplinarité, d'autre part une modification du contrat didactique

Impacts de l'environnement sur les diarrhées infantiles à Madagascar (Analyse du risque Campylobacter)

Les maladies diarrhéiques demeurent une cause majeure de mortalité infantile dans les pays en développement (PED). Du fait de l'insuffisance des plateaux techniques, les diagnostics étiologiques sont rarement réalisés et les traitements sont alors probabilistes. A Madagascar les données sur les diarrhées sont souvent parcellaires et anciennes. Le Réseau de surveillance sentinelle développé par l'Institut Pasteur de Madagascar à partir de 2007 nous a permis d'étudier la distribution spatio-temporelle des consultations pour diarrhée. Mais cette surveillance syndromique n'est pas couplée systématiquement à une surveillance biologique. Pour étudier les agents étiologiques des diarrhées, nous avons réalisé une enquête cas-témoins menée en 2008-2009 en milieu communautaire, chez les enfants de moins de 5 ans dans 14 districts. Nous avons pu identifier au moins un pathogène chez plus de la moitié des enfants (55%), avec une prédominance des étiologies parasitaires (37,2% des diarrhées), suivies par les bactéries (15%) puis les virus (6,7% de rotavirus). Les parasites ont été les seules étiologies pour lesquelles une pathogénicité a pu être mise en évidence. Parmi les étiologies bactériennes, l'infection à Campylobacter a été la plus fréquente (9,5%). Pour analyser le rôle de Campylobacter et les effets des facteurs environnementaux dans la survenue des diarrhées infantiles, nous avons initié et coordonné depuis 2010 une étude de cohorte dynamique d'enfants inclus avant l'âge de 24 mois et suivis jusqu'à l'âge de 36 mois à Moramanga, site où la prévalence de Campylobacter a été la plus élevée au cours de l'étude de 2008 (20,6%). Une surveillance des diarrhées a été menée 2 fois par semaine et les portages asymptomatiques évalués à l'inclusion et tous les 2 mois. Une étude de portage familial a été mise en œuvre ainsi qu'un suivi coprologique bi-annuel de la population avicole, des points d'eaux collectifs et de l'eau de boisson des familles. La recherche de Campylobacter chez les volailles portait sur les écouvillonnages rectaux. De janvier 2010 à mai 2012, 508 enfants correspondant à 256 346 enfant-jour ont participé à l'étude. La prévalence globale d'isolement de Campylobacter a été de 9,3%. Plus de 2/5 des enfants (43,3%) ont eu au moins un épisode d'infection à Campylobacter au cours de leur suivi. Les taux d'incidence annuelle des diarrhées ainsi que des infections symptomatiques ont été faibles, respectivement de 0,7 épisode /enfant et de 5,8 épisodes/100 enfant pouvant s'expliquer par le faible niveau d'exposition environnementale des enfants. Nous avons pu étudier l'importance des facteurs liés à l'hôte comme l'âge. Le pic d'infection à Campylobacter se situe entre 18 à 29 mois, celui des diarrhées entre 6 à 11 mois puis diminue ensuite. La 1ère infection à Campylobacter a été toujours pathogène chez les plus jeunes. Elle se situe vers le 8ème mois de la vie pour 10% d'entre eux. Les réinfections se font à des distances différentes de l'événement initial en fonction de l'âge. Ce profil d'infection pourrait traduire une compétence immunitaire différente selon l'âge et/ou une immunité acquise au cours du temps suite aux expositions répétées des enfants. L'environnement pourrait avoir un effet indirect dans l'entretien d'une immunité protectrice s'exprimant par un taux élevé d'infection asymptomatique. Il apparaît nécessaire de poursuivre des études de cohorte dans des zones à plus fort risque de transmission avec des données immunologiques car la compréhension actuelle des interactions entre l'hôte, le Campylobacter et l'environnement ne permet pas d'expliquer la variabilité de l'expression clinique de l'infection.Diarrheal diseases remain a major cause of infant mortality in developing countries (DCs). Due to the lack of technical platforms, the etiologic diagnoses are rarely made and treatments are then probabilistic. In Madagascar data on diarrhea are often fragmented and old. The sentinel surveillance network developed by the Institut Pasteur of Madagascar from 2007 allowed us to study the spatial and temporal distribution of consultations for diarrhea. But this syndromic surveillance cannot be coupled to biological monitoring for many diseases. In this context, we have no information on the causative agents of diarrhea. To achieve the coupling of syndromic and etiologic data, we performed a case-control study conducted in 2008-2009 in children less than 5 years in 14 districts. We have identified at least one pathogen in more than half of the children (55%), with a predominance of parasitic etiologies (37.2% diarrhea), followed by bacteria (15%) and viruses (6.7% rotavirus). Parasites were the only etiologies for which pathogenicity has been demonstrated. Among the bacterial etiologies, Campylobacter infection was the most common (9.5%). To better understand the role of Campylobacter in the occurrence of diarrhea in children and analyze the effect of environmental factors, we initiated and coordinated a dynamical cohort study including of children before the age of 24 months and followed up till the age of 36 months in Moramanga site, where the prevalence of Campylobacter was highest during the 2008 study (20.6%). Diarrhea surveillance was conducted two times per week and asymptomatic carriers assessed at baseline and every 2 months. A family study has been implemented and bi-annual stool follow-up in poultry population, water points and community drinking water for families. Campylobacter monitoring in poultry focused on rectal swabs. From January 2010 to May 2012, 508 children - corresponding to 256,346 child days -participated in the study. The overall prevalence of Campylobacter isolation was 9.3%. More than two fifths of children (43.3%) had at least one episode of Campylobacter during follow-up. The annual incidence of diarrhea and symptomatic infections were low, respectively 0.7 episodes / child and 5.8 episodes /100 children, can be explained by the low level of environmental exposure of children. We have studied the role of host factors such as age. The peak of Campylobacter infection is between 18 to 29 months, the diarrhea between 6 to 11 months then decreases. The first Campylobacter infection was always pathogen in the youngest children. It happens to the eighth month of life for 10% of them. Reinfections are at different distances from the initial event according to the age. This pattern of infection may reflect a variation of the immune competence according the age and / or acquired immunity over time after repeated exposure of the children. The local environment may have an indirect impact on maintaining protective immunity expressed by a high rate of asymptomatic infection. However, it is necessary to continue cohort study with immunologic data in a high risk transmission area as the current understanding of the interactions between the host, the environment and Campylobacter does not explain the variability of the clinical expression of infection.SAVOIE-SCD - Bib.électronique (730659901) / SudocGRENOBLE1/INP-Bib.électronique (384210012) / SudocGRENOBLE2/3-Bib.électronique (384219901) / SudocSudocFranceF

Trust in MDE Components: the DOMINO Experiment

International audienceA large number of modeling activities can be automatic or computer assisted. This automation ensures a more rapid and robust software development. However, engineers must ensure that the models have the properties required for the application. In order to tend towards this requirement, the DOMINO project (DOMaINs and methodological prOcess) proposes to use the socalled trustworthy Model-Driven Engineering (MDE) components and aims to provide a methodology for the validation and qualification of such components